MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum neutrophilum V24Sta chromosome

Total Repeats: 45595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010525	GAGGGA	2	12	533435	533446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_010525	TTCGCG	2	12	533481	533492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_010525	AGGA	2	8	533493	533500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_010525	GCT	2	6	533506	533511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_010525	TCC	2	6	533587	533592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185050
14006	NC_010525	GGC	2	6	533595	533600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185050
14007	NC_010525	GGC	2	6	533615	533620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185050
14008	NC_010525	ACG	2	6	533637	533642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185050
14009	NC_010525	AGG	2	6	533652	533657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185050
14010	NC_010525	GGC	2	6	533660	533665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185050
14011	NC_010525	GTC	2	6	533747	533752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185050
14012	NC_010525	CCT	2	6	533773	533778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185050
14013	NC_010525	CTT	2	6	533834	533839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185050
14014	NC_010525	CTC	2	6	533898	533903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185050
14015	NC_010525	TCG	2	6	533907	533912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185050
14016	NC_010525	CTC	2	6	533931	533936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185050
14017	NC_010525	AGG	2	6	533985	533990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185050
14018	NC_010525	G	6	6	534042	534047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_010525	CGG	2	6	534115	534120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_010525	G	6	6	534187	534192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_010525	GGC	2	6	534245	534250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_010525	C	6	6	534294	534299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14023	NC_010525	GGC	3	9	534349	534357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_010525	CGT	2	6	534419	534424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_010525	TAG	2	6	534438	534443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_010525	TTG	2	6	534452	534457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_010525	G	6	6	534523	534528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_010525	TGGCTA	2	12	534569	534580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14029	NC_010525	CGC	2	6	534668	534673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14030	NC_010525	GCG	2	6	534724	534729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_010525	GCC	2	6	534747	534752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14032	NC_010525	AT	4	8	534765	534772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_010525	GCC	2	6	534775	534780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_010525	GGT	2	6	534811	534816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185051
14035	NC_010525	GCT	2	6	534840	534845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185051
14036	NC_010525	G	6	6	534848	534853	0 %	0 %	100 %	0 %	171185051
14037	NC_010525	GTG	2	6	534881	534886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185051
14038	NC_010525	GT	3	6	534896	534901	0 %	50 %	50 %	0 %	171185051
14039	NC_010525	GGTGGA	2	12	534913	534924	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	171185051
14040	NC_010525	CT	3	6	534929	534934	0 %	50 %	0 %	50 %	171185051
14041	NC_010525	TGGGG	2	10	534946	534955	0 %	20 %	80 %	0 %	171185051
14042	NC_010525	GGC	2	6	534988	534993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185051
14043	NC_010525	TCG	2	6	535002	535007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185051
14044	NC_010525	GGCCT	2	10	535020	535029	0 %	20 %	40 %	40 %	171185051
14045	NC_010525	G	6	6	535081	535086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_010525	GGC	2	6	535107	535112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185052
14047	NC_010525	CTC	2	6	535212	535217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185052
14048	NC_010525	GTA	2	6	535272	535277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185052
14049	NC_010525	CGG	2	6	535403	535408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185052
14050	NC_010525	AGG	3	9	535468	535476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185052
14051	NC_010525	TCT	2	6	535481	535486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185052
14052	NC_010525	TA	3	6	535587	535592	50 %	50 %	0 %	0 %	171185052
14053	NC_010525	TCC	2	6	535600	535605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185052
14054	NC_010525	CTC	2	6	535623	535628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185052
14055	NC_010525	TAG	2	6	535629	535634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185052
14056	NC_010525	GTC	2	6	535674	535679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185052
14057	NC_010525	GCA	2	6	535694	535699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185052
14058	NC_010525	AGA	2	6	535703	535708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_010525	CT	3	6	535723	535728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14060	NC_010525	ACC	2	6	535733	535738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_010525	GGGT	2	8	535911	535918	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_010525	CGC	2	6	535940	535945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14063	NC_010525	CGG	2	6	536004	536009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_010525	CCG	2	6	536013	536018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14065	NC_010525	TCC	2	6	536067	536072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14066	NC_010525	CAC	2	6	536096	536101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14067	NC_010525	TCG	2	6	536155	536160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185053
14068	NC_010525	GCG	2	6	536205	536210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185053
14069	NC_010525	GAG	2	6	536211	536216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
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14071	NC_010525	AGG	2	6	536251	536256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
14072	NC_010525	CGG	2	6	536269	536274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185053
14073	NC_010525	CTC	2	6	536289	536294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185053
14074	NC_010525	GCTG	2	8	536312	536319	0 %	25 %	50 %	25 %	171185053
14075	NC_010525	GAG	2	6	536331	536336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
