MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012914	TGC	2	6	424191	424196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8502	NC_012914	TCCGGA	2	12	424255	424266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8503	NC_012914	TAT	2	6	424285	424290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794393
8504	NC_012914	GGT	2	6	424297	424302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794393
8505	NC_012914	TCC	2	6	424337	424342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794393
8506	NC_012914	GCT	2	6	424393	424398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8507	NC_012914	GCT	2	6	424414	424419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8508	NC_012914	GA	3	6	424453	424458	50 %	0 %	50 %	0 %	251794393
8509	NC_012914	CTT	2	6	424489	424494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794393
8510	NC_012914	CAT	2	6	424576	424581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794393
8511	NC_012914	TCA	2	6	424611	424616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794393
8512	NC_012914	GCT	3	9	424654	424662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8513	NC_012914	GCG	2	6	424760	424765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794393
8514	NC_012914	ACA	2	6	424857	424862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794393
8515	NC_012914	TGC	2	6	424906	424911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8516	NC_012914	AGC	2	6	424998	425003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8517	NC_012914	GCT	2	6	425009	425014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8518	NC_012914	GCA	2	6	425036	425041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794393
8519	NC_012914	CGG	2	6	425065	425070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794393
8520	NC_012914	GAACAA	2	12	425094	425105	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	251794393
8521	NC_012914	GCAGG	2	10	425110	425119	20 %	0 %	60 %	20 %	251794394
8522	NC_012914	A	7	7	425166	425172	100 %	0 %	0 %	0 %	251794394
8523	NC_012914	TGC	2	6	425206	425211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794394
8524	NC_012914	GCT	2	6	425249	425254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794394
8525	NC_012914	CTG	2	6	425319	425324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794394
8526	NC_012914	AGA	2	6	425325	425330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794394
8527	NC_012914	GCG	2	6	425344	425349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794394
8528	NC_012914	ATCG	2	8	425477	425484	25 %	25 %	25 %	25 %	251794394
8529	NC_012914	TCCGA	2	10	425537	425546	20 %	20 %	20 %	40 %	251794394
8530	NC_012914	TG	3	6	425588	425593	0 %	50 %	50 %	0 %	251794394
8531	NC_012914	GCG	2	6	425602	425607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794394
8532	NC_012914	CGC	2	6	425681	425686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794394
8533	NC_012914	GCTG	2	8	425693	425700	0 %	25 %	50 %	25 %	251794394
8534	NC_012914	CGG	2	6	425785	425790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_012914	AGC	2	6	425846	425851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_012914	GA	3	6	425892	425897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_012914	AGC	2	6	425971	425976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_012914	CGG	2	6	426034	426039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_012914	AGG	2	6	426141	426146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_012914	TTTTA	2	10	426184	426193	20 %	80 %	0 %	0 %	251794395
8541	NC_012914	AAG	2	6	426292	426297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794395
8542	NC_012914	TGC	2	6	426422	426427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794395
8543	NC_012914	CG	3	6	426459	426464	0 %	0 %	50 %	50 %	251794395
8544	NC_012914	GC	3	6	426502	426507	0 %	0 %	50 %	50 %	251794395
8545	NC_012914	GGAC	2	8	426552	426559	25 %	0 %	50 %	25 %	251794395
8546	NC_012914	TGTA	2	8	426650	426657	25 %	50 %	25 %	0 %	251794395
8547	NC_012914	GCA	2	6	426672	426677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794395
8548	NC_012914	CGG	2	6	426693	426698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794395
8549	NC_012914	AGC	3	9	426878	426886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794395
8550	NC_012914	GGCA	2	8	426935	426942	25 %	0 %	50 %	25 %	251794395
8551	NC_012914	TGC	2	6	426989	426994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794395
8552	NC_012914	GCG	2	6	426998	427003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794395
8553	NC_012914	AGC	2	6	427277	427282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794395
8554	NC_012914	AGCCGC	2	12	427365	427376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	251794395
8555	NC_012914	ACA	2	6	427435	427440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794395
8556	NC_012914	GAAG	2	8	427538	427545	50 %	0 %	50 %	0 %	251794396
8557	NC_012914	CTG	2	6	427677	427682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794396
8558	NC_012914	GGA	2	6	427694	427699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794396
8559	NC_012914	GGC	2	6	427724	427729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794396
8560	NC_012914	GGCG	2	8	427733	427740	0 %	0 %	75 %	25 %	251794396
8561	NC_012914	CAGG	2	8	427821	427828	25 %	0 %	50 %	25 %	251794396
8562	NC_012914	TCC	2	6	427851	427856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794396
8563	NC_012914	GAA	2	6	427940	427945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794396
8564	NC_012914	TA	3	6	427981	427986	50 %	50 %	0 %	0 %	251794396
8565	NC_012914	ACG	2	6	427995	428000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794396
8566	NC_012914	TTC	2	6	428010	428015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794396
8567	NC_012914	GCC	2	6	428035	428040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794396
8568	NC_012914	GATCCG	2	12	428211	428222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251794396
8569	NC_012914	ACA	2	6	428251	428256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794396
8570	NC_012914	CAA	3	9	428261	428269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794396
8571	NC_012914	TCA	2	6	428290	428295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794396
8572	NC_012914	TCCG	2	8	428410	428417	0 %	25 %	25 %	50 %	251794396
8573	NC_012914	TAT	2	6	428469	428474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794396
8574	NC_012914	CGG	2	6	428497	428502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794396
8575	NC_012914	GGC	2	6	428507	428512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794396
