MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012914	TCT	2	6	491380	491385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794452
10002	NC_012914	GAAG	2	8	491418	491425	50 %	0 %	50 %	0 %	251794452
10003	NC_012914	GCT	2	6	491436	491441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794452
10004	NC_012914	CTG	2	6	491453	491458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794452
10005	NC_012914	GTG	2	6	491459	491464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794452
10006	NC_012914	CTG	3	9	491471	491479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794452
10007	NC_012914	TC	3	6	491557	491562	0 %	50 %	0 %	50 %	251794452
10008	NC_012914	CAA	2	6	491571	491576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794452
10009	NC_012914	AGA	2	6	491639	491644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794452
10010	NC_012914	AGC	2	6	491679	491684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794452
10011	NC_012914	ACA	2	6	491701	491706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794452
10012	NC_012914	GGA	2	6	491710	491715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794452
10013	NC_012914	GGA	2	6	491725	491730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794452
10014	NC_012914	TCAA	2	8	491776	491783	50 %	25 %	0 %	25 %	251794452
10015	NC_012914	AGT	2	6	491785	491790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794452
10016	NC_012914	AGC	2	6	491862	491867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794452
10017	NC_012914	A	6	6	491942	491947	100 %	0 %	0 %	0 %	251794452
10018	NC_012914	GCA	2	6	492055	492060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794452
10019	NC_012914	TAT	2	6	492117	492122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_012914	TATG	2	8	492132	492139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_012914	TGT	2	6	492174	492179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794453
10022	NC_012914	AGT	2	6	492195	492200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794453
10023	NC_012914	AGCC	2	8	492273	492280	25 %	0 %	25 %	50 %	251794453
10024	NC_012914	CCT	2	6	492290	492295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_012914	ATGA	2	8	492299	492306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_012914	T	6	6	492470	492475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_012914	ATTTCC	2	12	492492	492503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_012914	AGAT	2	8	492533	492540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_012914	A	6	6	492587	492592	100 %	0 %	0 %	0 %	251794454
10030	NC_012914	A	6	6	492599	492604	100 %	0 %	0 %	0 %	251794454
10031	NC_012914	T	6	6	492618	492623	0 %	100 %	0 %	0 %	251794454
10032	NC_012914	T	7	7	492640	492646	0 %	100 %	0 %	0 %	251794454
10033	NC_012914	ATC	2	6	492659	492664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794454
10034	NC_012914	CAG	2	6	492678	492683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794454
10035	NC_012914	TAAA	2	8	492700	492707	75 %	25 %	0 %	0 %	251794454
10036	NC_012914	GCA	2	6	492766	492771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794454
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10038	NC_012914	TTC	3	9	492810	492818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794454
10039	NC_012914	GCAG	2	8	492895	492902	25 %	0 %	50 %	25 %	251794454
10040	NC_012914	TGC	2	6	492907	492912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794454
10041	NC_012914	TTA	2	6	492916	492921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794454
10042	NC_012914	CGGG	2	8	492937	492944	0 %	0 %	75 %	25 %	251794454
10043	NC_012914	GCG	2	6	492948	492953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794454
10044	NC_012914	GGC	2	6	493026	493031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794454
10045	NC_012914	ATC	2	6	493044	493049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794454
10046	NC_012914	ATTA	2	8	493059	493066	50 %	50 %	0 %	0 %	251794454
10047	NC_012914	CGG	2	6	493086	493091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794454
10048	NC_012914	GCAG	2	8	493123	493130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10049	NC_012914	TGT	2	6	493167	493172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_012914	TTA	2	6	493179	493184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_012914	AG	3	6	493212	493217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_012914	GT	3	6	493218	493223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_012914	GAG	2	6	493225	493230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_012914	TAA	2	6	493244	493249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794455
10055	NC_012914	ATG	2	6	493284	493289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794455
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10057	NC_012914	TTC	2	6	493341	493346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794455
10058	NC_012914	GA	3	6	493392	493397	50 %	0 %	50 %	0 %	251794455
10059	NC_012914	AGG	2	6	493459	493464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794455
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10061	NC_012914	TGG	2	6	493603	493608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794455
10062	NC_012914	GCT	2	6	493616	493621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794455
10063	NC_012914	CGA	2	6	493651	493656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794455
10064	NC_012914	CTG	2	6	493695	493700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794455
10065	NC_012914	AGG	2	6	493723	493728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794455
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10074	NC_012914	GGC	2	6	494217	494222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794455
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10076	NC_012914	ATAC	2	8	494258	494265	50 %	25 %	0 %	25 %	251794455
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10084	NC_012914	TCC	2	6	494584	494589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794455
