MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_009512	GCG	2	6	862446	862451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546015
18002	NC_009512	GCTG	2	8	862466	862473	0 %	25 %	50 %	25 %	148546015
18003	NC_009512	TCA	2	6	862501	862506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546015
18004	NC_009512	TGC	2	6	862517	862522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546015
18005	NC_009512	GGC	2	6	862529	862534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546015
18006	NC_009512	GC	3	6	862604	862609	0 %	0 %	50 %	50 %	148546015
18007	NC_009512	CAG	2	6	862629	862634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546015
18008	NC_009512	GGCGTA	2	12	862647	862658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148546015
18009	NC_009512	GCA	2	6	862682	862687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546015
18010	NC_009512	GGC	2	6	862700	862705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546015
18011	NC_009512	CTT	2	6	862706	862711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546015
18012	NC_009512	CGC	2	6	862760	862765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546015
18013	NC_009512	CCA	2	6	862768	862773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546015
18014	NC_009512	AAG	2	6	862826	862831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148546015
18015	NC_009512	GTC	2	6	862863	862868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546015
18016	NC_009512	GGTC	2	8	862907	862914	0 %	25 %	50 %	25 %	148546015
18017	NC_009512	CG	3	6	862985	862990	0 %	0 %	50 %	50 %	148546015
18018	NC_009512	AC	3	6	863019	863024	50 %	0 %	0 %	50 %	148546015
18019	NC_009512	GCC	2	6	863082	863087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546015
18020	NC_009512	CAGG	2	8	863112	863119	25 %	0 %	50 %	25 %	148546015
18021	NC_009512	GCGCC	2	10	863290	863299	0 %	0 %	40 %	60 %	148546016
18022	NC_009512	GGGC	2	8	863414	863421	0 %	0 %	75 %	25 %	148546016
18023	NC_009512	GGT	2	6	863456	863461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546016
18024	NC_009512	ACT	2	6	863510	863515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546016
18025	NC_009512	GGC	2	6	863538	863543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546016
18026	NC_009512	TCG	2	6	863585	863590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546016
18027	NC_009512	TGC	2	6	863601	863606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546016
18028	NC_009512	GCCA	2	8	863615	863622	25 %	0 %	25 %	50 %	148546016
18029	NC_009512	AGC	2	6	863646	863651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546016
18030	NC_009512	AGGT	2	8	863700	863707	25 %	25 %	50 %	0 %	148546016
18031	NC_009512	GCC	2	6	863732	863737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546016
18032	NC_009512	GGC	2	6	863749	863754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546016
18033	NC_009512	GTGGC	2	10	863760	863769	0 %	20 %	60 %	20 %	148546016
18034	NC_009512	CGG	2	6	864030	864035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546016
18035	NC_009512	TGC	2	6	864044	864049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546016
18036	NC_009512	GC	3	6	864105	864110	0 %	0 %	50 %	50 %	148546016
18037	NC_009512	GGC	2	6	864202	864207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546016
18038	NC_009512	GAT	2	6	864232	864237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546016
18039	NC_009512	ATG	2	6	864254	864259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546016
18040	NC_009512	A	6	6	864386	864391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_009512	ACC	2	6	864413	864418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18042	NC_009512	AT	3	6	864447	864452	50 %	50 %	0 %	0 %	148546017
18043	NC_009512	CTGG	2	8	864499	864506	0 %	25 %	50 %	25 %	148546017
18044	NC_009512	CG	3	6	864586	864591	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
18045	NC_009512	CGA	2	6	864610	864615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
18046	NC_009512	GGT	2	6	864628	864633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546017
18047	NC_009512	GCC	2	6	864674	864679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546017
18048	NC_009512	TTGG	2	8	864733	864740	0 %	50 %	50 %	0 %	148546017
18049	NC_009512	AGC	2	6	864750	864755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
18050	NC_009512	GCGAAC	2	12	864807	864818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
18051	NC_009512	GCCA	2	8	864854	864861	25 %	0 %	25 %	50 %	148546017
18052	NC_009512	GGC	2	6	864956	864961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546017
18053	NC_009512	GGGC	2	8	865000	865007	0 %	0 %	75 %	25 %	148546017
18054	NC_009512	GGC	2	6	865020	865025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546017
18055	NC_009512	GAC	2	6	865049	865054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
18056	NC_009512	TGAT	2	8	865065	865072	25 %	50 %	25 %	0 %	148546017
18057	NC_009512	GCA	2	6	865081	865086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
18058	NC_009512	GC	3	6	865116	865121	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
18059	NC_009512	CGGC	2	8	865175	865182	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
18060	NC_009512	TGC	2	6	865203	865208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546017
18061	NC_009512	TGC	2	6	865239	865244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546017
18062	NC_009512	GC	3	6	865259	865264	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
18063	NC_009512	CTG	3	9	865377	865385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
18064	NC_009512	GCG	2	6	865487	865492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546018
18065	NC_009512	CTGATC	2	12	865506	865517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148546018
18066	NC_009512	TGG	2	6	865557	865562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546018
18067	NC_009512	GAG	2	6	865563	865568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148546018
18068	NC_009512	GCAG	2	8	865601	865608	25 %	0 %	50 %	25 %	148546018
18069	NC_009512	GCCA	2	8	865660	865667	25 %	0 %	25 %	50 %	148546018
18070	NC_009512	GCC	2	6	865695	865700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546018
18071	NC_009512	GGT	2	6	865766	865771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546018
18072	NC_009512	AGCG	2	8	865794	865801	25 %	0 %	50 %	25 %	148546018
18073	NC_009512	TGC	2	6	865825	865830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
18074	NC_009512	ACC	2	6	865906	865911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546018
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18076	NC_009512	TGC	2	6	865988	865993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
