MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Persephonella marina EX-H1 chromosome

Total Repeats: 44711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_012440	A	7	7	1921596	1921602	100 %	0 %	0 %	0 %	225851535
44502	NC_012440	AAG	2	6	1921671	1921676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225851535
44503	NC_012440	ATT	2	6	1921701	1921706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225851535
44504	NC_012440	CTTT	2	8	1921716	1921723	0 %	75 %	0 %	25 %	225851536
44505	NC_012440	TTC	2	6	1921762	1921767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225851536
44506	NC_012440	TCA	2	6	1921826	1921831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851536
44507	NC_012440	TC	3	6	1921843	1921848	0 %	50 %	0 %	50 %	225851536
44508	NC_012440	CT	4	8	1921873	1921880	0 %	50 %	0 %	50 %	225851536
44509	NC_012440	GA	3	6	1921924	1921929	50 %	0 %	50 %	0 %	225851536
44510	NC_012440	AG	3	6	1921946	1921951	50 %	0 %	50 %	0 %	225851536
44511	NC_012440	ATCT	2	8	1921956	1921963	25 %	50 %	0 %	25 %	225851536
44512	NC_012440	TTG	2	6	1922019	1922024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225851536
44513	NC_012440	A	6	6	1922074	1922079	100 %	0 %	0 %	0 %	225851536
44514	NC_012440	CCT	2	6	1922099	1922104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44515	NC_012440	T	8	8	1922104	1922111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44516	NC_012440	TTAA	2	8	1922120	1922127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44517	NC_012440	A	7	7	1922126	1922132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44518	NC_012440	ATA	2	6	1922142	1922147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44519	NC_012440	AAC	2	6	1922164	1922169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44520	NC_012440	TAAT	2	8	1922186	1922193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44521	NC_012440	AAAAT	2	10	1922249	1922258	80 %	20 %	0 %	0 %	225851537
44522	NC_012440	TAT	2	6	1922263	1922268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225851537
44523	NC_012440	ATA	2	6	1922300	1922305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225851537
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44525	NC_012440	ATA	2	6	1922396	1922401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225851537
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44527	NC_012440	ACA	2	6	1922475	1922480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225851537
44528	NC_012440	AT	3	6	1922489	1922494	50 %	50 %	0 %	0 %	225851537
44529	NC_012440	TA	3	6	1922540	1922545	50 %	50 %	0 %	0 %	225851537
44530	NC_012440	GAC	2	6	1922549	1922554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225851537
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44533	NC_012440	T	6	6	1922734	1922739	0 %	100 %	0 %	0 %	225851537
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44536	NC_012440	GA	3	6	1923024	1923029	50 %	0 %	50 %	0 %	225851538
44537	NC_012440	AGA	2	6	1923063	1923068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225851538
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44540	NC_012440	AGA	2	6	1923134	1923139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225851538
44541	NC_012440	A	6	6	1923153	1923158	100 %	0 %	0 %	0 %	225851538
44542	NC_012440	CTT	2	6	1923183	1923188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225851538
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44544	NC_012440	AT	3	6	1923208	1923213	50 %	50 %	0 %	0 %	225851538
44545	NC_012440	GAAAA	2	10	1923225	1923234	80 %	0 %	20 %	0 %	225851538
44546	NC_012440	A	7	7	1923231	1923237	100 %	0 %	0 %	0 %	225851538
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44550	NC_012440	A	6	6	1923411	1923416	100 %	0 %	0 %	0 %	225851539
44551	NC_012440	A	6	6	1923433	1923438	100 %	0 %	0 %	0 %	225851539
44552	NC_012440	CAGA	2	8	1923446	1923453	50 %	0 %	25 %	25 %	225851539
44553	NC_012440	GTTCTG	2	12	1923488	1923499	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225851539
44554	NC_012440	GCA	2	6	1923512	1923517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225851539
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44557	NC_012440	TCA	2	6	1923710	1923715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851540
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44570	NC_012440	ACA	2	6	1924268	1924273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225851540
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44582	NC_012440	ACA	2	6	1924997	1925002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225851540
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44587	NC_012440	GAT	2	6	1925401	1925406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44588	NC_012440	TCAGCA	2	12	1925411	1925422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44589	NC_012440	AT	3	6	1925448	1925453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44592	NC_012440	ACC	2	6	1925630	1925635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225851541
44593	NC_012440	ATC	2	6	1925738	1925743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851541
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44601	NC_012440	CTG	2	6	1926334	1926339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225851541
44602	NC_012440	AGC	2	6	1926395	1926400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225851541
44603	NC_012440	TAA	2	6	1926407	1926412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225851541
44604	NC_012440	GCT	2	6	1926417	1926422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225851541
44605	NC_012440	TCT	2	6	1926440	1926445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225851541
44606	NC_012440	CCT	2	6	1926455	1926460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44607	NC_012440	ATTTA	2	10	1926469	1926478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44608	NC_012440	TCA	2	6	1926532	1926537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851542
44609	NC_012440	TCA	2	6	1926559	1926564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851542
44610	NC_012440	ACA	2	6	1926604	1926609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225851542
44611	NC_012440	TA	4	8	1926626	1926633	50 %	50 %	0 %	0 %	225851542
44612	NC_012440	TCA	2	6	1926799	1926804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851542
44613	NC_012440	CTT	2	6	1926816	1926821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225851542
44614	NC_012440	TAT	2	6	1926867	1926872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225851542
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44617	NC_012440	CAA	2	6	1926917	1926922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225851542
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44619	NC_012440	CAT	2	6	1927052	1927057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851542
44620	NC_012440	AAACC	2	10	1927084	1927093	60 %	0 %	0 %	40 %	225851542
44621	NC_012440	AGC	2	6	1927110	1927115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225851542
44622	NC_012440	GAA	2	6	1927138	1927143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225851542
44623	NC_012440	AAG	2	6	1927182	1927187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225851542
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44625	NC_012440	ACC	3	9	1927275	1927283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225851542
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44652	NC_012440	TCA	2	6	1928123	1928128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225851543
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44674	NC_012440	TC	3	6	1928940	1928945	0 %	50 %	0 %	50 %	225851544
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.