MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
135001	NC_012660	AAC	2	6	6405654	6405659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135002	NC_012660	CAT	2	6	6405670	6405675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593219
135003	NC_012660	ATC	2	6	6405729	6405734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593219
135004	NC_012660	TGGTG	2	10	6405775	6405784	0 %	40 %	60 %	0 %	229593219
135005	NC_012660	CCTG	2	8	6405841	6405848	0 %	25 %	25 %	50 %	229593219
135006	NC_012660	GGCCTG	2	12	6405896	6405907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	229593219
135007	NC_012660	CTG	2	6	6405992	6405997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593219
135008	NC_012660	TTC	2	6	6406028	6406033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593219
135009	NC_012660	CG	3	6	6406041	6406046	0 %	0 %	50 %	50 %	229593219
135010	NC_012660	GAC	2	6	6406076	6406081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593219
135011	NC_012660	GCC	2	6	6406149	6406154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593219
135012	NC_012660	CTCG	2	8	6406164	6406171	0 %	25 %	25 %	50 %	229593219
135013	NC_012660	CGA	2	6	6406216	6406221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593219
135014	NC_012660	CGA	2	6	6406225	6406230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593219
135015	NC_012660	CAC	2	6	6406337	6406342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593219
135016	NC_012660	ACC	2	6	6406427	6406432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593219
135017	NC_012660	CAGGC	2	10	6406452	6406461	20 %	0 %	40 %	40 %	229593219
135018	NC_012660	CGC	2	6	6406543	6406548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593219
135019	NC_012660	CGG	2	6	6406564	6406569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593219
135020	NC_012660	ACCG	2	8	6406705	6406712	25 %	0 %	25 %	50 %	229593219
135021	NC_012660	GGCG	2	8	6406747	6406754	0 %	0 %	75 %	25 %	229593219
135022	NC_012660	CTG	2	6	6406772	6406777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593219
135023	NC_012660	CAC	2	6	6406802	6406807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593219
135024	NC_012660	CAA	2	6	6406816	6406821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593219
135025	NC_012660	GAAC	2	8	6406864	6406871	50 %	0 %	25 %	25 %	229593219
135026	NC_012660	AAC	2	6	6406883	6406888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593219
135027	NC_012660	GAC	2	6	6406913	6406918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593219
135028	NC_012660	A	6	6	6407066	6407071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135029	NC_012660	CGC	2	6	6407072	6407077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135030	NC_012660	T	7	7	6407097	6407103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135031	NC_012660	CTG	2	6	6407255	6407260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135032	NC_012660	GTT	2	6	6407285	6407290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135033	NC_012660	GAA	2	6	6407324	6407329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135034	NC_012660	CCTG	2	8	6407341	6407348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135035	NC_012660	CTT	2	6	6407350	6407355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135036	NC_012660	TGG	2	6	6407374	6407379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135037	NC_012660	GAA	2	6	6407405	6407410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135038	NC_012660	CAG	2	6	6407477	6407482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135039	NC_012660	GCTG	2	8	6407497	6407504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135040	NC_012660	CCG	2	6	6407563	6407568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135041	NC_012660	CGG	2	6	6407634	6407639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135042	NC_012660	GCT	2	6	6407658	6407663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135043	NC_012660	CGC	2	6	6407704	6407709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135044	NC_012660	TGAT	2	8	6407718	6407725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135045	NC_012660	GGC	3	9	6407800	6407808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135046	NC_012660	CTG	2	6	6407814	6407819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135047	NC_012660	CCA	2	6	6407833	6407838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135048	NC_012660	CTG	2	6	6407873	6407878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135049	NC_012660	GA	3	6	6407893	6407898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135050	NC_012660	CG	3	6	6407904	6407909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135051	NC_012660	CTC	2	6	6408077	6408082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135052	NC_012660	AG	3	6	6408114	6408119	50 %	0 %	50 %	0 %	229593220
135053	NC_012660	T	6	6	6408128	6408133	0 %	100 %	0 %	0 %	229593220
135054	NC_012660	TCG	2	6	6408197	6408202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593220
135055	NC_012660	GCG	2	6	6408268	6408273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593220
135056	NC_012660	ATC	2	6	6408328	6408333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593220
135057	NC_012660	GCA	2	6	6408347	6408352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593220
135058	NC_012660	CCT	2	6	6408398	6408403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135059	NC_012660	ACA	2	6	6408485	6408490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135060	NC_012660	ACC	2	6	6408539	6408544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593221
135061	NC_012660	CGC	2	6	6408550	6408555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593221
135062	NC_012660	CGC	2	6	6408607	6408612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593221
135063	NC_012660	GCC	2	6	6408626	6408631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593221
135064	NC_012660	CGT	2	6	6408687	6408692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593221
135065	NC_012660	CAG	2	6	6408741	6408746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593221
135066	NC_012660	GCA	2	6	6408755	6408760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593221
135067	NC_012660	CG	3	6	6408764	6408769	0 %	0 %	50 %	50 %	229593221
135068	NC_012660	ACTC	2	8	6408795	6408802	25 %	25 %	0 %	50 %	229593221
135069	NC_012660	TCG	2	6	6408828	6408833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593221
