MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida W619 chromosome

Total Repeats: 120510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010501	TCGG	2	8	130131	130138	0 %	25 %	50 %	25 %	170719310
2502	NC_010501	TCT	2	6	130165	130170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719310
2503	NC_010501	TCA	2	6	130183	130188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719310
2504	NC_010501	GCG	2	6	130201	130206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719310
2505	NC_010501	CCGGCC	2	12	130209	130220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719310
2506	NC_010501	GGTC	2	8	130252	130259	0 %	25 %	50 %	25 %	170719310
2507	NC_010501	TGC	2	6	130349	130354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719311
2508	NC_010501	GGT	2	6	130371	130376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719311
2509	NC_010501	ACG	2	6	130412	130417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719311
2510	NC_010501	CGG	2	6	130452	130457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719311
2511	NC_010501	GAT	2	6	130596	130601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719311
2512	NC_010501	CAG	2	6	130714	130719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719311
2513	NC_010501	TGC	2	6	130721	130726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719311
2514	NC_010501	TCG	2	6	130763	130768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719311
2515	NC_010501	CCG	2	6	130840	130845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719311
2516	NC_010501	ACT	2	6	130920	130925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719312
2517	NC_010501	CCA	2	6	130959	130964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719312
2518	NC_010501	TCA	2	6	130974	130979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719312
2519	NC_010501	TCG	2	6	131055	131060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719312
2520	NC_010501	GCT	3	9	131065	131073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719312
2521	NC_010501	GGT	2	6	131104	131109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719312
2522	NC_010501	GC	3	6	131136	131141	0 %	0 %	50 %	50 %	170719312
2523	NC_010501	TCT	2	6	131181	131186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719312
2524	NC_010501	TTC	2	6	131198	131203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719312
2525	NC_010501	CTT	2	6	131209	131214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719312
2526	NC_010501	TACG	2	8	131228	131235	25 %	25 %	25 %	25 %	170719312
2527	NC_010501	GGT	2	6	131258	131263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719312
2528	NC_010501	CGC	2	6	131352	131357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719312
2529	NC_010501	ACCATC	2	12	131426	131437	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170719312
2530	NC_010501	CAT	2	6	131441	131446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719312
2531	NC_010501	ACC	2	6	131460	131465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719312
2532	NC_010501	CTG	2	6	131501	131506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719312
2533	NC_010501	CTT	2	6	131599	131604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719312
2534	NC_010501	GGC	2	6	131719	131724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719312
2535	NC_010501	TCG	2	6	131742	131747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719312
2536	NC_010501	TGTGG	2	10	131749	131758	0 %	40 %	60 %	0 %	170719312
2537	NC_010501	GCT	2	6	131884	131889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_010501	TGA	2	6	131959	131964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719313
2539	NC_010501	CAGG	2	8	131990	131997	25 %	0 %	50 %	25 %	170719313
2540	NC_010501	TGG	2	6	132091	132096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719313
2541	NC_010501	CAT	2	6	132104	132109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719313
2542	NC_010501	ACCC	2	8	132208	132215	25 %	0 %	0 %	75 %	170719314
2543	NC_010501	GCT	2	6	132255	132260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719314
2544	NC_010501	GCCGA	2	10	132270	132279	20 %	0 %	40 %	40 %	170719314
2545	NC_010501	GC	3	6	132286	132291	0 %	0 %	50 %	50 %	170719314
2546	NC_010501	CGC	2	6	132327	132332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719314
2547	NC_010501	CAGTTG	2	12	132344	132355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170719314
2548	NC_010501	CCG	2	6	132373	132378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719314
2549	NC_010501	TGC	2	6	132417	132422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719314
2550	NC_010501	CAGG	2	8	132446	132453	25 %	0 %	50 %	25 %	170719314
2551	NC_010501	TGC	2	6	132462	132467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719314
2552	NC_010501	CCAGC	2	10	132481	132490	20 %	0 %	20 %	60 %	170719314
2553	NC_010501	GGT	2	6	132516	132521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719314
2554	NC_010501	CCG	2	6	132535	132540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719314
2555	NC_010501	GCA	2	6	132609	132614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719314
2556	NC_010501	ACCCCG	2	12	132627	132638	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	170719314
2557	NC_010501	CTG	2	6	132659	132664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719314
2558	NC_010501	GCCCG	2	10	132736	132745	0 %	0 %	40 %	60 %	170719314
2559	NC_010501	GTG	2	6	132770	132775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719314
2560	NC_010501	TGC	2	6	132840	132845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719314
2561	NC_010501	TGGC	2	8	132859	132866	0 %	25 %	50 %	25 %	170719314
2562	NC_010501	ACA	2	6	132867	132872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719314
2563	NC_010501	GCC	2	6	132891	132896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719314
2564	NC_010501	ACC	2	6	132897	132902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719314
2565	NC_010501	CTG	2	6	132969	132974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719315
2566	NC_010501	GTG	2	6	132975	132980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719315
2567	NC_010501	GAT	2	6	132989	132994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719315
2568	NC_010501	CCA	2	6	133000	133005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719315
