MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012660	ATG	2	6	217850	217855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587768
4502	NC_012660	GGC	2	6	217896	217901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587768
4503	NC_012660	CCG	2	6	217927	217932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587768
4504	NC_012660	CTG	2	6	217951	217956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587768
4505	NC_012660	GCT	2	6	218037	218042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587768
4506	NC_012660	GAT	2	6	218043	218048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587768
4507	NC_012660	CGC	2	6	218080	218085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587768
4508	NC_012660	AGG	2	6	218102	218107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587768
4509	NC_012660	AGC	2	6	218285	218290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587769
4510	NC_012660	GTA	2	6	218374	218379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587769
4511	NC_012660	TGC	2	6	218421	218426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587769
4512	NC_012660	CTG	2	6	218458	218463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587769
4513	NC_012660	GCG	2	6	218627	218632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587769
4514	NC_012660	GGT	2	6	218688	218693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587770
4515	NC_012660	CGG	2	6	218711	218716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587770
4516	NC_012660	GC	3	6	218744	218749	0 %	0 %	50 %	50 %	229587770
4517	NC_012660	GC	3	6	218771	218776	0 %	0 %	50 %	50 %	229587770
4518	NC_012660	CGC	3	9	218807	218815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587770
4519	NC_012660	AGCAAC	2	12	218818	218829	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229587770
4520	NC_012660	TTG	2	6	218863	218868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587770
4521	NC_012660	GC	3	6	218872	218877	0 %	0 %	50 %	50 %	229587770
4522	NC_012660	TGGC	2	8	218932	218939	0 %	25 %	50 %	25 %	229587770
4523	NC_012660	TGT	2	6	218945	218950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587770
4524	NC_012660	CCA	2	6	218978	218983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587770
4525	NC_012660	GCC	2	6	218991	218996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587770
4526	NC_012660	GCG	2	6	219016	219021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587770
4527	NC_012660	GC	3	6	219054	219059	0 %	0 %	50 %	50 %	229587770
4528	NC_012660	GGC	2	6	219120	219125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587770
4529	NC_012660	TGA	2	6	219220	219225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_012660	GTT	2	6	219264	219269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_012660	GCGCA	2	10	219292	219301	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4532	NC_012660	GGCT	2	8	219321	219328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4533	NC_012660	ATGGC	2	10	219350	219359	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4534	NC_012660	TTG	2	6	219371	219376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012660	CGC	2	6	219470	219475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_012660	CGGG	2	8	219494	219501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_012660	TGG	2	6	219575	219580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_012660	GAA	2	6	219588	219593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_012660	GCG	2	6	219600	219605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_012660	TGAT	2	8	219619	219626	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_012660	GCCATC	2	12	219647	219658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_012660	CCATCA	2	12	219725	219736	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_012660	ACCT	2	8	219743	219750	25 %	25 %	0 %	50 %	229587771
4544	NC_012660	ATCC	2	8	219757	219764	25 %	25 %	0 %	50 %	229587771
4545	NC_012660	CG	3	6	219803	219808	0 %	0 %	50 %	50 %	229587771
4546	NC_012660	GCT	2	6	219815	219820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587771
4547	NC_012660	GCA	2	6	219883	219888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587771
4548	NC_012660	CATT	2	8	219906	219913	25 %	50 %	0 %	25 %	229587771
4549	NC_012660	CG	3	6	220040	220045	0 %	0 %	50 %	50 %	229587771
4550	NC_012660	GCG	2	6	220161	220166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587771
4551	NC_012660	A	6	6	220193	220198	100 %	0 %	0 %	0 %	229587771
4552	NC_012660	CGC	2	6	220319	220324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587771
4553	NC_012660	GCA	2	6	220372	220377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587771
4554	NC_012660	ACC	2	6	220434	220439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587771
4555	NC_012660	CCA	2	6	220489	220494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587771
4556	NC_012660	GTG	2	6	220599	220604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587771
4557	NC_012660	TGT	2	6	220641	220646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587771
