MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum neutrophilum V24Sta chromosome

Total Repeats: 45595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010525	GA	3	6	611917	611922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_010525	ACC	2	6	611949	611954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16003	NC_010525	CTG	2	6	611982	611987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_010525	GC	3	6	612032	612037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16005	NC_010525	TGCT	2	8	612152	612159	0 %	50 %	25 %	25 %	171185146
16006	NC_010525	G	6	6	612162	612167	0 %	0 %	100 %	0 %	171185146
16007	NC_010525	AAC	2	6	612197	612202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185146
16008	NC_010525	G	6	6	612231	612236	0 %	0 %	100 %	0 %	171185146
16009	NC_010525	GTT	2	6	612286	612291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171185146
16010	NC_010525	GAG	2	6	612339	612344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185146
16011	NC_010525	G	6	6	612344	612349	0 %	0 %	100 %	0 %	171185146
16012	NC_010525	CTC	2	6	612351	612356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185146
16013	NC_010525	CGG	2	6	612404	612409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185146
16014	NC_010525	TGT	2	6	612444	612449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171185146
16015	NC_010525	G	6	6	612467	612472	0 %	0 %	100 %	0 %	171185146
16016	NC_010525	GTG	2	6	612486	612491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185146
16017	NC_010525	TCG	2	6	612524	612529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185146
16018	NC_010525	CTCG	2	8	612562	612569	0 %	25 %	25 %	50 %	171185146
16019	NC_010525	GTTG	2	8	612609	612616	0 %	50 %	50 %	0 %	171185146
16020	NC_010525	TCA	2	6	612632	612637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185146
16021	NC_010525	AAC	2	6	612670	612675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185146
16022	NC_010525	GGC	2	6	612684	612689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185146
16023	NC_010525	GAG	2	6	612735	612740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185146
16024	NC_010525	TG	3	6	612755	612760	0 %	50 %	50 %	0 %	171185146
16025	NC_010525	GGT	2	6	612834	612839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185147
16026	NC_010525	CTG	2	6	612976	612981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185147
16027	NC_010525	CCG	2	6	613131	613136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185147
16028	NC_010525	AGG	3	9	613145	613153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185147
16029	NC_010525	GC	3	6	613176	613181	0 %	0 %	50 %	50 %	171185147
16030	NC_010525	AAC	2	6	613198	613203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185147
16031	NC_010525	CCA	2	6	613206	613211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185147
16032	NC_010525	CT	3	6	613220	613225	0 %	50 %	0 %	50 %	171185147
16033	NC_010525	GCTG	2	8	613239	613246	0 %	25 %	50 %	25 %	171185147
16034	NC_010525	CGT	2	6	613361	613366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_010525	T	6	6	613417	613422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_010525	GAG	2	6	613495	613500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185148
16037	NC_010525	AAG	2	6	613558	613563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185148
16038	NC_010525	TACC	2	8	613598	613605	25 %	25 %	0 %	50 %	171185148
16039	NC_010525	CCA	2	6	613649	613654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185148
16040	NC_010525	TCC	2	6	613688	613693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185148
16041	NC_010525	G	6	6	613697	613702	0 %	0 %	100 %	0 %	171185148
16042	NC_010525	CGT	2	6	613722	613727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185148
16043	NC_010525	TC	3	6	613731	613736	0 %	50 %	0 %	50 %	171185148
16044	NC_010525	GGGA	2	8	613761	613768	25 %	0 %	75 %	0 %	171185148
16045	NC_010525	TAA	2	6	613811	613816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171185148
16046	NC_010525	GAG	4	12	613830	613841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185148
16047	NC_010525	AG	3	6	613840	613845	50 %	0 %	50 %	0 %	171185148
16048	NC_010525	GCC	2	6	613873	613878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185148
16049	NC_010525	GGT	2	6	613980	613985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185148
16050	NC_010525	AAG	2	6	613987	613992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185148
16051	NC_010525	GGA	2	6	614025	614030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185148
16052	NC_010525	GAG	2	6	614044	614049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185148
16053	NC_010525	AG	3	6	614073	614078	50 %	0 %	50 %	0 %	171185148
16054	NC_010525	TGGTG	2	10	614106	614115	0 %	40 %	60 %	0 %	171185148
16055	NC_010525	GA	3	6	614124	614129	50 %	0 %	50 %	0 %	171185148
16056	NC_010525	TA	3	6	614261	614266	50 %	50 %	0 %	0 %	171185149
16057	NC_010525	CTC	2	6	614322	614327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185149
16058	NC_010525	CGC	2	6	614453	614458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185149
16059	NC_010525	AGA	2	6	614470	614475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185149
16060	NC_010525	ACG	3	9	614512	614520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185149
16061	NC_010525	CGT	2	6	614558	614563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185149
16062	NC_010525	TA	3	6	614595	614600	50 %	50 %	0 %	0 %	171185149
16063	NC_010525	GCCACA	2	12	614643	614654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171185149
16064	NC_010525	TCG	2	6	614758	614763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185149
16065	NC_010525	CGC	2	6	614780	614785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185149