2569	NC_010501	GAT	2	6	133058	133063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719315
2570	NC_010501	CTG	2	6	133122	133127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719315
2571	NC_010501	TTGGCC	2	12	133195	133206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719315
2572	NC_010501	GCCA	2	8	133221	133228	25 %	0 %	25 %	50 %	170719315
2573	NC_010501	CGC	2	6	133351	133356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719315
2574	NC_010501	TCG	2	6	133366	133371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719315
2575	NC_010501	TGC	2	6	133390	133395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719315
2576	NC_010501	CTG	2	6	133522	133527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2577	NC_010501	GCT	2	6	133530	133535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2578	NC_010501	CTGGC	2	10	133593	133602	0 %	20 %	40 %	40 %	170719316
2579	NC_010501	TCA	2	6	133613	133618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719316
2580	NC_010501	CG	3	6	133781	133786	0 %	0 %	50 %	50 %	170719316
2581	NC_010501	GGC	2	6	133839	133844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719316
2582	NC_010501	GTC	2	6	133885	133890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2583	NC_010501	CTG	2	6	133900	133905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2584	NC_010501	TAC	2	6	133914	133919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719316
2585	NC_010501	TTG	2	6	133927	133932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170719316
2586	NC_010501	TCC	2	6	133934	133939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170719316
2587	NC_010501	GCG	2	6	133995	134000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719316
2588	NC_010501	TGC	2	6	134004	134009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2589	NC_010501	GCT	2	6	134016	134021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2590	NC_010501	GGT	2	6	134022	134027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719316
2591	NC_010501	GGC	2	6	134047	134052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719316
2592	NC_010501	GTG	2	6	134112	134117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719316
2593	NC_010501	GGGC	2	8	134178	134185	0 %	0 %	75 %	25 %	170719316
2594	NC_010501	GC	3	6	134200	134205	0 %	0 %	50 %	50 %	170719316
2595	NC_010501	CCAT	2	8	134210	134217	25 %	25 %	0 %	50 %	170719316
2596	NC_010501	GC	3	6	134234	134239	0 %	0 %	50 %	50 %	170719316
2597	NC_010501	TGC	2	6	134255	134260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2598	NC_010501	CTG	2	6	134317	134322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2599	NC_010501	GGC	2	6	134404	134409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719316
2600	NC_010501	TGC	2	6	134417	134422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2601	NC_010501	CGT	2	6	134454	134459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719316
2602	NC_010501	GGT	3	9	134606	134614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719317
2603	NC_010501	GCTGAT	2	12	134615	134626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170719317
2604	NC_010501	TGG	2	6	134635	134640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719317
2605	NC_010501	TGC	2	6	134680	134685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719317
2606	NC_010501	G	6	6	134717	134722	0 %	0 %	100 %	0 %	170719317
2607	NC_010501	GCG	2	6	134727	134732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719317
2608	NC_010501	TCGCCC	2	12	134833	134844	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	170719317
2609	NC_010501	GCT	2	6	134849	134854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719317
2610	NC_010501	CGC	2	6	134962	134967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719317
2611	NC_010501	GGCGC	2	10	134994	135003	0 %	0 %	60 %	40 %	170719317
2612	NC_010501	CGC	3	9	135001	135009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719317
2613	NC_010501	CAGT	2	8	135025	135032	25 %	25 %	25 %	25 %	170719317
2614	NC_010501	TGC	2	6	135055	135060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719317
2615	NC_010501	ATC	2	6	135069	135074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719317
2616	NC_010501	CGC	2	6	135085	135090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719317
2617	NC_010501	AGG	2	6	135121	135126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170719317
2618	NC_010501	TGC	2	6	135151	135156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719317
2619	NC_010501	CTG	2	6	135213	135218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719317
2620	NC_010501	TGC	2	6	135229	135234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719317
2621	NC_010501	GCCG	2	8	135331	135338	0 %	0 %	50 %	50 %	170719317
2622	NC_010501	TTG	2	6	135403	135408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170719317
2623	NC_010501	CAA	2	6	135499	135504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719318
2624	NC_010501	CAT	2	6	135556	135561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719318
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2626	NC_010501	TGACCA	2	12	135594	135605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170719318
2627	NC_010501	GCT	2	6	135655	135660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719318
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2630	NC_010501	TCG	2	6	135843	135848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719318
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2632	NC_010501	CGG	2	6	135912	135917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719318
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2635	NC_010501	CAA	2	6	136107	136112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_010501	GC	3	6	136135	136140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2637	NC_010501	ATT	2	6	136278	136283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170719319
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2691	NC_010501	ACG	2	6	138367	138372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2713	NC_010501	A	7	7	139477	139483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2714	NC_010501	GCA	2	6	139556	139561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2721	NC_010501	CAG	2	6	140084	140089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719322
