MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida W619 chromosome

Total Repeats: 120510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010501	GA	3	6	533267	533272	50 %	0 %	50 %	0 %	170719671
11002	NC_010501	CGGG	2	8	533481	533488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11003	NC_010501	TG	3	6	533516	533521	0 %	50 %	50 %	0 %	170719672
11004	NC_010501	CTG	2	6	533530	533535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719672
11005	NC_010501	TGC	2	6	533562	533567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719672
11006	NC_010501	TGA	2	6	533697	533702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719672
11007	NC_010501	CTG	2	6	533722	533727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719672
11008	NC_010501	GGC	2	6	533742	533747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719672
11009	NC_010501	CGC	2	6	533833	533838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719672
11010	NC_010501	CGG	2	6	533948	533953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719672
11011	NC_010501	GGCCT	2	10	534055	534064	0 %	20 %	40 %	40 %	170719672
11012	NC_010501	GTG	2	6	534143	534148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719672
11013	NC_010501	CAGGCG	2	12	534217	534228	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	170719672
11014	NC_010501	CTGC	2	8	534231	534238	0 %	25 %	25 %	50 %	170719672
11015	NC_010501	CAGG	2	8	534250	534257	25 %	0 %	50 %	25 %	170719672
11016	NC_010501	AGC	2	6	534260	534265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719672
11017	NC_010501	AGA	2	6	534273	534278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719672
11018	NC_010501	GCA	2	6	534348	534353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_010501	GCA	2	6	534391	534396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719673
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11021	NC_010501	GGGGTA	2	12	534560	534571	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	170719673
11022	NC_010501	ACA	2	6	534580	534585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719673
11023	NC_010501	CGG	2	6	534659	534664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719673
11024	NC_010501	GGC	2	6	534704	534709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719673
11025	NC_010501	GTGG	2	8	534718	534725	0 %	25 %	75 %	0 %	170719673
11026	NC_010501	AGT	2	6	534784	534789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719673
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11028	NC_010501	GGC	2	6	534833	534838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719673
11029	NC_010501	TGGA	2	8	534884	534891	25 %	25 %	50 %	0 %	170719673
11030	NC_010501	CGG	2	6	534937	534942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719673
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11032	NC_010501	CAG	2	6	535013	535018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719673
11033	NC_010501	CTG	2	6	535037	535042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719673
11034	NC_010501	CCG	2	6	535059	535064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719673
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11039	NC_010501	TGCT	2	8	535194	535201	0 %	50 %	25 %	25 %	170719673
11040	NC_010501	GTTC	2	8	535222	535229	0 %	50 %	25 %	25 %	170719673
11041	NC_010501	GCCGA	2	10	535395	535404	20 %	0 %	40 %	40 %	170719673
11042	NC_010501	TGGC	2	8	535450	535457	0 %	25 %	50 %	25 %	170719673
11043	NC_010501	GAAAT	2	10	535475	535484	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_010501	AAT	2	6	535538	535543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_010501	GTT	2	6	535563	535568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170719674
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11052	NC_010501	ATG	2	6	535795	535800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719674
11053	NC_010501	GC	3	6	535835	535840	0 %	0 %	50 %	50 %	170719674
11054	NC_010501	GAAGTA	2	12	535848	535859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170719674
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11060	NC_010501	GC	3	6	536143	536148	0 %	0 %	50 %	50 %	170719674
11061	NC_010501	TGCGG	2	10	536182	536191	0 %	20 %	60 %	20 %	170719674
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11109	NC_010501	CAT	2	6	538223	538228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11119	NC_010501	CGA	2	6	538814	538819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719677
11120	NC_010501	CAC	2	6	538823	538828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719677
11121	NC_010501	CAG	3	9	538844	538852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719677
11122	NC_010501	GCG	2	6	538961	538966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719677
11123	NC_010501	CAG	2	6	538967	538972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719677
11124	NC_010501	CAG	2	6	538994	538999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719677
11125	NC_010501	CAG	2	6	539006	539011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719677
11126	NC_010501	CGCCAG	2	12	539015	539026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170719677
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11147	NC_010501	GCA	2	6	539863	539868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719677
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11152	NC_010501	TGA	2	6	540047	540052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11153	NC_010501	CTGG	3	12	540085	540096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11154	NC_010501	TA	3	6	540151	540156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11155	NC_010501	CTG	2	6	540225	540230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719678