4558	NC_012660	GCAC	2	8	220663	220670	25 %	0 %	25 %	50 %	229587771
4559	NC_012660	GCT	2	6	220702	220707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587771
4560	NC_012660	AATA	2	8	220834	220841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_012660	CAG	2	6	220879	220884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4562	NC_012660	GTG	2	6	220921	220926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587772
4563	NC_012660	GCA	2	6	220953	220958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4564	NC_012660	TGC	2	6	220967	220972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4565	NC_012660	TGG	2	6	221021	221026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587772
4566	NC_012660	CGG	2	6	221030	221035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587772
4567	NC_012660	TGG	2	6	221062	221067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587772
4568	NC_012660	GCCT	2	8	221068	221075	0 %	25 %	25 %	50 %	229587772
4569	NC_012660	GCT	2	6	221076	221081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4570	NC_012660	TGA	2	6	221171	221176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587772
4571	NC_012660	TGGC	2	8	221188	221195	0 %	25 %	50 %	25 %	229587772
4572	NC_012660	GCACCT	2	12	221229	221240	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	229587772
4573	NC_012660	GC	3	6	221283	221288	0 %	0 %	50 %	50 %	229587772
4574	NC_012660	GC	3	6	221317	221322	0 %	0 %	50 %	50 %	229587772
4575	NC_012660	ATC	2	6	221401	221406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587772
4576	NC_012660	GCT	2	6	221415	221420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4577	NC_012660	CGC	2	6	221429	221434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587772
4578	NC_012660	GCT	2	6	221439	221444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4579	NC_012660	GCC	2	6	221482	221487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587772
4580	NC_012660	GAT	2	6	221544	221549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587772
4581	NC_012660	CGC	2	6	221565	221570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587772
4582	NC_012660	GTG	2	6	221572	221577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587772
4583	NC_012660	ATC	2	6	221578	221583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587772
4584	NC_012660	TGC	2	6	221594	221599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4585	NC_012660	ACT	2	6	221636	221641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587772
4586	NC_012660	CAG	2	6	221671	221676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4587	NC_012660	TGG	2	6	221695	221700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587772
4588	NC_012660	GCA	2	6	221735	221740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587772
4589	NC_012660	GCGT	2	8	221831	221838	0 %	25 %	50 %	25 %	229587772
4590	NC_012660	CAC	2	6	221936	221941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587773
4591	NC_012660	TCG	2	6	221949	221954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4592	NC_012660	CTG	2	6	221960	221965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4593	NC_012660	CG	3	6	222116	222121	0 %	0 %	50 %	50 %	229587773
4594	NC_012660	GTC	3	9	222152	222160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4595	NC_012660	GCG	2	6	222214	222219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587773
4596	NC_012660	ACGC	2	8	222254	222261	25 %	0 %	25 %	50 %	229587773
4597	NC_012660	GGT	2	6	222380	222385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587773
4598	NC_012660	TGT	2	6	222481	222486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587773
4599	NC_012660	AGGT	2	8	222501	222508	25 %	25 %	50 %	0 %	229587773
4600	NC_012660	CAG	2	6	222542	222547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4601	NC_012660	CTG	2	6	222605	222610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4602	NC_012660	CCA	2	6	222622	222627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587773
4603	NC_012660	CGC	2	6	222662	222667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587773
4604	NC_012660	TCG	2	6	222705	222710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4605	NC_012660	GGC	2	6	222716	222721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587773
4606	NC_012660	GCA	2	6	222811	222816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4607	NC_012660	CGT	2	6	222829	222834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4608	NC_012660	CGA	2	6	222853	222858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587773
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4611	NC_012660	GGA	2	6	222974	222979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587773
4612	NC_012660	GTC	2	6	223013	223018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4613	NC_012660	TCG	2	6	223065	223070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4614	NC_012660	GGC	2	6	223097	223102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587773
