MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Psychrobacter sp. PRwf-1 plasmid pRWF101

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009516	CTG	2	6	41	46	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009516	TAA	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009516	CTA	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009516	TAA	2	6	103	108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009516	TTA	2	6	157	162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009516	TTA	2	6	214	219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
7	NC_009516	TTA	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
8	NC_009516	AGA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641525
9	NC_009516	GGT	2	6	318	323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148641525
10	NC_009516	ATT	2	6	325	330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
11	NC_009516	ATC	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641525
12	NC_009516	ATT	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
13	NC_009516	AG	3	6	512	517	50 %	0 %	50 %	0 %	148641525
14	NC_009516	TAA	2	6	518	523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641525
15	NC_009516	AGC	2	6	602	607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009516	AAC	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641526
17	NC_009516	GAAG	2	8	698	705	50 %	0 %	50 %	0 %	148641526
18	NC_009516	AAG	2	6	741	746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641526
19	NC_009516	TAT	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641526
20	NC_009516	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
21	NC_009516	TCA	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641526
22	NC_009516	TAG	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
23	NC_009516	TAC	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641526
24	NC_009516	ATG	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
25	NC_009516	CTC	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148641526
26	NC_009516	TTG	2	6	1373	1378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148641526
27	NC_009516	T	6	6	1394	1399	0 %	100 %	0 %	0 %	148641526
28	NC_009516	GGGT	2	8	1401	1408	0 %	25 %	75 %	0 %	148641526
29	NC_009516	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
30	NC_009516	CA	3	6	1687	1692	50 %	0 %	0 %	50 %	148641526
31	NC_009516	T	6	6	1732	1737	0 %	100 %	0 %	0 %	148641526
32	NC_009516	ACGA	2	8	1741	1748	50 %	0 %	25 %	25 %	148641526
33	NC_009516	GTC	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148641526
34	NC_009516	CT	3	6	2020	2025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009516	TACG	2	8	2094	2101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009516	TAG	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009516	TCA	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009516	TTTTTG	2	12	2208	2219	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009516	ATA	2	6	2246	2251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009516	AGTA	2	8	2255	2262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009516	TA	3	6	2261	2266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009516	GCC	2	6	2320	2325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009516	T	7	7	2350	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009516	GAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009516	ACA	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
46	NC_009516	ACA	2	6	2482	2487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
47	NC_009516	GCCAAA	2	12	2529	2540	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148641527
48	NC_009516	CAAACT	2	12	2582	2593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148641527
49	NC_009516	A	6	6	2676	2681	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
50	NC_009516	GTG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148641527
51	NC_009516	TAAA	2	8	2697	2704	75 %	25 %	0 %	0 %	148641527
52	NC_009516	CAT	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
53	NC_009516	CAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
54	NC_009516	CT	3	6	2843	2848	0 %	50 %	0 %	50 %	148641527
55	NC_009516	AAC	2	6	2858	2863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
56	NC_009516	CAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
57	NC_009516	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
58	NC_009516	AGCT	2	8	2952	2959	25 %	25 %	25 %	25 %	148641527
59	NC_009516	TGA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
60	NC_009516	TCT	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148641527
61	NC_009516	GAC	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641527
62	NC_009516	A	6	6	3068	3073	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
63	NC_009516	A	6	6	3094	3099	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
64	NC_009516	GTA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
65	NC_009516	CAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641527
66	NC_009516	GAA	2	6	3233	3238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
67	NC_009516	TA	3	6	3270	3275	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
68	NC_009516	GAA	2	6	3421	3426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
69	NC_009516	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
70	NC_009516	TGA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
71	NC_009516	AAC	2	6	3491	3496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
72	NC_009516	AC	3	6	3495	3500	50 %	0 %	0 %	50 %	148641527
73	NC_009516	ACC	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148641527
74	NC_009516	GACC	2	8	3801	3808	25 %	0 %	25 %	50 %	148641527
75	NC_009516	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641527
76	NC_009516	TCC	2	6	3910	3915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148641527
77	NC_009516	TAG	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
78	NC_009516	TA	3	6	4019	4024	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
79	NC_009516	TAA	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641527
80	NC_009516	TA	3	6	4067	4072	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
81	NC_009516	CAA	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
82	NC_009516	TGA	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
83	NC_009516	CAT	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
84	NC_009516	ATT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641527
85	NC_009516	TAG	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
