MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009512	TGC	2	6	125478	125483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545378
2502	NC_009512	TCG	2	6	125520	125525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545378
2503	NC_009512	CCG	2	6	125597	125602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545378
2504	NC_009512	GCG	2	6	125615	125620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545378
2505	NC_009512	ACT	2	6	125677	125682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545379
2506	NC_009512	ATC	2	6	125709	125714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545379
2507	NC_009512	CCA	2	6	125716	125721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545379
2508	NC_009512	TCA	2	6	125731	125736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545379
2509	NC_009512	TTC	2	6	125808	125813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545379
2510	NC_009512	GTT	2	6	125822	125827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545379
2511	NC_009512	TCT	2	6	125938	125943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545379
2512	NC_009512	TTC	2	6	125955	125960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545379
2513	NC_009512	CTT	2	6	125966	125971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545379
2514	NC_009512	GCT	2	6	126077	126082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545379
2515	NC_009512	CGC	2	6	126109	126114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545379
2516	NC_009512	CTG	2	6	126162	126167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545379
2517	NC_009512	CAC	2	6	126198	126203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545379
2518	NC_009512	ACC	2	6	126217	126222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545379
2519	NC_009512	TTC	2	6	126357	126362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545379
2520	NC_009512	TCG	2	6	126499	126504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545379
2521	NC_009512	TGTGG	2	10	126506	126515	0 %	40 %	60 %	0 %	148545379
2522	NC_009512	GTT	2	6	126521	126526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545379
2523	NC_009512	TGT	2	6	126541	126546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545379
2524	NC_009512	G	6	6	126564	126569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_009512	TCA	2	6	126694	126699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545380
2526	NC_009512	G	6	6	126791	126796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_009512	TGG	2	6	126865	126870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545381
2528	NC_009512	CTG	2	6	126879	126884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2529	NC_009512	TGC	2	6	126940	126945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2530	NC_009512	CTC	2	6	126996	127001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545381
2531	NC_009512	AGA	2	6	127007	127012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545381
2532	NC_009512	CCG	2	6	127022	127027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545381
2533	NC_009512	TGC	2	6	127066	127071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2534	NC_009512	GCT	2	6	127109	127114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2535	NC_009512	TGGC	2	8	127163	127170	0 %	25 %	50 %	25 %	148545381
2536	NC_009512	CCG	2	6	127184	127189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545381
2537	NC_009512	CGG	2	6	127289	127294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545381
2538	NC_009512	CTCTAC	2	12	127494	127505	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148545381
2539	NC_009512	CCACT	2	10	127547	127556	20 %	20 %	0 %	60 %	148545381
2540	NC_009512	CTG	2	6	127615	127620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545382
2541	NC_009512	GTG	2	6	127621	127626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545382
2542	NC_009512	CCA	2	6	127646	127651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545382
2543	NC_009512	GC	3	6	127778	127783	0 %	0 %	50 %	50 %	148545382
2544	NC_009512	GCCA	2	8	127867	127874	25 %	0 %	25 %	50 %	148545382
2545	NC_009512	GCC	3	9	127882	127890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545382
2546	NC_009512	CAG	2	6	127975	127980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545382
2547	NC_009512	GCCCG	2	10	127992	128001	0 %	0 %	40 %	60 %	148545382
2548	NC_009512	TCG	2	6	128012	128017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545382
2549	NC_009512	TGC	2	6	128036	128041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545382
2550	NC_009512	ACG	2	6	128045	128050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545382
2551	NC_009512	CTG	2	6	128167	128172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545383
2552	NC_009512	CTG	2	6	128176	128181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545383
2553	NC_009512	GTC	2	6	128182	128187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545383
2554	NC_009512	GCC	2	6	128329	128334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545383
2555	NC_009512	GTG	2	6	128383	128388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545383
2556	NC_009512	TGC	2	6	128456	128461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545383