4615	NC_012660	CAA	2	6	223109	223114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587773
4616	NC_012660	GAAC	2	8	223118	223125	50 %	0 %	25 %	25 %	229587773
4617	NC_012660	CGG	2	6	223156	223161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587773
4618	NC_012660	TCA	2	6	223186	223191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587773
4619	NC_012660	GCA	2	6	223213	223218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4620	NC_012660	CCA	2	6	223231	223236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587773
4621	NC_012660	TGG	2	6	223323	223328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587773
4622	NC_012660	AGC	2	6	223341	223346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587773
4623	NC_012660	GCG	2	6	223426	223431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587773
4624	NC_012660	T	6	6	223528	223533	0 %	100 %	0 %	0 %	229587774
4625	NC_012660	CAG	2	6	223534	223539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587774
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4627	NC_012660	GCA	2	6	223616	223621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587774
4628	NC_012660	TTC	2	6	223623	223628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587774
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4633	NC_012660	GTG	2	6	223780	223785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587774
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4651	NC_012660	CCAG	2	8	224533	224540	25 %	0 %	25 %	50 %	229587775
4652	NC_012660	TCAGGC	2	12	224548	224559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229587775
4653	NC_012660	GCG	2	6	224583	224588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587775
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4670	NC_012660	GCAGC	2	10	225361	225370	20 %	0 %	40 %	40 %	229587775
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4684	NC_012660	GCCA	2	8	225810	225817	25 %	0 %	25 %	50 %	229587775
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4687	NC_012660	CGTGG	2	10	225882	225891	0 %	20 %	60 %	20 %	229587775
4688	NC_012660	GGA	2	6	225938	225943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4689	NC_012660	GAT	2	6	225999	226004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4690	NC_012660	GAA	2	6	226060	226065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4691	NC_012660	TGG	2	6	226257	226262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587776
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4701	NC_012660	GCCA	2	8	226700	226707	25 %	0 %	25 %	50 %	229587776
4702	NC_012660	TGAG	2	8	226713	226720	25 %	25 %	50 %	0 %	229587776
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4728	NC_012660	GC	3	6	227718	227723	0 %	0 %	50 %	50 %	229587777
4729	NC_012660	GC	3	6	227866	227871	0 %	0 %	50 %	50 %	229587777
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4731	NC_012660	TCACT	2	10	227955	227964	20 %	40 %	0 %	40 %	229587777
4732	NC_012660	GGC	2	6	227974	227979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587777
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4736	NC_012660	CAG	2	6	228356	228361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4737	NC_012660	TCA	2	6	228373	228378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4738	NC_012660	CGC	2	6	228389	228394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587778
4739	NC_012660	GCCG	2	8	228441	228448	0 %	0 %	50 %	50 %	229587778
4740	NC_012660	GCC	2	6	228495	228500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587778
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4742	NC_012660	GGT	2	6	228539	228544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587778
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4986	NC_012660	GGC	2	6	239426	239431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587787
4987	NC_012660	TGG	2	6	239476	239481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587787
4988	NC_012660	CCTGC	2	10	239514	239523	0 %	20 %	20 %	60 %	229587787
4989	NC_012660	CCGA	2	8	239541	239548	25 %	0 %	25 %	50 %	229587787
4990	NC_012660	TGC	2	6	239551	239556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587787
4991	NC_012660	CCCA	2	8	239562	239569	25 %	0 %	0 %	75 %	229587787
4992	NC_012660	GGT	2	6	239570	239575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587787
4993	NC_012660	CCA	2	6	239690	239695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587787
4994	NC_012660	GCC	2	6	239737	239742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587787
4995	NC_012660	GCCA	2	8	239843	239850	25 %	0 %	25 %	50 %	229587788
4996	NC_012660	CTG	2	6	239851	239856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587788
4997	NC_012660	A	6	6	239873	239878	100 %	0 %	0 %	0 %	229587788
4998	NC_012660	TTG	2	6	239912	239917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587788
4999	NC_012660	CGCGC	2	10	239958	239967	0 %	0 %	40 %	60 %	229587788
5000	NC_012660	GCT	2	6	240012	240017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587788

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