MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_009512	GCA	2	6	696446	696451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545869
14502	NC_009512	AGC	2	6	696484	696489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545869
14503	NC_009512	ATC	2	6	696501	696506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545869
14504	NC_009512	TCA	2	6	696512	696517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545869
14505	NC_009512	GGC	2	6	696566	696571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545869
14506	NC_009512	CAT	2	6	696572	696577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545869
14507	NC_009512	CGC	2	6	696665	696670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545869
14508	NC_009512	GCTG	2	8	696684	696691	0 %	25 %	50 %	25 %	148545869
14509	NC_009512	GCGG	2	8	696711	696718	0 %	0 %	75 %	25 %	148545869
14510	NC_009512	GCA	2	6	696787	696792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545870
14511	NC_009512	GACC	2	8	696803	696810	25 %	0 %	25 %	50 %	148545870
14512	NC_009512	CTGG	2	8	696817	696824	0 %	25 %	50 %	25 %	148545870
14513	NC_009512	TGC	2	6	696967	696972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545870
14514	NC_009512	CAG	2	6	697085	697090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545870
14515	NC_009512	GC	3	6	697097	697102	0 %	0 %	50 %	50 %	148545870
14516	NC_009512	GC	3	6	697114	697119	0 %	0 %	50 %	50 %	148545870
14517	NC_009512	CAC	2	6	697241	697246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545870
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14519	NC_009512	AT	3	6	697303	697308	50 %	50 %	0 %	0 %	148545870
14520	NC_009512	GCC	2	6	697325	697330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545870
14521	NC_009512	CAG	3	9	697379	697387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545870
14522	NC_009512	GGC	2	6	697424	697429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545870
14523	NC_009512	CG	3	6	697438	697443	0 %	0 %	50 %	50 %	148545870
14524	NC_009512	CGG	2	6	697464	697469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545870
14525	NC_009512	CCG	2	6	697470	697475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545870
14526	NC_009512	TCC	2	6	697491	697496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545870
14527	NC_009512	CTGG	2	8	697499	697506	0 %	25 %	50 %	25 %	148545870
14528	NC_009512	GAA	2	6	697562	697567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545870
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14530	NC_009512	GTC	2	6	697703	697708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545870
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14532	NC_009512	GGCC	2	8	697861	697868	0 %	0 %	50 %	50 %	148545870
14533	NC_009512	GGC	2	6	697999	698004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545870
14534	NC_009512	GGC	3	9	698059	698067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545870
14535	NC_009512	AGG	2	6	698210	698215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_009512	GGC	2	6	698255	698260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545871
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14538	NC_009512	CG	3	6	698412	698417	0 %	0 %	50 %	50 %	148545871
14539	NC_009512	CAG	2	6	698486	698491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545871
14540	NC_009512	GCTGC	2	10	698513	698522	0 %	20 %	40 %	40 %	148545871
14541	NC_009512	TGG	2	6	698523	698528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545871
14542	NC_009512	AT	3	6	698625	698630	50 %	50 %	0 %	0 %	148545871
14543	NC_009512	TGC	2	6	698631	698636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545871
14544	NC_009512	TCA	2	6	698695	698700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545871
14545	NC_009512	GCT	2	6	698818	698823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545871
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14547	NC_009512	GAC	2	6	698867	698872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545871
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14549	NC_009512	ACA	2	6	698904	698909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545871
14550	NC_009512	GGGCA	2	10	698972	698981	20 %	0 %	60 %	20 %	148545871
14551	NC_009512	CGG	2	6	698988	698993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545871
14552	NC_009512	GCA	3	9	699055	699063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545871
14553	NC_009512	CTG	2	6	699102	699107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545871
14554	NC_009512	GTT	2	6	699136	699141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545871
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14556	NC_009512	TGC	2	6	699232	699237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545871
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14558	NC_009512	GGC	2	6	699358	699363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545871
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14560	NC_009512	CGG	2	6	699426	699431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545871
14561	NC_009512	TCG	2	6	699489	699494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545871
