MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida W619 chromosome

Total Repeats: 120510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_010501	GCT	2	6	5209028	5209033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109002	NC_010501	AAT	2	6	5209036	5209041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170723874
109003	NC_010501	GAGC	2	8	5209055	5209062	25 %	0 %	50 %	25 %	170723874
109004	NC_010501	TCA	2	6	5209089	5209094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170723874
109005	NC_010501	CAG	2	6	5209147	5209152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723874
109006	NC_010501	GCA	2	6	5209155	5209160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723874
109007	NC_010501	CCGC	2	8	5209191	5209198	0 %	0 %	25 %	75 %	170723874
109008	NC_010501	CT	3	6	5209216	5209221	0 %	50 %	0 %	50 %	170723874
109009	NC_010501	GCGCT	2	10	5209233	5209242	0 %	20 %	40 %	40 %	170723874
109010	NC_010501	GCT	2	6	5209279	5209284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723874
109011	NC_010501	GGC	2	6	5209289	5209294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723874
109012	NC_010501	GGT	2	6	5209328	5209333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170723874
109013	NC_010501	GCG	2	6	5209344	5209349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723874
109014	NC_010501	GCG	2	6	5209382	5209387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723874
109015	NC_010501	A	6	6	5209417	5209422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109016	NC_010501	TCA	2	6	5209492	5209497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170723875
109017	NC_010501	CAG	2	6	5209511	5209516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723875
109018	NC_010501	GCG	2	6	5209523	5209528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723875
109019	NC_010501	GCG	2	6	5209538	5209543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723875
109020	NC_010501	GCT	2	6	5209550	5209555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723875
109021	NC_010501	CTG	2	6	5209578	5209583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723875
109022	NC_010501	TGC	2	6	5209609	5209614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723875
109023	NC_010501	GTT	2	6	5209632	5209637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170723875
109024	NC_010501	ACC	3	9	5209638	5209646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170723875
109025	NC_010501	CGC	2	6	5209661	5209666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170723875
109026	NC_010501	AGC	2	6	5209696	5209701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723875
109027	NC_010501	CGA	2	6	5209721	5209726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723875
109028	NC_010501	GGT	2	6	5209734	5209739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170723875
109029	NC_010501	AC	3	6	5209856	5209861	50 %	0 %	0 %	50 %	170723875
109030	NC_010501	CTT	2	6	5210129	5210134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170723876
109031	NC_010501	CCA	2	6	5210138	5210143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170723876
109032	NC_010501	GGC	2	6	5210245	5210250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723876
109033	NC_010501	ACC	2	6	5210269	5210274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170723876
109034	NC_010501	CA	3	6	5210285	5210290	50 %	0 %	0 %	50 %	170723876
109035	NC_010501	CAGC	2	8	5210337	5210344	25 %	0 %	25 %	50 %	170723876
109036	NC_010501	CAGCG	2	10	5210361	5210370	20 %	0 %	40 %	40 %	170723876
109037	NC_010501	CTGG	2	8	5210379	5210386	0 %	25 %	50 %	25 %	170723876
109038	NC_010501	GCC	2	6	5210415	5210420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170723876
109039	NC_010501	CAG	2	6	5210463	5210468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109040	NC_010501	AGA	2	6	5210534	5210539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170723876
109041	NC_010501	CCA	2	6	5210546	5210551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170723876
109042	NC_010501	GCA	2	6	5210552	5210557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109043	NC_010501	AC	3	6	5210558	5210563	50 %	0 %	0 %	50 %	170723876
109044	NC_010501	T	7	7	5210599	5210605	0 %	100 %	0 %	0 %	170723876
109045	NC_010501	GAT	2	6	5210613	5210618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170723876
109046	NC_010501	A	6	6	5210634	5210639	100 %	0 %	0 %	0 %	170723876
109047	NC_010501	CCA	2	6	5210667	5210672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170723876
109048	NC_010501	GCC	2	6	5210691	5210696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170723876
109049	NC_010501	CGA	2	6	5210702	5210707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109050	NC_010501	CGA	2	6	5210723	5210728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109051	NC_010501	GGA	2	6	5210750	5210755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170723876
109052	NC_010501	GC	3	6	5210817	5210822	0 %	0 %	50 %	50 %	170723876
