MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 141750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012660	GCA	2	6	18	23	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587579
2	NC_012660	CTGC	2	8	49	56	0 %	25 %	25 %	50 %	229587579
3	NC_012660	CGA	2	6	105	110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587579
4	NC_012660	TTA	2	6	226	231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587579
5	NC_012660	GCA	2	6	236	241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587579
6	NC_012660	TGC	2	6	261	266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587579
7	NC_012660	GCT	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587579
8	NC_012660	GGC	2	6	306	311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587579
9	NC_012660	GAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587579
10	NC_012660	GAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587579
11	NC_012660	CG	3	6	389	394	0 %	0 %	50 %	50 %	229587579
12	NC_012660	CACGTT	2	12	504	515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229587579
13	NC_012660	TCG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587579
14	NC_012660	GCC	2	6	559	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587579
15	NC_012660	CT	3	6	602	607	0 %	50 %	0 %	50 %	229587579
16	NC_012660	TGG	2	6	615	620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587579
17	NC_012660	ACC	2	6	662	667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587579
18	NC_012660	AGA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587579
19	NC_012660	CAG	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587579
20	NC_012660	GAA	2	6	937	942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587579
21	NC_012660	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587579
22	NC_012660	TGA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587579
23	NC_012660	TGC	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587579
24	NC_012660	CGTG	2	8	1098	1105	0 %	25 %	50 %	25 %	229587579
25	NC_012660	CGCACT	2	12	1136	1147	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	229587579
26	NC_012660	TTG	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587579
27	NC_012660	CTG	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587579
28	NC_012660	ACCA	2	8	1354	1361	50 %	0 %	0 %	50 %	229587579
29	NC_012660	GGCG	2	8	1390	1397	0 %	0 %	75 %	25 %	229587579
30	NC_012660	ACCAC	2	10	1400	1409	40 %	0 %	0 %	60 %	229587579
31	NC_012660	CTG	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587579
32	NC_012660	TGA	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587579
33	NC_012660	TTA	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012660	CGT	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587580
35	NC_012660	TGG	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587580
36	NC_012660	TGGT	2	8	1702	1709	0 %	50 %	50 %	0 %	229587580
37	NC_012660	CCG	2	6	1729	1734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587580
38	NC_012660	GC	3	6	1758	1763	0 %	0 %	50 %	50 %	229587580
39	NC_012660	ACG	2	6	1795	1800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587580
40	NC_012660	TGA	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587580
41	NC_012660	GTC	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587580
42	NC_012660	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587580
43	NC_012660	AGCAA	2	10	1936	1945	60 %	0 %	20 %	20 %	229587580
44	NC_012660	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587580
45	NC_012660	TTGA	2	8	1956	1963	25 %	50 %	25 %	0 %	229587580
46	NC_012660	CAG	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587580
47	NC_012660	TAC	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587580
48	NC_012660	CAC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587580
49	NC_012660	TGC	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587580
50	NC_012660	AAC	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587580
51	NC_012660	GAA	2	6	2445	2450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587580
52	NC_012660	GAA	3	9	2454	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587580
53	NC_012660	CGG	2	6	2480	2485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587580
54	NC_012660	CTG	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587580
55	NC_012660	TGA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587580
56	NC_012660	CAG	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587580
57	NC_012660	ACG	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587580
58	NC_012660	CGT	2	6	2624	2629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587580
59	NC_012660	CAG	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012660	TCCCCC	2	12	2726	2737	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	229587581
61	NC_012660	TCC	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587581
62	NC_012660	GCTG	2	8	2893	2900	0 %	25 %	50 %	25 %	229587581
63	NC_012660	CGG	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587581
64	NC_012660	TGC	2	6	2983	2988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587581
65	NC_012660	CGC	2	6	3184	3189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587581
66	NC_012660	CGA	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587581
67	NC_012660	CCG	2	6	3247	3252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587581
68	NC_012660	TGAG	2	8	3294	3301	25 %	25 %	50 %	0 %	229587581
69	NC_012660	TAC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587581
70	NC_012660	AGTGC	2	10	3365	3374	20 %	20 %	40 %	20 %	229587581
71	NC_012660	GC	3	6	3456	3461	0 %	0 %	50 %	50 %	229587581
72	NC_012660	TGC	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587581