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2727	NC_010501	CAG	3	9	140516	140524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719322
2728	NC_010501	CGT	2	6	140551	140556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719322
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2730	NC_010501	GGTACT	2	12	140596	140607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170719322
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2732	NC_010501	TGG	2	6	140671	140676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719322
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2734	NC_010501	GGC	2	6	140762	140767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719322
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2736	NC_010501	GTT	2	6	140888	140893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170719322
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2738	NC_010501	GTA	2	6	140918	140923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719322
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2740	NC_010501	ATG	2	6	140991	140996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719322
2741	NC_010501	ATC	2	6	141000	141005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719322
2742	NC_010501	GCC	2	6	141217	141222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719323
2743	NC_010501	GGC	2	6	141300	141305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719323
2744	NC_010501	CGG	2	6	141353	141358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719323
2745	NC_010501	CAT	2	6	141427	141432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719323
2746	NC_010501	GGC	3	9	141465	141473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719323
2747	NC_010501	TGG	2	6	141551	141556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719323
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2749	NC_010501	ACC	2	6	141682	141687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719323
2750	NC_010501	TTGC	2	8	141763	141770	0 %	50 %	25 %	25 %	170719323
2751	NC_010501	CCTT	2	8	141785	141792	0 %	50 %	0 %	50 %	170719323
2752	NC_010501	CTG	3	9	141808	141816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719323
2753	NC_010501	GTG	2	6	141929	141934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719323
2754	NC_010501	TG	3	6	142175	142180	0 %	50 %	50 %	0 %	170719324
2755	NC_010501	ACCC	2	8	142193	142200	25 %	0 %	0 %	75 %	170719324
2756	NC_010501	GCG	2	6	142259	142264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719324
2757	NC_010501	AGGCC	2	10	142311	142320	20 %	0 %	40 %	40 %	170719324
2758	NC_010501	TCA	2	6	142362	142367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719324
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2760	NC_010501	GTGGG	2	10	142514	142523	0 %	20 %	80 %	0 %	170719324
2761	NC_010501	TCG	2	6	142580	142585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719324
2762	NC_010501	TCG	2	6	142601	142606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719324
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2765	NC_010501	CAC	2	6	142744	142749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2766	NC_010501	GGGC	2	8	142829	142836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2767	NC_010501	TTG	2	6	142927	142932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2768	NC_010501	GC	3	6	142939	142944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2769	NC_010501	CGA	2	6	142969	142974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719325
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2772	NC_010501	CTG	2	6	143106	143111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719325
2773	NC_010501	ATC	2	6	143154	143159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719325
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2796	NC_010501	GGTC	2	8	144474	144481	0 %	25 %	50 %	25 %	170719326
2797	NC_010501	CAA	2	6	144606	144611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2798	NC_010501	CAT	2	6	144672	144677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719327
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2845	NC_010501	TCT	2	6	146925	146930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719330
2846	NC_010501	TAC	2	6	147022	147027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2848	NC_010501	GGC	2	6	147117	147122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2849	NC_010501	TA	4	8	147146	147153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2850	NC_010501	CGA	2	6	147167	147172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2982	NC_010501	TCGA	2	8	153328	153335	25 %	25 %	25 %	25 %	170719334
2983	NC_010501	TTC	2	6	153343	153348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719334
2984	NC_010501	CTG	2	6	153388	153393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719334
2985	NC_010501	GCT	2	6	153414	153419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719334
2986	NC_010501	GGT	2	6	153429	153434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719334
2987	NC_010501	CGTG	2	8	153477	153484	0 %	25 %	50 %	25 %	170719334
2988	NC_010501	TGC	2	6	153536	153541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719334
2989	NC_010501	ATG	2	6	153559	153564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719334
2990	NC_010501	TGG	2	6	153620	153625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719334
2991	NC_010501	CGT	2	6	153644	153649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719334
2992	NC_010501	AGA	2	6	153689	153694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719334
2993	NC_010501	ACG	2	6	153719	153724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719334
2994	NC_010501	CG	3	6	153753	153758	0 %	0 %	50 %	50 %	170719334
2995	NC_010501	GCT	3	9	153780	153788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719334
2996	NC_010501	GGTGAT	2	12	153789	153800	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170719334
2997	NC_010501	CGG	2	6	153818	153823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719334
2998	NC_010501	ACC	2	6	153836	153841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719334
2999	NC_010501	GCA	2	6	153978	153983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719335
3000	NC_010501	TAC	2	6	154090	154095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719335

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