16066	NC_010525	ACT	2	6	614833	614838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185149
16067	NC_010525	CGA	2	6	614879	614884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185149
16068	NC_010525	GTG	2	6	614907	614912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185149
16069	NC_010525	ACA	2	6	614934	614939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185149
16070	NC_010525	CGA	2	6	614948	614953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185149
16071	NC_010525	CTG	2	6	615147	615152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185149
16072	NC_010525	AT	3	6	615165	615170	50 %	50 %	0 %	0 %	171185149
16073	NC_010525	AG	3	6	615232	615237	50 %	0 %	50 %	0 %	171185149
16074	NC_010525	TAA	2	6	615246	615251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171185149
16075	NC_010525	GTG	2	6	615262	615267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_010525	AG	3	6	615336	615341	50 %	0 %	50 %	0 %	171185150
16077	NC_010525	CTA	2	6	615354	615359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185150
16078	NC_010525	GGC	2	6	615396	615401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185150
16079	NC_010525	CG	3	6	615415	615420	0 %	0 %	50 %	50 %	171185150
16080	NC_010525	GAG	2	6	615439	615444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185150
16081	NC_010525	AGG	2	6	615448	615453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185150
16082	NC_010525	GCG	2	6	615462	615467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185150
16083	NC_010525	TAG	2	6	615470	615475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185150
16084	NC_010525	CAT	2	6	615477	615482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185150
16085	NC_010525	GAG	2	6	615526	615531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185150
16086	NC_010525	GAG	2	6	615544	615549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185150
16087	NC_010525	AT	3	6	615571	615576	50 %	50 %	0 %	0 %	171185150
16088	NC_010525	AGG	2	6	615604	615609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185150
16089	NC_010525	CGA	2	6	615630	615635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185150
16090	NC_010525	CTAC	2	8	615641	615648	25 %	25 %	0 %	50 %	171185150
16091	NC_010525	AG	3	6	615673	615678	50 %	0 %	50 %	0 %	171185150
16092	NC_010525	CTAG	2	8	615703	615710	25 %	25 %	25 %	25 %	171185150
16093	NC_010525	GAG	2	6	615873	615878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185151
16094	NC_010525	AG	3	6	615877	615882	50 %	0 %	50 %	0 %	171185151
16095	NC_010525	AAG	2	6	615944	615949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185151
16096	NC_010525	CGC	2	6	615977	615982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185151
16097	NC_010525	GTC	2	6	616023	616028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185151
16098	NC_010525	GGC	2	6	616046	616051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185151
16099	NC_010525	ACAA	2	8	616125	616132	75 %	0 %	0 %	25 %	171185151
16100	NC_010525	TAC	2	6	616185	616190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185151
16101	NC_010525	GCC	2	6	616241	616246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185152
16102	NC_010525	GCC	2	6	616316	616321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185152
16103	NC_010525	GGC	2	6	616396	616401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185152
16104	NC_010525	CAC	2	6	616418	616423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185152
16105	NC_010525	TGG	2	6	616442	616447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185152
16106	NC_010525	AGG	2	6	616449	616454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185152
16107	NC_010525	CAC	2	6	616466	616471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185152
16108	NC_010525	ACG	2	6	616530	616535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185152
16109	NC_010525	C	6	6	616539	616544	0 %	0 %	0 %	100 %	171185152
16110	NC_010525	TTA	2	6	616720	616725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171185152
16111	NC_010525	C	6	6	616729	616734	0 %	0 %	0 %	100 %	171185152
16112	NC_010525	CCG	2	6	616803	616808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185152
16113	NC_010525	CTT	2	6	616828	616833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185152
16114	NC_010525	CCT	2	6	616882	616887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185152
16115	NC_010525	AAC	2	6	616909	616914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185153
16116	NC_010525	CGA	2	6	616923	616928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185153
16117	NC_010525	GAG	2	6	617002	617007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185153
16118	NC_010525	C	7	7	617046	617052	0 %	0 %	0 %	100 %	171185153
16119	NC_010525	ATCTT	2	10	617055	617064	20 %	60 %	0 %	20 %	171185153
16120	NC_010525	CGT	2	6	617068	617073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185153
16121	NC_010525	CGC	3	9	617110	617118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185153
16122	NC_010525	TA	3	6	617174	617179	50 %	50 %	0 %	0 %	171185153
16123	NC_010525	TAA	2	6	617208	617213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171185153
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16126	NC_010525	A	6	6	617282	617287	100 %	0 %	0 %	0 %	171185153
16127	NC_010525	A	6	6	617339	617344	100 %	0 %	0 %	0 %	171185153
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16130	NC_010525	CT	3	6	617410	617415	0 %	50 %	0 %	50 %	171185153
16131	NC_010525	GTA	2	6	617431	617436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185153
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16364	NC_010525	CGG	2	6	627827	627832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185166
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