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14566	NC_009512	G	6	6	699788	699793	0 %	0 %	100 %	0 %	148545872
14567	NC_009512	TGCCGA	2	12	699804	699815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545872
14568	NC_009512	TGCC	2	8	699873	699880	0 %	25 %	25 %	50 %	148545872
14569	NC_009512	CGC	2	6	699917	699922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545872
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14571	NC_009512	GAC	2	6	699976	699981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545872
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14574	NC_009512	ACCAG	2	10	700107	700116	40 %	0 %	20 %	40 %	148545872
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14601	NC_009512	CCAGC	2	10	701559	701568	20 %	0 %	20 %	60 %	148545873
14602	NC_009512	TCGACC	2	12	701614	701625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148545873
14603	NC_009512	GCT	2	6	701678	701683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545873
14604	NC_009512	GCG	2	6	701695	701700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545873
14605	NC_009512	CG	3	6	701702	701707	0 %	0 %	50 %	50 %	148545873
14606	NC_009512	CGTTGC	2	12	701720	701731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545873
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14612	NC_009512	GGCC	3	12	701987	701998	0 %	0 %	50 %	50 %	148545873
14613	NC_009512	GCC	2	6	702009	702014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545873
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14617	NC_009512	GCT	3	9	702252	702260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545873
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14619	NC_009512	TGA	2	6	702296	702301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545873
14620	NC_009512	CCA	2	6	702302	702307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545873
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14622	NC_009512	GCA	2	6	702435	702440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_009512	TATT	2	8	702469	702476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_009512	TGGT	2	8	702488	702495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_009512	CAG	2	6	702555	702560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545874
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14650	NC_009512	GGCCTG	2	12	703591	703602	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148545875
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14683	NC_009512	CTC	2	6	705359	705364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14684	NC_009512	TTG	2	6	705468	705473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545876
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14727	NC_009512	GTTT	2	8	707787	707794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14728	NC_009512	TCA	2	6	707795	707800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14730	NC_009512	TTGA	2	8	707838	707845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14732	NC_009512	GCT	2	6	707877	707882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14741	NC_009512	TCG	2	6	708369	708374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545880
14742	NC_009512	GC	3	6	708396	708401	0 %	0 %	50 %	50 %	148545880
14743	NC_009512	TGGG	2	8	708418	708425	0 %	25 %	75 %	0 %	148545880
14744	NC_009512	TGG	3	9	708454	708462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545880
14745	NC_009512	CTGG	2	8	708463	708470	0 %	25 %	50 %	25 %	148545880
14746	NC_009512	GGGC	2	8	708510	708517	0 %	0 %	75 %	25 %	148545880
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14848	NC_009512	CATC	2	8	713227	713234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14849	NC_009512	CCG	2	6	713259	713264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14850	NC_009512	GCCA	2	8	713298	713305	25 %	0 %	25 %	50 %	148545886
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14988	NC_009512	CAGG	2	8	722293	722300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14989	NC_009512	CCA	2	6	722360	722365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14990	NC_009512	CTG	3	9	722463	722471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545888
14991	NC_009512	TGC	2	6	722482	722487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545888
14992	NC_009512	ATG	2	6	722491	722496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545888
14993	NC_009512	GTG	2	6	722715	722720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545888
14994	NC_009512	GCA	2	6	722728	722733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545888
14995	NC_009512	GCTG	2	8	722765	722772	0 %	25 %	50 %	25 %	148545888
14996	NC_009512	TCT	2	6	722818	722823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545888
14997	NC_009512	TGG	2	6	722884	722889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545888
14998	NC_009512	TGG	2	6	722902	722907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545888
14999	NC_009512	CTGTT	2	10	722937	722946	0 %	60 %	20 %	20 %	148545888
15000	NC_009512	TCA	2	6	722947	722952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545888

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