MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_012660	TGT	2	6	5208234	5208239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592130
110002	NC_012660	CTG	2	6	5208259	5208264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592130
110003	NC_012660	GCC	2	6	5208272	5208277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592130
110004	NC_012660	CG	3	6	5208349	5208354	0 %	0 %	50 %	50 %	229592130
110005	NC_012660	GAC	2	6	5208356	5208361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592130
110006	NC_012660	TGT	2	6	5208390	5208395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592130
110007	NC_012660	GTT	2	6	5208411	5208416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592130
110008	NC_012660	TC	3	6	5208463	5208468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110009	NC_012660	CAG	2	6	5208551	5208556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592131
110010	NC_012660	CGC	2	6	5208562	5208567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592131
110011	NC_012660	CAC	2	6	5208761	5208766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592131
110012	NC_012660	CCG	2	6	5208808	5208813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592131
110013	NC_012660	GAT	3	9	5208875	5208883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592131
110014	NC_012660	CGA	2	6	5208899	5208904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592131
110015	NC_012660	GAG	2	6	5208921	5208926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229592131
110016	NC_012660	GGC	2	6	5209118	5209123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592131
110017	NC_012660	GCT	2	6	5209133	5209138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592131
110018	NC_012660	GTT	2	6	5209190	5209195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592131
110019	NC_012660	ATT	2	6	5209215	5209220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229592131
110020	NC_012660	CAT	2	6	5209260	5209265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592132
110021	NC_012660	TCA	2	6	5209280	5209285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592132
110022	NC_012660	GTA	2	6	5209359	5209364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592132
110023	NC_012660	GCC	2	6	5209384	5209389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592132
110024	NC_012660	GGT	2	6	5209391	5209396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592132
110025	NC_012660	GCC	2	6	5209497	5209502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592132
110026	NC_012660	TGG	2	6	5209523	5209528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592132
110027	NC_012660	GC	3	6	5209628	5209633	0 %	0 %	50 %	50 %	229592132
110028	NC_012660	TCGA	2	8	5209807	5209814	25 %	25 %	25 %	25 %	229592133
110029	NC_012660	CAC	2	6	5209850	5209855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592133
110030	NC_012660	CTG	2	6	5209929	5209934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592133
110031	NC_012660	GGC	2	6	5209935	5209940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592133
110032	NC_012660	TGT	2	6	5210000	5210005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592133
110033	NC_012660	TGG	2	6	5210151	5210156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110034	NC_012660	CGA	2	6	5210194	5210199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110035	NC_012660	CT	3	6	5210262	5210267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110036	NC_012660	A	8	8	5210281	5210288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110037	NC_012660	GT	3	6	5210317	5210322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110038	NC_012660	ACC	2	6	5210345	5210350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110039	NC_012660	CTGCA	2	10	5210425	5210434	20 %	20 %	20 %	40 %	229592134
110040	NC_012660	GCC	2	6	5210493	5210498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592134
110041	NC_012660	GCA	2	6	5210522	5210527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592134
110042	NC_012660	TCTT	2	8	5210533	5210540	0 %	75 %	0 %	25 %	229592134
110043	NC_012660	GC	3	6	5210807	5210812	0 %	0 %	50 %	50 %	229592134
110044	NC_012660	GGA	2	6	5210886	5210891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229592134
110045	NC_012660	GCA	2	6	5210896	5210901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592134
110046	NC_012660	GCA	2	6	5210948	5210953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592134
110047	NC_012660	TGG	2	6	5211008	5211013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592134
110048	NC_012660	ACC	2	6	5211025	5211030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592134
110049	NC_012660	CTG	2	6	5211099	5211104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592134
110050	NC_012660	CAT	2	6	5211108	5211113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592134
110051	NC_012660	TTG	2	6	5211115	5211120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229592134
110052	NC_012660	CTG	2	6	5211279	5211284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592135