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10087	NC_012914	CG	3	6	494699	494704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10088	NC_012914	GCA	2	6	494713	494718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10101	NC_012914	GCT	2	6	495172	495177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794456
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10108	NC_012914	GCA	2	6	495763	495768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_012914	GGA	2	6	495781	495786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_012914	AGC	2	6	495880	495885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794458
10111	NC_012914	CGT	2	6	495928	495933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794458
10112	NC_012914	GCGGG	2	10	495990	495999	0 %	0 %	80 %	20 %	251794458
10113	NC_012914	GAA	2	6	496030	496035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794458
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10119	NC_012914	GCC	2	6	496392	496397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794458
10120	NC_012914	TTCGC	2	10	496453	496462	0 %	40 %	20 %	40 %	251794458
10121	NC_012914	TGGC	2	8	496510	496517	0 %	25 %	50 %	25 %	251794458
10122	NC_012914	CTG	2	6	496537	496542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794458
10123	NC_012914	TCT	2	6	496545	496550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794458
10124	NC_012914	CTT	2	6	496556	496561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794458
10125	NC_012914	CGTA	2	8	496607	496614	25 %	25 %	25 %	25 %	251794458
10126	NC_012914	CGCTTG	2	12	496656	496667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794458
10127	NC_012914	TTCAGA	2	12	496671	496682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251794458
10128	NC_012914	AGG	2	6	496713	496718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794458
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10130	NC_012914	CTG	3	9	496871	496879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794458
10131	NC_012914	TA	3	6	496997	497002	50 %	50 %	0 %	0 %	251794458
10132	NC_012914	TTG	2	6	497028	497033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794458
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10145	NC_012914	AGC	2	6	497491	497496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794459
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10150	NC_012914	GCG	2	6	497679	497684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794459
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10152	NC_012914	CCCAT	2	10	497718	497727	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10153	NC_012914	AT	3	6	497726	497731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_012914	GCT	2	6	497759	497764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10158	NC_012914	AAG	2	6	497872	497877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794460
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10200	NC_012914	TAA	2	6	499684	499689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10201	NC_012914	GGA	2	6	499730	499735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10236	NC_012914	GGT	2	6	501055	501060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794463
10237	NC_012914	GAAGC	2	10	501111	501120	40 %	0 %	40 %	20 %	251794463
10238	NC_012914	ACG	2	6	501156	501161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794463
10239	NC_012914	ACG	2	6	501168	501173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794463
10240	NC_012914	TTC	2	6	501323	501328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794463
10241	NC_012914	ATC	2	6	501381	501386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794463
10242	NC_012914	TCT	2	6	501419	501424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794463
10243	NC_012914	GAT	2	6	501471	501476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_012914	TGA	2	6	501541	501546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794464
10245	NC_012914	GAA	2	6	501704	501709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794464
10246	NC_012914	CTT	2	6	501717	501722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794464
10247	NC_012914	TGAT	2	8	501757	501764	25 %	50 %	25 %	0 %	251794464
10248	NC_012914	GAA	2	6	501788	501793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794464
10249	NC_012914	TGC	2	6	501805	501810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794464
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10251	NC_012914	TCG	2	6	501874	501879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794464
10252	NC_012914	TCCTGT	2	12	501889	501900	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	251794464
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10254	NC_012914	ATC	2	6	501984	501989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794464
10255	NC_012914	TGCT	2	8	502000	502007	0 %	50 %	25 %	25 %	251794464
10256	NC_012914	GTC	2	6	502008	502013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794464
10257	NC_012914	ATC	2	6	502017	502022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794464
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10262	NC_012914	AGC	2	6	502168	502173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794464
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10267	NC_012914	TCGA	2	8	502335	502342	25 %	25 %	25 %	25 %	251794464
10268	NC_012914	CTG	2	6	502356	502361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794464
10269	NC_012914	TC	3	6	502393	502398	0 %	50 %	0 %	50 %	251794464
10270	NC_012914	TAT	2	6	502482	502487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794464
10271	NC_012914	TAT	2	6	502525	502530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794464
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10275	NC_012914	CCT	2	6	502735	502740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794464
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10280	NC_012914	GATA	2	8	503024	503031	50 %	25 %	25 %	0 %	251794464
10281	NC_012914	GCT	2	6	503075	503080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794464
