MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 29422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010531	ATT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010531	T	6	6	20	25	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010531	ATT	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010531	C	6	6	131	136	0 %	0 %	0 %	100 %	171462833
5	NC_010531	GAT	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462833
6	NC_010531	TTATT	2	10	237	246	20 %	80 %	0 %	0 %	171462833
7	NC_010531	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462833
8	NC_010531	TGA	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462833
9	NC_010531	TGGAT	2	10	303	312	20 %	40 %	40 %	0 %	171462833
10	NC_010531	TAG	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462833
11	NC_010531	TGG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462833
12	NC_010531	GGTT	2	8	652	659	0 %	50 %	50 %	0 %	171462833
13	NC_010531	ACC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171462833
14	NC_010531	TACA	2	8	731	738	50 %	25 %	0 %	25 %	171462833
15	NC_010531	CAA	2	6	776	781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462833
16	NC_010531	TTA	2	6	805	810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462833
17	NC_010531	TGA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462833
18	NC_010531	T	6	6	848	853	0 %	100 %	0 %	0 %	171462833
19	NC_010531	AAG	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462833
20	NC_010531	CAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462833
21	NC_010531	ATT	2	6	926	931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462833
22	NC_010531	ATAC	2	8	939	946	50 %	25 %	0 %	25 %	171462833
23	NC_010531	TGA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462833
24	NC_010531	TC	3	6	981	986	0 %	50 %	0 %	50 %	171462833
25	NC_010531	CCA	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171462833
26	NC_010531	TGA	2	6	1050	1055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462833
27	NC_010531	CTT	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462833
28	NC_010531	A	6	6	1322	1327	100 %	0 %	0 %	0 %	171462833
29	NC_010531	ATT	2	6	1414	1419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462833
30	NC_010531	TGG	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462833
31	NC_010531	CA	3	6	1433	1438	50 %	0 %	0 %	50 %	171462833
32	NC_010531	TGA	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462833
33	NC_010531	T	6	6	1538	1543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010531	TTGT	2	8	1589	1596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010531	T	6	6	1695	1700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010531	TGT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010531	TATTAC	2	12	1760	1771	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010531	AT	3	6	1779	1784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010531	GTT	2	6	1850	1855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462834
40	NC_010531	TTG	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462834
41	NC_010531	CAC	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171462834
42	NC_010531	TGCG	2	8	2040	2047	0 %	25 %	50 %	25 %	171462834
43	NC_010531	GTT	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462834
44	NC_010531	GGTGA	2	10	2168	2177	20 %	20 %	60 %	0 %	171462834
45	NC_010531	CTG	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462834
46	NC_010531	TTA	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462834
47	NC_010531	TGT	2	6	2277	2282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462834
48	NC_010531	AGG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171462834
49	NC_010531	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462834
50	NC_010531	CGAC	2	8	2316	2323	25 %	0 %	25 %	50 %	171462834
51	NC_010531	AGTTG	2	10	2347	2356	20 %	40 %	40 %	0 %	171462834
52	NC_010531	AAG	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462834
53	NC_010531	TCA	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462834
54	NC_010531	TGA	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462834
55	NC_010531	GTTG	2	8	2521	2528	0 %	50 %	50 %	0 %	171462834
56	NC_010531	TAG	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462834
57	NC_010531	CGTT	2	8	2656	2663	0 %	50 %	25 %	25 %	171462834
58	NC_010531	TCAA	2	8	2692	2699	50 %	25 %	0 %	25 %	171462834
59	NC_010531	AAG	3	9	2712	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462834
60	NC_010531	AAG	2	6	2724	2729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462834
61	NC_010531	A	6	6	2817	2822	100 %	0 %	0 %	0 %	171462834
62	NC_010531	TAG	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462834
63	NC_010531	AG	3	6	2878	2883	50 %	0 %	50 %	0 %	171462834
64	NC_010531	TGT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462834
65	NC_010531	A	7	7	2923	2929	100 %	0 %	0 %	0 %	171462835
66	NC_010531	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462835
67	NC_010531	A	8	8	2939	2946	100 %	0 %	0 %	0 %	171462835
68	NC_010531	GTA	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462835
69	NC_010531	TTG	2	6	3158	3163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
70	NC_010531	ACG	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462835
71	NC_010531	TGC	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
72	NC_010531	TGG	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462835
73	NC_010531	CGG	2	6	3294	3299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462835
74	NC_010531	GC	3	6	3394	3399	0 %	0 %	50 %	50 %	171462835
75	NC_010531	TGA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462835
76	NC_010531	GTG	2	6	3434	3439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462835
77	NC_010531	CGA	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462835
78	NC_010531	TTGA	2	8	3604	3611	25 %	50 %	25 %	0 %	171462835
79	NC_010531	TGG	2	6	3648	3653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462835
80	NC_010531	TTG	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
81	NC_010531	AACCA	2	10	3679	3688	60 %	0 %	0 %	40 %	171462835
82	NC_010531	T	6	6	3710	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	171462835
83	NC_010531	GGT	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462835
84	NC_010531	ATG	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462835
85	NC_010531	AAC	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462835
86	NC_010531	TGG	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462835
87	NC_010531	AATA	2	8	3886	3893	75 %	25 %	0 %	0 %	171462835
88	NC_010531	TGA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462835
89	NC_010531	TGA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462835
90	NC_010531	AGA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462835
91	NC_010531	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
92	NC_010531	TTG	2	6	4130	4135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
93	NC_010531	TGC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
94	NC_010531	GCGG	2	8	4288	4295	0 %	0 %	75 %	25 %	171462835
