MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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131002	NC_012660	CCA	2	6	6216202	6216207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593045
131003	NC_012660	TGC	2	6	6216220	6216225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593045
131004	NC_012660	CGG	2	6	6216240	6216245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593045
131005	NC_012660	ACC	2	6	6216344	6216349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593046
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131007	NC_012660	ACG	2	6	6216411	6216416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593046
131008	NC_012660	GCA	2	6	6216471	6216476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593046
131009	NC_012660	GT	3	6	6216522	6216527	0 %	50 %	50 %	0 %	229593046
131010	NC_012660	GCC	2	6	6216561	6216566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593046
131011	NC_012660	GGCCAA	2	12	6216586	6216597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593046
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131013	NC_012660	GT	3	6	6216617	6216622	0 %	50 %	50 %	0 %	229593046
131014	NC_012660	TTG	3	9	6216656	6216664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229593046
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131114	NC_012660	GTG	2	6	6221644	6221649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593052
131115	NC_012660	CA	3	6	6221732	6221737	50 %	0 %	0 %	50 %	229593052
131116	NC_012660	GAT	2	6	6221751	6221756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593052
131117	NC_012660	GTA	2	6	6221811	6221816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593052
131118	NC_012660	TGGT	2	8	6221962	6221969	0 %	50 %	50 %	0 %	229593052
131119	NC_012660	GGC	2	6	6222048	6222053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593052
131120	NC_012660	GCA	2	6	6222089	6222094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593052
131121	NC_012660	GCG	2	6	6222104	6222109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593052
131122	NC_012660	GCC	2	6	6222114	6222119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593052
131123	NC_012660	GC	3	6	6222300	6222305	0 %	0 %	50 %	50 %	229593052
131124	NC_012660	CGC	3	9	6222359	6222367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593052
131125	NC_012660	GTC	2	6	6222469	6222474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593052
131126	NC_012660	CAG	2	6	6222561	6222566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593052
131127	NC_012660	ACG	2	6	6222620	6222625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593052
131128	NC_012660	CA	3	6	6222643	6222648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131129	NC_012660	GTG	2	6	6222655	6222660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131130	NC_012660	AAGG	2	8	6222696	6222703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131131	NC_012660	ATGCC	2	10	6222728	6222737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131132	NC_012660	TGA	2	6	6222777	6222782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131133	NC_012660	TA	3	6	6222789	6222794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131134	NC_012660	TG	3	6	6222856	6222861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131135	NC_012660	CAC	2	6	6222916	6222921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131136	NC_012660	GGT	2	6	6222936	6222941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131137	NC_012660	G	6	6	6223046	6223051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131138	NC_012660	GCC	2	6	6223056	6223061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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131141	NC_012660	CCCA	2	8	6223368	6223375	25 %	0 %	0 %	75 %	229593053
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131151	NC_012660	GGC	2	6	6223809	6223814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593053
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131183	NC_012660	GCG	2	6	6224914	6224919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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131185	NC_012660	A	6	6	6224931	6224936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131186	NC_012660	GTT	3	9	6224971	6224979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229593054
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131220	NC_012660	GCTGTC	2	12	6226626	6226637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593055
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131222	NC_012660	TGG	2	6	6226658	6226663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593055
131223	NC_012660	GGT	2	6	6226686	6226691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593055
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131225	NC_012660	CAT	2	6	6226758	6226763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593055
131226	NC_012660	AAC	2	6	6226781	6226786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593055
131227	NC_012660	TCT	2	6	6226846	6226851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593056
131228	NC_012660	GCT	2	6	6226877	6226882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593056
131229	NC_012660	TCCGGC	2	12	6226995	6227006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229593056
131230	NC_012660	CTG	2	6	6227016	6227021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593056
131231	NC_012660	CCG	2	6	6227110	6227115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593056
131232	NC_012660	ATG	2	6	6227124	6227129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593056
131233	NC_012660	GTC	2	6	6227224	6227229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593056
131234	NC_012660	TGG	2	6	6227251	6227256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593056
131235	NC_012660	TGG	2	6	6227272	6227277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593056
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131237	NC_012660	CGG	2	6	6227318	6227323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593056
131238	NC_012660	GCA	2	6	6227327	6227332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593056
131239	NC_012660	CTG	2	6	6227376	6227381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593056
131240	NC_012660	GCT	2	6	6227438	6227443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593056
131241	NC_012660	ATC	2	6	6227547	6227552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593056
