MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum neutrophilum V24Sta chromosome

Total Repeats: 45595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010525	GAG	2	6	423134	423139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184940
11002	NC_010525	C	7	7	423164	423170	0 %	0 %	0 %	100 %	171184940
11003	NC_010525	GGA	3	9	423271	423279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184940
11004	NC_010525	ACT	2	6	423300	423305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184940
11005	NC_010525	GAG	2	6	423404	423409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184940
11006	NC_010525	CGT	2	6	423478	423483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184940
11007	NC_010525	GCC	2	6	423511	423516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184940
11008	NC_010525	G	6	6	423520	423525	0 %	0 %	100 %	0 %	171184940
11009	NC_010525	CGC	2	6	423534	423539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184940
11010	NC_010525	AGG	2	6	423546	423551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184940
11011	NC_010525	ACA	2	6	423585	423590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171184940
11012	NC_010525	TCG	2	6	423636	423641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184940
11013	NC_010525	ACT	2	6	423645	423650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184940
11014	NC_010525	CCA	2	6	423651	423656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171184940
11015	NC_010525	GGT	2	6	423658	423663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171184940
11016	NC_010525	GCC	2	6	423664	423669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184940
11017	NC_010525	ATC	2	6	423727	423732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184941
11018	NC_010525	GAG	2	6	423757	423762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184941
11019	NC_010525	AG	3	6	423805	423810	50 %	0 %	50 %	0 %	171184941
11020	NC_010525	CGT	2	6	423852	423857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184941
11021	NC_010525	CTG	2	6	423916	423921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184941
11022	NC_010525	GAG	2	6	423931	423936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184941
11023	NC_010525	AC	3	6	423985	423990	50 %	0 %	0 %	50 %	171184941
11024	NC_010525	TCC	2	6	424001	424006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184941
11025	NC_010525	TGT	2	6	424007	424012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171184941
11026	NC_010525	TCG	2	6	424037	424042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184941
11027	NC_010525	GAG	2	6	424126	424131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184941
11028	NC_010525	GTC	2	6	424135	424140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184941
11029	NC_010525	G	6	6	424166	424171	0 %	0 %	100 %	0 %	171184941
11030	NC_010525	CG	3	6	424227	424232	0 %	0 %	50 %	50 %	171184941
11031	NC_010525	CG	3	6	424262	424267	0 %	0 %	50 %	50 %	171184941
11032	NC_010525	GA	3	6	424284	424289	50 %	0 %	50 %	0 %	171184941
11033	NC_010525	GA	3	6	424329	424334	50 %	0 %	50 %	0 %	171184941
11034	NC_010525	AGG	2	6	424351	424356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184941
11035	NC_010525	G	6	6	424424	424429	0 %	0 %	100 %	0 %	171184941
11036	NC_010525	AGGC	2	8	424501	424508	25 %	0 %	50 %	25 %	171184941
11037	NC_010525	CGG	2	6	424550	424555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184941
11038	NC_010525	GCG	2	6	424570	424575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184941
11039	NC_010525	GCC	2	6	424579	424584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184941
11040	NC_010525	TGGAGG	2	12	424619	424630	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	171184941
11041	NC_010525	C	6	6	424631	424636	0 %	0 %	0 %	100 %	171184941
11042	NC_010525	CGG	2	6	424667	424672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184941
11043	NC_010525	GGA	2	6	424748	424753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184941
11044	NC_010525	CGG	2	6	424760	424765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184941
11045	NC_010525	ATG	2	6	424777	424782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171184941
11046	NC_010525	TGA	2	6	424787	424792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171184941
11047	NC_010525	CTA	2	6	424824	424829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184941
11048	NC_010525	GGC	2	6	424840	424845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184941
11049	NC_010525	GGCG	2	8	424852	424859	0 %	0 %	75 %	25 %	171184941
11050	NC_010525	ATA	2	6	425059	425064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171184941
11051	NC_010525	GGC	2	6	425101	425106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184941
11052	NC_010525	GGCGG	2	10	425141	425150	0 %	0 %	80 %	20 %	171184941
11053	NC_010525	CGA	2	6	425184	425189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184941
11054	NC_010525	CGA	2	6	425193	425198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184941
11055	NC_010525	GGA	2	6	425221	425226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171184941
11056	NC_010525	C	6	6	425235	425240	0 %	0 %	0 %	100 %	171184941
11057	NC_010525	TA	4	8	425269	425276	50 %	50 %	0 %	0 %	171184942
11058	NC_010525	CTG	2	6	425280	425285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184942
11059	NC_010525	C	6	6	425399	425404	0 %	0 %	0 %	100 %	171184942
11060	NC_010525	CCA	2	6	425477	425482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171184942
11061	NC_010525	C	6	6	425492	425497	0 %	0 %	0 %	100 %	171184942
11062	NC_010525	CAT	2	6	425555	425560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184942
11063	NC_010525	ACACCC	2	12	425600	425611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_010525	C	6	6	425641	425646	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11065	NC_010525	CCG	2	6	425670	425675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184943
