MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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112002	NC_012660	TGC	2	6	5301946	5301951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592215
112003	NC_012660	GCCACC	2	12	5301960	5301971	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	229592215
112004	NC_012660	TCA	2	6	5301994	5301999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592215
112005	NC_012660	C	6	6	5302113	5302118	0 %	0 %	0 %	100 %	229592216
112006	NC_012660	ACC	2	6	5302202	5302207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592216
112007	NC_012660	CGC	2	6	5302252	5302257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592216
112008	NC_012660	CGG	2	6	5302414	5302419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592216
112009	NC_012660	TTC	2	6	5302430	5302435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592216
112010	NC_012660	GTGC	2	8	5302457	5302464	0 %	25 %	50 %	25 %	229592216
112011	NC_012660	GTG	2	6	5302574	5302579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592216
112012	NC_012660	GGC	2	6	5302630	5302635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592216
112013	NC_012660	CAG	2	6	5302640	5302645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592216
112014	NC_012660	CGGC	2	8	5302658	5302665	0 %	0 %	50 %	50 %	229592216
112015	NC_012660	GCA	2	6	5302682	5302687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592216
112016	NC_012660	T	6	6	5302879	5302884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112017	NC_012660	TCT	2	6	5302920	5302925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112018	NC_012660	CTTT	2	8	5302932	5302939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112019	NC_012660	ATG	2	6	5302958	5302963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112020	NC_012660	ACC	2	6	5302999	5303004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112021	NC_012660	GGGC	2	8	5303159	5303166	0 %	0 %	75 %	25 %	229592217
112022	NC_012660	GC	3	6	5303178	5303183	0 %	0 %	50 %	50 %	229592217
112023	NC_012660	CGG	2	6	5303225	5303230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592217
112024	NC_012660	TTG	2	6	5303251	5303256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592217
112025	NC_012660	GGC	2	6	5303282	5303287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592217
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112032	NC_012660	TG	3	6	5303495	5303500	0 %	50 %	50 %	0 %	229592217
112033	NC_012660	CGG	2	6	5303530	5303535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112034	NC_012660	GAT	2	6	5303554	5303559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112035	NC_012660	CAG	2	6	5303645	5303650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592218
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112041	NC_012660	GGT	2	6	5303941	5303946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592218
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112106	NC_012660	TTGCA	2	10	5307918	5307927	20 %	40 %	20 %	20 %	229592222
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112116	NC_012660	GCG	2	6	5308159	5308164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592222
112117	NC_012660	CG	3	6	5308302	5308307	0 %	0 %	50 %	50 %	229592222
112118	NC_012660	GGA	2	6	5308378	5308383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229592222
112119	NC_012660	TGC	2	6	5308434	5308439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592222
112120	NC_012660	TTG	2	6	5308518	5308523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592222
112121	NC_012660	GATT	2	8	5308579	5308586	25 %	50 %	25 %	0 %	229592222
112122	NC_012660	GCA	2	6	5308590	5308595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592222
112123	NC_012660	CGG	2	6	5308600	5308605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592222
112124	NC_012660	CTC	2	6	5308646	5308651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112125	NC_012660	TCA	2	6	5308673	5308678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112126	NC_012660	ATT	3	9	5308693	5308701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112127	NC_012660	T	7	7	5308710	5308716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112128	NC_012660	GC	3	6	5308758	5308763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112129	NC_012660	AGC	2	6	5308771	5308776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112130	NC_012660	GCC	2	6	5308787	5308792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112131	NC_012660	AAG	2	6	5308801	5308806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112132	NC_012660	AAT	2	6	5308838	5308843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112133	NC_012660	AAC	2	6	5308905	5308910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112134	NC_012660	TGAC	2	8	5308971	5308978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112135	NC_012660	T	7	7	5309010	5309016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112136	NC_012660	CGC	2	6	5309053	5309058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592223
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112144	NC_012660	TGC	2	6	5309434	5309439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592223
112145	NC_012660	TCA	2	6	5309450	5309455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592223
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112216	NC_012660	CTG	2	6	5313269	5313274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592227
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112228	NC_012660	GC	3	6	5314058	5314063	0 %	0 %	50 %	50 %	229592228
112229	NC_012660	GC	3	6	5314176	5314181	0 %	0 %	50 %	50 %	229592228
112230	NC_012660	CGCA	2	8	5314276	5314283	25 %	0 %	25 %	50 %	229592228
112231	NC_012660	TGA	2	6	5314314	5314319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592228
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112233	NC_012660	CAG	2	6	5314505	5314510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592228
