MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012914	GCTT	2	8	299953	299960	0 %	50 %	25 %	25 %	251794286
6002	NC_012914	ACG	2	6	300125	300130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6003	NC_012914	TGA	2	6	300147	300152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794286
6004	NC_012914	ATG	2	6	300219	300224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794286
6005	NC_012914	GCA	2	6	300270	300275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6006	NC_012914	CGG	2	6	300283	300288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794286
6007	NC_012914	GGAA	2	8	300319	300326	50 %	0 %	50 %	0 %	251794286
6008	NC_012914	TCT	2	6	300441	300446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794286
6009	NC_012914	CG	3	6	300468	300473	0 %	0 %	50 %	50 %	251794286
6010	NC_012914	GCA	2	6	300476	300481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6011	NC_012914	CGC	2	6	300528	300533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794286
6012	NC_012914	ACG	2	6	300548	300553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6013	NC_012914	GTT	2	6	300557	300562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794286
6014	NC_012914	AGC	2	6	300588	300593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6015	NC_012914	GCA	2	6	300626	300631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6016	NC_012914	CATA	2	8	300640	300647	50 %	25 %	0 %	25 %	251794286
6017	NC_012914	TA	3	6	300646	300651	50 %	50 %	0 %	0 %	251794286
6018	NC_012914	CTAC	2	8	300678	300685	25 %	25 %	0 %	50 %	251794286
6019	NC_012914	TTA	2	6	300766	300771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794286
6020	NC_012914	TTG	2	6	300804	300809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794286
6021	NC_012914	A	7	7	300977	300983	100 %	0 %	0 %	0 %	251794286
6022	NC_012914	GAC	2	6	301096	301101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6023	NC_012914	GACC	2	8	301135	301142	25 %	0 %	25 %	50 %	251794286
6024	NC_012914	TTC	2	6	301215	301220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794286
6025	NC_012914	CAA	2	6	301224	301229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794286
6026	NC_012914	GCCG	2	8	301231	301238	0 %	0 %	50 %	50 %	251794286
6027	NC_012914	GCT	2	6	301411	301416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6028	NC_012914	AGC	2	6	301562	301567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6029	NC_012914	TAT	2	6	301789	301794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794286
6030	NC_012914	GCTG	2	8	301888	301895	0 %	25 %	50 %	25 %	251794286
6031	NC_012914	GAT	2	6	301997	302002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794286
6032	NC_012914	CGG	2	6	302022	302027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794286
6033	NC_012914	ACG	2	6	302088	302093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6034	NC_012914	GCA	2	6	302300	302305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6035	NC_012914	A	6	6	302327	302332	100 %	0 %	0 %	0 %	251794286
6036	NC_012914	TAT	2	6	302441	302446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794286
6037	NC_012914	GGT	2	6	302449	302454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794286
6038	NC_012914	TAT	2	6	302606	302611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794286
6039	NC_012914	GCA	2	6	302628	302633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6040	NC_012914	CGT	2	6	302698	302703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794286
6041	NC_012914	TTTATA	2	12	302745	302756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794286
6042	NC_012914	GAA	2	6	302810	302815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794286
6043	NC_012914	TTCAA	2	10	302817	302826	40 %	40 %	0 %	20 %	251794286
6044	NC_012914	TGAT	2	8	302880	302887	25 %	50 %	25 %	0 %	251794286
6045	NC_012914	TTA	2	6	302924	302929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794286
6046	NC_012914	AC	3	6	303040	303045	50 %	0 %	0 %	50 %	251794286
6047	NC_012914	ATA	2	6	303049	303054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794286
6048	NC_012914	ACA	2	6	303081	303086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794287
6049	NC_012914	CTTA	2	8	303101	303108	25 %	50 %	0 %	25 %	251794287
6050	NC_012914	CTG	3	9	303130	303138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794287
6051	NC_012914	GCA	2	6	303155	303160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794287
6052	NC_012914	CG	3	6	303163	303168	0 %	0 %	50 %	50 %	251794287
6053	NC_012914	CGG	2	6	303225	303230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794287
6054	NC_012914	AGC	2	6	303257	303262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794287
6055	NC_012914	GCT	2	6	303386	303391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794287
6056	NC_012914	GCG	2	6	303452	303457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794287
6057	NC_012914	ACGG	2	8	303577	303584	25 %	0 %	50 %	25 %	251794287
6058	NC_012914	CGAT	2	8	303647	303654	25 %	25 %	25 %	25 %	251794287
6059	NC_012914	GTAAA	2	10	303659	303668	60 %	20 %	20 %	0 %	251794287
6060	NC_012914	GTT	2	6	303736	303741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794287
6061	NC_012914	AGC	2	6	303776	303781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794287
6062	NC_012914	GTC	2	6	303835	303840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794287