11066	NC_010525	GGCC	2	8	425695	425702	0 %	0 %	50 %	50 %	171184943
11067	NC_010525	CCACC	2	10	425726	425735	20 %	0 %	0 %	80 %	171184943
11068	NC_010525	GAC	2	6	425783	425788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184943
11069	NC_010525	TC	3	6	425790	425795	0 %	50 %	0 %	50 %	171184943
11070	NC_010525	GCC	2	6	425796	425801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184943
11071	NC_010525	TCC	2	6	425802	425807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184943
11072	NC_010525	GTCCGG	2	12	425834	425845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171184943
11073	NC_010525	CCAG	2	8	425980	425987	25 %	0 %	25 %	50 %	171184943
11074	NC_010525	CTC	3	9	425993	426001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184943
11075	NC_010525	GGC	3	9	426008	426016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184943
11076	NC_010525	GCC	2	6	426048	426053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184943
11077	NC_010525	CGC	2	6	426086	426091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184943
11078	NC_010525	CGA	2	6	426139	426144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184943
11079	NC_010525	AAG	2	6	426152	426157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171184943
11080	NC_010525	CGC	2	6	426161	426166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184943
11081	NC_010525	CTC	2	6	426176	426181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184943
11082	NC_010525	TC	3	6	426200	426205	0 %	50 %	0 %	50 %	171184943
11083	NC_010525	A	6	6	426246	426251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_010525	GC	3	6	426290	426295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11085	NC_010525	AGTAT	2	10	426407	426416	40 %	40 %	20 %	0 %	171184944
11086	NC_010525	TG	3	6	426424	426429	0 %	50 %	50 %	0 %	171184944
11087	NC_010525	GCTTG	2	10	426432	426441	0 %	40 %	40 %	20 %	171184944
11088	NC_010525	CT	3	6	426453	426458	0 %	50 %	0 %	50 %	171184944
11089	NC_010525	ACT	2	6	426502	426507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184944
11090	NC_010525	ACCCCC	2	12	426523	426534	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	171184944
11091	NC_010525	CTA	2	6	426538	426543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184944
11092	NC_010525	ACC	2	6	426562	426567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171184944
11093	NC_010525	CAT	2	6	426626	426631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171184944
11094	NC_010525	TCT	2	6	426696	426701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171184944
11095	NC_010525	ACG	2	6	426709	426714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184944
11096	NC_010525	CCT	2	6	426743	426748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184944
11097	NC_010525	CGG	2	6	426889	426894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184945
11098	NC_010525	TCG	2	6	426925	426930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184945
11099	NC_010525	CCT	2	6	426953	426958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184945
11100	NC_010525	TCC	2	6	426970	426975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184945
11101	NC_010525	GCC	2	6	426985	426990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171184945
11102	NC_010525	CT	3	6	426999	427004	0 %	50 %	0 %	50 %	171184945
11103	NC_010525	CGG	2	6	427031	427036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184945
11104	NC_010525	CCT	2	6	427070	427075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184945
11105	NC_010525	CAG	2	6	427098	427103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184945
11106	NC_010525	TG	4	8	427172	427179	0 %	50 %	50 %	0 %	171184945
11107	NC_010525	AAG	2	6	427222	427227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171184945
11108	NC_010525	CTC	2	6	427272	427277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184945
11109	NC_010525	CAG	2	6	427308	427313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184945
11110	NC_010525	GAGAA	2	10	427315	427324	60 %	0 %	40 %	0 %	171184945
11111	NC_010525	CCCT	2	8	427400	427407	0 %	25 %	0 %	75 %	171184945
11112	NC_010525	GCG	2	6	427408	427413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184945
11113	NC_010525	CAG	2	6	427434	427439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171184945
11114	NC_010525	GCG	3	9	427444	427452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184945
11115	NC_010525	TCG	2	6	427474	427479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171184945
11116	NC_010525	CTCG	2	8	427506	427513	0 %	25 %	25 %	50 %	171184945
11117	NC_010525	CTC	2	6	427551	427556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184945
11118	NC_010525	AACC	2	8	427557	427564	50 %	0 %	0 %	50 %	171184945
11119	NC_010525	GGC	2	6	427670	427675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184945
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11121	NC_010525	CTC	2	6	427755	427760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184945
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11493	NC_010525	GGC	2	6	442533	442538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171184959
11494	NC_010525	CCA	2	6	442577	442582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171184959
11495	NC_010525	CCT	2	6	442605	442610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171184959
11496	NC_010525	GGT	2	6	442645	442650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171184959
11497	NC_010525	TC	3	6	442683	442688	0 %	50 %	0 %	50 %	171184959
11498	NC_010525	TTG	2	6	442843	442848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171184959
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11500	NC_010525	AT	3	6	442972	442977	50 %	50 %	0 %	0 %	171184959

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