MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 chromosome

Total Repeats: 49907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_011059	GCC	2	6	2420856	2420861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335028
48003	NC_011059	A	6	6	2421086	2421091	100 %	0 %	0 %	0 %	194335029
48004	NC_011059	CG	3	6	2421099	2421104	0 %	0 %	50 %	50 %	194335029
48005	NC_011059	CCGA	2	8	2421201	2421208	25 %	0 %	25 %	50 %	194335029
48006	NC_011059	TGC	2	6	2421242	2421247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335029
48007	NC_011059	ATC	2	6	2421300	2421305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335029
48008	NC_011059	CG	4	8	2421392	2421399	0 %	0 %	50 %	50 %	194335029
48009	NC_011059	AG	3	6	2421460	2421465	50 %	0 %	50 %	0 %	194335029
48010	NC_011059	AGCA	2	8	2421504	2421511	50 %	0 %	25 %	25 %	194335029
48011	NC_011059	ATA	2	6	2421528	2421533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335029
48012	NC_011059	TCC	2	6	2421562	2421567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335029
48013	NC_011059	ATA	2	6	2421610	2421615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335029
48014	NC_011059	CTTTT	2	10	2421627	2421636	0 %	80 %	0 %	20 %	194335029
48015	NC_011059	CAAC	2	8	2421638	2421645	50 %	0 %	0 %	50 %	194335029
48016	NC_011059	GAA	2	6	2421700	2421705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335029
48017	NC_011059	CA	3	6	2421732	2421737	50 %	0 %	0 %	50 %	194335029
48018	NC_011059	CAA	2	6	2421746	2421751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335029
48019	NC_011059	A	6	6	2421815	2421820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48020	NC_011059	TC	3	6	2421842	2421847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48021	NC_011059	ACA	2	6	2421850	2421855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48022	NC_011059	TTCT	2	8	2421909	2421916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48023	NC_011059	GGT	2	6	2421980	2421985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335030
48024	NC_011059	GTT	2	6	2422007	2422012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335030
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48027	NC_011059	GAAAA	2	10	2422153	2422162	80 %	0 %	20 %	0 %	194335030
48028	NC_011059	T	6	6	2422190	2422195	0 %	100 %	0 %	0 %	194335030
48029	NC_011059	T	7	7	2422214	2422220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48030	NC_011059	AAG	2	6	2422289	2422294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48031	NC_011059	CTC	2	6	2422315	2422320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48032	NC_011059	GAGC	2	8	2422334	2422341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48033	NC_011059	CGGA	2	8	2422353	2422360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48034	NC_011059	CAA	2	6	2422433	2422438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48035	NC_011059	GA	3	6	2422466	2422471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48036	NC_011059	A	6	6	2422489	2422494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48037	NC_011059	ATC	2	6	2422530	2422535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48045	NC_011059	CAT	2	6	2422869	2422874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335031
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48051	NC_011059	CAT	2	6	2422945	2422950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335031
48052	NC_011059	AGCAA	2	10	2422952	2422961	60 %	0 %	20 %	20 %	194335031
48053	NC_011059	TCT	2	6	2422999	2423004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48054	NC_011059	AAC	2	6	2423048	2423053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48055	NC_011059	GAA	2	6	2423065	2423070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48056	NC_011059	AAG	2	6	2423072	2423077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48057	NC_011059	CAA	2	6	2423117	2423122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48058	NC_011059	AAGC	2	8	2423166	2423173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48059	NC_011059	GTA	2	6	2423196	2423201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48060	NC_011059	AAG	2	6	2423261	2423266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48061	NC_011059	GTTT	2	8	2423281	2423288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48062	NC_011059	CATC	2	8	2423324	2423331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48063	NC_011059	GCA	2	6	2423337	2423342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48067	NC_011059	CTAT	2	8	2423609	2423616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48068	NC_011059	A	7	7	2423666	2423672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48069	NC_011059	CAG	2	6	2423690	2423695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48070	NC_011059	T	6	6	2423698	2423703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48071	NC_011059	ATT	2	6	2423704	2423709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48082	NC_011059	GCT	2	6	2424604	2424609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335033
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48091	NC_011059	TACCAA	2	12	2425052	2425063	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194335034
48092	NC_011059	TTA	2	6	2425164	2425169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48093	NC_011059	A	9	9	2425214	2425222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48094	NC_011059	TCC	2	6	2425235	2425240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48095	NC_011059	TGC	2	6	2425254	2425259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335035