6063	NC_012914	GCC	2	6	304051	304056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794287
6064	NC_012914	ATCC	2	8	304190	304197	25 %	25 %	0 %	50 %	251794287
6065	NC_012914	TACC	2	8	304247	304254	25 %	25 %	0 %	50 %	251794287
6066	NC_012914	ACT	2	6	304277	304282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794287
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6068	NC_012914	TTA	2	6	304589	304594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794287
6069	NC_012914	CGGA	2	8	304604	304611	25 %	0 %	50 %	25 %	251794287
6070	NC_012914	CATC	2	8	304628	304635	25 %	25 %	0 %	50 %	251794287
6071	NC_012914	AAG	2	6	304643	304648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794287
6072	NC_012914	TGA	2	6	304655	304660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794287
6073	NC_012914	TCA	2	6	304721	304726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794287
6074	NC_012914	AAG	2	6	304741	304746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794287
6075	NC_012914	GCG	2	6	304768	304773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794287
6076	NC_012914	AGCAA	2	10	304785	304794	60 %	0 %	20 %	20 %	251794287
6077	NC_012914	AGC	2	6	304832	304837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794287
6078	NC_012914	CG	3	6	304846	304851	0 %	0 %	50 %	50 %	251794287
6079	NC_012914	TTA	2	6	304895	304900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794287
6080	NC_012914	A	7	7	304918	304924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_012914	T	6	6	304957	304962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_012914	TCG	2	6	305037	305042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794288
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6085	NC_012914	AGT	2	6	305162	305167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794288
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6089	NC_012914	CGGC	2	8	305566	305573	0 %	0 %	50 %	50 %	251794288
6090	NC_012914	TC	3	6	305725	305730	0 %	50 %	0 %	50 %	251794288
6091	NC_012914	CTC	2	6	305807	305812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794288
6092	NC_012914	AATC	2	8	305833	305840	50 %	25 %	0 %	25 %	251794288
6093	NC_012914	CTG	2	6	305843	305848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794288
6094	NC_012914	CCT	2	6	305887	305892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_012914	TGA	2	6	305939	305944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_012914	GCT	3	9	305989	305997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_012914	CTT	2	6	306008	306013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794289
6098	NC_012914	TGCC	2	8	306026	306033	0 %	25 %	25 %	50 %	251794289
6099	NC_012914	TTC	2	6	306054	306059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794289
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6103	NC_012914	GGC	2	6	306314	306319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794289
6104	NC_012914	AGT	2	6	306320	306325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794289
6105	NC_012914	TGC	2	6	306332	306337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794289
6106	NC_012914	GTT	2	6	306440	306445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794289
6107	NC_012914	T	6	6	306453	306458	0 %	100 %	0 %	0 %	251794289
6108	NC_012914	AGC	2	6	306460	306465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794289
6109	NC_012914	CAA	2	6	306560	306565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794289
6110	NC_012914	GCAGGA	2	12	306581	306592	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	251794289
6111	NC_012914	CGTC	2	8	306629	306636	0 %	25 %	25 %	50 %	251794289
6112	NC_012914	ATA	2	6	306706	306711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794289
6113	NC_012914	GAA	2	6	306795	306800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794289
6114	NC_012914	CCT	2	6	306942	306947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_012914	GAT	2	6	306954	306959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_012914	TGA	2	6	306987	306992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_012914	TGC	2	6	306997	307002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_012914	GCC	2	6	307020	307025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_012914	GGCA	2	8	307193	307200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_012914	GGC	3	9	307250	307258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794290
6121	NC_012914	CGGC	2	8	307275	307282	0 %	0 %	50 %	50 %	251794290
6122	NC_012914	CGG	2	6	307338	307343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794290
6123	NC_012914	GAA	2	6	307450	307455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794290
6124	NC_012914	CGA	2	6	307486	307491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794290
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6126	NC_012914	CTG	2	6	307622	307627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794290
6127	NC_012914	GCT	2	6	307630	307635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794290
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6129	NC_012914	GCT	2	6	307693	307698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794290
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6131	NC_012914	TCCGA	2	10	307712	307721	20 %	20 %	20 %	40 %	251794290