8576	NC_012914	GCT	2	6	428587	428592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8577	NC_012914	CAG	3	9	428594	428602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8578	NC_012914	TCTCC	2	10	428625	428634	0 %	40 %	0 %	60 %	251794397
8579	NC_012914	TGA	2	6	428655	428660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794397
8580	NC_012914	GCT	2	6	428689	428694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8581	NC_012914	CCG	2	6	428761	428766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794397
8582	NC_012914	CGGA	2	8	428815	428822	25 %	0 %	50 %	25 %	251794397
8583	NC_012914	GCG	2	6	428825	428830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794397
8584	NC_012914	GGT	2	6	428848	428853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794397
8585	NC_012914	GAA	2	6	428896	428901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794397
8586	NC_012914	TGC	2	6	428945	428950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8587	NC_012914	GAG	2	6	428972	428977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794397
8588	NC_012914	GGC	2	6	429009	429014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794397
8589	NC_012914	GCG	2	6	429092	429097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794397
8590	NC_012914	GATC	2	8	429115	429122	25 %	25 %	25 %	25 %	251794397
8591	NC_012914	AGG	2	6	429123	429128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794397
8592	NC_012914	GGC	2	6	429145	429150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794397
8593	NC_012914	GC	3	6	429149	429154	0 %	0 %	50 %	50 %	251794397
8594	NC_012914	CTG	2	6	429179	429184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8595	NC_012914	TCG	2	6	429315	429320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8596	NC_012914	CAG	2	6	429323	429328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8597	NC_012914	ATT	2	6	429335	429340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794397
8598	NC_012914	AAG	2	6	429384	429389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794397
8599	NC_012914	GTT	2	6	429434	429439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794397
8600	NC_012914	AG	3	6	429461	429466	50 %	0 %	50 %	0 %	251794397
8601	NC_012914	TGG	2	6	429468	429473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794397
8602	NC_012914	GCG	2	6	429536	429541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794397
8603	NC_012914	ATG	2	6	429542	429547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794397
8604	NC_012914	CGC	2	6	429587	429592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794397
8605	NC_012914	CTG	2	6	429744	429749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8606	NC_012914	GCT	3	9	429751	429759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8607	NC_012914	GCT	2	6	429784	429789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8608	NC_012914	TGAAGC	2	12	429792	429803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	251794397
8609	NC_012914	AGC	3	9	429825	429833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8610	NC_012914	GCT	2	6	429949	429954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794397
8611	NC_012914	ATT	2	6	429985	429990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794397
8612	NC_012914	TGG	2	6	430017	430022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794397
8613	NC_012914	GTCC	2	8	430088	430095	0 %	25 %	25 %	50 %	251794397
8614	NC_012914	GCG	2	6	430180	430185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794397
8615	NC_012914	CAT	2	6	430311	430316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794397
8616	NC_012914	GGA	2	6	430350	430355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794398
8617	NC_012914	GGC	2	6	430446	430451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794398
8618	NC_012914	GAC	2	6	430459	430464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794398
8619	NC_012914	GGC	2	6	430489	430494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794398
8620	NC_012914	GCAT	2	8	430547	430554	25 %	25 %	25 %	25 %	251794398
8621	NC_012914	ATCGGC	2	12	430561	430572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251794398
8622	NC_012914	CT	4	8	430606	430613	0 %	50 %	0 %	50 %	251794398
8623	NC_012914	TCT	2	6	430621	430626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794398
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8638	NC_012914	GC	3	6	431090	431095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8642	NC_012914	AAACC	2	10	431229	431238	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8643	NC_012914	GC	3	6	431242	431247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8644	NC_012914	CG	3	6	431266	431271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8645	NC_012914	GCCC	2	8	431281	431288	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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8652	NC_012914	GCT	2	6	431530	431535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794399
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8723	NC_012914	AGC	2	6	434648	434653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794401
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8726	NC_012914	AGG	3	9	434892	434900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8727	NC_012914	GCT	2	6	434939	434944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794402
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8733	NC_012914	AAG	2	6	435117	435122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794402
8734	NC_012914	AAC	2	6	435161	435166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794402
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8739	NC_012914	GGCAAC	2	12	435248	435259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794402
8740	NC_012914	CAA	2	6	435265	435270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794402
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8991	NC_012914	ATAC	2	8	445960	445967	50 %	25 %	0 %	25 %	251794414
8992	NC_012914	CGAA	2	8	446018	446025	50 %	0 %	25 %	25 %	251794414
8993	NC_012914	GAT	2	6	446134	446139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794414
8994	NC_012914	TGC	2	6	446203	446208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794414
8995	NC_012914	GTCA	2	8	446270	446277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8996	NC_012914	T	6	6	446305	446310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8997	NC_012914	CGG	2	6	446349	446354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8998	NC_012914	ATTA	2	8	446397	446404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8999	NC_012914	GTT	2	6	446410	446415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9000	NC_012914	TTAA	2	8	446454	446461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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