MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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130002	NC_012660	GAC	2	6	6168258	6168263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593003
130003	NC_012660	TGC	2	6	6168280	6168285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593003
130004	NC_012660	CGG	2	6	6168289	6168294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593003
130005	NC_012660	AAGG	2	8	6168336	6168343	50 %	0 %	50 %	0 %	229593003
130006	NC_012660	GAG	2	6	6168462	6168467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229593003
130007	NC_012660	ACC	2	6	6168552	6168557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593003
130008	NC_012660	GCT	2	6	6168572	6168577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593003
130009	NC_012660	AGC	2	6	6168601	6168606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593003
130010	NC_012660	AC	3	6	6168607	6168612	50 %	0 %	0 %	50 %	229593003
130011	NC_012660	GTG	2	6	6168614	6168619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593003
130012	NC_012660	CGA	2	6	6168676	6168681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130013	NC_012660	A	6	6	6168713	6168718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130014	NC_012660	C	7	7	6168728	6168734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130015	NC_012660	GCC	2	6	6168793	6168798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130016	NC_012660	TTG	2	6	6168822	6168827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229593004
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130018	NC_012660	GC	3	6	6168914	6168919	0 %	0 %	50 %	50 %	229593004
130019	NC_012660	CGG	2	6	6168931	6168936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593004
130020	NC_012660	GCCA	2	8	6168966	6168973	25 %	0 %	25 %	50 %	229593004
130021	NC_012660	GGC	2	6	6168975	6168980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593004
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130026	NC_012660	CG	3	6	6169456	6169461	0 %	0 %	50 %	50 %	229593004
130027	NC_012660	GT	3	6	6169462	6169467	0 %	50 %	50 %	0 %	229593004
130028	NC_012660	CTG	2	6	6169512	6169517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593004
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130032	NC_012660	GCCAT	2	10	6169603	6169612	20 %	20 %	20 %	40 %	229593004
130033	NC_012660	CGA	2	6	6169673	6169678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593004
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130100	NC_012660	AAT	2	6	6172602	6172607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130101	NC_012660	TAA	2	6	6172615	6172620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130102	NC_012660	CA	3	6	6172666	6172671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130103	NC_012660	CGA	2	6	6172754	6172759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593007
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130115	NC_012660	CCT	2	6	6173156	6173161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229593007
130116	NC_012660	GACC	2	8	6173165	6173172	25 %	0 %	25 %	50 %	229593007
130117	NC_012660	GAG	2	6	6173268	6173273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229593007
130118	NC_012660	GTC	2	6	6173292	6173297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593007
130119	NC_012660	CGT	2	6	6173339	6173344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593007
130120	NC_012660	TCG	2	6	6173362	6173367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593007
130121	NC_012660	TCA	2	6	6173431	6173436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593007
130122	NC_012660	CGA	2	6	6173441	6173446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593007
130123	NC_012660	GGCA	2	8	6173540	6173547	25 %	0 %	50 %	25 %	229593007
130124	NC_012660	GAC	2	6	6173571	6173576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593007
130125	NC_012660	CTGAC	2	10	6173587	6173596	20 %	20 %	20 %	40 %	229593007
130126	NC_012660	CCT	2	6	6173686	6173691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229593007
130127	NC_012660	ACAATA	2	12	6173717	6173728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130128	NC_012660	AGGT	2	8	6173729	6173736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130129	NC_012660	GCT	2	6	6173784	6173789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593008
130130	NC_012660	CCA	2	6	6173873	6173878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593008
130131	NC_012660	AC	3	6	6173879	6173884	50 %	0 %	0 %	50 %	229593008
130132	NC_012660	TG	3	6	6173918	6173923	0 %	50 %	50 %	0 %	229593008
130133	NC_012660	GCT	2	6	6173982	6173987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593008
130134	NC_012660	A	6	6	6173992	6173997	100 %	0 %	0 %	0 %	229593008
130135	NC_012660	ACG	2	6	6173999	6174004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593008
130136	NC_012660	GTCG	2	8	6174084	6174091	0 %	25 %	50 %	25 %	229593008
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130138	NC_012660	CGGC	2	8	6174203	6174210	0 %	0 %	50 %	50 %	229593008
130139	NC_012660	TCCC	2	8	6174228	6174235	0 %	25 %	0 %	75 %	229593008
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130141	NC_012660	GGC	2	6	6174258	6174263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593008
130142	NC_012660	GCT	2	6	6174300	6174305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593008
130143	NC_012660	CTG	2	6	6174333	6174338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593008