73	NC_012660	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587581
74	NC_012660	TGG	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587581
75	NC_012660	TG	3	6	3507	3512	0 %	50 %	50 %	0 %	229587581
76	NC_012660	TGG	2	6	3573	3578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587581
77	NC_012660	AGC	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587581
78	NC_012660	CCG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587581
79	NC_012660	CG	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	229587581
80	NC_012660	TTG	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587581
81	NC_012660	GAA	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587581
82	NC_012660	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587581
83	NC_012660	GAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587582
84	NC_012660	TGA	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587582
85	NC_012660	CAC	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587582
86	NC_012660	GGT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587582
87	NC_012660	CGA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
88	NC_012660	CGA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
89	NC_012660	ATC	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587582
90	NC_012660	AGA	2	6	4034	4039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587582
91	NC_012660	CGG	2	6	4048	4053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587582
92	NC_012660	TCA	2	6	4060	4065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587582
93	NC_012660	CGG	2	6	4082	4087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587582
94	NC_012660	CGA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
95	NC_012660	GGT	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587582
96	NC_012660	GGCGTG	2	12	4131	4142	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	229587582
97	NC_012660	GAA	2	6	4164	4169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587582
98	NC_012660	TCG	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587582
99	NC_012660	TCCT	2	8	4362	4369	0 %	50 %	0 %	50 %	229587582
100	NC_012660	GGT	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587582
101	NC_012660	CAA	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587582
102	NC_012660	TGT	2	6	4576	4581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587582
103	NC_012660	CAA	2	6	4589	4594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587582
104	NC_012660	TGG	2	6	4624	4629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587582
105	NC_012660	TTCCG	2	10	4632	4641	0 %	40 %	20 %	40 %	229587582
106	NC_012660	AAG	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587582
107	NC_012660	CCA	2	6	4705	4710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587582
108	NC_012660	CTG	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587582
109	NC_012660	CGAA	2	8	4873	4880	50 %	0 %	25 %	25 %	229587582
110	NC_012660	GTC	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587582
111	NC_012660	GAT	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587582
112	NC_012660	CCG	2	6	4955	4960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587582
113	NC_012660	GC	3	6	4966	4971	0 %	0 %	50 %	50 %	229587582
114	NC_012660	TGG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587582
115	NC_012660	CTG	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587582
116	NC_012660	GAT	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587582
117	NC_012660	TTC	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587582
118	NC_012660	CGA	2	6	5219	5224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
119	NC_012660	ACA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587582
120	NC_012660	CAT	4	12	5255	5266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587582
121	NC_012660	CTT	3	9	5315	5323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587582
122	NC_012660	GCC	2	6	5372	5377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587582
123	NC_012660	GCAA	2	8	5398	5405	50 %	0 %	25 %	25 %	229587582
124	NC_012660	GAC	3	9	5421	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
125	NC_012660	ACG	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
126	NC_012660	CCGT	2	8	5616	5623	0 %	25 %	25 %	50 %	229587582
127	NC_012660	CA	3	6	5650	5655	50 %	0 %	0 %	50 %	229587582
128	NC_012660	TGGC	2	8	5664	5671	0 %	25 %	50 %	25 %	229587582
129	NC_012660	AACGT	2	10	5746	5755	40 %	20 %	20 %	20 %	229587582
130	NC_012660	CTT	2	6	5819	5824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587582
131	NC_012660	GCA	2	6	5827	5832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
132	NC_012660	GTA	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587582
133	NC_012660	GC	3	6	5860	5865	0 %	0 %	50 %	50 %	229587582
134	NC_012660	GCT	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587582
135	NC_012660	GAC	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587582
136	NC_012660	AAG	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587582
137	NC_012660	AAG	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587582
138	NC_012660	ACC	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587582
139	NC_012660	TGC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587582
140	NC_012660	TCG	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587582
141	NC_012660	T	6	6	6240	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012660	CT	3	6	6324	6329	0 %	50 %	0 %	50 %	229587583
143	NC_012660	GATA	2	8	6406	6413	50 %	25 %	25 %	0 %	229587583
144	NC_012660	CGA	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587583
145	NC_012660	TTC	2	6	6443	6448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587583
146	NC_012660	CCCG	2	8	6558	6565	0 %	0 %	25 %	75 %	229587583
