MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115001	NC_012660	GAT	2	6	5447342	5447347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592351
115002	NC_012660	CCG	2	6	5447350	5447355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592351
115003	NC_012660	TGGT	2	8	5447385	5447392	0 %	50 %	50 %	0 %	229592351
115004	NC_012660	CCG	2	6	5447397	5447402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592351
115005	NC_012660	GAT	2	6	5447417	5447422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592351
115006	NC_012660	TCG	2	6	5447442	5447447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592351
115007	NC_012660	GT	3	6	5447539	5447544	0 %	50 %	50 %	0 %	229592351
115008	NC_012660	ACGA	2	8	5447553	5447560	50 %	0 %	25 %	25 %	229592351
115009	NC_012660	TGGT	2	8	5447601	5447608	0 %	50 %	50 %	0 %	229592351
115010	NC_012660	AGGTGC	2	12	5447626	5447637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229592351
115011	NC_012660	CAG	2	6	5447669	5447674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592351
115012	NC_012660	GCCTT	2	10	5447688	5447697	0 %	40 %	20 %	40 %	229592351
115013	NC_012660	TGTT	2	8	5447727	5447734	0 %	75 %	25 %	0 %	229592351
115014	NC_012660	GCCC	2	8	5447755	5447762	0 %	0 %	25 %	75 %	229592351
115015	NC_012660	ATC	2	6	5447772	5447777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592351
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115017	NC_012660	CAT	2	6	5447804	5447809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592351
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115019	NC_012660	TGT	2	6	5447863	5447868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592351
115020	NC_012660	CCG	2	6	5447881	5447886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592351
115021	NC_012660	GCC	2	6	5447972	5447977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592351
115022	NC_012660	CCGA	2	8	5447988	5447995	25 %	0 %	25 %	50 %	229592351
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115025	NC_012660	TCA	2	6	5448103	5448108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592351
115026	NC_012660	GCTG	2	8	5448197	5448204	0 %	25 %	50 %	25 %	229592351
115027	NC_012660	CGC	2	6	5448205	5448210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592351
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115029	NC_012660	AAT	2	6	5448468	5448473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115030	NC_012660	ACA	2	6	5448486	5448491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115031	NC_012660	CGA	2	6	5448495	5448500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115032	NC_012660	CAAT	2	8	5448530	5448537	50 %	25 %	0 %	25 %	229592352
115033	NC_012660	GC	3	6	5448567	5448572	0 %	0 %	50 %	50 %	229592352
115034	NC_012660	TCG	2	6	5448608	5448613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592352
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115036	NC_012660	ACCG	2	8	5448823	5448830	25 %	0 %	25 %	50 %	229592352
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115041	NC_012660	ATC	2	6	5448955	5448960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592352
115042	NC_012660	TGC	2	6	5449007	5449012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592352
115043	NC_012660	TGA	2	6	5449040	5449045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592352
115044	NC_012660	CG	4	8	5449108	5449115	0 %	0 %	50 %	50 %	229592352
115045	NC_012660	GCC	2	6	5449153	5449158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592352
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115053	NC_012660	GTC	2	6	5449383	5449388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592352
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115055	NC_012660	TG	3	6	5449534	5449539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115056	NC_012660	TGA	2	6	5449609	5449614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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115060	NC_012660	CGAT	2	8	5449802	5449809	25 %	25 %	25 %	25 %	229592353
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115089	NC_012660	CGTCT	2	10	5451252	5451261	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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115100	NC_012660	GCGG	2	8	5451685	5451692	0 %	0 %	75 %	25 %	229592355
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115115	NC_012660	GAT	2	6	5452402	5452407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592355
115116	NC_012660	GGC	2	6	5452435	5452440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592355
115117	NC_012660	GACC	2	8	5452596	5452603	25 %	0 %	25 %	50 %	229592355
115118	NC_012660	GAC	2	6	5452605	5452610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592355
115119	NC_012660	CGC	2	6	5452633	5452638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592355
115120	NC_012660	CAC	2	6	5452729	5452734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592355
115121	NC_012660	CAC	2	6	5452746	5452751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592355
115122	NC_012660	AGC	2	6	5452757	5452762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592355
115123	NC_012660	CG	3	6	5452778	5452783	0 %	0 %	50 %	50 %	229592355
115124	NC_012660	GCC	2	6	5452789	5452794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592355