130144	NC_012660	TCG	2	6	6174443	6174448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593008
130145	NC_012660	CTC	2	6	6174535	6174540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130146	NC_012660	GCG	2	6	6174548	6174553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130147	NC_012660	AAC	2	6	6174621	6174626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229593009
130148	NC_012660	GCT	2	6	6174667	6174672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593009
130149	NC_012660	GCTG	2	8	6174748	6174755	0 %	25 %	50 %	25 %	229593009
130150	NC_012660	ACT	2	6	6174826	6174831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593009
130151	NC_012660	CTG	2	6	6174836	6174841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593009
130152	NC_012660	TTA	2	6	6174847	6174852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229593009
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130154	NC_012660	GCC	2	6	6174884	6174889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593009
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130182	NC_012660	CTTTCC	2	12	6176110	6176121	0 %	50 %	0 %	50 %	229593011
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130192	NC_012660	GC	3	6	6176869	6176874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130193	NC_012660	GGT	2	6	6177032	6177037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593012
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130200	NC_012660	CTG	2	6	6177474	6177479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593012
130201	NC_012660	TCG	2	6	6177493	6177498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593012
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130207	NC_012660	CAG	2	6	6177777	6177782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593013
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130211	NC_012660	CAT	2	6	6178016	6178021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593013
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130217	NC_012660	C	6	6	6178333	6178338	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130218	NC_012660	GCA	2	6	6178393	6178398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130219	NC_012660	GCT	2	6	6178454	6178459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130220	NC_012660	CCA	2	6	6178535	6178540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130221	NC_012660	CTG	2	6	6178554	6178559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130222	NC_012660	TCC	2	6	6178561	6178566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130223	NC_012660	CCAGT	2	10	6178640	6178649	20 %	20 %	20 %	40 %	229593014
130224	NC_012660	CAG	2	6	6178676	6178681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593014
130225	NC_012660	CAG	3	9	6178688	6178696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593014
130226	NC_012660	CAG	2	6	6178730	6178735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593014
130227	NC_012660	CGC	2	6	6178757	6178762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593014
130228	NC_012660	CA	3	6	6178835	6178840	50 %	0 %	0 %	50 %	229593014
130229	NC_012660	GACAAC	2	12	6178887	6178898	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229593014
130230	NC_012660	AGC	2	6	6178899	6178904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593014
130231	NC_012660	CCA	2	6	6178930	6178935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593014
130232	NC_012660	GAA	2	6	6178985	6178990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593014
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130249	NC_012660	TGA	2	6	6179860	6179865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593014
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130253	NC_012660	TC	3	6	6179954	6179959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130254	NC_012660	TG	3	6	6179990	6179995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130255	NC_012660	TG	3	6	6180023	6180028	0 %	50 %	50 %	0 %	229593015
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130261	NC_012660	CGT	2	6	6180238	6180243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593015
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130324	NC_012660	GCA	2	6	6182666	6182671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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130326	NC_012660	GCT	2	6	6182751	6182756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130327	NC_012660	GCCC	2	8	6182764	6182771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130328	NC_012660	GCC	2	6	6182797	6182802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593018
130329	NC_012660	CTG	2	6	6182826	6182831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593018
130330	NC_012660	CCCA	2	8	6182991	6182998	25 %	0 %	0 %	75 %	229593018
130331	NC_012660	CGG	3	9	6183011	6183019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593018
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130335	NC_012660	A	6	6	6183135	6183140	100 %	0 %	0 %	0 %	229593018
130336	NC_012660	GCCTG	2	10	6183166	6183175	0 %	20 %	40 %	40 %	229593018
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130341	NC_012660	GGC	2	6	6183416	6183421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593018
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130343	NC_012660	GCG	2	6	6183505	6183510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593018
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130345	NC_012660	GC	3	6	6183662	6183667	0 %	0 %	50 %	50 %	229593018
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