MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum neutrophilum V24Sta chromosome

Total Repeats: 45595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_010525	GTA	2	6	570376	570381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185100
15002	NC_010525	GCG	2	6	570382	570387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185100
15003	NC_010525	GCTG	2	8	570423	570430	0 %	25 %	50 %	25 %	171185100
15004	NC_010525	CGC	2	6	570435	570440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185100
15005	NC_010525	CTG	2	6	570489	570494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185100
15006	NC_010525	G	6	6	570506	570511	0 %	0 %	100 %	0 %	171185100
15007	NC_010525	TCT	2	6	570512	570517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185100
15008	NC_010525	GCGCC	2	10	570518	570527	0 %	0 %	40 %	60 %	171185100
15009	NC_010525	CGG	2	6	570566	570571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185100
15010	NC_010525	CAC	2	6	570642	570647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185100
15011	NC_010525	GTA	2	6	570696	570701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185100
15012	NC_010525	CCA	2	6	570722	570727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185100
15013	NC_010525	AT	4	8	570829	570836	50 %	50 %	0 %	0 %	171185100
15014	NC_010525	TGG	2	6	570856	570861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185100
15015	NC_010525	CAG	2	6	570975	570980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185100
15016	NC_010525	GGT	2	6	571040	571045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185101
15017	NC_010525	CCG	2	6	571048	571053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185101
15018	NC_010525	CGC	2	6	571160	571165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185101
15019	NC_010525	CCG	2	6	571252	571257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185101
15020	NC_010525	AG	3	6	571272	571277	50 %	0 %	50 %	0 %	171185101
15021	NC_010525	AGCCCA	2	12	571327	571338	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171185101
15022	NC_010525	CGC	2	6	571339	571344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185101
15023	NC_010525	GC	3	6	571510	571515	0 %	0 %	50 %	50 %	171185101
15024	NC_010525	GAG	2	6	571578	571583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185101
15025	NC_010525	TC	3	6	571715	571720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15026	NC_010525	CTC	2	6	571803	571808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185102
15027	NC_010525	C	6	6	571814	571819	0 %	0 %	0 %	100 %	171185102
15028	NC_010525	CCG	2	6	571821	571826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185102
15029	NC_010525	CTC	2	6	571834	571839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185102
15030	NC_010525	CAC	2	6	571847	571852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185102
15031	NC_010525	CTG	2	6	571958	571963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185102
15032	NC_010525	ACG	2	6	572014	572019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185102
15033	NC_010525	GTT	2	6	572072	572077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171185102
15034	NC_010525	CGT	2	6	572094	572099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185102
15035	NC_010525	CCA	2	6	572207	572212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185102
15036	NC_010525	AACA	2	8	572214	572221	75 %	0 %	0 %	25 %	171185102
15037	NC_010525	CGT	2	6	572222	572227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185102
15038	NC_010525	CCA	2	6	572317	572322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185102
15039	NC_010525	TGA	2	6	572353	572358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185102
15040	NC_010525	ACC	2	6	572394	572399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185102
15041	NC_010525	AC	3	6	572448	572453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15042	NC_010525	GTG	3	9	572478	572486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185103
15043	NC_010525	CAGG	2	8	572525	572532	25 %	0 %	50 %	25 %	171185103
15044	NC_010525	GGT	2	6	572543	572548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185103
15045	NC_010525	CGG	2	6	572555	572560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185103
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15047	NC_010525	GGA	2	6	572615	572620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185103
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15049	NC_010525	AGG	2	6	572655	572660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185103
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15052	NC_010525	GGT	2	6	572825	572830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185103
15053	NC_010525	GAG	2	6	572918	572923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185103
15054	NC_010525	GGAG	2	8	572927	572934	25 %	0 %	75 %	0 %	171185103
15055	NC_010525	GTG	2	6	572940	572945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185103
15056	NC_010525	GGC	2	6	572948	572953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185103
15057	NC_010525	GAGG	2	8	572978	572985	25 %	0 %	75 %	0 %	171185103
15058	NC_010525	C	7	7	573108	573114	0 %	0 %	0 %	100 %	171185103
15059	NC_010525	C	6	6	573159	573164	0 %	0 %	0 %	100 %	171185103
15060	NC_010525	TAAC	2	8	573181	573188	50 %	25 %	0 %	25 %	171185103
15061	NC_010525	GTG	2	6	573213	573218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185103
15062	NC_010525	C	6	6	573253	573258	0 %	0 %	0 %	100 %	171185103
15063	NC_010525	G	6	6	573261	573266	0 %	0 %	100 %	0 %	171185103
15064	NC_010525	GGC	2	6	573312	573317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185103
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15067	NC_010525	ACA	2	6	573426	573431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185103
