MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum neutrophilum V24Sta chromosome

Total Repeats: 45595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010525	CGG	2	6	551424	551429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185073
14502	NC_010525	GGC	2	6	551467	551472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185073
14503	NC_010525	TGG	2	6	551481	551486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185073
14504	NC_010525	GCGG	2	8	551531	551538	0 %	0 %	75 %	25 %	171185073
14505	NC_010525	GCC	2	6	551540	551545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185073
14506	NC_010525	GTG	2	6	551566	551571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185073
14507	NC_010525	CTC	2	6	551669	551674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185073
14508	NC_010525	AGC	2	6	551675	551680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185073
14509	NC_010525	AT	3	6	551698	551703	50 %	50 %	0 %	0 %	171185073
14510	NC_010525	CGA	2	6	551727	551732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185073
14511	NC_010525	TCA	2	6	551739	551744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185073
14512	NC_010525	CGT	2	6	551780	551785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185074
14513	NC_010525	CCT	2	6	551786	551791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185074
14514	NC_010525	CCG	2	6	551797	551802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185074
14515	NC_010525	CTT	2	6	551820	551825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185074
14516	NC_010525	CTT	2	6	551841	551846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185074
14517	NC_010525	G	6	6	551853	551858	0 %	0 %	100 %	0 %	171185074
14518	NC_010525	GCC	2	6	551866	551871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185074
14519	NC_010525	TAGA	2	8	551898	551905	50 %	25 %	25 %	0 %	171185074
14520	NC_010525	GCG	2	6	551918	551923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185074
14521	NC_010525	CGG	2	6	551925	551930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185074
14522	NC_010525	CGC	2	6	551967	551972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185074
14523	NC_010525	GCG	3	9	552025	552033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185074
14524	NC_010525	GGC	2	6	552042	552047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185074
14525	NC_010525	C	6	6	552064	552069	0 %	0 %	0 %	100 %	171185074
14526	NC_010525	CCG	2	6	552172	552177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185074
14527	NC_010525	GCC	2	6	552217	552222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185074
14528	NC_010525	GGA	2	6	552229	552234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185074
14529	NC_010525	CTC	2	6	552250	552255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185074
14530	NC_010525	AGG	3	9	552265	552273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185074
14531	NC_010525	TCC	2	6	552298	552303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185074
14532	NC_010525	GCC	2	6	552360	552365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185074
14533	NC_010525	AGG	2	6	552382	552387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185074
14534	NC_010525	TTGG	2	8	552429	552436	0 %	50 %	50 %	0 %	171185074
14535	NC_010525	CCTG	2	8	552491	552498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14536	NC_010525	GGA	2	6	552518	552523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185075
14537	NC_010525	CTC	2	6	552568	552573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185075
14538	NC_010525	GA	3	6	552595	552600	50 %	0 %	50 %	0 %	171185075
14539	NC_010525	GGC	2	6	552633	552638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185075
14540	NC_010525	CTC	2	6	552649	552654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185075
14541	NC_010525	AGG	2	6	552671	552676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185075
14542	NC_010525	TGA	2	6	552754	552759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_010525	GT	3	6	552766	552771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_010525	TCA	2	6	552866	552871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185076
14545	NC_010525	ACC	2	6	552895	552900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185076
14546	NC_010525	AAC	2	6	552916	552921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185076
14547	NC_010525	G	6	6	552929	552934	0 %	0 %	100 %	0 %	171185076
14548	NC_010525	CG	3	6	552964	552969	0 %	0 %	50 %	50 %	171185076
14549	NC_010525	AGT	2	6	552971	552976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185076
14550	NC_010525	CCG	2	6	553025	553030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185076
14551	NC_010525	GTA	2	6	553050	553055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185076
14552	NC_010525	CGG	2	6	553064	553069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185076
14553	NC_010525	TCT	2	6	553085	553090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185076
14554	NC_010525	CGG	2	6	553103	553108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185076
14555	NC_010525	CCA	3	9	553109	553117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185076
14556	NC_010525	GGT	2	6	553122	553127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185076
14557	NC_010525	CTC	2	6	553161	553166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185076
14558	NC_010525	GCCTCA	2	12	553217	553228	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171185076
14559	NC_010525	CCA	2	6	553244	553249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185076
14560	NC_010525	GCCGAC	2	12	553260	553271	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171185076
14561	NC_010525	TA	3	6	553297	553302	50 %	50 %	0 %	0 %	171185076
14562	NC_010525	TCT	2	6	553303	553308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185076
14563	NC_010525	TAT	2	6	553362	553367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171185076
14564	NC_010525	CAC	2	6	553407	553412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185076
14565	NC_010525	CGC	2	6	553542	553547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185077