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18080	NC_009512	GCT	2	6	866201	866206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
18081	NC_009512	GCTGGT	2	12	866303	866314	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148546018
18082	NC_009512	TG	3	6	866362	866367	0 %	50 %	50 %	0 %	148546018
18083	NC_009512	GCC	2	6	866388	866393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18084	NC_009512	ACCG	2	8	866405	866412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18085	NC_009512	CTT	2	6	866426	866431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546019
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18090	NC_009512	GCA	2	6	866707	866712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546019
18091	NC_009512	GC	3	6	866713	866718	0 %	0 %	50 %	50 %	148546019
18092	NC_009512	GGT	2	6	866825	866830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546019
18093	NC_009512	GGGC	2	8	866834	866841	0 %	0 %	75 %	25 %	148546019
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18099	NC_009512	CAG	2	6	867185	867190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546019
18100	NC_009512	GGC	2	6	867269	867274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546019
18101	NC_009512	GAT	2	6	867302	867307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546019
18102	NC_009512	CAC	2	6	867320	867325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546019
18103	NC_009512	CGG	2	6	867326	867331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546019
18104	NC_009512	CGC	2	6	867412	867417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546019
18105	NC_009512	GAT	2	6	867455	867460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546019
18106	NC_009512	TGA	2	6	867466	867471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546019
18107	NC_009512	GCCG	2	8	867505	867512	0 %	0 %	50 %	50 %	148546019
18108	NC_009512	CGG	2	6	867544	867549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546019
18109	NC_009512	GC	3	6	867601	867606	0 %	0 %	50 %	50 %	148546019
18110	NC_009512	GC	3	6	867628	867633	0 %	0 %	50 %	50 %	148546019
18111	NC_009512	TCGA	2	8	867770	867777	25 %	25 %	25 %	25 %	148546020
18112	NC_009512	CCA	2	6	867813	867818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546020
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18118	NC_009512	AGGT	2	8	867980	867987	25 %	25 %	50 %	0 %	148546020
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18120	NC_009512	ATGCCG	2	12	868073	868084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148546020
18121	NC_009512	GC	3	6	868085	868090	0 %	0 %	50 %	50 %	148546020
18122	NC_009512	TAC	2	6	868099	868104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546020
18123	NC_009512	TCT	2	6	868110	868115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546020
18124	NC_009512	T	6	6	868125	868130	0 %	100 %	0 %	0 %	148546020
18125	NC_009512	GC	3	6	868209	868214	0 %	0 %	50 %	50 %	148546020
18126	NC_009512	A	7	7	868345	868351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_009512	GTC	2	6	868383	868388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18129	NC_009512	GC	3	6	868476	868481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18130	NC_009512	CCG	2	6	868487	868492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546021
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18235	NC_009512	CGG	2	6	872701	872706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18237	NC_009512	GCCAG	2	10	872753	872762	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18238	NC_009512	GTG	2	6	872798	872803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18239	NC_009512	GGC	2	6	872907	872912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18242	NC_009512	GGT	3	9	873186	873194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546026
18243	NC_009512	GGCC	2	8	873208	873215	0 %	0 %	50 %	50 %	148546026
18244	NC_009512	TCAGCG	2	12	873266	873277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148546026
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18343	NC_009512	CCCCG	2	10	878558	878567	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18344	NC_009512	TGG	2	6	878641	878646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18349	NC_009512	GT	3	6	878962	878967	0 %	50 %	50 %	0 %	148546035
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18353	NC_009512	CAGC	2	8	879068	879075	25 %	0 %	25 %	50 %	148546035
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18358	NC_009512	ACC	2	6	879283	879288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546035
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18480	NC_009512	ACC	2	6	884700	884705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546038
18481	NC_009512	ACG	2	6	884749	884754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546038
18482	NC_009512	CAGT	2	8	884854	884861	25 %	25 %	25 %	25 %	148546038
18483	NC_009512	CTT	2	6	884918	884923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546038
18484	NC_009512	TCG	2	6	884959	884964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546038
18485	NC_009512	GAC	2	6	885005	885010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18486	NC_009512	CTG	2	6	885064	885069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546039
18487	NC_009512	CCG	2	6	885095	885100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546039
18488	NC_009512	GGC	2	6	885105	885110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546039
18489	NC_009512	CGC	2	6	885405	885410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546039
18490	NC_009512	GGC	2	6	885448	885453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546039
18491	NC_009512	AAC	2	6	885463	885468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148546039
18492	NC_009512	CGG	2	6	885476	885481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546039
18493	NC_009512	TCCCGA	2	12	885488	885499	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148546039
18494	NC_009512	G	7	7	885542	885548	0 %	0 %	100 %	0 %	148546039
18495	NC_009512	GCC	2	6	885557	885562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546039
18496	NC_009512	CGC	2	6	885578	885583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546039
18497	NC_009512	AAC	2	6	885661	885666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148546039
18498	NC_009512	GC	3	6	885712	885717	0 %	0 %	50 %	50 %	148546039
18499	NC_009512	TGC	2	6	885731	885736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546039
18500	NC_009512	CCG	3	9	885848	885856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546039

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