MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012914	GA	3	6	251911	251916	50 %	0 %	50 %	0 %	251794244
5002	NC_012914	GAA	2	6	251923	251928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
5003	NC_012914	AGC	2	6	251932	251937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
5004	NC_012914	GAG	2	6	251984	251989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794244
5005	NC_012914	GAT	2	6	252119	252124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794244
5006	NC_012914	AGG	2	6	252189	252194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794244
5007	NC_012914	GTT	3	9	252227	252235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794244
5008	NC_012914	GAA	2	6	252239	252244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
5009	NC_012914	GAA	2	6	252253	252258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
5010	NC_012914	ATG	2	6	252264	252269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794244
5011	NC_012914	AGC	2	6	252278	252283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
5012	NC_012914	GAA	2	6	252310	252315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
5013	NC_012914	AGC	2	6	252339	252344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
5014	NC_012914	CAA	2	6	252370	252375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794244
5015	NC_012914	CGAAGC	2	12	252388	252399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
5016	NC_012914	T	6	6	252401	252406	0 %	100 %	0 %	0 %	251794244
5017	NC_012914	TTCCG	2	10	252496	252505	0 %	40 %	20 %	40 %	251794245
5018	NC_012914	GCT	2	6	252558	252563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794245
5019	NC_012914	CTG	2	6	252572	252577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794245
5020	NC_012914	GCC	2	6	252595	252600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794245
5021	NC_012914	AGA	3	9	252620	252628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
5022	NC_012914	AAC	2	6	252637	252642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794245
5023	NC_012914	CTG	2	6	252652	252657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794245
5024	NC_012914	GCG	2	6	252736	252741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
5025	NC_012914	AAC	2	6	252750	252755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794245
5026	NC_012914	AGA	2	6	252784	252789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
5027	NC_012914	TAA	2	6	252815	252820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794245
5028	NC_012914	CGGC	2	8	252865	252872	0 %	0 %	50 %	50 %	251794245
5029	NC_012914	GGCC	2	8	252950	252957	0 %	0 %	50 %	50 %	251794245
5030	NC_012914	GGT	2	6	252972	252977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794245
5031	NC_012914	CGC	2	6	252993	252998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794245
5032	NC_012914	GCG	3	9	253023	253031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
5033	NC_012914	GCA	2	6	253049	253054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794245
5034	NC_012914	GCC	2	6	253055	253060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794245
5035	NC_012914	CGG	2	6	253157	253162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
5036	NC_012914	GAA	2	6	253188	253193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
5037	NC_012914	CAA	2	6	253199	253204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794245
5038	NC_012914	AGA	2	6	253240	253245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
5039	NC_012914	ACG	2	6	253264	253269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794245
5040	NC_012914	AGG	2	6	253298	253303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794245
5041	NC_012914	GGC	2	6	253323	253328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
5042	NC_012914	AAGAA	2	10	253363	253372	80 %	0 %	20 %	0 %	251794245
5043	NC_012914	CTGC	2	8	253531	253538	0 %	25 %	25 %	50 %	251794245
5044	NC_012914	GGA	2	6	253551	253556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794245
5045	NC_012914	AGC	2	6	253596	253601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794245
5046	NC_012914	CGT	2	6	253722	253727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_012914	ATA	2	6	253748	253753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012914	TTTC	2	8	253790	253797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_012914	T	10	10	253802	253811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012914	GGC	2	6	253892	253897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794246
5051	NC_012914	CTT	2	6	253934	253939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794246
5052	NC_012914	A	6	6	253982	253987	100 %	0 %	0 %	0 %	251794246
5053	NC_012914	GC	3	6	253995	254000	0 %	0 %	50 %	50 %	251794246
5054	NC_012914	CGA	2	6	254015	254020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794246
5055	NC_012914	TA	3	6	254021	254026	50 %	50 %	0 %	0 %	251794246
5056	NC_012914	TGG	2	6	254029	254034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794246
5057	NC_012914	GGC	2	6	254043	254048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794246
5058	NC_012914	CGT	2	6	254049	254054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794246
5059	NC_012914	ATGG	2	8	254056	254063	25 %	25 %	50 %	0 %	251794246
5060	NC_012914	TCAT	2	8	254129	254136	25 %	50 %	0 %	25 %	251794246
5061	NC_012914	TTA	2	6	254180	254185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794246
5062	NC_012914	TCG	2	6	254192	254197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794246
5063	NC_012914	CGA	2	6	254211	254216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794246
5064	NC_012914	A	6	6	254311	254316	100 %	0 %	0 %	0 %	251794246