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6137	NC_012914	GCGG	2	8	308087	308094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6138	NC_012914	AGT	2	6	308117	308122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6140	NC_012914	AAATA	2	10	308288	308297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6155	NC_012914	CGG	2	6	308994	308999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6167	NC_012914	TCC	2	6	309480	309485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6168	NC_012914	GAC	2	6	309509	309514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6169	NC_012914	TA	3	6	309524	309529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6170	NC_012914	ATT	2	6	309574	309579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6171	NC_012914	AAG	2	6	309657	309662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6182	NC_012914	TAG	3	9	310179	310187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6183	NC_012914	TAG	2	6	310190	310195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6184	NC_012914	CAA	2	6	310217	310222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6185	NC_012914	GAT	3	9	310232	310240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6218	NC_012914	T	6	6	311675	311680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6219	NC_012914	G	6	6	311702	311707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6220	NC_012914	AGA	2	6	311733	311738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794295
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6228	NC_012914	TTG	2	6	312070	312075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6229	NC_012914	TCAT	2	8	312080	312087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6230	NC_012914	ATGA	2	8	312120	312127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_012914	GTAT	2	8	312137	312144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_012914	CCG	2	6	312178	312183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6233	NC_012914	AGC	2	6	312199	312204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6235	NC_012914	ACTA	2	8	312255	312262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6236	NC_012914	CCGG	2	8	312366	312373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6237	NC_012914	CCG	2	6	312488	312493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6238	NC_012914	GCG	2	6	312498	312503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6240	NC_012914	CTC	2	6	312559	312564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6241	NC_012914	TAA	2	6	312639	312644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_012914	CCGG	2	8	312676	312683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6243	NC_012914	TAT	2	6	312733	312738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_012914	CCG	2	6	312798	312803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6372	NC_012914	AGG	2	6	320084	320089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6373	NC_012914	GAA	2	6	320099	320104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794302
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6392	NC_012914	GCAA	2	8	320826	320833	50 %	0 %	25 %	25 %	251794302
6393	NC_012914	GAAG	2	8	320843	320850	50 %	0 %	50 %	0 %	251794302
6394	NC_012914	TCAA	2	8	320893	320900	50 %	25 %	0 %	25 %	251794302
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6397	NC_012914	T	7	7	321024	321030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6398	NC_012914	AGGA	2	8	321039	321046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_012914	GCGGTT	2	12	321143	321154	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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6401	NC_012914	TGG	2	6	321260	321265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_012914	TGC	2	6	321275	321280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794303
6403	NC_012914	A	6	6	321365	321370	100 %	0 %	0 %	0 %	251794303
6404	NC_012914	TAG	2	6	321380	321385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6405	NC_012914	CT	3	6	321499	321504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6406	NC_012914	TGCA	2	8	321571	321578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6407	NC_012914	GTGA	2	8	321632	321639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6408	NC_012914	CTCG	2	8	321722	321729	0 %	25 %	25 %	50 %	251794304
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6483	NC_012914	TCC	2	6	325024	325029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6484	NC_012914	AATTAA	2	12	325030	325041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6485	NC_012914	AGG	2	6	325102	325107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6492	NC_012914	AAAC	2	8	325733	325740	75 %	0 %	0 %	25 %	251794306
6493	NC_012914	ATC	2	6	325775	325780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794306
6494	NC_012914	TC	3	6	325792	325797	0 %	50 %	0 %	50 %	251794306
6495	NC_012914	GGTT	2	8	325816	325823	0 %	50 %	50 %	0 %	251794306
6496	NC_012914	GGT	2	6	325954	325959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794306
6497	NC_012914	TATTCT	2	12	325966	325977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251794306
6498	NC_012914	A	6	6	325997	326002	100 %	0 %	0 %	0 %	251794306
6499	NC_012914	GA	3	6	326038	326043	50 %	0 %	50 %	0 %	251794307
6500	NC_012914	CTG	2	6	326087	326092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794307

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