MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum neutrophilum V24Sta chromosome

Total Repeats: 45595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010525	CTC	2	6	515679	515684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13502	NC_010525	CGG	2	6	515705	515710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185032
13503	NC_010525	C	6	6	515736	515741	0 %	0 %	0 %	100 %	171185032
13504	NC_010525	CTC	2	6	515782	515787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13505	NC_010525	TCT	2	6	515798	515803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185032
13506	NC_010525	CCTC	2	8	515807	515814	0 %	25 %	0 %	75 %	171185032
13507	NC_010525	CCA	2	6	515837	515842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185032
13508	NC_010525	GCCACG	2	12	515845	515856	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171185032
13509	NC_010525	TCC	2	6	515857	515862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13510	NC_010525	CTC	2	6	515901	515906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13511	NC_010525	CCT	2	6	515994	515999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13512	NC_010525	TCC	2	6	516073	516078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13513	NC_010525	CCG	2	6	516116	516121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13514	NC_010525	TCT	2	6	516155	516160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185032
13515	NC_010525	GT	3	6	516174	516179	0 %	50 %	50 %	0 %	171185032
13516	NC_010525	GGC	2	6	516183	516188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185032
13517	NC_010525	TCG	2	6	516220	516225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13518	NC_010525	GGC	2	6	516228	516233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185032
13519	NC_010525	CTC	2	6	516265	516270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13520	NC_010525	CT	3	6	516277	516282	0 %	50 %	0 %	50 %	171185032
13521	NC_010525	TGCG	2	8	516306	516313	0 %	25 %	50 %	25 %	171185032
13522	NC_010525	GTA	2	6	516320	516325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185032
13523	NC_010525	TCG	2	6	516328	516333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13524	NC_010525	CGGCGC	2	12	516365	516376	0 %	0 %	50 %	50 %	171185032
13525	NC_010525	GTA	2	6	516399	516404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171185032
13526	NC_010525	AGC	2	6	516482	516487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13527	NC_010525	CGC	2	6	516488	516493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13528	NC_010525	CAG	2	6	516519	516524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13529	NC_010525	CCTC	2	8	516590	516597	0 %	25 %	0 %	75 %	171185032
13530	NC_010525	ACC	2	6	516598	516603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171185032
13531	NC_010525	TCC	2	6	516604	516609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13532	NC_010525	TCT	2	6	516644	516649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185032
13533	NC_010525	GAAGTA	2	12	516756	516767	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	171185032
13534	NC_010525	CAG	2	6	516795	516800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13535	NC_010525	CGA	2	6	516821	516826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13536	NC_010525	TCC	2	6	516893	516898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13537	NC_010525	CCG	2	6	516961	516966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13538	NC_010525	TCG	2	6	517006	517011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13539	NC_010525	CGT	2	6	517016	517021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13540	NC_010525	GGC	2	6	517086	517091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185032
13541	NC_010525	AGA	2	6	517094	517099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185032
13542	NC_010525	CCG	2	6	517111	517116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13543	NC_010525	CCT	2	6	517160	517165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13544	NC_010525	CCG	2	6	517166	517171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13545	NC_010525	TGTA	2	8	517216	517223	25 %	50 %	25 %	0 %	171185032
13546	NC_010525	GCC	2	6	517236	517241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13547	NC_010525	GCC	2	6	517251	517256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13548	NC_010525	CGA	2	6	517280	517285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13549	NC_010525	CCG	2	6	517291	517296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13550	NC_010525	CGA	2	6	517328	517333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13551	NC_010525	CT	3	6	517335	517340	0 %	50 %	0 %	50 %	171185032
13552	NC_010525	TCC	3	9	517351	517359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185032
13553	NC_010525	G	6	6	517366	517371	0 %	0 %	100 %	0 %	171185032
13554	NC_010525	CAG	2	6	517377	517382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185032
13555	NC_010525	GCC	2	6	517387	517392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185032
13556	NC_010525	T	6	6	517393	517398	0 %	100 %	0 %	0 %	171185032
13557	NC_010525	A	6	6	517417	517422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_010525	TAAT	2	8	517424	517431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_010525	CTG	2	6	517549	517554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185033
13560	NC_010525	CGT	2	6	517592	517597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185033
13561	NC_010525	GAA	2	6	517632	517637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185033
13562	NC_010525	CTC	3	9	517726	517734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185033
13563	NC_010525	GAG	2	6	517743	517748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185033
13564	NC_010525	AAC	2	6	517773	517778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171185033
13565	NC_010525	CTC	2	6	517852	517857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185033
13566	NC_010525	AAG	2	6	517867	517872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185033
13567	NC_010525	GTC	2	6	517900	517905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185033
13568	NC_010525	AGC	2	6	518000	518005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185033
13569	NC_010525	CGA	2	6	518052	518057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185033
13570	NC_010525	TCG	2	6	518072	518077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185033
13571	NC_010525	TACAG	2	10	518093	518102	40 %	20 %	20 %	20 %	171185033
13572	NC_010525	GAG	2	6	518152	518157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185033
