MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_012660	TGTT	2	8	5351142	5351149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113002	NC_012660	CGG	2	6	5351266	5351271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113003	NC_012660	G	6	6	5351294	5351299	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113004	NC_012660	CGA	2	6	5351317	5351322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113005	NC_012660	CAA	2	6	5351356	5351361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113006	NC_012660	TAA	2	6	5351425	5351430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113007	NC_012660	ATTC	2	8	5351480	5351487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113008	NC_012660	A	6	6	5351491	5351496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113009	NC_012660	A	6	6	5351517	5351522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113010	NC_012660	CT	3	6	5351566	5351571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113011	NC_012660	AAC	2	6	5351621	5351626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113012	NC_012660	CGA	2	6	5351687	5351692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113013	NC_012660	GCC	2	6	5351718	5351723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113014	NC_012660	ATG	2	6	5351730	5351735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113015	NC_012660	GGCA	2	8	5351789	5351796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113016	NC_012660	CTA	2	6	5351890	5351895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592260
113017	NC_012660	CAC	2	6	5351903	5351908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592260
113018	NC_012660	ACG	2	6	5351964	5351969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592260
113019	NC_012660	CAG	2	6	5351992	5351997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592260
113020	NC_012660	GCC	2	6	5351999	5352004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592260
113021	NC_012660	CCA	2	6	5352039	5352044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592260
113022	NC_012660	A	6	6	5352179	5352184	100 %	0 %	0 %	0 %	229592260
113023	NC_012660	CTG	2	6	5352188	5352193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592260
113024	NC_012660	ACT	2	6	5352210	5352215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592260
113025	NC_012660	AGC	2	6	5352344	5352349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592260
113026	NC_012660	AAG	2	6	5352353	5352358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229592260
113027	NC_012660	CCAC	2	8	5352411	5352418	25 %	0 %	0 %	75 %	229592260
113028	NC_012660	CG	3	6	5352478	5352483	0 %	0 %	50 %	50 %	229592260
113029	NC_012660	TGC	2	6	5352495	5352500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592260
113030	NC_012660	GAT	2	6	5352572	5352577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592260
113031	NC_012660	AATA	2	8	5352581	5352588	75 %	25 %	0 %	0 %	229592260
113032	NC_012660	GGA	2	6	5352619	5352624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229592260
113033	NC_012660	GC	3	6	5352665	5352670	0 %	0 %	50 %	50 %	229592260
113034	NC_012660	GAG	2	6	5352683	5352688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229592260
113035	NC_012660	CCTGGG	2	12	5352706	5352717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	229592260
113036	NC_012660	GGGC	2	8	5352718	5352725	0 %	0 %	75 %	25 %	229592260
113037	NC_012660	GATCT	2	10	5352746	5352755	20 %	40 %	20 %	20 %	229592260
113038	NC_012660	TGGC	2	8	5352897	5352904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113039	NC_012660	AAT	2	6	5353018	5353023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113040	NC_012660	CA	3	6	5353024	5353029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113041	NC_012660	CAT	2	6	5353045	5353050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113042	NC_012660	CTT	2	6	5353057	5353062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113043	NC_012660	GATC	2	8	5353123	5353130	25 %	25 %	25 %	25 %	229592261
113044	NC_012660	CCTG	2	8	5353134	5353141	0 %	25 %	25 %	50 %	229592261
113045	NC_012660	CGTA	2	8	5353259	5353266	25 %	25 %	25 %	25 %	229592261
113046	NC_012660	GCT	3	9	5353299	5353307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592261
113047	NC_012660	TTCG	2	8	5353356	5353363	0 %	50 %	25 %	25 %	229592261
113048	NC_012660	GGGC	2	8	5353377	5353384	0 %	0 %	75 %	25 %	229592261
113049	NC_012660	CCA	2	6	5353426	5353431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592261
113050	NC_012660	TTG	2	6	5353682	5353687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592261
113051	NC_012660	GTGCC	2	10	5353721	5353730	0 %	20 %	40 %	40 %	229592261
113052	NC_012660	CCG	2	6	5353741	5353746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592261
113053	NC_012660	CTT	2	6	5353843	5353848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592261
113054	NC_012660	CCT	2	6	5353869	5353874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229592261
113055	NC_012660	TCG	2	6	5353904	5353909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592261
113056	NC_012660	CGGT	2	8	5353995	5354002	0 %	25 %	50 %	25 %	229592261
113057	NC_012660	GCG	2	6	5354017	5354022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592261
113058	NC_012660	CCT	2	6	5354122	5354127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113059	NC_012660	A	9	9	5354237	5354245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113060	NC_012660	T	7	7	5354266	5354272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113061	NC_012660	GCA	2	6	5354275	5354280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113062	NC_012660	CTT	2	6	5354296	5354301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592262