86	NC_009516	AAAG	2	8	4255	4262	75 %	0 %	25 %	0 %	148641527
87	NC_009516	A	6	6	4310	4315	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
88	NC_009516	TAG	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
89	NC_009516	AAG	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
90	NC_009516	AGT	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
91	NC_009516	CAA	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
92	NC_009516	TA	3	6	4457	4462	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
93	NC_009516	TAAT	2	8	4467	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
94	NC_009516	ATG	2	6	4511	4516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
95	NC_009516	A	6	6	4599	4604	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
96	NC_009516	TTA	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641527
97	NC_009516	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641527
98	NC_009516	CGT	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148641527
99	NC_009516	ATC	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
100	NC_009516	AGA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
101	NC_009516	AAC	2	6	4946	4951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
102	NC_009516	TGA	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
103	NC_009516	GA	3	6	5002	5007	50 %	0 %	50 %	0 %	148641527
104	NC_009516	ACT	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
105	NC_009516	TGA	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
106	NC_009516	CGAGT	3	15	5202	5216	20 %	20 %	40 %	20 %	148641527
107	NC_009516	AAG	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
108	NC_009516	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
109	NC_009516	A	8	8	5253	5260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009516	TAACG	2	10	5321	5330	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009516	AAT	2	6	5342	5347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009516	T	6	6	5418	5423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009516	T	8	8	5433	5440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009516	TAA	2	6	5479	5484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009516	T	6	6	5532	5537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009516	T	6	6	5572	5577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009516	GTTT	2	8	5588	5595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009516	T	6	6	5593	5598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009516	TTTAG	2	10	5664	5673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009516	TTA	2	6	5697	5702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009516	AAC	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009516	CAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009516	AG	3	6	5842	5847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009516	AGAT	2	8	5917	5924	50 %	25 %	25 %	0 %	148641528
125	NC_009516	TAC	2	6	5963	5968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641528
126	NC_009516	CCA	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148641528
127	NC_009516	AAAATA	2	12	6019	6030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148641528
128	NC_009516	TGGAGA	2	12	6094	6105	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148641528
129	NC_009516	A	6	6	6110	6115	100 %	0 %	0 %	0 %	148641528
130	NC_009516	GCA	3	9	6125	6133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641528
131	NC_009516	ATC	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641528
132	NC_009516	GTTG	2	8	6152	6159	0 %	50 %	50 %	0 %	148641528
133	NC_009516	TAAG	2	8	6187	6194	50 %	25 %	25 %	0 %	148641528
134	NC_009516	TC	3	6	6280	6285	0 %	50 %	0 %	50 %	148641528
135	NC_009516	AAC	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641528
136	NC_009516	ATTCAA	2	12	6340	6351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148641528
137	NC_009516	CTA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641528
138	NC_009516	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641528
139	NC_009516	TGG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148641528
140	NC_009516	AGT	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009516	TAT	2	6	6534	6539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009516	TA	3	6	7215	7220	50 %	50 %	0 %	0 %	148641531
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171	NC_009516	TCA	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_009516	A	7	7	8245	8251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_009516	TGGTT	2	10	8299	8308	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_009516	T	6	6	11546	11551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_009516	ATA	2	6	12126	12131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641536
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270	NC_009516	AAT	2	6	12191	12196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641536
271	NC_009516	ACT	2	6	12198	12203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641536
272	NC_009516	ATG	2	6	12225	12230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641536
273	NC_009516	A	7	7	12271	12277	100 %	0 %	0 %	0 %	148641536
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275	NC_009516	TGA	2	6	12532	12537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641537
276	NC_009516	TTTAAT	2	12	12546	12557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641537
277	NC_009516	TCCT	2	8	12558	12565	0 %	50 %	0 %	50 %	148641537
278	NC_009516	TTC	2	6	12571	12576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148641537
279	NC_009516	TTA	2	6	12601	12606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641537
280	NC_009516	TAG	2	6	12616	12621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641537
281	NC_009516	AT	3	6	12643	12648	50 %	50 %	0 %	0 %	148641537
282	NC_009516	ACC	2	6	12687	12692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148641537
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290	NC_009516	TAT	2	6	12986	12991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641537
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297	NC_009516	ACTCG	2	10	13570	13579	20 %	20 %	20 %	40 %	148641538
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299	NC_009516	CT	3	6	13854	13859	0 %	50 %	0 %	50 %	148641538
300	NC_009516	ATA	2	6	13889	13894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641538
301	NC_009516	CA	3	6	13942	13947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.