5065	NC_012914	CTG	2	6	254371	254376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794246
5066	NC_012914	CAG	2	6	254423	254428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794246
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5068	NC_012914	AAAAG	2	10	254463	254472	80 %	0 %	20 %	0 %	251794246
5069	NC_012914	T	7	7	254508	254514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_012914	TA	3	6	254528	254533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_012914	T	6	6	254536	254541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_012914	AAG	2	6	254577	254582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794247
5073	NC_012914	CGG	2	6	254606	254611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794247
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5075	NC_012914	CGGC	2	8	254693	254700	0 %	0 %	50 %	50 %	251794247
5076	NC_012914	AATG	2	8	254731	254738	50 %	25 %	25 %	0 %	251794247
5077	NC_012914	CGA	2	6	254758	254763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794247
5078	NC_012914	TGC	2	6	254868	254873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794247
5079	NC_012914	CAG	2	6	254911	254916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794247
5080	NC_012914	TGC	2	6	254937	254942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794247
5081	NC_012914	GC	3	6	254941	254946	0 %	0 %	50 %	50 %	251794247
5082	NC_012914	AG	3	6	255128	255133	50 %	0 %	50 %	0 %	251794247
5083	NC_012914	TTC	3	9	255149	255157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794247
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5085	NC_012914	TCC	2	6	255230	255235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794247
5086	NC_012914	AAT	2	6	255313	255318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794247
5087	NC_012914	GC	3	6	255321	255326	0 %	0 %	50 %	50 %	251794247
5088	NC_012914	GCC	2	6	255332	255337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794247
5089	NC_012914	TCT	2	6	255374	255379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794247
5090	NC_012914	GCT	2	6	255407	255412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794247
5091	NC_012914	CCT	2	6	255441	255446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_012914	TTAA	2	8	255483	255490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_012914	CTG	2	6	255520	255525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794248
5094	NC_012914	GCC	2	6	255544	255549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794248
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5096	NC_012914	GCC	2	6	255602	255607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794248
5097	NC_012914	GCCGC	2	10	255644	255653	0 %	0 %	40 %	60 %	251794248
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5099	NC_012914	CGCTT	2	10	255790	255799	0 %	40 %	20 %	40 %	251794248
5100	NC_012914	CGG	2	6	255806	255811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794248
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5102	NC_012914	TGT	2	6	255897	255902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794248
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5106	NC_012914	GCC	2	6	256183	256188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794248
5107	NC_012914	CGCC	2	8	256212	256219	0 %	0 %	25 %	75 %	251794248
5108	NC_012914	CGT	2	6	256305	256310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794248
5109	NC_012914	GCC	2	6	256487	256492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794248
5110	NC_012914	CGGC	2	8	256497	256504	0 %	0 %	50 %	50 %	251794248
5111	NC_012914	CT	3	6	256548	256553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_012914	GCC	2	6	256588	256593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_012914	CTT	2	6	256600	256605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_012914	T	6	6	256652	256657	0 %	100 %	0 %	0 %	251794249
5115	NC_012914	TGC	2	6	256675	256680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794249
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5117	NC_012914	ATCC	2	8	256884	256891	25 %	25 %	0 %	50 %	251794249
5118	NC_012914	ACG	2	6	257017	257022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794249
5119	NC_012914	ATC	2	6	257080	257085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794249
5120	NC_012914	CAG	2	6	257091	257096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794249
5121	NC_012914	GCA	2	6	257195	257200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794249
5122	NC_012914	CTT	2	6	257225	257230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794249
5123	NC_012914	ACT	2	6	257318	257323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_012914	ATT	2	6	257337	257342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_012914	ATTCA	2	10	257347	257356	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5126	NC_012914	CATTA	2	10	257390	257399	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5127	NC_012914	AT	3	6	257416	257421	50 %	50 %	0 %	0 %	251794250
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5131	NC_012914	AAG	2	6	257616	257621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794250
5132	NC_012914	GAT	2	6	257635	257640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794250
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5135	NC_012914	GGC	2	6	257876	257881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794250
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5137	NC_012914	GC	3	6	258021	258026	0 %	0 %	50 %	50 %	251794250
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5141	NC_012914	TCT	2	6	258228	258233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_012914	TGT	2	6	258234	258239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_012914	TGCC	2	8	258262	258269	0 %	25 %	25 %	50 %	251794251