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14078	NC_010525	TCG	2	6	536476	536481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185053
14079	NC_010525	TCG	2	6	536527	536532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185053
14080	NC_010525	AGA	2	6	536576	536581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185053
14081	NC_010525	AG	3	6	536615	536620	50 %	0 %	50 %	0 %	171185053
14082	NC_010525	TGT	2	6	536705	536710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171185053
14083	NC_010525	TGG	2	6	536746	536751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185053
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14085	NC_010525	GAG	2	6	536819	536824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
14086	NC_010525	GAG	2	6	536832	536837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
14087	NC_010525	GCC	2	6	536842	536847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185053
14088	NC_010525	CGAG	2	8	536852	536859	25 %	0 %	50 %	25 %	171185053
14089	NC_010525	GA	3	6	536942	536947	50 %	0 %	50 %	0 %	171185053
14090	NC_010525	GA	3	6	536987	536992	50 %	0 %	50 %	0 %	171185053
14091	NC_010525	GGA	2	6	537023	537028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
14092	NC_010525	AGG	2	6	537049	537054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
14093	NC_010525	GAG	2	6	537104	537109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185053
14094	NC_010525	AAC	2	6	537310	537315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185053
14095	NC_010525	TCT	2	6	537357	537362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_010525	GCC	2	6	537452	537457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14097	NC_010525	CT	3	6	537558	537563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_010525	CACC	2	8	537564	537571	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14099	NC_010525	GGC	3	9	537590	537598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185054
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14101	NC_010525	GCG	3	9	537609	537617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185054
14102	NC_010525	CT	3	6	537622	537627	0 %	50 %	0 %	50 %	171185054
14103	NC_010525	GCG	2	6	537633	537638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185054
14104	NC_010525	CAG	2	6	537677	537682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185054
14105	NC_010525	TGG	2	6	537685	537690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185054
14106	NC_010525	TC	3	6	537692	537697	0 %	50 %	0 %	50 %	171185054
14107	NC_010525	CCT	2	6	537703	537708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185054
14108	NC_010525	G	6	6	537721	537726	0 %	0 %	100 %	0 %	171185054
14109	NC_010525	CGG	2	6	537775	537780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185054
14110	NC_010525	G	6	6	537808	537813	0 %	0 %	100 %	0 %	171185054
14111	NC_010525	CGG	2	6	537850	537855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185054
14112	NC_010525	CT	3	6	537917	537922	0 %	50 %	0 %	50 %	171185054
14113	NC_010525	TC	3	6	537939	537944	0 %	50 %	0 %	50 %	171185054
14114	NC_010525	CTC	2	6	538038	538043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14115	NC_010525	AGG	2	6	538146	538151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_010525	TTG	2	6	538163	538168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_010525	GGC	2	6	538178	538183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_010525	CCT	2	6	538193	538198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14119	NC_010525	GTCTT	2	10	538203	538212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14120	NC_010525	GC	3	6	538234	538239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14121	NC_010525	CTGT	2	8	538262	538269	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_010525	CGG	2	6	538338	538343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_010525	CGG	2	6	538346	538351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_010525	TCC	2	6	538352	538357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14125	NC_010525	G	6	6	538423	538428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_010525	GCC	3	9	538433	538441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14127	NC_010525	GAG	2	6	538526	538531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_010525	ACG	2	6	538565	538570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_010525	TTCT	2	8	538646	538653	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14130	NC_010525	CTC	2	6	538716	538721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14131	NC_010525	CGC	2	6	538742	538747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14132	NC_010525	GCC	2	6	538762	538767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14133	NC_010525	T	6	6	538784	538789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_010525	GGT	2	6	538810	538815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185055
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14136	NC_010525	TCTG	2	8	538926	538933	0 %	50 %	25 %	25 %	171185055
14137	NC_010525	CGACT	2	10	538936	538945	20 %	20 %	20 %	40 %	171185055
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14158	NC_010525	CCTC	2	8	540007	540014	0 %	25 %	0 %	75 %	171185058
14159	NC_010525	CGG	2	6	540015	540020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185058
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14216	NC_010525	TAA	2	6	541766	541771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14231	NC_010525	CAG	2	6	542201	542206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185061
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14488	NC_010525	GTT	2	6	551006	551011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14489	NC_010525	CCG	2	6	551046	551051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185072
14490	NC_010525	GAC	2	6	551084	551089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185072
14491	NC_010525	CCT	2	6	551107	551112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185072
14492	NC_010525	C	6	6	551124	551129	0 %	0 %	0 %	100 %	171185072
14493	NC_010525	GGCG	2	8	551155	551162	0 %	0 %	75 %	25 %	171185072
14494	NC_010525	CGG	2	6	551164	551169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185072
14495	NC_010525	CGGC	2	8	551243	551250	0 %	0 %	50 %	50 %	171185073
14496	NC_010525	GCC	2	6	551303	551308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185073
14497	NC_010525	CT	4	8	551375	551382	0 %	50 %	0 %	50 %	171185073
14498	NC_010525	GAC	2	6	551383	551388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185073
14499	NC_010525	ACC	2	6	551393	551398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185073
14500	NC_010525	CCT	2	6	551401	551406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185073

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