95	NC_010531	TCG	2	6	4317	4322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
96	NC_010531	TTC	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462835
97	NC_010531	GC	3	6	4372	4377	0 %	0 %	50 %	50 %	171462835
98	NC_010531	AAG	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462835
99	NC_010531	GGTATT	2	12	4435	4446	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	171462835
100	NC_010531	GAA	2	6	4447	4452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462835
101	NC_010531	TATCAT	2	12	4482	4493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	171462835
102	NC_010531	TTG	2	6	4534	4539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
103	NC_010531	TTGA	2	8	4567	4574	25 %	50 %	25 %	0 %	171462835
104	NC_010531	ACC	2	6	4599	4604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171462835
105	NC_010531	GTT	3	9	4668	4676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
106	NC_010531	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462835
107	NC_010531	TCGA	2	8	4784	4791	25 %	25 %	25 %	25 %	171462835
108	NC_010531	TGA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462835
109	NC_010531	CTG	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
110	NC_010531	AGA	2	6	4956	4961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462835
111	NC_010531	TCG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
112	NC_010531	TCC	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171462835
113	NC_010531	TGA	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462835
114	NC_010531	GCA	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462835
115	NC_010531	GTT	2	6	5098	5103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
116	NC_010531	TCG	2	6	5118	5123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
117	NC_010531	GTT	2	6	5187	5192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462835
118	NC_010531	GTC	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
119	NC_010531	ACC	2	6	5269	5274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171462835
120	NC_010531	TGC	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462835
121	NC_010531	CCG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171462835
122	NC_010531	A	7	7	5390	5396	100 %	0 %	0 %	0 %	171462835
123	NC_010531	A	6	6	5438	5443	100 %	0 %	0 %	0 %	171462836
124	NC_010531	TCT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462836
125	NC_010531	TTG	2	6	5475	5480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462836
126	NC_010531	TCC	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171462836
127	NC_010531	A	6	6	5531	5536	100 %	0 %	0 %	0 %	171462836
128	NC_010531	CCAC	2	8	5596	5603	25 %	0 %	0 %	75 %	171462836
129	NC_010531	AGA	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462836
130	NC_010531	CGG	2	6	5674	5679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462836
131	NC_010531	GC	3	6	5687	5692	0 %	0 %	50 %	50 %	171462836
132	NC_010531	TATT	2	8	5760	5767	25 %	75 %	0 %	0 %	171462836
133	NC_010531	GAG	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171462836
134	NC_010531	ACT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462836
135	NC_010531	A	6	6	5852	5857	100 %	0 %	0 %	0 %	171462836
136	NC_010531	A	6	6	5882	5887	100 %	0 %	0 %	0 %	171462836
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254	NC_010531	GCAT	2	8	11446	11453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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270	NC_010531	CGT	2	6	12126	12131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462843
271	NC_010531	AACC	2	8	12138	12145	50 %	0 %	0 %	50 %	171462843
272	NC_010531	TGA	2	6	12173	12178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462843
273	NC_010531	GGT	2	6	12248	12253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462843
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278	NC_010531	CCCCG	2	10	12400	12409	0 %	0 %	20 %	80 %	171462843
279	NC_010531	AGC	2	6	12448	12453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462843
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292	NC_010531	TGGG	2	8	13251	13258	0 %	25 %	75 %	0 %	171462843
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394	NC_010531	ATTTT	2	10	17565	17574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_010531	CAA	2	6	17611	17616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462848
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399	NC_010531	TTA	2	6	17864	17869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462848
400	NC_010531	TTC	2	6	17977	17982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462849
401	NC_010531	TGG	2	6	17989	17994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462849
402	NC_010531	GTT	2	6	17995	18000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462849
403	NC_010531	GCC	2	6	18015	18020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171462849
404	NC_010531	GCT	2	6	18070	18075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462849
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407	NC_010531	TAAA	2	8	18131	18138	75 %	25 %	0 %	0 %	171462849
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410	NC_010531	GCA	2	6	18252	18257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462849
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425	NC_010531	ATTG	2	8	18850	18857	25 %	50 %	25 %	0 %	171462850
426	NC_010531	GCAA	2	8	18925	18932	50 %	0 %	25 %	25 %	171462850
427	NC_010531	AGTA	2	8	18984	18991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
428	NC_010531	AAC	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462851
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431	NC_010531	AGCC	2	8	19418	19425	25 %	0 %	25 %	50 %	171462851
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435	NC_010531	TTG	3	9	19656	19664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462851
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456	NC_010531	A	6	6	20690	20695	100 %	0 %	0 %	0 %	171462852
457	NC_010531	TTG	2	6	20705	20710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462852
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461	NC_010531	A	7	7	20873	20879	100 %	0 %	0 %	0 %	171462852
462	NC_010531	GAA	2	6	21318	21323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462852
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474	NC_010531	TGA	2	6	21844	21849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462853
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485	NC_010531	TGGT	2	8	22539	22546	0 %	50 %	50 %	0 %	171462853
486	NC_010531	GC	3	6	22565	22570	0 %	0 %	50 %	50 %	171462853
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497	NC_010531	GGTTC	2	10	23039	23048	0 %	40 %	40 %	20 %	171462854
498	NC_010531	GAT	3	9	23063	23071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462854
499	NC_010531	GTTT	2	8	23077	23084	0 %	75 %	25 %	0 %	171462854
500	NC_010531	TGA	2	6	23164	23169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462854

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