MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131501	NC_012660	CAG	2	6	6239802	6239807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593064
131502	NC_012660	GGT	2	6	6239826	6239831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593064
131503	NC_012660	CTG	2	6	6239875	6239880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593064
131504	NC_012660	CCG	2	6	6239891	6239896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593064
131505	NC_012660	CAT	2	6	6239961	6239966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593064
131506	NC_012660	GGC	3	9	6239976	6239984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593064
131507	NC_012660	TTTTG	2	10	6240114	6240123	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131508	NC_012660	CCG	2	6	6240177	6240182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593065
131509	NC_012660	ACA	2	6	6240441	6240446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593065
131510	NC_012660	GCG	3	9	6240465	6240473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593065
131511	NC_012660	TCG	2	6	6240522	6240527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131512	NC_012660	CAG	2	6	6240545	6240550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131513	NC_012660	CGA	2	6	6240601	6240606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131514	NC_012660	ACG	2	6	6240636	6240641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131515	NC_012660	CAT	2	6	6240652	6240657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593065
131516	NC_012660	CGC	2	6	6240669	6240674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593065
131517	NC_012660	GCC	2	6	6240675	6240680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593065
131518	NC_012660	CTG	2	6	6240686	6240691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131519	NC_012660	GC	4	8	6240742	6240749	0 %	0 %	50 %	50 %	229593065
131520	NC_012660	GCA	2	6	6240751	6240756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131521	NC_012660	AGC	2	6	6240795	6240800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131522	NC_012660	CCT	2	6	6240870	6240875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229593065
131523	NC_012660	AGC	2	6	6240897	6240902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131524	NC_012660	CCG	2	6	6240945	6240950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593065
131525	NC_012660	GCA	2	6	6241014	6241019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131526	NC_012660	TGG	2	6	6241029	6241034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593065
131527	NC_012660	CGC	2	6	6241045	6241050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593065
131528	NC_012660	ATCCAC	2	12	6241115	6241126	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	229593065
131529	NC_012660	CGC	2	6	6241230	6241235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593065
131530	NC_012660	GCT	2	6	6241282	6241287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131531	NC_012660	ACG	2	6	6241476	6241481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593065
131532	NC_012660	GGCT	2	8	6241557	6241564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131533	NC_012660	AGC	2	6	6241603	6241608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131534	NC_012660	ACA	2	6	6241661	6241666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131535	NC_012660	GGCGCC	2	12	6241748	6241759	0 %	0 %	50 %	50 %	229593066
131536	NC_012660	TG	3	6	6241770	6241775	0 %	50 %	50 %	0 %	229593066
131537	NC_012660	CCG	3	9	6241782	6241790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593066
131538	NC_012660	CGG	2	6	6241855	6241860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593066
131539	NC_012660	TGG	2	6	6241974	6241979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593066
131540	NC_012660	GAA	2	6	6242005	6242010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593066
131541	NC_012660	TGC	2	6	6242058	6242063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593066
131542	NC_012660	ACC	2	6	6242153	6242158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593066
131543	NC_012660	CTGCG	2	10	6242168	6242177	0 %	20 %	40 %	40 %	229593066
131544	NC_012660	GGC	2	6	6242198	6242203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593066
131545	NC_012660	GCG	2	6	6242331	6242336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593066
131546	NC_012660	CTG	2	6	6242486	6242491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593066
131547	NC_012660	GCAACA	2	12	6242518	6242529	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229593066
131548	NC_012660	CTG	2	6	6242561	6242566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593066
131549	NC_012660	CTG	2	6	6242597	6242602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593066
131550	NC_012660	CGG	2	6	6242697	6242702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593066
131551	NC_012660	CCG	2	6	6242721	6242726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593066
131552	NC_012660	GTC	2	6	6242761	6242766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593066
131553	NC_012660	GTGGGC	2	12	6242857	6242868	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	229593066
131554	NC_012660	CTGA	2	8	6242896	6242903	25 %	25 %	25 %	25 %	229593066
131555	NC_012660	ACTG	2	8	6242970	6242977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131556	NC_012660	AC	3	6	6242978	6242983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131557	NC_012660	GT	3	6	6243023	6243028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131558	NC_012660	GCG	2	6	6243155	6243160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593067
131559	NC_012660	GCA	2	6	6243217	6243222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131560	NC_012660	GCT	2	6	6243254	6243259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131561	NC_012660	GT	3	6	6243351	6243356	0 %	50 %	50 %	0 %	229593067
131562	NC_012660	CGC	2	6	6243365	6243370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593067
131563	NC_012660	GCT	2	6	6243383	6243388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131564	NC_012660	CCCTGG	2	12	6243418	6243429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229593067
131565	NC_012660	GCT	3	9	6243569	6243577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593067
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131568	NC_012660	CTCAAG	2	12	6243690	6243701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229593067
131569	NC_012660	TCG	2	6	6243702	6243707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131570	NC_012660	GCG	2	6	6243743	6243748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593067
131571	NC_012660	GCA	2	6	6243761	6243766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131572	NC_012660	GTG	2	6	6243777	6243782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593067
