MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 plasmid pPAES01

Total Repeats: 1388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011061	ATC	2	6	48338	48343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335168
1002	NC_011061	TTGTG	2	10	48429	48438	0 %	60 %	40 %	0 %	194335168
1003	NC_011061	TAT	2	6	48460	48465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335168
1004	NC_011061	CCA	2	6	48474	48479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194335168
1005	NC_011061	TGC	2	6	48488	48493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335168
1006	NC_011061	CTT	2	6	48535	48540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335168
1007	NC_011061	CGG	2	6	48584	48589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335168
1008	NC_011061	CCG	2	6	48628	48633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335168
1009	NC_011061	A	6	6	48684	48689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011061	T	6	6	48710	48715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011061	TAA	2	6	48855	48860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011061	CTT	2	6	48905	48910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_011061	CTGC	2	8	48969	48976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_011061	AGA	2	6	48993	48998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011061	TGG	2	6	49002	49007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011061	TGA	2	6	49013	49018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011061	TCC	2	6	49029	49034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_011061	TGT	2	6	49142	49147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011061	TTG	2	6	49149	49154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011061	ATC	2	6	49283	49288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011061	GAC	2	6	49300	49305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011061	GTAA	2	8	49318	49325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011061	A	6	6	49356	49361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011061	CTT	2	6	49482	49487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335169
1025	NC_011061	TCC	2	6	49530	49535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335169
1026	NC_011061	TTC	2	6	49538	49543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335169
1027	NC_011061	GCT	2	6	49555	49560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335169
1028	NC_011061	GTG	2	6	49654	49659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335169
1029	NC_011061	GCC	2	6	49665	49670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335169
1030	NC_011061	CTGC	2	8	49784	49791	0 %	25 %	25 %	50 %	194335169
1031	NC_011061	TGCA	2	8	49798	49805	25 %	25 %	25 %	25 %	194335169
1032	NC_011061	CGCT	2	8	49838	49845	0 %	25 %	25 %	50 %	194335169
1033	NC_011061	T	6	6	49881	49886	0 %	100 %	0 %	0 %	194335169
1034	NC_011061	GGC	2	6	49949	49954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335169
1035	NC_011061	A	6	6	50092	50097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011061	ATT	2	6	50130	50135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335170
1037	NC_011061	T	7	7	50139	50145	0 %	100 %	0 %	0 %	194335170
1038	NC_011061	TC	3	6	50190	50195	0 %	50 %	0 %	50 %	194335170
1039	NC_011061	CTTTT	2	10	50256	50265	0 %	80 %	0 %	20 %	194335170
1040	NC_011061	CTA	2	6	50275	50280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335170
1041	NC_011061	GAT	2	6	50297	50302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335170
1042	NC_011061	CAA	2	6	50363	50368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335170
1043	NC_011061	ACG	2	6	50376	50381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335170
1044	NC_011061	TAATT	2	10	50413	50422	40 %	60 %	0 %	0 %	194335170
1045	NC_011061	ATA	2	6	50425	50430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335170
1046	NC_011061	TGAT	2	8	50445	50452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011061	TC	3	6	50488	50493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_011061	AGC	2	6	50565	50570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011061	ACC	2	6	50584	50589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_011061	CTG	2	6	50634	50639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011061	ATT	2	6	50644	50649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011061	TCC	2	6	50735	50740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335171
1053	NC_011061	CAC	2	6	50742	50747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194335171
1054	NC_011061	CTG	2	6	50755	50760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335171
1055	NC_011061	CAG	2	6	50847	50852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335171
1056	NC_011061	GCA	2	6	50855	50860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335171
1057	NC_011061	CAACA	2	10	51013	51022	60 %	0 %	0 %	40 %	194335171
1058	NC_011061	TCTG	2	8	51032	51039	0 %	50 %	25 %	25 %	194335171
1059	NC_011061	AGA	2	6	51072	51077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335171
1060	NC_011061	T	6	6	51088	51093	0 %	100 %	0 %	0 %	194335171
1061	NC_011061	ACA	2	6	51107	51112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335171
1062	NC_011061	A	7	7	51162	51168	100 %	0 %	0 %	0 %	194335171
1063	NC_011061	CAG	2	6	51180	51185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335171
1064	NC_011061	TTCC	2	8	51270	51277	0 %	50 %	0 %	50 %	194335171
