MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 chromosome

Total Repeats: 49907

< Previous12...888990919293949596979899100Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_011059	GGA	2	6	2269672	2269677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194334882
45003	NC_011059	GCA	3	9	2269688	2269696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334882
45004	NC_011059	GCAA	2	8	2269717	2269724	50 %	0 %	25 %	25 %	194334882
45005	NC_011059	CAG	2	6	2269752	2269757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334882
45006	NC_011059	AGC	2	6	2269774	2269779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334882
45007	NC_011059	AT	4	8	2269832	2269839	50 %	50 %	0 %	0 %	194334883
45008	NC_011059	CAG	2	6	2269871	2269876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334883
45009	NC_011059	T	6	6	2269944	2269949	0 %	100 %	0 %	0 %	194334883
45010	NC_011059	GATC	2	8	2269956	2269963	25 %	25 %	25 %	25 %	194334883
45011	NC_011059	CAT	2	6	2269992	2269997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194334883
45012	NC_011059	CGG	3	9	2270142	2270150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194334883
45013	NC_011059	ACGC	2	8	2270223	2270230	25 %	0 %	25 %	50 %	194334883
45014	NC_011059	AGC	2	6	2270299	2270304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334883
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45016	NC_011059	TCG	2	6	2270398	2270403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194334883
45017	NC_011059	TCC	2	6	2270465	2270470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194334883
45018	NC_011059	GCA	2	6	2270472	2270477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334883
45019	NC_011059	TC	3	6	2270539	2270544	0 %	50 %	0 %	50 %	194334883
45020	NC_011059	CAC	2	6	2270591	2270596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194334883
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45022	NC_011059	TTC	2	6	2270679	2270684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194334883
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45024	NC_011059	CAG	2	6	2270734	2270739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334883
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45033	NC_011059	A	7	7	2271191	2271197	100 %	0 %	0 %	0 %	194334884
45034	NC_011059	GTGACC	2	12	2271250	2271261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194334884
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45053	NC_011059	AT	3	6	2272201	2272206	50 %	50 %	0 %	0 %	194334885
45054	NC_011059	CGGT	2	8	2272216	2272223	0 %	25 %	50 %	25 %	194334885
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45062	NC_011059	GCAG	2	8	2272667	2272674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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45098	NC_011059	T	6	6	2274356	2274361	0 %	100 %	0 %	0 %	194334888
45099	NC_011059	GAC	2	6	2274376	2274381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334888
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45101	NC_011059	CGA	2	6	2274495	2274500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334888
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45104	NC_011059	GCC	2	6	2274808	2274813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194334888
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45106	NC_011059	CCA	2	6	2274968	2274973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194334888
45107	NC_011059	CAA	2	6	2275011	2275016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194334888
45108	NC_011059	ACG	2	6	2275019	2275024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334888
45109	NC_011059	GA	3	6	2275118	2275123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45110	NC_011059	C	7	7	2275141	2275147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45111	NC_011059	A	7	7	2275155	2275161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45112	NC_011059	GCC	2	6	2275233	2275238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45113	NC_011059	CCGAT	2	10	2275292	2275301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45114	NC_011059	GAG	2	6	2275402	2275407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194334889
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45117	NC_011059	ACC	2	6	2275574	2275579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194334889
45118	NC_011059	CGA	2	6	2275623	2275628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334889
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45122	NC_011059	CA	3	6	2275763	2275768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45123	NC_011059	CAA	2	6	2275884	2275889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45135	NC_011059	ACC	2	6	2276708	2276713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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45143	NC_011059	CGGG	2	8	2277057	2277064	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45144	NC_011059	T	6	6	2277097	2277102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45147	NC_011059	T	6	6	2277147	2277152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45181	NC_011059	AGTT	2	8	2278829	2278836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45182	NC_011059	GCC	2	6	2278843	2278848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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45228	NC_011059	ATT	2	6	2280896	2280901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194334895
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45235	NC_011059	TGT	2	6	2281260	2281265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194334896
45236	NC_011059	A	7	7	2281282	2281288	100 %	0 %	0 %	0 %	194334896
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45479	NC_011059	TCG	2	6	2292080	2292085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194334903
45480	NC_011059	CAA	2	6	2292111	2292116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194334903
45481	NC_011059	CGA	2	6	2292134	2292139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334903
45482	NC_011059	AGC	2	6	2292159	2292164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194334903
45483	NC_011059	TTATC	2	10	2292209	2292218	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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