15068	NC_010525	GA	3	6	573534	573539	50 %	0 %	50 %	0 %	171185104
15069	NC_010525	C	6	6	573701	573706	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15070	NC_010525	C	6	6	573708	573713	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15071	NC_010525	GCT	2	6	573742	573747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185105
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15074	NC_010525	CGT	2	6	573831	573836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185105
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15078	NC_010525	TC	3	6	573903	573908	0 %	50 %	0 %	50 %	171185105
15079	NC_010525	ACT	2	6	573935	573940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185105
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15082	NC_010525	G	6	6	574127	574132	0 %	0 %	100 %	0 %	171185105
15083	NC_010525	GA	3	6	574197	574202	50 %	0 %	50 %	0 %	171185105
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15086	NC_010525	CAGGC	2	10	574281	574290	20 %	0 %	40 %	40 %	171185105
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15088	NC_010525	AT	3	6	574461	574466	50 %	50 %	0 %	0 %	171185105
15089	NC_010525	CTA	2	6	574477	574482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185105
15090	NC_010525	TGA	2	6	574508	574513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185105
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15092	NC_010525	GAC	2	6	574543	574548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_010525	GA	3	6	574558	574563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_010525	AG	3	6	574586	574591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_010525	AGG	2	6	574602	574607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185106
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15098	NC_010525	TTAT	2	8	574631	574638	25 %	75 %	0 %	0 %	171185106
15099	NC_010525	GCT	2	6	574650	574655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185106
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15102	NC_010525	TTC	2	6	574727	574732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185106
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15105	NC_010525	AGGG	2	8	574811	574818	25 %	0 %	75 %	0 %	171185106
15106	NC_010525	TTA	2	6	574924	574929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_010525	CCT	2	6	574938	574943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15108	NC_010525	CAA	2	6	574998	575003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_010525	GCG	2	6	575011	575016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_010525	TGT	2	6	575057	575062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_010525	CTGT	2	8	575114	575121	0 %	50 %	25 %	25 %	171185107
15112	NC_010525	GCC	2	6	575131	575136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185107
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15114	NC_010525	TGCC	2	8	575238	575245	0 %	25 %	25 %	50 %	171185107
15115	NC_010525	GGAG	2	8	575258	575265	25 %	0 %	75 %	0 %	171185107
15116	NC_010525	CTT	2	6	575287	575292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185107
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15118	NC_010525	AGGTG	2	10	575401	575410	20 %	20 %	60 %	0 %	171185107
15119	NC_010525	CCTC	2	8	575439	575446	0 %	25 %	0 %	75 %	171185107
15120	NC_010525	TGTA	2	8	575496	575503	25 %	50 %	25 %	0 %	171185107
15121	NC_010525	GAG	2	6	575525	575530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185107
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15123	NC_010525	ATC	2	6	575600	575605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185107
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15125	NC_010525	TCG	3	9	575625	575633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185107
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15230	NC_010525	CAACG	2	10	579427	579436	40 %	0 %	20 %	40 %	171185112
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15244	NC_010525	CTT	2	6	579901	579906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185112
15245	NC_010525	CAA	2	6	579958	579963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185112
15246	NC_010525	CGCC	2	8	580011	580018	0 %	0 %	25 %	75 %	171185112
15247	NC_010525	CCA	2	6	580080	580085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185112
15248	NC_010525	TGG	2	6	580100	580105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185112
15249	NC_010525	TCG	2	6	580133	580138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185112
15250	NC_010525	AGT	2	6	580158	580163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185112
15251	NC_010525	ACC	2	6	580164	580169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185112
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15253	NC_010525	AGT	2	6	580269	580274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185112
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15259	NC_010525	CT	3	6	580489	580494	0 %	50 %	0 %	50 %	171185113
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15262	NC_010525	CCT	2	6	580520	580525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185113
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15273	NC_010525	T	6	6	580880	580885	0 %	100 %	0 %	0 %	171185113
15274	NC_010525	CG	3	6	581033	581038	0 %	0 %	50 %	50 %	171185113
15275	NC_010525	CTC	2	6	581052	581057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185113
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15280	NC_010525	ACT	2	6	581558	581563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185114
15281	NC_010525	GGC	2	6	581584	581589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185114
15282	NC_010525	CGT	2	6	581656	581661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185114