1065	NC_011061	TGTTT	2	10	51659	51668	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011061	TTC	2	6	51779	51784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011061	TCC	2	6	51791	51796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_011061	CCG	2	6	51805	51810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_011061	CTTC	2	8	51825	51832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_011061	TTG	2	6	51857	51862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011061	TGA	2	6	51920	51925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011061	CAT	2	6	51932	51937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011061	T	6	6	51951	51956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011061	A	7	7	51989	51995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011061	AGGC	2	8	52005	52012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_011061	AAT	2	6	52101	52106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011061	CCA	2	6	52259	52264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_011061	ATG	2	6	52338	52343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011061	GCA	3	9	52373	52381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_011061	GGT	2	6	52404	52409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011061	TTC	2	6	52414	52419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_011061	TAC	2	6	52442	52447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_011061	CAT	2	6	52448	52453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011061	AG	3	6	52486	52491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011061	GGA	2	6	52587	52592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011061	GCCT	2	8	52617	52624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_011061	CAG	2	6	52637	52642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011061	CTG	2	6	52723	52728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011061	ATG	2	6	52732	52737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011061	TGC	2	6	52910	52915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011061	GGAT	2	8	52930	52937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011061	CATAC	2	10	53000	53009	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1093	NC_011061	TCG	2	6	53022	53027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011061	TCA	2	6	53140	53145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_011061	CGC	2	6	53156	53161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_011061	GTT	2	6	53276	53281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335172
1097	NC_011061	GGA	2	6	53293	53298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194335172
1098	NC_011061	AGT	2	6	53308	53313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335172
1099	NC_011061	AAT	2	6	53353	53358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335172
1100	NC_011061	GGA	2	6	53392	53397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194335172
1101	NC_011061	CCTG	2	8	53419	53426	0 %	25 %	25 %	50 %	194335172
1102	NC_011061	GGTA	2	8	53500	53507	25 %	25 %	50 %	0 %	194335172
1103	NC_011061	TGG	2	6	53559	53564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335172
1104	NC_011061	CTT	2	6	53608	53613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335172
1105	NC_011061	TGC	2	6	53630	53635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335172
1106	NC_011061	GAA	2	6	53663	53668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335172
1107	NC_011061	ATG	2	6	53675	53680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335172
1108	NC_011061	TGA	2	6	53681	53686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335172
1109	NC_011061	TCA	2	6	53716	53721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335172
1110	NC_011061	TTG	2	6	53757	53762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335172
1111	NC_011061	GTC	2	6	53783	53788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335172
1112	NC_011061	AT	3	6	53796	53801	50 %	50 %	0 %	0 %	194335172
1113	NC_011061	GAC	2	6	53843	53848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335172
1114	NC_011061	A	6	6	53855	53860	100 %	0 %	0 %	0 %	194335172
1115	NC_011061	TTC	2	6	53879	53884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335172
1116	NC_011061	TCA	2	6	53925	53930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335172
1117	NC_011061	TCTCCA	2	12	54025	54036	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	194335172
1118	NC_011061	A	6	6	54053	54058	100 %	0 %	0 %	0 %	194335172
1119	NC_011061	TTC	2	6	54170	54175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335172
1120	NC_011061	CAAA	2	8	54259	54266	75 %	0 %	0 %	25 %	194335172
1121	NC_011061	CTT	2	6	54275	54280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335172
1122	NC_011061	GTC	2	6	54314	54319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335172
1123	NC_011061	GCT	2	6	54381	54386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335173
1124	NC_011061	T	6	6	54397	54402	0 %	100 %	0 %	0 %	194335173
1125	NC_011061	GAGG	2	8	54454	54461	25 %	0 %	75 %	0 %	194335173
1126	NC_011061	T	6	6	54477	54482	0 %	100 %	0 %	0 %	194335173
1127	NC_011061	GTT	2	6	54483	54488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335173
1128	NC_011061	TTGT	2	8	54526	54533	0 %	75 %	25 %	0 %	194335173
1129	NC_011061	TAA	2	6	54585	54590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335173
1130	NC_011061	CTGT	2	8	54593	54600	0 %	50 %	25 %	25 %	194335173
1131	NC_011061	ACC	2	6	54700	54705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194335173
1132	NC_011061	CAA	2	6	54744	54749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335173
1133	NC_011061	TGTC	2	8	54771	54778	0 %	50 %	25 %	25 %	194335173