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48099	NC_011059	AGCGA	2	10	2425609	2425618	40 %	0 %	40 %	20 %	194335035
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48105	NC_011059	CAT	2	6	2425926	2425931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335035
48106	NC_011059	GAC	2	6	2425932	2425937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335035
48107	NC_011059	ATG	2	6	2426034	2426039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335035
48108	NC_011059	ATG	2	6	2426041	2426046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335035
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48113	NC_011059	CTTT	2	8	2426227	2426234	0 %	75 %	0 %	25 %	194335036
48114	NC_011059	AAT	2	6	2426270	2426275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335036
48115	NC_011059	A	6	6	2426327	2426332	100 %	0 %	0 %	0 %	194335036
48116	NC_011059	CTG	2	6	2426333	2426338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335036
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48120	NC_011059	GCA	2	6	2426490	2426495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335036
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48179	NC_011059	ATA	2	6	2429559	2429564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48181	NC_011059	GTT	2	6	2429588	2429593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48182	NC_011059	A	7	7	2429629	2429635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48183	NC_011059	CAAG	2	8	2429671	2429678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48184	NC_011059	ATGA	2	8	2429687	2429694	50 %	25 %	25 %	0 %	194335041
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48207	NC_011059	GC	3	6	2430784	2430789	0 %	0 %	50 %	50 %	194335042
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48229	NC_011059	CAAAC	2	10	2432119	2432128	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48230	NC_011059	CTTT	3	12	2432163	2432174	0 %	75 %	0 %	25 %	194335043
48231	NC_011059	AACA	2	8	2432178	2432185	75 %	0 %	0 %	25 %	194335043
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48234	NC_011059	CGT	2	6	2432285	2432290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335043
48235	NC_011059	TCC	2	6	2432305	2432310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335043
48236	NC_011059	CTG	2	6	2432311	2432316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335043
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48238	NC_011059	ACG	2	6	2432334	2432339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335043
48239	NC_011059	AAT	2	6	2432369	2432374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335043
48240	NC_011059	TGC	2	6	2432383	2432388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335043
48241	NC_011059	TGTCC	2	10	2432427	2432436	0 %	40 %	20 %	40 %	194335043
48242	NC_011059	GCT	2	6	2432459	2432464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335043
48243	NC_011059	CATC	2	8	2432528	2432535	25 %	25 %	0 %	50 %	194335043
48244	NC_011059	GCAT	2	8	2432629	2432636	25 %	25 %	25 %	25 %	194335043
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48249	NC_011059	TCA	2	6	2433037	2433042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335043
48250	NC_011059	CCGTTG	2	12	2433118	2433129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335043
48251	NC_011059	GCC	2	6	2433138	2433143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335043
48252	NC_011059	CTC	2	6	2433146	2433151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335043
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48263	NC_011059	AGC	2	6	2433774	2433779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335043
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48267	NC_011059	AG	3	6	2433978	2433983	50 %	0 %	50 %	0 %	194335044
48268	NC_011059	AGAC	2	8	2433988	2433995	50 %	0 %	25 %	25 %	194335044
48269	NC_011059	GAGCAA	2	12	2434082	2434093	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194335044
48270	NC_011059	AGC	3	9	2434096	2434104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335044
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48274	NC_011059	AAGA	2	8	2434323	2434330	75 %	0 %	25 %	0 %	194335044
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48292	NC_011059	GCAG	2	8	2435011	2435018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48293	NC_011059	C	7	7	2435019	2435025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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48306	NC_011059	TA	3	6	2435835	2435840	50 %	50 %	0 %	0 %	194335046
48307	NC_011059	AGAA	2	8	2435925	2435932	75 %	0 %	25 %	0 %	194335046
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48317	NC_011059	TCA	2	6	2436439	2436444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335047
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48319	NC_011059	TGC	2	6	2436505	2436510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335047
48320	NC_011059	GTCCT	2	10	2436514	2436523	0 %	40 %	20 %	40 %	194335047
48321	NC_011059	CGAA	2	8	2436524	2436531	50 %	0 %	25 %	25 %	194335047
48322	NC_011059	ATT	2	6	2436567	2436572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335047
48323	NC_011059	TAA	2	6	2436686	2436691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335047