5144	NC_012914	TCA	2	6	258287	258292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794251
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5148	NC_012914	AGT	2	6	258537	258542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794251
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5152	NC_012914	GCA	2	6	258663	258668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794251
5153	NC_012914	GCT	2	6	258669	258674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794251
5154	NC_012914	CTG	2	6	258729	258734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794251
5155	NC_012914	TCC	2	6	258932	258937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794251
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5157	NC_012914	TGT	3	9	259041	259049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_012914	TGT	2	6	259054	259059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_012914	ATTG	2	8	259106	259113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_012914	ACA	2	6	259158	259163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5165	NC_012914	GTTAT	2	10	259478	259487	20 %	60 %	20 %	0 %	251794252
5166	NC_012914	TTCCT	2	10	259517	259526	0 %	60 %	0 %	40 %	251794252
5167	NC_012914	AAG	2	6	259567	259572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794252
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5183	NC_012914	TA	3	6	260635	260640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5184	NC_012914	TGAA	2	8	260641	260648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5185	NC_012914	GAA	2	6	260677	260682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794253
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5221	NC_012914	AT	3	6	262735	262740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5222	NC_012914	ATA	2	6	262745	262750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_012914	TAT	2	6	262765	262770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_012914	CTTTT	2	10	262811	262820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5230	NC_012914	AGG	2	6	263145	263150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794256
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5236	NC_012914	ATT	2	6	263337	263342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794256
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5238	NC_012914	TGG	2	6	263396	263401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794256
5239	NC_012914	ACG	2	6	263417	263422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794256
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5242	NC_012914	GGC	2	6	263698	263703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794256
5243	NC_012914	GA	3	6	263714	263719	50 %	0 %	50 %	0 %	251794256
5244	NC_012914	CTG	2	6	263738	263743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794256
5245	NC_012914	GGC	2	6	263774	263779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794256
5246	NC_012914	GTT	2	6	263819	263824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794256
5247	NC_012914	CAG	2	6	263830	263835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794256
5248	NC_012914	TGGC	2	8	263876	263883	0 %	25 %	50 %	25 %	251794256
5249	NC_012914	CAG	2	6	263951	263956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794256
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5255	NC_012914	AGC	2	6	264524	264529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794256
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5258	NC_012914	CGGC	2	8	264705	264712	0 %	0 %	50 %	50 %	251794256
5259	NC_012914	AAT	2	6	264743	264748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794256
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5287	NC_012914	CAA	2	6	266309	266314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5288	NC_012914	AGG	2	6	266318	266323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5289	NC_012914	A	6	6	266350	266355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5290	NC_012914	TTG	2	6	266374	266379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5353	NC_012914	GCC	2	6	269446	269451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794257
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5358	NC_012914	ATTC	2	8	269637	269644	25 %	50 %	0 %	25 %	251794257
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5362	NC_012914	GAACG	2	10	269803	269812	40 %	0 %	40 %	20 %	251794257
5363	NC_012914	GCCTT	2	10	269813	269822	0 %	40 %	20 %	40 %	251794257
5364	NC_012914	CTT	2	6	269897	269902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794257
5365	NC_012914	AAG	2	6	269924	269929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794257
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5491	NC_012914	CTG	2	6	275671	275676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794264
5492	NC_012914	AAG	2	6	275692	275697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794264
5493	NC_012914	GGC	2	6	275721	275726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
5494	NC_012914	CGG	4	12	275766	275777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
5495	NC_012914	GCG	2	6	275782	275787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
5496	NC_012914	TTG	2	6	275864	275869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794264
5497	NC_012914	CGG	2	6	275882	275887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
5498	NC_012914	CTG	2	6	275926	275931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794264
5499	NC_012914	TGC	2	6	275951	275956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794264
5500	NC_012914	GAAAT	3	15	276035	276049	60 %	20 %	20 %	0 %	251794264

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