15283	NC_010525	TA	3	6	581662	581667	50 %	50 %	0 %	0 %	171185114
15284	NC_010525	CCG	2	6	581685	581690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185114
15285	NC_010525	CAGC	2	8	581707	581714	25 %	0 %	25 %	50 %	171185114
15286	NC_010525	TCC	2	6	581733	581738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185114
15287	NC_010525	TGAGG	2	10	581773	581782	20 %	20 %	60 %	0 %	171185114
15288	NC_010525	GGC	2	6	581816	581821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185114
15289	NC_010525	CGC	2	6	581859	581864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185114
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15291	NC_010525	CG	3	6	581964	581969	0 %	0 %	50 %	50 %	171185114
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15294	NC_010525	GAA	2	6	582094	582099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185114
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15301	NC_010525	CCA	2	6	582348	582353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185114
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15304	NC_010525	TGA	2	6	582387	582392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185114
15305	NC_010525	TG	3	6	582408	582413	0 %	50 %	50 %	0 %	171185114
15306	NC_010525	GCCGT	2	10	582434	582443	0 %	20 %	40 %	40 %	171185114
15307	NC_010525	CGT	2	6	582453	582458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185114
15308	NC_010525	CCA	2	6	582459	582464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185114
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15310	NC_010525	GTT	2	6	582478	582483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171185114
15311	NC_010525	CT	3	6	582514	582519	0 %	50 %	0 %	50 %	171185114
15312	NC_010525	AAC	2	6	582547	582552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185114
15313	NC_010525	TAA	2	6	582636	582641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15314	NC_010525	GAG	2	6	582668	582673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185115
15315	NC_010525	AGG	2	6	582763	582768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185115
15316	NC_010525	GGA	2	6	582769	582774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185115
15317	NC_010525	GGA	2	6	582848	582853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185115
15318	NC_010525	GTG	3	9	582855	582863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185115
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15324	NC_010525	AAG	2	6	583401	583406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185115
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15327	NC_010525	GGT	2	6	583513	583518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185115
15328	NC_010525	AG	3	6	583530	583535	50 %	0 %	50 %	0 %	171185115
15329	NC_010525	CA	3	6	583649	583654	50 %	0 %	0 %	50 %	171185115
15330	NC_010525	AT	3	6	583700	583705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15331	NC_010525	CTG	2	6	583719	583724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15332	NC_010525	AT	3	6	583817	583822	50 %	50 %	0 %	0 %	171185116
15333	NC_010525	CTA	2	6	583853	583858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185116
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15338	NC_010525	A	6	6	583972	583977	100 %	0 %	0 %	0 %	171185116
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15347	NC_010525	GCG	2	6	584299	584304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185117
15348	NC_010525	AGT	2	6	584324	584329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185117
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15351	NC_010525	AAC	2	6	584424	584429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185117
15352	NC_010525	CCG	2	6	584561	584566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185117
15353	NC_010525	CGA	2	6	584639	584644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185117
15354	NC_010525	C	6	6	584746	584751	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15355	NC_010525	GCC	2	6	584807	584812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185118
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15357	NC_010525	G	6	6	584867	584872	0 %	0 %	100 %	0 %	171185118
15358	NC_010525	AGT	2	6	584907	584912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185118
15359	NC_010525	ACC	2	6	584939	584944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185118
15360	NC_010525	GAG	2	6	585022	585027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185118
15361	NC_010525	CGG	2	6	585028	585033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185118
15362	NC_010525	TAG	2	6	585067	585072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185118
15363	NC_010525	GGC	2	6	585175	585180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185118
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15485	NC_010525	TTC	2	6	589715	589720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185122
15486	NC_010525	CGC	2	6	589752	589757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185122
15487	NC_010525	GTA	2	6	589839	589844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185122
15488	NC_010525	A	6	6	589904	589909	100 %	0 %	0 %	0 %	171185122
15489	NC_010525	GCC	2	6	589933	589938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185122
15490	NC_010525	CGG	2	6	590091	590096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185123
15491	NC_010525	ATC	2	6	590122	590127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185123
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15499	NC_010525	AGA	2	6	590611	590616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185124
15500	NC_010525	GCAA	2	8	590652	590659	50 %	0 %	25 %	25 %	171185124

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