115125	NC_012660	CCTG	2	8	5452796	5452803	0 %	25 %	25 %	50 %	229592355
115126	NC_012660	CCGAC	2	10	5453018	5453027	20 %	0 %	20 %	60 %	229592355
115127	NC_012660	ACG	2	6	5453042	5453047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592355
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115130	NC_012660	ACA	2	6	5453336	5453341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592355
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115133	NC_012660	GT	3	6	5453456	5453461	0 %	50 %	50 %	0 %	229592355
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115135	NC_012660	ACG	2	6	5453498	5453503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592355
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115145	NC_012660	TGA	2	6	5453899	5453904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592355
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115147	NC_012660	T	6	6	5453949	5453954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115148	NC_012660	TCT	2	6	5453966	5453971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115149	NC_012660	CT	3	6	5453993	5453998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115150	NC_012660	T	6	6	5454032	5454037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115151	NC_012660	CA	3	6	5454109	5454114	50 %	0 %	0 %	50 %	229592356
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115172	NC_012660	GCCT	2	8	5455230	5455237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115173	NC_012660	GTGA	2	8	5455324	5455331	25 %	25 %	50 %	0 %	229592358
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115200	NC_012660	CTG	2	6	5456419	5456424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592358
115201	NC_012660	GCC	2	6	5456434	5456439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592358
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115203	NC_012660	CTG	3	9	5456452	5456460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592358
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115210	NC_012660	AATGA	2	10	5456764	5456773	60 %	20 %	20 %	0 %	229592358
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115214	NC_012660	CTG	2	6	5457007	5457012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592358
115215	NC_012660	CGC	2	6	5457021	5457026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592358
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115217	NC_012660	CGA	2	6	5457078	5457083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592358
115218	NC_012660	GGA	2	6	5457120	5457125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229592358
115219	NC_012660	CGTGG	2	10	5457163	5457172	0 %	20 %	60 %	20 %	229592358
115220	NC_012660	CCA	2	6	5457176	5457181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592358
115221	NC_012660	GCC	2	6	5457304	5457309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592358
115222	NC_012660	AAC	2	6	5457311	5457316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592358
115223	NC_012660	CGG	2	6	5457401	5457406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592358
115224	NC_012660	CAG	2	6	5457411	5457416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592358
115225	NC_012660	GCCA	2	8	5457433	5457440	25 %	0 %	25 %	50 %	229592358
115226	NC_012660	AC	3	6	5457548	5457553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115227	NC_012660	CGC	2	6	5457625	5457630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592359
115228	NC_012660	GCC	2	6	5457644	5457649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592359
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115230	NC_012660	GCG	2	6	5457666	5457671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592359
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115346	NC_012660	TGA	2	6	5462916	5462921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592363
115347	NC_012660	TGC	2	6	5462975	5462980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592363
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115459	NC_012660	GC	3	6	5469157	5469162	0 %	0 %	50 %	50 %	229592366
115460	NC_012660	TGT	2	6	5469163	5469168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592366
115461	NC_012660	TGC	2	6	5469250	5469255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592366
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115464	NC_012660	CAT	2	6	5469371	5469376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592366
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115466	NC_012660	GC	3	6	5469391	5469396	0 %	0 %	50 %	50 %	229592366
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115488	NC_012660	GAA	2	6	5470515	5470520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229592366
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115491	NC_012660	A	8	8	5470740	5470747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115492	NC_012660	TCGCA	2	10	5470753	5470762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115493	NC_012660	CAA	2	6	5470836	5470841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592367
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115495	NC_012660	TG	3	6	5470927	5470932	0 %	50 %	50 %	0 %	229592367
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