110053	NC_012660	TCA	2	6	5211317	5211322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592135
110054	NC_012660	GAT	2	6	5211406	5211411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592135
110055	NC_012660	ATC	3	9	5211494	5211502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592135
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110057	NC_012660	CTT	2	6	5211520	5211525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592135
110058	NC_012660	CCA	2	6	5211534	5211539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592135
110059	NC_012660	CCA	2	6	5211582	5211587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592135
110060	NC_012660	CCA	2	6	5211696	5211701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592135
110061	NC_012660	TCT	2	6	5211747	5211752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592135
110062	NC_012660	GAT	2	6	5211760	5211765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592135
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110065	NC_012660	GGAT	2	8	5211836	5211843	25 %	25 %	50 %	0 %	229592135
110066	NC_012660	CTC	2	6	5211844	5211849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229592135
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110068	NC_012660	GAATCG	2	12	5211984	5211995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229592135
110069	NC_012660	ATG	2	6	5212046	5212051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229592135
110070	NC_012660	GCA	2	6	5212068	5212073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592135
110071	NC_012660	GCT	2	6	5212107	5212112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592135
110072	NC_012660	CAA	2	6	5212132	5212137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592135
110073	NC_012660	TG	3	6	5212163	5212168	0 %	50 %	50 %	0 %	229592135
110074	NC_012660	TATT	2	8	5212270	5212277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110075	NC_012660	CGA	2	6	5212322	5212327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110076	NC_012660	TTGC	2	8	5212358	5212365	0 %	50 %	25 %	25 %	229592136
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110081	NC_012660	CCTC	2	8	5212776	5212783	0 %	25 %	0 %	75 %	229592136
110082	NC_012660	TCA	2	6	5212833	5212838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592136
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110084	NC_012660	CAG	2	6	5212900	5212905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592136
110085	NC_012660	TGAG	2	8	5212956	5212963	25 %	25 %	50 %	0 %	229592136
110086	NC_012660	TCA	2	6	5212998	5213003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592136
110087	NC_012660	T	6	6	5213179	5213184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110088	NC_012660	ACC	2	6	5213246	5213251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592137
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110090	NC_012660	GGT	2	6	5213398	5213403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229592137
110091	NC_012660	GCT	2	6	5213485	5213490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592137
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110098	NC_012660	GCT	2	6	5213674	5213679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592138
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110100	NC_012660	GC	3	6	5213693	5213698	0 %	0 %	50 %	50 %	229592138
110101	NC_012660	CTG	2	6	5213717	5213722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592138
110102	NC_012660	A	6	6	5213735	5213740	100 %	0 %	0 %	0 %	229592138
110103	NC_012660	GCCA	2	8	5213801	5213808	25 %	0 %	25 %	50 %	229592138
110104	NC_012660	TCGG	2	8	5213813	5213820	0 %	25 %	50 %	25 %	229592138
110105	NC_012660	TCAA	2	8	5213850	5213857	50 %	25 %	0 %	25 %	229592138
110106	NC_012660	CGG	2	6	5213950	5213955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592138
110107	NC_012660	CAAGC	2	10	5214004	5214013	40 %	0 %	20 %	40 %	229592138
110108	NC_012660	GAA	2	6	5214119	5214124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110109	NC_012660	CAC	2	6	5214177	5214182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592139
110110	NC_012660	TGC	2	6	5214212	5214217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592139
110111	NC_012660	ATC	2	6	5214238	5214243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229592139
110112	NC_012660	CAGC	2	8	5214258	5214265	25 %	0 %	25 %	50 %	229592139
110113	NC_012660	CGG	2	6	5214300	5214305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592139
110114	NC_012660	CCCTGG	2	12	5214308	5214319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229592139
110115	NC_012660	ACG	2	6	5214389	5214394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592139
110116	NC_012660	CCG	2	6	5214476	5214481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592139
110117	NC_012660	CGC	2	6	5214516	5214521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592139
110118	NC_012660	GA	3	6	5214560	5214565	50 %	0 %	50 %	0 %	229592139
110119	NC_012660	GCT	2	6	5214591	5214596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592139