13573	NC_010525	TCC	2	6	518177	518182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185033
13574	NC_010525	AG	3	6	518215	518220	50 %	0 %	50 %	0 %	171185033
13575	NC_010525	GAA	2	6	518227	518232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171185033
13576	NC_010525	GGA	2	6	518247	518252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185033
13577	NC_010525	GT	4	8	518254	518261	0 %	50 %	50 %	0 %	171185033
13578	NC_010525	AG	3	6	518269	518274	50 %	0 %	50 %	0 %	171185033
13579	NC_010525	GCG	2	6	518278	518283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185033
13580	NC_010525	GGC	2	6	518284	518289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185033
13581	NC_010525	CGG	2	6	518310	518315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185033
13582	NC_010525	TGG	2	6	518339	518344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185033
13583	NC_010525	GAG	2	6	518364	518369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185034
13584	NC_010525	GAC	3	9	518415	518423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185034
13585	NC_010525	TC	3	6	518459	518464	0 %	50 %	0 %	50 %	171185034
13586	NC_010525	ACG	2	6	518472	518477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185034
13587	NC_010525	AG	3	6	518562	518567	50 %	0 %	50 %	0 %	171185034
13588	NC_010525	GAG	2	6	518604	518609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185034
13589	NC_010525	CCT	2	6	518611	518616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185034
13590	NC_010525	CGT	2	6	518663	518668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185034
13591	NC_010525	GCC	2	6	518673	518678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185034
13592	NC_010525	TCC	2	6	518721	518726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185034
13593	NC_010525	GCG	2	6	518727	518732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185034
13594	NC_010525	AAT	2	6	518779	518784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171185034
13595	NC_010525	GCC	2	6	518789	518794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185035
13596	NC_010525	TCAGAG	2	12	518796	518807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171185035
13597	NC_010525	CGC	2	6	518814	518819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185035
13598	NC_010525	TCG	2	6	518847	518852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185035
13599	NC_010525	TGG	2	6	518900	518905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171185035
13600	NC_010525	AGG	2	6	518920	518925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185035
13601	NC_010525	G	6	6	518952	518957	0 %	0 %	100 %	0 %	171185035
13602	NC_010525	AGG	2	6	518990	518995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185035
13603	NC_010525	AG	3	6	519056	519061	50 %	0 %	50 %	0 %	171185035
13604	NC_010525	TCG	2	6	519068	519073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185035
13605	NC_010525	CGT	2	6	519094	519099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185035
13606	NC_010525	GGC	2	6	519128	519133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185035
13607	NC_010525	CGG	2	6	519145	519150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185035
13608	NC_010525	CTC	2	6	519179	519184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185035
13609	NC_010525	C	6	6	519197	519202	0 %	0 %	0 %	100 %	171185035
13610	NC_010525	GCC	2	6	519281	519286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171185035
13611	NC_010525	G	6	6	519316	519321	0 %	0 %	100 %	0 %	171185035
13612	NC_010525	CT	3	6	519352	519357	0 %	50 %	0 %	50 %	171185035
13613	NC_010525	GAC	2	6	519446	519451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185035
13614	NC_010525	G	6	6	519455	519460	0 %	0 %	100 %	0 %	171185035
13615	NC_010525	C	6	6	519475	519480	0 %	0 %	0 %	100 %	171185035
13616	NC_010525	CGT	2	6	519487	519492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185035
13617	NC_010525	CGG	2	6	519501	519506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185035
13618	NC_010525	AT	3	6	519530	519535	50 %	50 %	0 %	0 %	171185035
13619	NC_010525	CTT	2	6	519571	519576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171185035
13620	NC_010525	TCC	2	6	519600	519605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171185035
13621	NC_010525	GGA	2	6	519622	519627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185035
13622	NC_010525	GAG	2	6	519709	519714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185035
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13650	NC_010525	CGG	3	9	520869	520877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13651	NC_010525	AAC	2	6	520882	520887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13652	NC_010525	GC	3	6	520895	520900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13653	NC_010525	GAA	2	6	520950	520955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13658	NC_010525	ATCT	2	8	521099	521106	25 %	50 %	0 %	25 %	171185037
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13729	NC_010525	GCT	2	6	524206	524211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171185041
13730	NC_010525	ACT	2	6	524217	524222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171185041
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13732	NC_010525	GGA	2	6	524297	524302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171185041
13733	NC_010525	AG	3	6	524315	524320	50 %	0 %	50 %	0 %	171185041
13734	NC_010525	CCAAG	2	10	524321	524330	40 %	0 %	20 %	40 %	171185041
13735	NC_010525	AC	3	6	524418	524423	50 %	0 %	0 %	50 %	171185041
13736	NC_010525	CGA	2	6	524425	524430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171185041
13737	NC_010525	ATAAGG	2	12	524466	524477	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	171185041
13738	NC_010525	GCG	2	6	524535	524540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185041
13739	NC_010525	GGC	2	6	524569	524574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171185041
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13995	NC_010525	GGT	2	6	533270	533275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13996	NC_010525	CGG	2	6	533295	533300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13997	NC_010525	GGC	2	6	533305	533310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13998	NC_010525	AGG	2	6	533328	533333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13999	NC_010525	AT	3	6	533347	533352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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