135070	NC_012660	ACG	2	6	6408855	6408860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593221
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135072	NC_012660	GC	3	6	6409052	6409057	0 %	0 %	50 %	50 %	229593221
135073	NC_012660	CACGC	2	10	6409081	6409090	20 %	0 %	20 %	60 %	229593221
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135077	NC_012660	GGCC	2	8	6409181	6409188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135078	NC_012660	GGC	2	6	6409264	6409269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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135083	NC_012660	CGG	2	6	6409576	6409581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593223
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135089	NC_012660	AGC	3	9	6409856	6409864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593223
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135100	NC_012660	GGCC	2	8	6410145	6410152	0 %	0 %	50 %	50 %	229593223
135101	NC_012660	GCA	2	6	6410160	6410165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593223
135102	NC_012660	CGAC	2	8	6410189	6410196	25 %	0 %	25 %	50 %	229593223
135103	NC_012660	CG	4	8	6410250	6410257	0 %	0 %	50 %	50 %	229593223
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135225	NC_012660	AGT	2	6	6416166	6416171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593229
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135230	NC_012660	CAG	2	6	6416403	6416408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593229
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135232	NC_012660	TGCT	2	8	6416491	6416498	0 %	50 %	25 %	25 %	229593229
135233	NC_012660	AGCCAA	2	12	6416521	6416532	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229593229
135234	NC_012660	CTT	2	6	6416539	6416544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593229
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135236	NC_012660	TGAC	2	8	6416637	6416644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135237	NC_012660	TG	3	6	6416661	6416666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135238	NC_012660	CTA	2	6	6416668	6416673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135239	NC_012660	CAT	2	6	6416914	6416919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135240	NC_012660	TCC	2	6	6416933	6416938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135241	NC_012660	TTCT	2	8	6416970	6416977	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135242	NC_012660	GCC	2	6	6416990	6416995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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135244	NC_012660	TC	3	6	6417154	6417159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135245	NC_012660	CTG	2	6	6417349	6417354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135246	NC_012660	GAGC	2	8	6417402	6417409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135247	NC_012660	CAGG	2	8	6417687	6417694	25 %	0 %	50 %	25 %	229593230
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135264	NC_012660	CAG	2	6	6418278	6418283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593230
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135272	NC_012660	TAA	2	6	6418772	6418777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135295	NC_012660	CACAA	2	10	6420089	6420098	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135296	NC_012660	AGAA	2	8	6420204	6420211	75 %	0 %	25 %	0 %	229593232
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135334	NC_012660	CTG	2	6	6421289	6421294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593232
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135337	NC_012660	GC	3	6	6421400	6421405	0 %	0 %	50 %	50 %	229593232
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135339	NC_012660	CGA	2	6	6421486	6421491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593232
135340	NC_012660	CGTG	2	8	6421538	6421545	0 %	25 %	50 %	25 %	229593232
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135342	NC_012660	GGGA	2	8	6421619	6421626	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135343	NC_012660	CCGGT	2	10	6421644	6421653	0 %	20 %	40 %	40 %	229593233
135344	NC_012660	GCA	2	6	6421793	6421798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593233
135345	NC_012660	TCT	2	6	6421937	6421942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593233
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135347	NC_012660	CGG	2	6	6422092	6422097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593233
135348	NC_012660	CGATT	2	10	6422159	6422168	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135349	NC_012660	ACC	2	6	6422266	6422271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593234
135350	NC_012660	TCG	2	6	6422336	6422341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593234
135351	NC_012660	TGT	2	6	6422360	6422365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229593234
135352	NC_012660	CGC	2	6	6422402	6422407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593234
135353	NC_012660	AACATC	2	12	6422443	6422454	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	229593234
135354	NC_012660	GATG	2	8	6422457	6422464	25 %	25 %	50 %	0 %	229593234
135355	NC_012660	GCTC	2	8	6422525	6422532	0 %	25 %	25 %	50 %	229593234
135356	NC_012660	CGG	2	6	6422552	6422557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593234
135357	NC_012660	TTG	2	6	6422676	6422681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229593235
135358	NC_012660	CAGC	2	8	6422782	6422789	25 %	0 %	25 %	50 %	229593235
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135362	NC_012660	CG	3	6	6423085	6423090	0 %	0 %	50 %	50 %	229593235
135363	NC_012660	TCG	2	6	6423231	6423236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593235
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135366	NC_012660	GGT	2	6	6423376	6423381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593235
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135374	NC_012660	GACCT	2	10	6423791	6423800	20 %	20 %	20 %	40 %	229593235
135375	NC_012660	CTG	2	6	6423821	6423826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593235
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135377	NC_012660	CTG	2	6	6423876	6423881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593235
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135382	NC_012660	ACC	2	6	6424280	6424285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593235
135383	NC_012660	TTTG	2	8	6424333	6424340	0 %	75 %	25 %	0 %	229593235
