MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_012660	CCG	2	6	891904	891909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588337
19003	NC_012660	GTC	2	6	892113	892118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_012660	GAC	2	6	892142	892147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_012660	TCG	2	6	892333	892338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588338
19006	NC_012660	CCA	2	6	892360	892365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588338
19007	NC_012660	ACC	2	6	892383	892388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588338
19008	NC_012660	AGGCCA	2	12	892393	892404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588338
19009	NC_012660	CGG	2	6	892496	892501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588338
19010	NC_012660	CCA	2	6	892633	892638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588338
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19012	NC_012660	GCG	2	6	892690	892695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588338
19013	NC_012660	ACA	2	6	892721	892726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_012660	CAG	2	6	892761	892766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588339
19015	NC_012660	GTG	2	6	892791	892796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588339
19016	NC_012660	CTG	2	6	892800	892805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588339
19017	NC_012660	GTCG	2	8	892895	892902	0 %	25 %	50 %	25 %	229588339
19018	NC_012660	TCA	2	6	892974	892979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229588339
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19020	NC_012660	TGC	2	6	893062	893067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588339
19021	NC_012660	GTC	2	6	893068	893073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588339
19022	NC_012660	TGG	3	9	893107	893115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588339
19023	NC_012660	TGC	2	6	893116	893121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588339
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19028	NC_012660	GTG	2	6	893339	893344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588339
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19032	NC_012660	GGTTG	2	10	893440	893449	0 %	40 %	60 %	0 %	229588339
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19042	NC_012660	TGGCG	2	10	893746	893755	0 %	20 %	60 %	20 %	229588339
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19047	NC_012660	TGATCG	2	12	894028	894039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229588339
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19052	NC_012660	CAA	2	6	894274	894279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_012660	GAT	2	6	894311	894316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_012660	TGA	2	6	894383	894388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_012660	AGC	2	6	894465	894470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588340
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19104	NC_012660	CCCCA	2	10	896600	896609	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
19105	NC_012660	CCG	2	6	896613	896618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19123	NC_012660	GCC	2	6	897325	897330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588342
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19126	NC_012660	GCC	2	6	897381	897386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588342
19127	NC_012660	TCG	2	6	897394	897399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588342
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19362	NC_012660	CAT	2	6	907511	907516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229588349
19363	NC_012660	CGG	2	6	907531	907536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588349
19364	NC_012660	CGG	2	6	907666	907671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588349
19365	NC_012660	TGC	2	6	907672	907677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588349
19366	NC_012660	GC	3	6	907697	907702	0 %	0 %	50 %	50 %	229588349
19367	NC_012660	GCCCAT	2	12	907704	907715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	229588349
19368	NC_012660	GT	3	6	907731	907736	0 %	50 %	50 %	0 %	229588349
19369	NC_012660	GGC	2	6	907745	907750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588349
19370	NC_012660	GCA	2	6	907813	907818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588349
19371	NC_012660	GC	3	6	907833	907838	0 %	0 %	50 %	50 %	229588349
19372	NC_012660	CGCC	2	8	907900	907907	0 %	0 %	25 %	75 %	229588349
19373	NC_012660	GTGC	2	8	907911	907918	0 %	25 %	50 %	25 %	229588349
19374	NC_012660	GC	3	6	907995	908000	0 %	0 %	50 %	50 %	229588350
19375	NC_012660	CTG	2	6	908034	908039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588350
19376	NC_012660	GCC	2	6	908046	908051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588350
19377	NC_012660	GA	3	6	908197	908202	50 %	0 %	50 %	0 %	229588350
19378	NC_012660	GCA	2	6	908206	908211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588350
19379	NC_012660	GGT	3	9	908336	908344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588350
19380	NC_012660	GCG	2	6	908440	908445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588350
19381	NC_012660	GC	3	6	908453	908458	0 %	0 %	50 %	50 %	229588350
19382	NC_012660	CAGC	2	8	908540	908547	25 %	0 %	25 %	50 %	229588350
19383	NC_012660	TGG	2	6	908572	908577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588350
19384	NC_012660	GCT	2	6	908681	908686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588350
19385	NC_012660	TGC	2	6	908695	908700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588350
19386	NC_012660	GCG	2	6	908713	908718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588350
19387	NC_012660	GCGCC	2	10	908738	908747	0 %	0 %	40 %	60 %	229588350
19388	NC_012660	GC	3	6	908811	908816	0 %	0 %	50 %	50 %	229588350
19389	NC_012660	GCG	2	6	908824	908829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588350
19390	NC_012660	TTG	2	6	908830	908835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229588350
19391	NC_012660	TGA	2	6	908868	908873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229588351
19392	NC_012660	TTG	2	6	908933	908938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229588351
19393	NC_012660	CGC	3	9	908941	908949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588351
19394	NC_012660	GTG	2	6	908981	908986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588351
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19398	NC_012660	GGC	2	6	909262	909267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588351
19399	NC_012660	GCA	2	6	909277	909282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588351
19400	NC_012660	TCGG	2	8	909329	909336	0 %	25 %	50 %	25 %	229588351