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48327	NC_011059	ATAG	2	8	2437005	2437012	50 %	25 %	25 %	0 %	194335047
48328	NC_011059	ATA	2	6	2437042	2437047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335047
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48332	NC_011059	AC	3	6	2437144	2437149	50 %	0 %	0 %	50 %	194335047
48333	NC_011059	ACCA	2	8	2437179	2437186	50 %	0 %	0 %	50 %	194335047
48334	NC_011059	TGG	2	6	2437208	2437213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335047
48335	NC_011059	CCT	2	6	2437244	2437249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335047
48336	NC_011059	GAA	2	6	2437354	2437359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335047
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48338	NC_011059	GCA	2	6	2437486	2437491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335047
48339	NC_011059	TATTGA	2	12	2437511	2437522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194335047
48340	NC_011059	CAA	3	9	2437604	2437612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335047
48341	NC_011059	CA	3	6	2437613	2437618	50 %	0 %	0 %	50 %	194335047
48342	NC_011059	GTT	2	6	2437624	2437629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335047
48343	NC_011059	CAA	2	6	2437803	2437808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335048
48344	NC_011059	T	6	6	2437831	2437836	0 %	100 %	0 %	0 %	194335048
48345	NC_011059	CGT	2	6	2437857	2437862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335048
48346	NC_011059	GCA	2	6	2437989	2437994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335048
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48348	NC_011059	TCACCC	2	12	2438046	2438057	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	194335048
48349	NC_011059	TGG	2	6	2438074	2438079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335048
48350	NC_011059	AAT	2	6	2438128	2438133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335048
48351	NC_011059	CGC	2	6	2438171	2438176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335048
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48353	NC_011059	GGC	2	6	2438224	2438229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335048
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48468	NC_011059	AGC	2	6	2442898	2442903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335052
48469	NC_011059	AAT	2	6	2442915	2442920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335052
48470	NC_011059	AGC	2	6	2442931	2442936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335052
48471	NC_011059	AC	3	6	2442956	2442961	50 %	0 %	0 %	50 %	194335052
48472	NC_011059	AATC	2	8	2442965	2442972	50 %	25 %	0 %	25 %	194335052
48473	NC_011059	CCGAGA	2	12	2442994	2443005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335052
48474	NC_011059	GCT	2	6	2443077	2443082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335052
48475	NC_011059	AGA	2	6	2443111	2443116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335052
48476	NC_011059	CAG	3	9	2443128	2443136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335052
48477	NC_011059	CTC	2	6	2443167	2443172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335052
48478	NC_011059	A	6	6	2443315	2443320	100 %	0 %	0 %	0 %	194335053
48479	NC_011059	CAG	2	6	2443390	2443395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335053
48480	NC_011059	GCC	2	6	2443431	2443436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335053
48481	NC_011059	CAA	2	6	2443447	2443452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335053
48482	NC_011059	GCATT	2	10	2443564	2443573	20 %	40 %	20 %	20 %	194335053
48483	NC_011059	TGG	2	6	2443579	2443584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335053
48484	NC_011059	CA	3	6	2443623	2443628	50 %	0 %	0 %	50 %	194335053
48485	NC_011059	CGA	2	6	2443679	2443684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335053
48486	NC_011059	GCA	2	6	2443719	2443724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335053
48487	NC_011059	GAG	2	6	2443766	2443771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194335053
48488	NC_011059	TCA	2	6	2443794	2443799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335053
48489	NC_011059	ATCC	2	8	2443824	2443831	25 %	25 %	0 %	50 %	194335053
48490	NC_011059	GGC	2	6	2443853	2443858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335053
48491	NC_011059	CGC	2	6	2443892	2443897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335053
48492	NC_011059	TTC	2	6	2443922	2443927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335053
48493	NC_011059	ATC	2	6	2443949	2443954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335053
48494	NC_011059	A	6	6	2443993	2443998	100 %	0 %	0 %	0 %	194335053
48495	NC_011059	TGC	2	6	2444029	2444034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335053
48496	NC_011059	TCA	2	6	2444071	2444076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335053
48497	NC_011059	GCT	2	6	2444120	2444125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335053
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48499	NC_011059	GAA	2	6	2444172	2444177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335053
48500	NC_011059	CTG	2	6	2444218	2444223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335053

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