135384	NC_012660	ACA	2	6	6424369	6424374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135385	NC_012660	CGT	2	6	6424393	6424398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135386	NC_012660	CTT	2	6	6424450	6424455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593236
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135388	NC_012660	GTC	2	6	6424498	6424503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593236
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135400	NC_012660	GCCG	2	8	6424926	6424933	0 %	0 %	50 %	50 %	229593236
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135417	NC_012660	CGG	2	6	6425562	6425567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593237
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135420	NC_012660	GTG	2	6	6425660	6425665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593237
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135423	NC_012660	ACCC	2	8	6425855	6425862	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135424	NC_012660	CAT	2	6	6425872	6425877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593238
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135431	NC_012660	A	6	6	6426203	6426208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135432	NC_012660	GCC	2	6	6426210	6426215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135433	NC_012660	T	7	7	6426229	6426235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135434	NC_012660	CGC	2	6	6426257	6426262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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135438	NC_012660	CTG	2	6	6426400	6426405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593239
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135450	NC_012660	T	6	6	6427078	6427083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135451	NC_012660	ATTC	2	8	6427099	6427106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135452	NC_012660	TCG	2	6	6427195	6427200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135453	NC_012660	TGA	2	6	6427244	6427249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593240
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135455	NC_012660	CGG	2	6	6427261	6427266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593240
135456	NC_012660	TCA	2	6	6427435	6427440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593240
135457	NC_012660	ATC	2	6	6427581	6427586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593240
135458	NC_012660	GGCC	2	8	6427598	6427605	0 %	0 %	50 %	50 %	229593240
135459	NC_012660	CAA	2	6	6427640	6427645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593240
135460	NC_012660	TCG	2	6	6427660	6427665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593240
135461	NC_012660	CGCAG	2	10	6427670	6427679	20 %	0 %	40 %	40 %	229593240
135462	NC_012660	CAA	2	6	6427751	6427756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593240
135463	NC_012660	AAC	2	6	6427794	6427799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593240
135464	NC_012660	TGGACG	2	12	6427867	6427878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229593240
135465	NC_012660	GGC	2	6	6427884	6427889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593240
135466	NC_012660	CGC	3	9	6427910	6427918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593240
135467	NC_012660	GC	3	6	6427977	6427982	0 %	0 %	50 %	50 %	229593240
135468	NC_012660	GCC	2	6	6428036	6428041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593240
135469	NC_012660	ACG	2	6	6428098	6428103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593240
135470	NC_012660	CCG	2	6	6428172	6428177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593240
135471	NC_012660	CTG	2	6	6428184	6428189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593240
135472	NC_012660	AAGG	2	8	6428214	6428221	50 %	0 %	50 %	0 %	229593240
135473	NC_012660	GGC	2	6	6428396	6428401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593241
135474	NC_012660	CAG	2	6	6428410	6428415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593241
135475	NC_012660	CAG	2	6	6428420	6428425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593241
135476	NC_012660	GCTTGA	2	12	6428452	6428463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229593241
135477	NC_012660	AGC	2	6	6428493	6428498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593241
135478	NC_012660	TTC	2	6	6428516	6428521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593241
135479	NC_012660	GGC	2	6	6428567	6428572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593241
135480	NC_012660	CAA	2	6	6428638	6428643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593241
135481	NC_012660	GC	3	6	6428714	6428719	0 %	0 %	50 %	50 %	229593241
135482	NC_012660	AAG	2	6	6428781	6428786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135483	NC_012660	GA	3	6	6428961	6428966	50 %	0 %	50 %	0 %	229593242
135484	NC_012660	ACC	2	6	6429011	6429016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593242
135485	NC_012660	TTC	2	6	6429040	6429045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593242
135486	NC_012660	GCT	2	6	6429080	6429085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593242
135487	NC_012660	CAGCG	2	10	6429097	6429106	20 %	0 %	40 %	40 %	229593242
135488	NC_012660	AATGA	2	10	6429112	6429121	60 %	20 %	20 %	0 %	229593242
135489	NC_012660	TGG	2	6	6429182	6429187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593242
135490	NC_012660	CCA	2	6	6429270	6429275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593242
135491	NC_012660	A	6	6	6429284	6429289	100 %	0 %	0 %	0 %	229593242
135492	NC_012660	GC	3	6	6429349	6429354	0 %	0 %	50 %	50 %	229593242
135493	NC_012660	TCT	2	6	6429441	6429446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593242
135494	NC_012660	GCAT	2	8	6429527	6429534	25 %	25 %	25 %	25 %	229593242
135495	NC_012660	GGC	2	6	6429559	6429564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593242
135496	NC_012660	ACC	2	6	6429569	6429574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593242
135497	NC_012660	GGC	2	6	6429583	6429588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593242
135498	NC_012660	CGGTA	2	10	6429591	6429600	20 %	20 %	40 %	20 %	229593242
135499	NC_012660	GTC	2	6	6429610	6429615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593242
135500	NC_012660	CAC	2	6	6429616	6429621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593242

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