19401	NC_012660	GCC	2	6	909392	909397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588351
19402	NC_012660	CAA	2	6	909487	909492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229588351
19403	NC_012660	CAGC	2	8	909522	909529	25 %	0 %	25 %	50 %	229588351
19404	NC_012660	AAG	2	6	909542	909547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229588351
19405	NC_012660	A	6	6	909549	909554	100 %	0 %	0 %	0 %	229588351
19406	NC_012660	CTG	2	6	909572	909577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588351
19407	NC_012660	GGCG	2	8	909610	909617	0 %	0 %	75 %	25 %	229588351
19408	NC_012660	GTT	2	6	909619	909624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229588351
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19410	NC_012660	CGG	2	6	909793	909798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588351
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19415	NC_012660	GC	3	6	909998	910003	0 %	0 %	50 %	50 %	229588351
19416	NC_012660	CAC	2	6	910042	910047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588351
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19419	NC_012660	CGG	2	6	910099	910104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588351
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19425	NC_012660	GC	3	6	910232	910237	0 %	0 %	50 %	50 %	229588351
19426	NC_012660	GGC	2	6	910273	910278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588351
19427	NC_012660	GAT	2	6	910279	910284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229588351
19428	NC_012660	CGC	2	6	910324	910329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588351
19429	NC_012660	CGG	2	6	910366	910371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588351
19430	NC_012660	CTG	2	6	910481	910486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588351
19431	NC_012660	GGTGT	2	10	910514	910523	0 %	40 %	60 %	0 %	229588351
19432	NC_012660	AGG	2	6	910599	910604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19433	NC_012660	TGT	2	6	910830	910835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229588352
19434	NC_012660	GCCCG	2	10	910953	910962	0 %	0 %	40 %	60 %	229588352
19435	NC_012660	AGTGG	2	10	910969	910978	20 %	20 %	60 %	0 %	229588352
19436	NC_012660	CCG	2	6	911076	911081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588352
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19439	NC_012660	TG	3	6	911194	911199	0 %	50 %	50 %	0 %	229588352
19440	NC_012660	GCG	2	6	911202	911207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588352
19441	NC_012660	GGC	2	6	911246	911251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588352
19442	NC_012660	TGCGCC	2	12	911271	911282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229588352
19443	NC_012660	CTT	2	6	911290	911295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229588352
19444	NC_012660	GCG	2	6	911304	911309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588352
19445	NC_012660	ACC	2	6	911348	911353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588352
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19448	NC_012660	GAC	2	6	911504	911509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588352
19449	NC_012660	GTG	2	6	911516	911521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588352
19450	NC_012660	AAC	2	6	911522	911527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229588352
19451	NC_012660	CAAG	2	8	911535	911542	50 %	0 %	25 %	25 %	229588352
19452	NC_012660	TGG	2	6	911583	911588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588352
19453	NC_012660	GC	3	6	911594	911599	0 %	0 %	50 %	50 %	229588352
19454	NC_012660	CTGG	2	8	911605	911612	0 %	25 %	50 %	25 %	229588352
19455	NC_012660	GCGG	3	12	911645	911656	0 %	0 %	75 %	25 %	229588352
19456	NC_012660	GCT	2	6	911683	911688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588352
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19461	NC_012660	GCG	2	6	912053	912058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588352
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19464	NC_012660	T	6	6	912212	912217	0 %	100 %	0 %	0 %	229588352
19465	NC_012660	CGG	2	6	912243	912248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588352
19466	NC_012660	CCA	2	6	912455	912460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588353
19467	NC_012660	GCC	2	6	912478	912483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588353
19468	NC_012660	CA	3	6	912502	912507	50 %	0 %	0 %	50 %	229588353
19469	NC_012660	CGC	2	6	912513	912518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588353
19470	NC_012660	GCCA	2	8	912526	912533	25 %	0 %	25 %	50 %	229588353
19471	NC_012660	GCA	2	6	912539	912544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588353
19472	NC_012660	CAC	2	6	912629	912634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588353
19473	NC_012660	GCCA	2	8	912637	912644	25 %	0 %	25 %	50 %	229588353
19474	NC_012660	GCT	2	6	912713	912718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588353
19475	NC_012660	GC	3	6	912732	912737	0 %	0 %	50 %	50 %	229588353
19476	NC_012660	CAG	2	6	912780	912785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588353
19477	NC_012660	GGCGCA	2	12	912830	912841	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	229588353
19478	NC_012660	GGC	2	6	912861	912866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588353
19479	NC_012660	AGCC	2	8	912877	912884	25 %	0 %	25 %	50 %	229588353
19480	NC_012660	CCAGGC	2	12	912890	912901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229588353
19481	NC_012660	CCA	2	6	913028	913033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588353
19482	NC_012660	CCAGGC	2	12	913124	913135	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229588353
19483	NC_012660	GCA	2	6	913175	913180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588353
19484	NC_012660	GT	3	6	913207	913212	0 %	50 %	50 %	0 %	229588353
19485	NC_012660	GCT	2	6	913254	913259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588353
19486	NC_012660	GTT	3	9	913355	913363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229588353
19487	NC_012660	GCA	2	6	913370	913375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588353
19488	NC_012660	GGT	2	6	913380	913385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588353
19489	NC_012660	GCC	2	6	913425	913430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588353
19490	NC_012660	AGT	2	6	913511	913516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229588353
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19492	NC_012660	GTC	2	6	913638	913643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588353
19493	NC_012660	GCC	2	6	913687	913692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588353
19494	NC_012660	CTGG	2	8	913740	913747	0 %	25 %	50 %	25 %	229588353
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