2557	NC_009512	GTG	2	6	128470	128475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545383
2558	NC_009512	GGT	2	6	128529	128534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545383
2559	NC_009512	TGT	2	6	128582	128587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545383
2560	NC_009512	GCT	2	6	128661	128666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545383
2561	NC_009512	GGT	2	6	128667	128672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545383
2562	NC_009512	GTG	2	6	128757	128762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545383
2563	NC_009512	GCG	2	6	128767	128772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545383
2564	NC_009512	GC	3	6	128845	128850	0 %	0 %	50 %	50 %	148545383
2565	NC_009512	GC	3	6	128879	128884	0 %	0 %	50 %	50 %	148545383
2566	NC_009512	TG	3	6	128896	128901	0 %	50 %	50 %	0 %	148545383
2567	NC_009512	TGC	2	6	128960	128965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545383
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2570	NC_009512	TGC	3	9	129059	129067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545383
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2572	NC_009512	ACG	2	6	129212	129217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545384
2573	NC_009512	GGT	3	9	129257	129265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545384
2574	NC_009512	GCTGAT	2	12	129266	129277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148545384
2575	NC_009512	CGGG	2	8	129309	129316	0 %	0 %	75 %	25 %	148545384
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2579	NC_009512	GCAC	2	8	129423	129430	25 %	0 %	25 %	50 %	148545384
2580	NC_009512	TGT	2	6	129478	129483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545384
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2584	NC_009512	TGGCC	2	10	129635	129644	0 %	20 %	40 %	40 %	148545384
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2590	NC_009512	CTG	2	6	129864	129869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545384
2591	NC_009512	AGC	2	6	129978	129983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545384
2592	NC_009512	CAA	2	6	130150	130155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545385
2593	NC_009512	TGAT	2	8	130194	130201	25 %	50 %	25 %	0 %	148545385
2594	NC_009512	CAT	2	6	130207	130212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545385
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2597	NC_009512	GCT	2	6	130306	130311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545385
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2599	NC_009512	GGT	2	6	130414	130419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545385
2600	NC_009512	TCGA	2	8	130511	130518	25 %	25 %	25 %	25 %	148545385
2601	NC_009512	CGG	2	6	130563	130568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545385
2602	NC_009512	CAA	2	6	130663	130668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545385
2603	NC_009512	CCT	2	6	130725	130730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_009512	GAT	2	6	130880	130885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545386
2605	NC_009512	AGTGC	2	10	130906	130915	20 %	20 %	40 %	20 %	148545386
2606	NC_009512	GCC	2	6	130917	130922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545386
2607	NC_009512	GTC	2	6	130934	130939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545386
2608	NC_009512	TTG	2	6	130947	130952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545386
2609	NC_009512	CGGG	2	8	130955	130962	0 %	0 %	75 %	25 %	148545386
2610	NC_009512	GGC	2	6	131063	131068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545386
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2612	NC_009512	TTG	2	6	131172	131177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545386
2613	NC_009512	CAG	3	9	131207	131215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545386
2614	NC_009512	GCC	2	6	131225	131230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545386
2615	NC_009512	TGG	2	6	131233	131238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545386
2616	NC_009512	CGT	2	6	131239	131244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545386
2617	NC_009512	GGA	2	6	131267	131272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545386
2618	NC_009512	TTG	2	6	131364	131369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545386
2619	NC_009512	GAA	2	6	131396	131401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545386
2620	NC_009512	CTT	2	6	131482	131487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545386
2621	NC_009512	GGC	2	6	131540	131545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545386
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2861	NC_009512	CCGG	2	8	143072	143079	0 %	0 %	50 %	50 %	148545397
2862	NC_009512	GTC	2	6	143082	143087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2863	NC_009512	GCG	2	6	143133	143138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2864	NC_009512	GGC	2	6	143181	143186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2865	NC_009512	CAT	2	6	143211	143216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545397
2866	NC_009512	TGC	2	6	143243	143248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2867	NC_009512	ACC	2	6	143323	143328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545397
