MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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133002	NC_012660	TTC	2	6	6312360	6312365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593129
133003	NC_012660	CACCCG	2	12	6312374	6312385	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	229593129
133004	NC_012660	CAC	2	6	6312386	6312391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593129
133005	NC_012660	GGC	2	6	6312401	6312406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593129
133006	NC_012660	TCG	2	6	6312450	6312455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593129
133007	NC_012660	GCC	2	6	6312507	6312512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593129
133008	NC_012660	ATC	2	6	6312588	6312593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593129
133009	NC_012660	CGG	2	6	6312596	6312601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593129
133010	NC_012660	TCG	2	6	6312694	6312699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593129
133011	NC_012660	CTG	2	6	6312792	6312797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593129
133012	NC_012660	GGATGT	2	12	6312857	6312868	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229593129
133013	NC_012660	TGC	2	6	6312877	6312882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593129
133014	NC_012660	CTG	2	6	6312912	6312917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593129
133015	NC_012660	CGTGG	2	10	6313017	6313026	0 %	20 %	60 %	20 %	229593129
133016	NC_012660	CGG	2	6	6313036	6313041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593129
133017	NC_012660	ATCAC	2	10	6313221	6313230	40 %	20 %	0 %	40 %	229593130
133018	NC_012660	ATC	2	6	6313256	6313261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593130
133019	NC_012660	GCGCC	2	10	6313269	6313278	0 %	0 %	40 %	60 %	229593130
133020	NC_012660	TGG	2	6	6313320	6313325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593130
133021	NC_012660	GCCTG	2	10	6313330	6313339	0 %	20 %	40 %	40 %	229593130
133022	NC_012660	CAT	2	6	6313390	6313395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593130
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133024	NC_012660	TGC	2	6	6313439	6313444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593130
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133026	NC_012660	CGG	2	6	6313476	6313481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593130
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133031	NC_012660	TGGCCC	2	12	6313806	6313817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229593130
133032	NC_012660	CTG	3	9	6313823	6313831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593130
133033	NC_012660	GTGC	2	8	6313847	6313854	0 %	25 %	50 %	25 %	229593130
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133035	NC_012660	CCG	2	6	6314006	6314011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593130
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133040	NC_012660	GGAT	2	8	6314191	6314198	25 %	25 %	50 %	0 %	229593130
133041	NC_012660	CTG	2	6	6314216	6314221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593130
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133044	NC_012660	TGG	2	6	6314409	6314414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593130
133045	NC_012660	CCA	2	6	6314509	6314514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133046	NC_012660	ACA	2	6	6314591	6314596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593131
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133049	NC_012660	CAG	2	6	6314622	6314627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593131
133050	NC_012660	CGG	2	6	6314729	6314734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593131
133051	NC_012660	CAGC	2	8	6314787	6314794	25 %	0 %	25 %	50 %	229593131
133052	NC_012660	CAG	2	6	6314889	6314894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593131
133053	NC_012660	TGC	2	6	6314923	6314928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593131
133054	NC_012660	CTG	2	6	6314937	6314942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593131
133055	NC_012660	GATA	2	8	6314974	6314981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133056	NC_012660	T	6	6	6314984	6314989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133057	NC_012660	CTTT	2	8	6314992	6314999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133058	NC_012660	T	6	6	6315005	6315010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133059	NC_012660	CCCTG	2	10	6315043	6315052	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133060	NC_012660	GCG	2	6	6315088	6315093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133061	NC_012660	TCG	2	6	6315096	6315101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133062	NC_012660	GAC	2	6	6315150	6315155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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133064	NC_012660	GCC	2	6	6315256	6315261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593132
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133079	NC_012660	TCG	2	6	6315961	6315966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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133087	NC_012660	ACC	2	6	6316277	6316282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593133
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133096	NC_012660	GC	3	6	6316828	6316833	0 %	0 %	50 %	50 %	229593133
133097	NC_012660	GGCC	2	8	6316998	6317005	0 %	0 %	50 %	50 %	229593133
133098	NC_012660	GCC	2	6	6317042	6317047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593133
133099	NC_012660	TTTCCA	2	12	6317073	6317084	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133100	NC_012660	CGA	2	6	6317129	6317134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593134
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133103	NC_012660	AGC	2	6	6317203	6317208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593134
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133105	NC_012660	GCC	2	6	6317266	6317271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593134
133106	NC_012660	CG	3	6	6317384	6317389	0 %	0 %	50 %	50 %	229593134
133107	NC_012660	AAC	2	6	6317456	6317461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593134
133108	NC_012660	CGCC	2	8	6317537	6317544	0 %	0 %	25 %	75 %	229593134
133109	NC_012660	CGCGC	2	10	6317632	6317641	0 %	0 %	40 %	60 %	229593134
133110	NC_012660	AC	3	6	6317699	6317704	50 %	0 %	0 %	50 %	229593134
133111	NC_012660	GCCA	2	8	6317801	6317808	25 %	0 %	25 %	50 %	229593134
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133115	NC_012660	CGC	2	6	6318132	6318137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593135
133116	NC_012660	CTGG	2	8	6318165	6318172	0 %	25 %	50 %	25 %	229593135
133117	NC_012660	CCG	2	6	6318248	6318253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593135