14566	NC_010525	GATA	2	8	553594	553601	50 %	25 %	25 %	0 %	171185077
14567	NC_010525	ACG	2	6	553616	553621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185077
14568	NC_010525	GCC	2	6	553636	553641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185077
14569	NC_010525	GAG	2	6	553672	553677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185077
14570	NC_010525	CGC	2	6	553696	553701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185077
14571	NC_010525	TGA	2	6	553716	553721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185077
14572	NC_010525	GCC	2	6	553724	553729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185077
14573	NC_010525	C	6	6	553805	553810	0 %	0 %	0 %	100 %	171185077
14574	NC_010525	TCA	2	6	553817	553822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14575	NC_010525	TAC	2	6	553866	553871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_010525	GAA	2	6	553954	553959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_010525	CTC	2	6	553967	553972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14578	NC_010525	TCC	3	9	553974	553982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14579	NC_010525	CTC	3	9	553985	553993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14580	NC_010525	CTC	4	12	554009	554020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14581	NC_010525	CTC	3	9	554027	554035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14582	NC_010525	GTA	2	6	554042	554047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_010525	GGC	2	6	554098	554103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185078
14584	NC_010525	GA	3	6	554110	554115	50 %	0 %	50 %	0 %	171185078
14585	NC_010525	GGA	2	6	554230	554235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185078
14586	NC_010525	G	6	6	554241	554246	0 %	0 %	100 %	0 %	171185078
14587	NC_010525	CCT	3	9	554284	554292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185078
14588	NC_010525	G	6	6	554306	554311	0 %	0 %	100 %	0 %	171185078
14589	NC_010525	CCT	2	6	554314	554319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185078
14590	NC_010525	CCGC	2	8	554363	554370	0 %	0 %	25 %	75 %	171185078
14591	NC_010525	GC	3	6	554377	554382	0 %	0 %	50 %	50 %	171185078
14592	NC_010525	GAG	2	6	554389	554394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185078
14593	NC_010525	CCG	2	6	554432	554437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185078
14594	NC_010525	AGG	2	6	554495	554500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185078
14595	NC_010525	GGT	2	6	554509	554514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185078
14596	NC_010525	CGG	2	6	554541	554546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185078
14597	NC_010525	GAG	2	6	554561	554566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185078
14598	NC_010525	AG	3	6	554565	554570	50 %	0 %	50 %	0 %	171185078
14599	NC_010525	GGCT	2	8	554586	554593	0 %	25 %	50 %	25 %	171185078
14600	NC_010525	ACG	2	6	554613	554618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185078
14601	NC_010525	GTG	2	6	554665	554670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185078
14602	NC_010525	CGC	2	6	554676	554681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185079
14603	NC_010525	GGT	2	6	554682	554687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185079
14604	NC_010525	GCGCG	2	10	554711	554720	0 %	0 %	60 %	40 %	171185079
14605	NC_010525	AGG	2	6	554731	554736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185079
14606	NC_010525	AGAT	2	8	554768	554775	50 %	25 %	25 %	0 %	171185079
14607	NC_010525	GGC	2	6	554778	554783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185079
14608	NC_010525	AG	3	6	554806	554811	50 %	0 %	50 %	0 %	171185079
14609	NC_010525	GAGG	2	8	554814	554821	25 %	0 %	75 %	0 %	171185079
14610	NC_010525	GTG	2	6	554824	554829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185079
14611	NC_010525	G	6	6	554897	554902	0 %	0 %	100 %	0 %	171185080
14612	NC_010525	CGAGG	2	10	554937	554946	20 %	0 %	60 %	20 %	171185080
14613	NC_010525	ACG	2	6	554950	554955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185080
14614	NC_010525	GAG	2	6	555017	555022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185080
14615	NC_010525	GAG	2	6	555030	555035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185080
14616	NC_010525	CCT	2	6	555047	555052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185080
14617	NC_010525	GTT	2	6	555105	555110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171185080
14618	NC_010525	CGT	2	6	555137	555142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185080
14619	NC_010525	CCA	2	6	555151	555156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185080
14620	NC_010525	GCA	2	6	555338	555343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185080
14621	NC_010525	C	7	7	555368	555374	0 %	0 %	0 %	100 %	171185080
14622	NC_010525	ATA	2	6	555384	555389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171185080
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14627	NC_010525	GGC	2	6	555539	555544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185080
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14737	NC_010525	GGCT	2	8	560135	560142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14738	NC_010525	T	6	6	560229	560234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14857	NC_010525	TAAAC	2	10	564615	564624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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14865	NC_010525	CCG	2	6	565194	565199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185093
14866	NC_010525	CGTCT	2	10	565253	565262	0 %	40 %	20 %	40 %	171185093
14867	NC_010525	C	6	6	565329	565334	0 %	0 %	0 %	100 %	171185093
14868	NC_010525	ACC	2	6	565344	565349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185093
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14873	NC_010525	G	6	6	565516	565521	0 %	0 %	100 %	0 %	171185093
14874	NC_010525	CGC	2	6	565540	565545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185093
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