147	NC_012660	CAT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587583
148	NC_012660	GTC	2	6	6710	6715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587583
149	NC_012660	ATG	2	6	6771	6776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587583
150	NC_012660	CGG	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587583
151	NC_012660	GCA	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587583
152	NC_012660	CAG	2	6	6860	6865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587583
153	NC_012660	GCA	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587583
154	NC_012660	CGG	2	6	6940	6945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587583
155	NC_012660	TGGG	2	8	7021	7028	0 %	25 %	75 %	0 %	229587583
156	NC_012660	GAA	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012660	TC	3	6	7142	7147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_012660	TGA	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587584
159	NC_012660	GCGCC	2	10	7340	7349	0 %	0 %	40 %	60 %	229587584
160	NC_012660	C	6	6	7352	7357	0 %	0 %	0 %	100 %	229587584
161	NC_012660	ATT	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587584
162	NC_012660	TGG	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587584
163	NC_012660	GGC	2	6	7388	7393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587584
164	NC_012660	GTTC	2	8	7401	7408	0 %	50 %	25 %	25 %	229587584
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167	NC_012660	GGT	2	6	7670	7675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587584
168	NC_012660	AGGCC	2	10	7685	7694	20 %	0 %	40 %	40 %	229587584
169	NC_012660	GCAC	2	8	7774	7781	25 %	0 %	25 %	50 %	229587584
170	NC_012660	GGAC	2	8	7826	7833	25 %	0 %	50 %	25 %	229587584
171	NC_012660	CGC	2	6	7949	7954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587584
172	NC_012660	GGAG	2	8	8180	8187	25 %	0 %	75 %	0 %	229587584
173	NC_012660	TCT	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587584
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176	NC_012660	CTG	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587585
177	NC_012660	GGCCT	2	10	8376	8385	0 %	20 %	40 %	40 %	229587585
178	NC_012660	AAT	2	6	8388	8393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587585
179	NC_012660	GCC	2	6	8413	8418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587585
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212	NC_012660	TGCG	2	8	9910	9917	0 %	25 %	50 %	25 %	229587585
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228	NC_012660	A	6	6	10549	10554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_012660	T	7	7	10572	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_012660	A	6	6	10585	10590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_012660	GTAA	2	8	10632	10639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
232	NC_012660	CTT	2	6	10645	10650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_012660	CAA	2	6	10674	10679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
234	NC_012660	GGTCA	2	10	10704	10713	20 %	20 %	40 %	20 %	229587586
235	NC_012660	GGC	2	6	10740	10745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587586
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241	NC_012660	CCG	2	6	10965	10970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587586
242	NC_012660	AGC	2	6	11046	11051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587586
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245	NC_012660	GCC	2	6	11082	11087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587586
246	NC_012660	GCA	2	6	11119	11124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587586
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249	NC_012660	TGG	2	6	11229	11234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587586
250	NC_012660	GC	3	6	11360	11365	0 %	0 %	50 %	50 %	229587586
251	NC_012660	A	6	6	11390	11395	100 %	0 %	0 %	0 %	229587586
252	NC_012660	CAG	2	6	11432	11437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587586
253	NC_012660	GGC	2	6	11477	11482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_012660	GTT	2	6	11562	11567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587587
255	NC_012660	GCC	2	6	11587	11592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587587
256	NC_012660	GCC	2	6	11692	11697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587587
257	NC_012660	CGA	2	6	11720	11725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587587
258	NC_012660	ACC	2	6	11833	11838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587587
259	NC_012660	CCA	2	6	11864	11869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587587
260	NC_012660	GC	3	6	11880	11885	0 %	0 %	50 %	50 %	229587587
261	NC_012660	TAA	2	6	11914	11919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587587
262	NC_012660	TGGT	2	8	11938	11945	0 %	50 %	50 %	0 %	229587587
263	NC_012660	TCGA	2	8	11992	11999	25 %	25 %	25 %	25 %	229587587
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391	NC_012660	CAG	2	6	17765	17770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587593
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394	NC_012660	GAT	2	6	17855	17860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587593
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474	NC_012660	ATA	2	6	21605	21610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_012660	GGC	3	9	23068	23076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587598
499	NC_012660	GAT	2	6	23077	23082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587598
500	NC_012660	CGCCC	2	10	23122	23131	0 %	0 %	20 %	80 %	229587598

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