MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 chromosome

Total Repeats: 49907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011059	ACA	2	6	555099	555104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194333354
11002	NC_011059	TTG	2	6	555135	555140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333354
11003	NC_011059	ACA	2	6	555141	555146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194333354
11004	NC_011059	TGA	2	6	555220	555225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333354
11005	NC_011059	A	6	6	555255	555260	100 %	0 %	0 %	0 %	194333354
11006	NC_011059	GA	3	6	555350	555355	50 %	0 %	50 %	0 %	194333354
11007	NC_011059	TCAA	2	8	555517	555524	50 %	25 %	0 %	25 %	194333354
11008	NC_011059	CTG	2	6	555626	555631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333354
11009	NC_011059	TGC	2	6	555749	555754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_011059	TCA	2	6	555926	555931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333355
11011	NC_011059	TGC	2	6	556033	556038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11012	NC_011059	CAC	2	6	556085	556090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194333355
11013	NC_011059	TGT	2	6	556112	556117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333355
11014	NC_011059	AGC	2	6	556156	556161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11015	NC_011059	GA	3	6	556177	556182	50 %	0 %	50 %	0 %	194333355
11016	NC_011059	CTG	2	6	556194	556199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11017	NC_011059	GGC	2	6	556260	556265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333355
11018	NC_011059	TGG	2	6	556292	556297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333355
11019	NC_011059	GCA	2	6	556346	556351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11020	NC_011059	CCT	2	6	556444	556449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333355
11021	NC_011059	ATG	2	6	556476	556481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333355
11022	NC_011059	GCA	2	6	556526	556531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11023	NC_011059	TGT	2	6	556554	556559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333355
11024	NC_011059	CCT	2	6	556568	556573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333355
11025	NC_011059	ATG	2	6	556591	556596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333355
11026	NC_011059	G	6	6	556635	556640	0 %	0 %	100 %	0 %	194333355
11027	NC_011059	CCT	2	6	556663	556668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333355
11028	NC_011059	T	7	7	556689	556695	0 %	100 %	0 %	0 %	194333355
11029	NC_011059	TGT	2	6	556702	556707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333355
11030	NC_011059	GGC	2	6	556741	556746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333355
11031	NC_011059	TCG	2	6	556759	556764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11032	NC_011059	GACTG	2	10	556776	556785	20 %	20 %	40 %	20 %	194333355
11033	NC_011059	GAC	2	6	556789	556794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11034	NC_011059	TGC	2	6	556850	556855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11035	NC_011059	CTT	2	6	556883	556888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333355
11036	NC_011059	GAA	2	6	556904	556909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194333355
11037	NC_011059	CGGA	2	8	556972	556979	25 %	0 %	50 %	25 %	194333355
11038	NC_011059	CTG	2	6	557034	557039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11039	NC_011059	CAG	2	6	557049	557054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333355
11040	NC_011059	T	8	8	557126	557133	0 %	100 %	0 %	0 %	194333355
11041	NC_011059	AGG	2	6	557225	557230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194333355
11042	NC_011059	GCG	2	6	557293	557298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333355
11043	NC_011059	GA	3	6	557306	557311	50 %	0 %	50 %	0 %	194333355
11044	NC_011059	GAA	2	6	557354	557359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_011059	CAA	2	6	557383	557388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_011059	CAGA	2	8	557408	557415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_011059	TGG	2	6	557420	557425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_011059	AT	3	6	557439	557444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_011059	GCAG	2	8	557491	557498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11050	NC_011059	GCTG	2	8	557554	557561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11051	NC_011059	TTG	2	6	557575	557580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_011059	TAT	2	6	557650	557655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_011059	GGT	2	6	557703	557708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333356
11054	NC_011059	TCA	2	6	557713	557718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333356
11055	NC_011059	CCG	2	6	557767	557772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194333356
11056	NC_011059	CTC	2	6	557794	557799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333356
11057	NC_011059	TCAT	2	8	557805	557812	25 %	50 %	0 %	25 %	194333356
11058	NC_011059	CTG	2	6	557823	557828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333356
11059	NC_011059	CT	3	6	557840	557845	0 %	50 %	0 %	50 %	194333356
11060	NC_011059	TAT	2	6	557846	557851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194333356
11061	NC_011059	GGT	2	6	557890	557895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333356
11062	NC_011059	GTT	2	6	558078	558083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333356