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11189	NC_010501	GAGCA	2	10	541469	541478	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11190	NC_010501	CTG	2	6	541550	541555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719680
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11209	NC_010501	CTG	2	6	542778	542783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719681
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11220	NC_010501	GCCA	2	8	543204	543211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11221	NC_010501	GCT	2	6	543223	543228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11222	NC_010501	GC	3	6	543234	543239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11223	NC_010501	CGCCTG	2	12	543350	543361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170719682
11224	NC_010501	CTT	2	6	543424	543429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719682
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11226	NC_010501	GCGCT	2	10	543540	543549	0 %	20 %	40 %	40 %	170719682
11227	NC_010501	GGC	2	6	543551	543556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719682
11228	NC_010501	TGC	2	6	543584	543589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719682
11229	NC_010501	GCG	2	6	543594	543599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719682
11230	NC_010501	CAGC	2	8	543619	543626	25 %	0 %	25 %	50 %	170719682
11231	NC_010501	GAA	2	6	543636	543641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719682
11232	NC_010501	CCT	2	6	543658	543663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11233	NC_010501	CCCT	2	8	543701	543708	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11234	NC_010501	TCG	2	6	543793	543798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719683
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11236	NC_010501	TTG	2	6	543847	543852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170719683
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11359	NC_010501	AGC	2	6	549961	549966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719687
11360	NC_010501	CCA	2	6	550022	550027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719687
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11362	NC_010501	AGTCG	2	10	550094	550103	20 %	20 %	40 %	20 %	170719687
11363	NC_010501	TCT	2	6	550156	550161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719687
11364	NC_010501	GCA	2	6	550175	550180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719687
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11367	NC_010501	CGTGT	2	10	550341	550350	0 %	40 %	40 %	20 %	170719687
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11371	NC_010501	GC	3	6	550826	550831	0 %	0 %	50 %	50 %	170719688
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11390	NC_010501	GCTGC	2	10	551949	551958	0 %	20 %	40 %	40 %	170719689
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11431	NC_010501	ACT	2	6	553670	553675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11460	NC_010501	T	7	7	554846	554852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11461	NC_010501	CGGC	2	8	554862	554869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11462	NC_010501	AC	3	6	554935	554940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11463	NC_010501	AAGTCG	2	12	554974	554985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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11466	NC_010501	ACC	2	6	555026	555031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719693
11467	NC_010501	TGG	3	9	555052	555060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719693
11468	NC_010501	ATC	2	6	555270	555275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719693
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11471	NC_010501	GCA	2	6	555422	555427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719693
11472	NC_010501	CG	3	6	555436	555441	0 %	0 %	50 %	50 %	170719693
11473	NC_010501	GGC	2	6	555449	555454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719693
11474	NC_010501	GCC	2	6	555486	555491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719693
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11477	NC_010501	GCT	2	6	555593	555598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719693
11478	NC_010501	TGC	2	6	555604	555609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719693
11479	NC_010501	ACG	2	6	555685	555690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719693
11480	NC_010501	GC	3	6	555739	555744	0 %	0 %	50 %	50 %	170719693
11481	NC_010501	GCCG	2	8	555749	555756	0 %	0 %	50 %	50 %	170719693
11482	NC_010501	CAG	2	6	555759	555764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719693
11483	NC_010501	TGG	2	6	555769	555774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719693
11484	NC_010501	CAG	2	6	555813	555818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719693
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11486	NC_010501	TGC	3	9	555895	555903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719693
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11491	NC_010501	GC	3	6	556059	556064	0 %	0 %	50 %	50 %	170719693
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11499	NC_010501	AGTCG	2	10	556379	556388	20 %	20 %	40 %	20 %	170719693
11500	NC_010501	CTG	2	6	556458	556463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719693

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