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133120	NC_012660	CCG	2	6	6318296	6318301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593135
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133124	NC_012660	CCG	3	9	6318404	6318412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593135
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133142	NC_012660	ATC	2	6	6319027	6319032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593136
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133144	NC_012660	GCT	2	6	6319128	6319133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593136
133145	NC_012660	GGC	2	6	6319144	6319149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593136
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133150	NC_012660	C	6	6	6319414	6319419	0 %	0 %	0 %	100 %	229593137
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133152	NC_012660	CTGC	2	8	6319492	6319499	0 %	25 %	25 %	50 %	229593137
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133177	NC_012660	GATCCC	2	12	6320478	6320489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	229593137
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133183	NC_012660	CAAG	2	8	6320650	6320657	50 %	0 %	25 %	25 %	229593138
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133202	NC_012660	GC	3	6	6321784	6321789	0 %	0 %	50 %	50 %	229593140
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133211	NC_012660	AACGT	2	10	6322112	6322121	40 %	20 %	20 %	20 %	229593140
133212	NC_012660	TGC	2	6	6322187	6322192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593140
133213	NC_012660	GCCTGA	2	12	6322199	6322210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229593140
133214	NC_012660	GC	3	6	6322252	6322257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133215	NC_012660	GGC	2	6	6322268	6322273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133216	NC_012660	TGC	2	6	6322282	6322287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593141
133217	NC_012660	GTG	2	6	6322316	6322321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593141
133218	NC_012660	TGC	2	6	6322372	6322377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593141
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133220	NC_012660	T	6	6	6322461	6322466	0 %	100 %	0 %	0 %	229593141
133221	NC_012660	GC	3	6	6322530	6322535	0 %	0 %	50 %	50 %	229593141
133222	NC_012660	CAG	2	6	6322659	6322664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593141
133223	NC_012660	GCC	2	6	6322895	6322900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593141
133224	NC_012660	GGA	2	6	6322910	6322915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229593141
133225	NC_012660	GCC	2	6	6323008	6323013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593141
133226	NC_012660	ACT	2	6	6323032	6323037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593141
133227	NC_012660	GTAC	2	8	6323109	6323116	25 %	25 %	25 %	25 %	229593141
133228	NC_012660	TGA	2	6	6323215	6323220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593141
133229	NC_012660	CGAAG	2	10	6323246	6323255	40 %	0 %	40 %	20 %	229593141
133230	NC_012660	GCC	2	6	6323302	6323307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593141
133231	NC_012660	GGC	2	6	6323354	6323359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593141
133232	NC_012660	GACC	2	8	6323360	6323367	25 %	0 %	25 %	50 %	229593141
133233	NC_012660	TCG	2	6	6323508	6323513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593142
133234	NC_012660	CTGC	2	8	6323515	6323522	0 %	25 %	25 %	50 %	229593142
133235	NC_012660	GC	3	6	6323561	6323566	0 %	0 %	50 %	50 %	229593142
133236	NC_012660	GCA	2	6	6323571	6323576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593142
133237	NC_012660	GCG	2	6	6323628	6323633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593142
133238	NC_012660	ACGCC	2	10	6323646	6323655	20 %	0 %	20 %	60 %	229593142
133239	NC_012660	TGGTAC	2	12	6323715	6323726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229593142
133240	NC_012660	CCG	2	6	6323746	6323751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593142
133241	NC_012660	TGAC	2	8	6323830	6323837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133242	NC_012660	TCA	2	6	6324041	6324046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593143
133243	NC_012660	GCC	2	6	6324099	6324104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593143
133244	NC_012660	TGC	2	6	6324116	6324121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593143
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133247	NC_012660	TGG	2	6	6324163	6324168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593143
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133252	NC_012660	CGGCG	2	10	6324360	6324369	0 %	0 %	60 %	40 %	229593143
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133283	NC_012660	CAG	2	6	6325615	6325620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593145
133284	NC_012660	GCC	2	6	6325688	6325693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133285	NC_012660	TGA	2	6	6325732	6325737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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133287	NC_012660	CCAGC	2	10	6325794	6325803	20 %	0 %	20 %	60 %	229593146
133288	NC_012660	TGA	2	6	6325829	6325834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593146
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133315	NC_012660	CGCGT	2	10	6327044	6327053	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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133334	NC_012660	ACT	2	6	6328038	6328043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593149
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133400	NC_012660	TAAA	2	8	6331250	6331257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133401	NC_012660	CAA	2	6	6331263	6331268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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133405	NC_012660	GAAT	2	8	6331474	6331481	50 %	25 %	25 %	0 %	229593152
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133451	NC_012660	GCCGAA	2	12	6333601	6333612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593153
133452	NC_012660	GGCCC	2	10	6333649	6333658	0 %	0 %	40 %	60 %	229593153
133453	NC_012660	ACCG	2	8	6333675	6333682	25 %	0 %	25 %	50 %	229593153
133454	NC_012660	CTG	2	6	6333733	6333738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593153
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133459	NC_012660	GCG	2	6	6333947	6333952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593153
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133482	NC_012660	GCG	2	6	6335027	6335032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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133489	NC_012660	GC	3	6	6335432	6335437	0 %	0 %	50 %	50 %	229593155
133490	NC_012660	GCGA	2	8	6335453	6335460	25 %	0 %	50 %	25 %	229593155
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