109053	NC_010501	TGC	2	6	5210839	5210844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109054	NC_010501	ACG	2	6	5210866	5210871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109055	NC_010501	CGA	2	6	5210960	5210965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109056	NC_010501	CATGGC	2	12	5211006	5211017	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109057	NC_010501	TGC	2	6	5211028	5211033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109058	NC_010501	CAG	2	6	5211051	5211056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723876
109059	NC_010501	GCC	2	6	5211136	5211141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170723876
109060	NC_010501	ATC	2	6	5211211	5211216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170723876
109061	NC_010501	A	6	6	5211231	5211236	100 %	0 %	0 %	0 %	170723876
109062	NC_010501	GCC	2	6	5211375	5211380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170723876
109063	NC_010501	GCG	2	6	5211382	5211387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723876
109064	NC_010501	CG	3	6	5211386	5211391	0 %	0 %	50 %	50 %	170723876
109065	NC_010501	CGG	2	6	5211451	5211456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109066	NC_010501	GC	3	6	5211516	5211521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109067	NC_010501	GAA	2	6	5211602	5211607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170723877
109068	NC_010501	GAT	2	6	5211758	5211763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170723877
109069	NC_010501	GGTA	2	8	5211851	5211858	25 %	25 %	50 %	0 %	170723877
109070	NC_010501	GCA	2	6	5211994	5211999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723877
109071	NC_010501	TGC	2	6	5212006	5212011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723877
109072	NC_010501	CGA	2	6	5212058	5212063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723877
109073	NC_010501	TTCG	2	8	5212080	5212087	0 %	50 %	25 %	25 %	170723877
109074	NC_010501	CGA	2	6	5212118	5212123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723877
109075	NC_010501	AGA	2	6	5212144	5212149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170723877
109076	NC_010501	GTA	2	6	5212164	5212169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170723877
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109080	NC_010501	CCGC	2	8	5212303	5212310	0 %	0 %	25 %	75 %	170723877
109081	NC_010501	CAA	2	6	5212370	5212375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170723877
109082	NC_010501	GGA	2	6	5212553	5212558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170723877
109083	NC_010501	GCG	2	6	5212703	5212708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723877
109084	NC_010501	GAG	2	6	5212740	5212745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170723877
109085	NC_010501	A	6	6	5212831	5212836	100 %	0 %	0 %	0 %	170723877
109086	NC_010501	CAG	2	6	5212874	5212879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723877
109087	NC_010501	CGT	2	6	5212908	5212913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723877
109088	NC_010501	TGC	2	6	5212922	5212927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723877
109089	NC_010501	CGG	2	6	5213021	5213026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170723877
109090	NC_010501	TGA	2	6	5213093	5213098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170723877
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109094	NC_010501	GGT	2	6	5213259	5213264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170723877
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109098	NC_010501	CTCAAG	2	12	5213394	5213405	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170723877
109099	NC_010501	CAA	2	6	5213417	5213422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170723877
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109101	NC_010501	CGTG	2	8	5213464	5213471	0 %	25 %	50 %	25 %	170723877
109102	NC_010501	CAA	2	6	5213507	5213512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170723877
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109106	NC_010501	ATGG	2	8	5213583	5213590	25 %	25 %	50 %	0 %	170723877
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109109	NC_010501	GGGC	2	8	5213765	5213772	0 %	0 %	75 %	25 %	170723877
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109111	NC_010501	GC	3	6	5213943	5213948	0 %	0 %	50 %	50 %	170723877
109112	NC_010501	TTC	2	6	5213952	5213957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170723877
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109230	NC_010501	TGC	2	6	5220334	5220339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723886
109231	NC_010501	CTG	2	6	5220422	5220427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170723886
109232	NC_010501	ACG	2	6	5220452	5220457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723886
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109344	NC_010501	GCA	2	6	5225898	5225903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170723899
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109458	NC_010501	TTC	2	6	5231560	5231565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170723908
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