110120	NC_012660	CGC	2	6	5214684	5214689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592139
110121	NC_012660	GCA	2	6	5214701	5214706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592139
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110124	NC_012660	GAC	3	9	5214862	5214870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592139
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110126	NC_012660	GC	3	6	5214943	5214948	0 %	0 %	50 %	50 %	229592140
110127	NC_012660	GGC	2	6	5214992	5214997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592140
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110223	NC_012660	GTC	2	6	5219594	5219599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229592144
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110226	NC_012660	GCA	2	6	5219710	5219715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592144
110227	NC_012660	TACTTC	2	12	5219765	5219776	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	229592144
110228	NC_012660	CAG	2	6	5219799	5219804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110229	NC_012660	ATCA	2	8	5219822	5219829	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110230	NC_012660	ACT	2	6	5219865	5219870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110231	NC_012660	CGG	2	6	5219902	5219907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110232	NC_012660	A	6	6	5219952	5219957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110233	NC_012660	GCA	2	6	5220022	5220027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110234	NC_012660	TTTG	2	8	5220113	5220120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110235	NC_012660	TTG	2	6	5220351	5220356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110236	NC_012660	T	6	6	5220395	5220400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110237	NC_012660	A	6	6	5220424	5220429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110238	NC_012660	AAT	2	6	5220452	5220457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110239	NC_012660	A	6	6	5220595	5220600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110240	NC_012660	TTC	2	6	5220622	5220627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229592145
110241	NC_012660	TCTT	2	8	5220635	5220642	0 %	75 %	0 %	25 %	229592145
110242	NC_012660	CACGGT	2	12	5220730	5220741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229592145
110243	NC_012660	ACG	2	6	5220778	5220783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592145
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110245	NC_012660	A	8	8	5220841	5220848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110246	NC_012660	GC	4	8	5220902	5220909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110247	NC_012660	A	7	7	5220929	5220935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110248	NC_012660	GCAC	2	8	5221021	5221028	25 %	0 %	25 %	50 %	229592146
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110252	NC_012660	TCCGC	2	10	5221247	5221256	0 %	20 %	20 %	60 %	229592146
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110262	NC_012660	GC	3	6	5221886	5221891	0 %	0 %	50 %	50 %	229592146
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110338	NC_012660	CG	3	6	5225610	5225615	0 %	0 %	50 %	50 %	229592148
110339	NC_012660	CCTTG	2	10	5225645	5225654	0 %	40 %	20 %	40 %	229592148
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110342	NC_012660	GGTCCA	2	12	5225729	5225740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229592148
110343	NC_012660	GGGCTG	2	12	5225766	5225777	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	229592148
110344	NC_012660	CCG	2	6	5225792	5225797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592148
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110346	NC_012660	CGA	2	6	5225837	5225842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592148
110347	NC_012660	CGC	2	6	5225852	5225857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229592148
110348	NC_012660	CAG	2	6	5225880	5225885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592148
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110462	NC_012660	CAG	2	6	5230459	5230464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592153
110463	NC_012660	CATC	2	8	5230500	5230507	25 %	25 %	0 %	50 %	229592153
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110489	NC_012660	CACC	2	8	5231546	5231553	25 %	0 %	0 %	75 %	229592154
110490	NC_012660	ACC	2	6	5231587	5231592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229592154
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110492	NC_012660	GCG	2	6	5231620	5231625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229592154
110493	NC_012660	GGCGT	2	10	5231668	5231677	0 %	20 %	60 %	20 %	229592154
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110496	NC_012660	AGC	2	6	5231885	5231890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229592154
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110500	NC_012660	AAC	2	6	5232067	5232072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229592154

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