113063	NC_012660	CCGG	2	8	5354330	5354337	0 %	0 %	50 %	50 %	229592262
113064	NC_012660	TTG	2	6	5354393	5354398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592262
113065	NC_012660	GCC	2	6	5354399	5354404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592262
113066	NC_012660	TGC	2	6	5354463	5354468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592262
113067	NC_012660	ACC	2	6	5354470	5354475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592262
113068	NC_012660	GCG	2	6	5354539	5354544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592262
113069	NC_012660	CCG	2	6	5354579	5354584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592262
113070	NC_012660	CGA	2	6	5354650	5354655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592262
113071	NC_012660	ACGC	2	8	5354818	5354825	25 %	0 %	25 %	50 %	229592262
113072	NC_012660	GGC	2	6	5354832	5354837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592262
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113074	NC_012660	CAC	2	6	5354896	5354901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592262
113075	NC_012660	GCTT	2	8	5354939	5354946	0 %	50 %	25 %	25 %	229592262
113076	NC_012660	CAC	2	6	5354980	5354985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592262
113077	NC_012660	GGT	2	6	5355100	5355105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592262
113078	NC_012660	GGT	2	6	5355121	5355126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592262
113079	NC_012660	CTT	2	6	5355162	5355167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592262
113080	NC_012660	GTC	2	6	5355211	5355216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592262
113081	NC_012660	TTG	2	6	5355242	5355247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592262
113082	NC_012660	CGG	2	6	5355273	5355278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592262
113083	NC_012660	TGA	2	6	5355291	5355296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592262
113084	NC_012660	CTG	2	6	5355453	5355458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592262
113085	NC_012660	GC	3	6	5355603	5355608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113086	NC_012660	CCG	2	6	5355655	5355660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592263
113087	NC_012660	TTC	2	6	5355734	5355739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592263
113088	NC_012660	TGC	2	6	5355759	5355764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592263
113089	NC_012660	GTC	2	6	5355784	5355789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592263
113090	NC_012660	TGG	2	6	5355822	5355827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592263
113091	NC_012660	TG	3	6	5355862	5355867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113092	NC_012660	AGC	2	6	5355911	5355916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113093	NC_012660	CGG	2	6	5355926	5355931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113094	NC_012660	CAC	2	6	5355959	5355964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113095	NC_012660	TAAA	2	8	5355998	5356005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113096	NC_012660	GGC	2	6	5356025	5356030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592264
113097	NC_012660	GCG	2	6	5356085	5356090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592264
113098	NC_012660	GCG	2	6	5356102	5356107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592264
113099	NC_012660	CGG	2	6	5356109	5356114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592264
113100	NC_012660	TCT	2	6	5356153	5356158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592264
113101	NC_012660	TCGGGC	2	12	5356159	5356170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	229592264
113102	NC_012660	GCA	2	6	5356222	5356227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592264
113103	NC_012660	CAA	2	6	5356236	5356241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592264
113104	NC_012660	ATC	2	6	5356242	5356247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592264
113105	NC_012660	TCCAGC	2	12	5356279	5356290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	229592264
113106	NC_012660	AAC	2	6	5356291	5356296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592264
113107	NC_012660	TTC	2	6	5356323	5356328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592264
113108	NC_012660	TCG	2	6	5356381	5356386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592264
113109	NC_012660	CGGCT	2	10	5356398	5356407	0 %	20 %	40 %	40 %	229592264
113110	NC_012660	GCG	2	6	5356430	5356435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592264
113111	NC_012660	TCG	2	6	5356441	5356446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592264
113112	NC_012660	TTC	2	6	5356450	5356455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592264
113113	NC_012660	TGG	3	9	5356481	5356489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592264
113114	NC_012660	CGA	2	6	5356526	5356531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592264
113115	NC_012660	CAG	2	6	5356551	5356556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592264
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113117	NC_012660	CGTC	2	8	5356771	5356778	0 %	25 %	25 %	50 %	229592264
113118	NC_012660	CTT	2	6	5356806	5356811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592264
113119	NC_012660	CGG	2	6	5356818	5356823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592264