11063	NC_011059	GCTCCC	2	12	558093	558104	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	194333356
11064	NC_011059	GCT	2	6	558135	558140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333356
11065	NC_011059	AGC	2	6	558152	558157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333356
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11067	NC_011059	TGT	2	6	558185	558190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333356
11068	NC_011059	AGC	2	6	558206	558211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333356
11069	NC_011059	A	6	6	558256	558261	100 %	0 %	0 %	0 %	194333356
11070	NC_011059	AGA	2	6	558270	558275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194333356
11071	NC_011059	A	6	6	558330	558335	100 %	0 %	0 %	0 %	194333356
11072	NC_011059	CAGA	2	8	558339	558346	50 %	0 %	25 %	25 %	194333356
11073	NC_011059	TGAAA	2	10	558359	558368	60 %	20 %	20 %	0 %	194333356
11074	NC_011059	AGAA	2	8	558390	558397	75 %	0 %	25 %	0 %	194333356
11075	NC_011059	TTG	2	6	558412	558417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333356
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11077	NC_011059	GAA	2	6	558485	558490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_011059	TTTTG	2	10	558501	558510	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_011059	TCA	2	6	558557	558562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_011059	T	7	7	558590	558596	0 %	100 %	0 %	0 %	194333357
11081	NC_011059	ATG	2	6	558619	558624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333357
11082	NC_011059	TCC	2	6	558644	558649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333357
11083	NC_011059	TGT	2	6	558665	558670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333357
11084	NC_011059	AC	3	6	558797	558802	50 %	0 %	0 %	50 %	194333357
11085	NC_011059	T	6	6	558944	558949	0 %	100 %	0 %	0 %	194333357
11086	NC_011059	ATG	2	6	558957	558962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_011059	GCT	2	6	559067	559072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_011059	GTG	2	6	559081	559086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_011059	CAA	2	6	559092	559097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_011059	GCA	2	6	559099	559104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_011059	CAG	2	6	559168	559173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333358
11092	NC_011059	G	6	6	559236	559241	0 %	0 %	100 %	0 %	194333358
11093	NC_011059	T	6	6	559254	559259	0 %	100 %	0 %	0 %	194333358
11094	NC_011059	GCT	2	6	559281	559286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333358
11095	NC_011059	GAG	2	6	559303	559308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194333358
11096	NC_011059	TAT	2	6	559377	559382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194333358
11097	NC_011059	GCA	2	6	559453	559458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333358
11098	NC_011059	G	6	6	559464	559469	0 %	0 %	100 %	0 %	194333358
11099	NC_011059	TC	3	6	559476	559481	0 %	50 %	0 %	50 %	194333358
11100	NC_011059	ACT	2	6	559487	559492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333358
11101	NC_011059	CAA	2	6	559533	559538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194333358
11102	NC_011059	TGT	2	6	559601	559606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333358
11103	NC_011059	TCT	2	6	559638	559643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333358
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11105	NC_011059	CGG	2	6	559708	559713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333358
11106	NC_011059	TCT	2	6	559765	559770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333358
11107	NC_011059	AAG	2	6	559830	559835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194333358
11108	NC_011059	CAG	3	9	559864	559872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333359
11109	NC_011059	T	6	6	559877	559882	0 %	100 %	0 %	0 %	194333359
11110	NC_011059	GAT	2	6	559899	559904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333359
11111	NC_011059	GAA	2	6	559975	559980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194333359
11112	NC_011059	TC	3	6	560013	560018	0 %	50 %	0 %	50 %	194333359
11113	NC_011059	GCTG	2	8	560042	560049	0 %	25 %	50 %	25 %	194333359
11114	NC_011059	TTG	2	6	560050	560055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333359
11115	NC_011059	CTC	2	6	560068	560073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333359
11116	NC_011059	ACA	2	6	560094	560099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194333359
11117	NC_011059	TGA	2	6	560132	560137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333359
11118	NC_011059	GTC	2	6	560187	560192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333359
11119	NC_011059	CTT	2	6	560238	560243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333359
11120	NC_011059	GCT	2	6	560281	560286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333359
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11122	NC_011059	GAG	3	9	560379	560387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194333359
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11486	NC_011059	GCA	2	6	578297	578302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333378
11487	NC_011059	GTT	2	6	578369	578374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333378
11488	NC_011059	GGT	2	6	578484	578489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333378
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11490	NC_011059	TGT	2	6	578681	578686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333378
11491	NC_011059	GGAC	2	8	578708	578715	25 %	0 %	50 %	25 %	194333378
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