131242	NC_012660	CGG	2	6	6227587	6227592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593056
131243	NC_012660	TCG	2	6	6227611	6227616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593056
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131245	NC_012660	GC	3	6	6227758	6227763	0 %	0 %	50 %	50 %	229593056
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131250	NC_012660	ACTG	2	8	6228074	6228081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131251	NC_012660	GGT	2	6	6228143	6228148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131252	NC_012660	ACC	2	6	6228161	6228166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131253	NC_012660	TCA	2	6	6228169	6228174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131254	NC_012660	TAA	2	6	6228312	6228317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229593057
131255	NC_012660	TTC	2	6	6228326	6228331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593057
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131257	NC_012660	CGCT	2	8	6228573	6228580	0 %	25 %	25 %	50 %	229593057
131258	NC_012660	ACG	2	6	6228587	6228592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593057
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131260	NC_012660	CAC	2	6	6228680	6228685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593057
131261	NC_012660	CAC	2	6	6228707	6228712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593057
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131264	NC_012660	GCG	2	6	6228802	6228807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593057
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131273	NC_012660	CCA	2	6	6229166	6229171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593057
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131298	NC_012660	GA	4	8	6230194	6230201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131299	NC_012660	GACG	2	8	6230247	6230254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131300	NC_012660	CCG	2	6	6230288	6230293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131301	NC_012660	TTGA	2	8	6230414	6230421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131302	NC_012660	TCAA	2	8	6230426	6230433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131303	NC_012660	CCA	2	6	6230449	6230454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131304	NC_012660	CGA	2	6	6230458	6230463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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131310	NC_012660	TGA	2	6	6230693	6230698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593058
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131316	NC_012660	GCAT	2	8	6230849	6230856	25 %	25 %	25 %	25 %	229593058
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131319	NC_012660	TGC	2	6	6230933	6230938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593058
131320	NC_012660	CGCA	3	12	6230945	6230956	25 %	0 %	25 %	50 %	229593058
131321	NC_012660	AGC	2	6	6230958	6230963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593058
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131325	NC_012660	CGG	2	6	6231166	6231171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131326	NC_012660	CGG	2	6	6231242	6231247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593059
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131331	NC_012660	GCC	2	6	6231465	6231470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593059
131332	NC_012660	ACGTCG	2	12	6231514	6231525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229593059
131333	NC_012660	TAC	2	6	6231549	6231554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593059
131334	NC_012660	CGC	2	6	6231621	6231626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593059
131335	NC_012660	GCC	2	6	6231708	6231713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593059
131336	NC_012660	GAT	2	6	6231722	6231727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593059
131337	NC_012660	ACC	2	6	6231756	6231761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593059
131338	NC_012660	CGG	2	6	6231890	6231895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593059
131339	NC_012660	CTC	2	6	6231935	6231940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229593059
131340	NC_012660	AAG	2	6	6231946	6231951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593059
131341	NC_012660	CGC	2	6	6231976	6231981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593059
131342	NC_012660	TGC	2	6	6232013	6232018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593059
131343	NC_012660	GAT	2	6	6232028	6232033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593059
131344	NC_012660	GT	3	6	6232078	6232083	0 %	50 %	50 %	0 %	229593059
131345	NC_012660	GGC	2	6	6232103	6232108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593059
131346	NC_012660	CTG	2	6	6232257	6232262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593059
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131353	NC_012660	CTG	2	6	6232520	6232525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593059
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131357	NC_012660	CAT	2	6	6232842	6232847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593060
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131452	NC_012660	C	6	6	6237649	6237654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131453	NC_012660	AGC	2	6	6237758	6237763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593063
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131455	NC_012660	GC	3	6	6237806	6237811	0 %	0 %	50 %	50 %	229593063
131456	NC_012660	CCA	2	6	6237815	6237820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593063
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131458	NC_012660	GAC	2	6	6237940	6237945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593063
131459	NC_012660	GC	3	6	6237960	6237965	0 %	0 %	50 %	50 %	229593063
131460	NC_012660	TGG	2	6	6237968	6237973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593063
131461	NC_012660	GGT	2	6	6238068	6238073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593063
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131470	NC_012660	GGT	2	6	6238677	6238682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593064
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131481	NC_012660	TGC	2	6	6239006	6239011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593064
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