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113174	NC_012660	GCC	2	6	5359340	5359345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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113216	NC_012660	GC	3	6	5361127	5361132	0 %	0 %	50 %	50 %	229592271
113217	NC_012660	CGG	2	6	5361153	5361158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592271
113218	NC_012660	AGCTGG	2	12	5361171	5361182	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229592271
113219	NC_012660	TGC	2	6	5361276	5361281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592271
113220	NC_012660	GGCC	2	8	5361413	5361420	0 %	0 %	50 %	50 %	229592271
113221	NC_012660	TAC	3	9	5361449	5361457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592271
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113223	NC_012660	CCG	2	6	5361574	5361579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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113226	NC_012660	GGC	2	6	5361731	5361736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592272
113227	NC_012660	ATG	2	6	5361749	5361754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592272
113228	NC_012660	CGG	2	6	5361769	5361774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592272
113229	NC_012660	CG	3	6	5361786	5361791	0 %	0 %	50 %	50 %	229592272
113230	NC_012660	GGC	2	6	5361797	5361802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592272
113231	NC_012660	AGC	2	6	5361831	5361836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592272
113232	NC_012660	CGC	2	6	5361949	5361954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592272
113233	NC_012660	CCGTG	2	10	5361982	5361991	0 %	20 %	40 %	40 %	229592272
113234	NC_012660	CAG	2	6	5362004	5362009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592272
113235	NC_012660	A	6	6	5362010	5362015	100 %	0 %	0 %	0 %	229592272
113236	NC_012660	CGA	2	6	5362018	5362023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592272
113237	NC_012660	AAG	2	6	5362031	5362036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229592272
113238	NC_012660	GCGCC	2	10	5362045	5362054	0 %	0 %	40 %	60 %	229592272
113239	NC_012660	GGAA	2	8	5362059	5362066	50 %	0 %	50 %	0 %	229592272
113240	NC_012660	AAT	2	6	5362104	5362109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229592272
113241	NC_012660	CCCAG	2	10	5362124	5362133	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
113242	NC_012660	CTGG	2	8	5362209	5362216	0 %	25 %	50 %	25 %	229592273
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113250	NC_012660	GTC	2	6	5362639	5362644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592273
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113254	NC_012660	CAGC	2	8	5362851	5362858	25 %	0 %	25 %	50 %	229592273
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113266	NC_012660	TAT	2	6	5363540	5363545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113267	NC_012660	TGA	2	6	5363556	5363561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592274
113268	NC_012660	CTG	2	6	5363567	5363572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592274
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113336	NC_012660	CCGC	2	8	5366638	5366645	0 %	0 %	25 %	75 %	229592276
113337	NC_012660	CAT	2	6	5366699	5366704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592276
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113342	NC_012660	GCA	2	6	5366878	5366883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592276
113343	NC_012660	CAG	2	6	5366903	5366908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592276
113344	NC_012660	ACG	2	6	5366911	5366916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592276
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113462	NC_012660	CGG	2	6	5371698	5371703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592280
113463	NC_012660	CAAC	2	8	5371705	5371712	50 %	0 %	0 %	50 %	229592280
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113465	NC_012660	GGC	3	9	5371819	5371827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592280
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113470	NC_012660	GCT	2	6	5372152	5372157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592280
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113473	NC_012660	TGG	2	6	5372191	5372196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592280
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113483	NC_012660	CGCC	2	8	5372452	5372459	0 %	0 %	25 %	75 %	229592280
113484	NC_012660	CCG	2	6	5372472	5372477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592280
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113488	NC_012660	TGC	2	6	5373129	5373134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113489	NC_012660	CAG	2	6	5373155	5373160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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113492	NC_012660	GGT	2	6	5373365	5373370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592282
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113494	NC_012660	CGC	2	6	5373390	5373395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592282
113495	NC_012660	CTG	2	6	5373414	5373419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592282
113496	NC_012660	GCC	2	6	5373420	5373425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592282
113497	NC_012660	GACC	2	8	5373428	5373435	25 %	0 %	25 %	50 %	229592282
113498	NC_012660	CTG	2	6	5373468	5373473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592282
113499	NC_012660	CCGG	2	8	5373510	5373517	0 %	0 %	50 %	50 %	229592282
113500	NC_012660	CTG	2	6	5373552	5373557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592282

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