10282	NC_012914	GTC	2	6	503085	503090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794464
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10284	NC_012914	AGTTG	2	10	503161	503170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10285	NC_012914	AGG	2	6	503178	503183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10286	NC_012914	TTC	2	6	503210	503215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794465
10287	NC_012914	CTG	2	6	503218	503223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794465
10288	NC_012914	CT	4	8	503304	503311	0 %	50 %	0 %	50 %	251794465
10289	NC_012914	TATTG	2	10	503315	503324	20 %	60 %	20 %	0 %	251794465
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10300	NC_012914	TCGA	2	8	503770	503777	25 %	25 %	25 %	25 %	251794465
10301	NC_012914	AG	3	6	503784	503789	50 %	0 %	50 %	0 %	251794465
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10310	NC_012914	TCT	2	6	504146	504151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794465
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10318	NC_012914	TATTC	2	10	504591	504600	20 %	60 %	0 %	20 %	251794465
10319	NC_012914	TTCT	2	8	504642	504649	0 %	75 %	0 %	25 %	251794465
10320	NC_012914	GCT	2	6	504738	504743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794465
10321	NC_012914	TGAT	2	8	504788	504795	25 %	50 %	25 %	0 %	251794465
10322	NC_012914	T	6	6	504869	504874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10323	NC_012914	GC	3	6	504912	504917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10324	NC_012914	GTT	2	6	504936	504941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10325	NC_012914	AGCAG	2	10	504950	504959	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10326	NC_012914	GA	4	8	504975	504982	50 %	0 %	50 %	0 %	251794466
10327	NC_012914	GCT	2	6	505043	505048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794466
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10330	NC_012914	TCCAA	2	10	505329	505338	40 %	20 %	0 %	40 %	251794466
10331	NC_012914	GATTG	2	10	505340	505349	20 %	40 %	40 %	0 %	251794466
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10336	NC_012914	G	6	6	505532	505537	0 %	0 %	100 %	0 %	251794466
10337	NC_012914	TTA	2	6	505733	505738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794466
10338	NC_012914	ATTA	2	8	505859	505866	50 %	50 %	0 %	0 %	251794466
10339	NC_012914	GTC	2	6	505896	505901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794466
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10343	NC_012914	AAGC	2	8	506065	506072	50 %	0 %	25 %	25 %	251794466
10344	NC_012914	ACA	2	6	506131	506136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794466
10345	NC_012914	CGC	2	6	506362	506367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794466
10346	NC_012914	GAT	2	6	506417	506422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794466
10347	NC_012914	GGA	2	6	506453	506458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794466
10348	NC_012914	AACGGA	2	12	506493	506504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	251794466
10349	NC_012914	GCT	2	6	506528	506533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794466
10350	NC_012914	AGC	2	6	506604	506609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794466
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10352	NC_012914	ACG	2	6	506661	506666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794466
10353	NC_012914	CATG	2	8	506684	506691	25 %	25 %	25 %	25 %	251794466
10354	NC_012914	AGG	3	9	506692	506700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794466
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10357	NC_012914	TGA	2	6	506871	506876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794467
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10360	NC_012914	GAG	2	6	507077	507082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794467
10361	NC_012914	GCG	2	6	507217	507222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794467
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10479	NC_012914	TTA	2	6	513622	513627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794473
10480	NC_012914	GCT	2	6	513649	513654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794473
10481	NC_012914	GTT	2	6	513665	513670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794473
10482	NC_012914	GCG	2	6	513739	513744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794473
10483	NC_012914	A	6	6	513906	513911	100 %	0 %	0 %	0 %	251794473
10484	NC_012914	GCG	2	6	513944	513949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794473
10485	NC_012914	GCA	2	6	513950	513955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794473
10486	NC_012914	GCTTT	2	10	514050	514059	0 %	60 %	20 %	20 %	251794473
10487	NC_012914	GGC	2	6	514061	514066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794473
10488	NC_012914	CTT	3	9	514123	514131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794473
10489	NC_012914	GTT	2	6	514177	514182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794473
10490	NC_012914	TGC	3	9	514275	514283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794473
10491	NC_012914	TCA	2	6	514344	514349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794473
10492	NC_012914	CGC	2	6	514367	514372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794473
10493	NC_012914	CTT	2	6	514399	514404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794473
10494	NC_012914	GGGCT	2	10	514418	514427	0 %	20 %	60 %	20 %	251794473
10495	NC_012914	CTG	2	6	514478	514483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794473
10496	NC_012914	TTAT	2	8	514500	514507	25 %	75 %	0 %	0 %	251794473
10497	NC_012914	GCC	2	6	514533	514538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794473
10498	NC_012914	GC	4	8	514540	514547	0 %	0 %	50 %	50 %	251794473
10499	NC_012914	TGT	2	6	514597	514602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_012914	GCA	2	6	514666	514671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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