MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012914	CCAG	2	8	25775	25782	25 %	0 %	25 %	50 %	251794058
502	NC_012914	CTG	2	6	25807	25812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794058
503	NC_012914	ATT	2	6	25934	25939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794058
504	NC_012914	AT	3	6	25969	25974	50 %	50 %	0 %	0 %	251794058
505	NC_012914	ATT	2	6	26002	26007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794058
506	NC_012914	GCT	2	6	26088	26093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794058
507	NC_012914	TCT	2	6	26153	26158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794058
508	NC_012914	GAG	2	6	26170	26175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794058
509	NC_012914	TGA	2	6	26244	26249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794058
510	NC_012914	GGC	2	6	26274	26279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794058
511	NC_012914	A	6	6	26374	26379	100 %	0 %	0 %	0 %	251794058
512	NC_012914	CTG	2	6	26407	26412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794058
513	NC_012914	GAT	2	6	26419	26424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794058
514	NC_012914	TAT	2	6	26503	26508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794058
515	NC_012914	GCT	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794058
516	NC_012914	GTT	2	6	26562	26567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794058
517	NC_012914	TA	3	6	26583	26588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012914	GAT	2	6	26607	26612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794059
519	NC_012914	AC	3	6	26624	26629	50 %	0 %	0 %	50 %	251794059
520	NC_012914	TGC	2	6	26691	26696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794059
521	NC_012914	ACG	2	6	26746	26751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794059
522	NC_012914	TTTA	2	8	26776	26783	25 %	75 %	0 %	0 %	251794059
523	NC_012914	TGGC	2	8	26793	26800	0 %	25 %	50 %	25 %	251794059
524	NC_012914	AGC	2	6	26849	26854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794059
525	NC_012914	GCA	2	6	26931	26936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794059
526	NC_012914	TCAT	2	8	26990	26997	25 %	50 %	0 %	25 %	251794059
527	NC_012914	GA	3	6	27033	27038	50 %	0 %	50 %	0 %	251794059
528	NC_012914	GGA	2	6	27058	27063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794059
529	NC_012914	CGG	2	6	27135	27140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794059
530	NC_012914	TCT	2	6	27204	27209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794059
531	NC_012914	GCA	2	6	27295	27300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794059
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533	NC_012914	TTA	2	6	27338	27343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794059
534	NC_012914	A	6	6	27358	27363	100 %	0 %	0 %	0 %	251794059
535	NC_012914	GCG	2	6	27415	27420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_012914	TTG	2	6	27437	27442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012914	ATGC	2	8	27621	27628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_012914	TGC	2	6	27650	27655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012914	TTC	2	6	27663	27668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012914	GCG	2	6	27682	27687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_012914	CT	3	6	27722	27727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_012914	AG	3	6	27764	27769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012914	CTT	2	6	27846	27851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012914	ATT	2	6	27868	27873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012914	GGC	2	6	27987	27992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012914	AGG	2	6	28003	28008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012914	ATC	2	6	28057	28062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794060
548	NC_012914	GTT	2	6	28159	28164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794060
549	NC_012914	GTA	2	6	28193	28198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794060
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553	NC_012914	GTTACC	2	12	28505	28516	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251794060
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556	NC_012914	A	6	6	28624	28629	100 %	0 %	0 %	0 %	251794060
557	NC_012914	TCC	2	6	28682	28687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794060
558	NC_012914	GTCA	2	8	28721	28728	25 %	25 %	25 %	25 %	251794060
559	NC_012914	AAG	2	6	28748	28753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794060
560	NC_012914	GCG	2	6	28800	28805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794060
561	NC_012914	GAA	2	6	28819	28824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794060
562	NC_012914	GAAG	2	8	28930	28937	50 %	0 %	50 %	0 %	251794060
563	NC_012914	TGG	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794060
564	NC_012914	GGA	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794060
565	NC_012914	CAA	2	6	29044	29049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794060
566	NC_012914	A	6	6	29099	29104	100 %	0 %	0 %	0 %	251794060
567	NC_012914	CCAA	2	8	29129	29136	50 %	0 %	0 %	50 %	251794060
568	NC_012914	AAG	2	6	29195	29200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012914	CTT	2	6	29212	29217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012914	TG	3	6	29220	29225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012914	ATT	2	6	29252	29257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012914	AGA	2	6	29267	29272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012914	TGC	2	6	29281	29286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_012914	ATT	2	6	29320	29325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794061
575	NC_012914	GTG	2	6	29326	29331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794061
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580	NC_012914	CGGA	2	8	29629	29636	25 %	0 %	50 %	25 %	251794061
581	NC_012914	TGG	2	6	29639	29644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794061
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587	NC_012914	GC	3	6	30055	30060	0 %	0 %	50 %	50 %	251794062
588	NC_012914	GCA	2	6	30065	30070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794062
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592	NC_012914	A	6	6	30201	30206	100 %	0 %	0 %	0 %	251794062
593	NC_012914	GAA	2	6	30213	30218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794062
594	NC_012914	TGGC	2	8	30232	30239	0 %	25 %	50 %	25 %	251794062
595	NC_012914	GTG	2	6	30246	30251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794062
596	NC_012914	TAC	2	6	30264	30269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794062
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598	NC_012914	TGA	2	6	30286	30291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794062
599	NC_012914	GCT	2	6	30293	30298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794062
600	NC_012914	TCG	2	6	30325	30330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794062
601	NC_012914	GAAG	2	8	30341	30348	50 %	0 %	50 %	0 %	251794062
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611	NC_012914	GGC	2	6	30734	30739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794062
612	NC_012914	GGC	2	6	30769	30774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_012914	CGG	2	6	30791	30796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012914	GCC	2	6	30809	30814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_012914	TGT	2	6	30820	30825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012914	CCGC	2	8	30830	30837	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
617	NC_012914	GGCG	2	8	30847	30854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
618	NC_012914	AAC	2	6	30926	30931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012914	ACC	2	6	30948	30953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_012914	CCA	2	6	31074	31079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_012914	AGC	2	6	31260	31265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_012914	CCAC	2	8	31275	31282	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
623	NC_012914	ATTG	2	8	31318	31325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012914	AAT	2	6	31327	31332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012914	TGA	2	6	31338	31343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012914	AGC	2	6	31389	31394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_012914	TGAAG	2	10	31452	31461	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012914	GGC	2	6	31515	31520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_012914	CGG	2	6	31585	31590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_012914	AGC	2	6	31645	31650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_012914	GT	4	8	31652	31659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012914	ACA	2	6	31693	31698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_012914	GGCA	2	8	31702	31709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_012914	GCCC	2	8	31715	31722	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
635	NC_012914	CGC	2	6	31730	31735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_012914	GCA	2	6	31743	31748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_012914	CCG	2	6	31852	31857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794063
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661	NC_012914	A	6	6	32989	32994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_012914	ATA	2	6	33023	33028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_012914	GGT	2	6	33082	33087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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669	NC_012914	T	8	8	33414	33421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
670	NC_012914	AGG	2	6	33445	33450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_012914	AGG	2	6	33512	33517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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