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112235	NC_012660	TAC	2	6	5314549	5314554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592228
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112343	NC_012660	GTA	2	6	5320324	5320329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592234
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112345	NC_012660	GACCA	2	10	5320370	5320379	40 %	0 %	20 %	40 %	229592234
112346	NC_012660	TGCCGC	2	12	5320407	5320418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229592234
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112348	NC_012660	TTG	2	6	5320661	5320666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592234
112349	NC_012660	GTC	2	6	5320903	5320908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592234
112350	NC_012660	GCC	2	6	5320915	5320920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592234
112351	NC_012660	CAC	2	6	5320995	5321000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592234
112352	NC_012660	GCC	2	6	5321045	5321050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592234
112353	NC_012660	GCT	2	6	5321075	5321080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592234
112354	NC_012660	GTT	2	6	5321110	5321115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592234
112355	NC_012660	TTA	2	6	5321153	5321158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112356	NC_012660	T	6	6	5321185	5321190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112357	NC_012660	ACA	2	6	5321198	5321203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112358	NC_012660	GCT	2	6	5321209	5321214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112359	NC_012660	GAA	2	6	5321267	5321272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229592235
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112367	NC_012660	CGT	2	6	5321553	5321558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592235
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112371	NC_012660	TTTC	2	8	5321709	5321716	0 %	75 %	0 %	25 %	229592235
112372	NC_012660	TTG	2	6	5321728	5321733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592235
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112376	NC_012660	TCG	2	6	5321894	5321899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592235
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112378	NC_012660	GC	3	6	5321920	5321925	0 %	0 %	50 %	50 %	229592235
112379	NC_012660	GCC	2	6	5321959	5321964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592235
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112382	NC_012660	CGC	2	6	5322195	5322200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592235
112383	NC_012660	TCA	2	6	5322231	5322236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592235
112384	NC_012660	CCTT	2	8	5322284	5322291	0 %	50 %	0 %	50 %	229592235
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112454	NC_012660	AGCCC	2	10	5325677	5325686	20 %	0 %	20 %	60 %	229592239
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112456	NC_012660	GCC	2	6	5325766	5325771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592239
112457	NC_012660	TGC	2	6	5325780	5325785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592239
112458	NC_012660	GTTG	2	8	5325789	5325796	0 %	50 %	50 %	0 %	229592239
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112460	NC_012660	GCG	2	6	5325926	5325931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592239
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112462	NC_012660	TCCAG	2	10	5325984	5325993	20 %	20 %	20 %	40 %	229592239
112463	NC_012660	GTCA	2	8	5326066	5326073	25 %	25 %	25 %	25 %	229592239
112464	NC_012660	GC	3	6	5326108	5326113	0 %	0 %	50 %	50 %	229592239
112465	NC_012660	GCA	2	6	5326125	5326130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592239
112466	NC_012660	CGG	2	6	5326188	5326193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592239
112467	NC_012660	CGG	2	6	5326266	5326271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592239
112468	NC_012660	CGA	2	6	5326293	5326298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592239
112469	NC_012660	GC	3	6	5326305	5326310	0 %	0 %	50 %	50 %	229592239
112470	NC_012660	CCAG	2	8	5326314	5326321	25 %	0 %	25 %	50 %	229592239
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112474	NC_012660	GAT	2	6	5326471	5326476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592239
112475	NC_012660	CGT	2	6	5326485	5326490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592239
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112478	NC_012660	GGC	2	6	5326537	5326542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592239
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112480	NC_012660	GCC	2	6	5326615	5326620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592239
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112482	NC_012660	GC	4	8	5326751	5326758	0 %	0 %	50 %	50 %	229592239
112483	NC_012660	CGGC	2	8	5326761	5326768	0 %	0 %	50 %	50 %	229592239
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112486	NC_012660	TGA	2	6	5326865	5326870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592239
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112489	NC_012660	T	6	6	5326933	5326938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112490	NC_012660	GAAGGG	2	12	5326985	5326996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112491	NC_012660	GTG	2	6	5327009	5327014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112492	NC_012660	AAC	2	6	5327125	5327130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592240
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112499	NC_012660	A	6	6	5327416	5327421	100 %	0 %	0 %	0 %	229592240
112500	NC_012660	CGG	2	6	5327495	5327500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592240

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