131573	NC_012660	GCG	2	6	6243783	6243788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593067
131574	NC_012660	ATC	2	6	6243807	6243812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593067
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131576	NC_012660	CAG	2	6	6243987	6243992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593067
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131580	NC_012660	CTG	2	6	6244239	6244244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131581	NC_012660	GCT	2	6	6244310	6244315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131582	NC_012660	TGCGC	2	10	6244325	6244334	0 %	20 %	40 %	40 %	229593067
131583	NC_012660	TGC	2	6	6244366	6244371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131584	NC_012660	ATC	2	6	6244401	6244406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593067
131585	NC_012660	ATC	2	6	6244470	6244475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593067
131586	NC_012660	CGC	2	6	6244556	6244561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593067
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131588	NC_012660	CCG	2	6	6244609	6244614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593067
131589	NC_012660	GTTCCT	2	12	6244727	6244738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	229593067
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131592	NC_012660	CGA	2	6	6244844	6244849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593067
131593	NC_012660	CA	3	6	6244879	6244884	50 %	0 %	0 %	50 %	229593067
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131597	NC_012660	CA	3	6	6244986	6244991	50 %	0 %	0 %	50 %	229593067
131598	NC_012660	GCCG	2	8	6245039	6245046	0 %	0 %	50 %	50 %	229593067
131599	NC_012660	GGC	2	6	6245087	6245092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593067
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131601	NC_012660	GGC	2	6	6245168	6245173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593067
131602	NC_012660	TGA	2	6	6245201	6245206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593067
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131604	NC_012660	TCA	2	6	6245432	6245437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593068
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131606	NC_012660	TC	3	6	6245474	6245479	0 %	50 %	0 %	50 %	229593068
131607	NC_012660	CGA	2	6	6245492	6245497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593068
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131610	NC_012660	CGC	2	6	6245730	6245735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593068
131611	NC_012660	CAC	2	6	6245754	6245759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593068
131612	NC_012660	TCG	2	6	6245809	6245814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593068
131613	NC_012660	TGA	2	6	6245822	6245827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593068
131614	NC_012660	TG	3	6	6245872	6245877	0 %	50 %	50 %	0 %	229593068
131615	NC_012660	CGCCCA	2	12	6245924	6245935	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	229593068
131616	NC_012660	AGCC	2	8	6246015	6246022	25 %	0 %	25 %	50 %	229593068
131617	NC_012660	CAGGCG	2	12	6246072	6246083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	229593068
131618	NC_012660	CAA	2	6	6246108	6246113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593068
131619	NC_012660	GA	3	6	6246137	6246142	50 %	0 %	50 %	0 %	229593068
131620	NC_012660	CAGG	2	8	6246168	6246175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131621	NC_012660	AAG	2	6	6246231	6246236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131622	NC_012660	ATG	2	6	6246256	6246261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131623	NC_012660	CCTGCG	2	12	6246416	6246427	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229593069
131624	NC_012660	CAC	2	6	6246501	6246506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593069
131625	NC_012660	GAT	2	6	6246522	6246527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593069
131626	NC_012660	CTG	2	6	6246549	6246554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593069
131627	NC_012660	GCG	2	6	6246571	6246576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593069
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131629	NC_012660	GAT	2	6	6246638	6246643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593069
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131631	NC_012660	TAC	2	6	6246723	6246728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593069
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131636	NC_012660	CCG	2	6	6246901	6246906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131637	NC_012660	CCG	2	6	6246962	6246967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593070
131638	NC_012660	CA	3	6	6247039	6247044	50 %	0 %	0 %	50 %	229593070
131639	NC_012660	GCT	2	6	6247127	6247132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593070
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131642	NC_012660	GGTC	2	8	6247208	6247215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131643	NC_012660	CAT	2	6	6247299	6247304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593071
131644	NC_012660	TTG	2	6	6247330	6247335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229593071
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131649	NC_012660	ATC	2	6	6247663	6247668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593071
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131719	NC_012660	T	6	6	6251487	6251492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131721	NC_012660	A	6	6	6251603	6251608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131722	NC_012660	CTT	2	6	6251626	6251631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131723	NC_012660	AC	3	6	6251764	6251769	50 %	0 %	0 %	50 %	229593075
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131732	NC_012660	GGTG	2	8	6252027	6252034	0 %	25 %	75 %	0 %	229593075
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131756	NC_012660	GCT	2	6	6252767	6252772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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131758	NC_012660	TGA	2	6	6252828	6252833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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131760	NC_012660	AC	3	6	6252924	6252929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131761	NC_012660	CCCG	2	8	6253009	6253016	0 %	0 %	25 %	75 %	229593076
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131840	NC_012660	CGG	2	6	6256878	6256883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593080
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