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2869	NC_009512	GGC	2	6	143499	143504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2870	NC_009512	GCC	2	6	143534	143539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545397
2871	NC_009512	CCCTG	2	10	143571	143580	0 %	20 %	20 %	60 %	148545397
2872	NC_009512	CTG	2	6	143627	143632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2873	NC_009512	CAT	2	6	143637	143642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545397
2874	NC_009512	ACG	2	6	143717	143722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
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2878	NC_009512	TGT	2	6	144043	144048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2879	NC_009512	T	8	8	144134	144141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2880	NC_009512	TCCA	2	8	144290	144297	25 %	25 %	0 %	50 %	148545398
2881	NC_009512	C	6	6	144372	144377	0 %	0 %	0 %	100 %	148545398
2882	NC_009512	CAG	2	6	144406	144411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545398
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2885	NC_009512	CAT	2	6	144499	144504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545398
2886	NC_009512	CAT	2	6	144538	144543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545398
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2888	NC_009512	TGC	2	6	144605	144610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545398
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2891	NC_009512	GTC	2	6	144811	144816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545398
2892	NC_009512	TA	3	6	144978	144983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2893	NC_009512	TG	3	6	144997	145002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2894	NC_009512	GCT	2	6	145110	145115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545399
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2899	NC_009512	CTG	2	6	145488	145493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545400
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2912	NC_009512	ATG	2	6	146074	146079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2914	NC_009512	T	6	6	146100	146105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2915	NC_009512	CGT	2	6	146167	146172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2916	NC_009512	GCGCT	2	10	146221	146230	0 %	20 %	40 %	40 %	148545401
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2934	NC_009512	CAGCA	2	10	147222	147231	40 %	0 %	20 %	40 %	148545402
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2952	NC_009512	A	6	6	148089	148094	100 %	0 %	0 %	0 %	148545403
2953	NC_009512	GAA	2	6	148100	148105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545403
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2962	NC_009512	CTG	2	6	148384	148389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545403
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2967	NC_009512	GCA	2	6	148835	148840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545403
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2977	NC_009512	TGGCGA	2	12	149278	149289	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545403
2978	NC_009512	CTGG	2	8	149337	149344	0 %	25 %	50 %	25 %	148545403
2979	NC_009512	GGC	2	6	149418	149423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545403
2980	NC_009512	GC	3	6	149489	149494	0 %	0 %	50 %	50 %	148545403
2981	NC_009512	CAC	2	6	149543	149548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545403
2982	NC_009512	AGCC	2	8	149665	149672	25 %	0 %	25 %	50 %	148545403
2983	NC_009512	GGCA	2	8	149680	149687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2984	NC_009512	A	7	7	149755	149761	100 %	0 %	0 %	0 %	148545404
2985	NC_009512	TGT	2	6	149780	149785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545404
2986	NC_009512	GCT	2	6	149907	149912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2987	NC_009512	CAG	2	6	149928	149933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2988	NC_009512	TGG	2	6	149975	149980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545404
2989	NC_009512	CGT	2	6	149989	149994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2990	NC_009512	CTC	2	6	150042	150047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545404
2991	NC_009512	GCT	2	6	150147	150152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2992	NC_009512	ATC	2	6	150193	150198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545404
2993	NC_009512	GCA	2	6	150312	150317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2994	NC_009512	CAG	2	6	150358	150363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2995	NC_009512	CGC	2	6	150432	150437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545404
2996	NC_009512	CCGC	2	8	150453	150460	0 %	0 %	25 %	75 %	148545404
2997	NC_009512	CAG	2	6	150491	150496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2998	NC_009512	TGC	2	6	150500	150505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545404
2999	NC_009512	GGCG	2	8	150534	150541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3000	NC_009512	TTG	2	6	150548	150553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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