1134	NC_011061	GCT	2	6	54978	54983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335173
1135	NC_011061	T	6	6	54994	54999	0 %	100 %	0 %	0 %	194335173
1136	NC_011061	T	6	6	55074	55079	0 %	100 %	0 %	0 %	194335173
1137	NC_011061	CAT	2	6	55122	55127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335173
1138	NC_011061	T	6	6	55127	55132	0 %	100 %	0 %	0 %	194335173
1139	NC_011061	TAA	2	6	55196	55201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335173
1140	NC_011061	TACA	2	8	55257	55264	50 %	25 %	0 %	25 %	194335173
1141	NC_011061	TAC	2	6	55317	55322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335173
1142	NC_011061	TCA	2	6	55403	55408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335173
1143	NC_011061	TCCCA	2	10	55440	55449	20 %	20 %	0 %	60 %	194335173
1144	NC_011061	TCC	3	9	55477	55485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335173
1145	NC_011061	C	6	6	55518	55523	0 %	0 %	0 %	100 %	194335173
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1150	NC_011061	TCC	2	6	55662	55667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335174
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1153	NC_011061	GAGCT	2	10	55824	55833	20 %	20 %	40 %	20 %	194335174
1154	NC_011061	CTCA	2	8	55886	55893	25 %	25 %	0 %	50 %	194335174
1155	NC_011061	GCCT	2	8	55901	55908	0 %	25 %	25 %	50 %	194335174
1156	NC_011061	GAT	2	6	55928	55933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335174
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1162	NC_011061	TCA	2	6	56121	56126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335174
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1164	NC_011061	TTC	2	6	56210	56215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335174
1165	NC_011061	TTG	3	9	56237	56245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335174
1166	NC_011061	CTC	2	6	56246	56251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335174
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1170	NC_011061	T	6	6	56423	56428	0 %	100 %	0 %	0 %	194335174
1171	NC_011061	CCAG	2	8	56452	56459	25 %	0 %	25 %	50 %	194335174
1172	NC_011061	TGT	2	6	56476	56481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335174
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1202	NC_011061	TGG	2	6	57849	57854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335174
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1224	NC_011061	TCCA	2	8	58812	58819	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1225	NC_011061	C	6	6	58838	58843	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1226	NC_011061	TCA	2	6	58856	58861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1227	NC_011061	ACT	2	6	58911	58916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1229	NC_011061	GTA	2	6	58945	58950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1231	NC_011061	CAA	2	6	59028	59033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1232	NC_011061	GGT	2	6	59049	59054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1233	NC_011061	CTG	2	6	59059	59064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1234	NC_011061	CT	3	6	59071	59076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1243	NC_011061	CAT	2	6	59317	59322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335175
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1245	NC_011061	CCT	2	6	59374	59379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1246	NC_011061	AACA	2	8	59421	59428	75 %	0 %	0 %	25 %	194335176
1247	NC_011061	AAC	2	6	59454	59459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335176
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1250	NC_011061	A	6	6	59582	59587	100 %	0 %	0 %	0 %	194335176
1251	NC_011061	CCT	2	6	59672	59677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335176
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1253	NC_011061	CCT	2	6	59810	59815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335176
1254	NC_011061	CGT	2	6	59880	59885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335176
1255	NC_011061	CCT	2	6	59948	59953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335176
1256	NC_011061	CGT	2	6	60018	60023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335176
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1258	NC_011061	CGT	2	6	60156	60161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335176
1259	NC_011061	CCT	2	6	60224	60229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335176
1260	NC_011061	CCT	2	6	60362	60367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335176
1261	NC_011061	CGT	2	6	60432	60437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335176
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1353	NC_011061	GAT	2	6	65065	65070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1355	NC_011061	ACA	2	6	65217	65222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1382	NC_011061	TAT	2	6	66583	66588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1383	NC_011061	CAT	2	6	66601	66606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1384	NC_011061	CAA	2	6	66607	66612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1385	NC_011061	T	6	6	66654	66659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1386	NC_011061	T	7	7	66668	66674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1387	NC_011061	TA	3	6	66689	66694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1388	NC_011061	TCA	3	9	66749	66757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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