MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_009512	CAG	2	6	672768	672773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545851
14003	NC_009512	ATC	2	6	672784	672789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545851
14004	NC_009512	GAT	2	6	672798	672803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545851
14005	NC_009512	GCG	2	6	672856	672861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545851
14006	NC_009512	TGT	2	6	672868	672873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545851
14007	NC_009512	GGT	2	6	672894	672899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545851
14008	NC_009512	GGC	2	6	672900	672905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545851
14009	NC_009512	CTG	2	6	673011	673016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545851
14010	NC_009512	CAT	2	6	673041	673046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545851
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14012	NC_009512	GCT	2	6	673179	673184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545851
14013	NC_009512	GCC	2	6	673211	673216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545851
14014	NC_009512	GCA	2	6	673244	673249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545851
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14017	NC_009512	CAG	2	6	673377	673382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545851
14018	NC_009512	CTG	2	6	673473	673478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545851
14019	NC_009512	CGC	2	6	673514	673519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545851
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14021	NC_009512	CTG	2	6	673563	673568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545851
14022	NC_009512	GC	3	6	673615	673620	0 %	0 %	50 %	50 %	148545851
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14025	NC_009512	TGA	2	6	673771	673776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_009512	A	6	6	673797	673802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_009512	TGGC	2	8	673826	673833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14028	NC_009512	AAG	2	6	673923	673928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_009512	AGTG	2	8	673936	673943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_009512	ACGA	2	8	673962	673969	50 %	0 %	25 %	25 %	148545852
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14033	NC_009512	GCT	2	6	674237	674242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545852
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14044	NC_009512	GCCGGC	2	12	674751	674762	0 %	0 %	50 %	50 %	148545852
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14055	NC_009512	GCA	2	6	675179	675184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545852
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14063	NC_009512	CTGA	2	8	675423	675430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14064	NC_009512	GGT	2	6	675449	675454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_009512	CGT	2	6	675528	675533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14115	NC_009512	CTGC	2	8	677876	677883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14120	NC_009512	CAG	2	6	678255	678260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14121	NC_009512	GGT	2	6	678266	678271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545856
14122	NC_009512	CAT	2	6	678278	678283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545856
14123	NC_009512	GCTGGC	2	12	678344	678355	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148545856
14124	NC_009512	GGC	2	6	678363	678368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545856
14125	NC_009512	TCATCG	2	12	678448	678459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148545856
14126	NC_009512	GCC	2	6	678495	678500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545856
14127	NC_009512	GTC	2	6	678542	678547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14128	NC_009512	GTTTG	2	10	678593	678602	0 %	60 %	40 %	0 %	148545856
14129	NC_009512	CCG	2	6	678604	678609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545856
14130	NC_009512	GGT	2	6	678623	678628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545856
14131	NC_009512	CTG	2	6	678669	678674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14132	NC_009512	TTA	2	6	678743	678748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545856
14133	NC_009512	TGCG	2	8	678757	678764	0 %	25 %	50 %	25 %	148545856
14134	NC_009512	GTGG	2	8	678792	678799	0 %	25 %	75 %	0 %	148545856
14135	NC_009512	ACG	2	6	678817	678822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14136	NC_009512	CACT	2	8	678824	678831	25 %	25 %	0 %	50 %	148545856
14137	NC_009512	GAC	2	6	678864	678869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14138	NC_009512	GTG	3	9	678879	678887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545856
14139	NC_009512	TCT	2	6	678937	678942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545856
14140	NC_009512	CAC	2	6	678969	678974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545856
14141	NC_009512	GAC	2	6	679017	679022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14142	NC_009512	CGAC	2	8	679090	679097	25 %	0 %	25 %	50 %	148545856
14143	NC_009512	GC	3	6	679124	679129	0 %	0 %	50 %	50 %	148545856
14144	NC_009512	GCC	2	6	679225	679230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545856
14145	NC_009512	ATC	2	6	679377	679382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545856
14146	NC_009512	GCG	2	6	679412	679417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545856
14147	NC_009512	GAGCA	2	10	679476	679485	40 %	0 %	40 %	20 %	148545856
14148	NC_009512	AGG	2	6	679516	679521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545856
14149	NC_009512	CTG	2	6	679533	679538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14150	NC_009512	TGC	2	6	679684	679689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14151	NC_009512	TGA	2	6	679717	679722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545856
14152	NC_009512	GTC	2	6	679823	679828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545856
14153	NC_009512	GCC	2	6	679841	679846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14154	NC_009512	TCGCG	2	10	679889	679898	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14155	NC_009512	GTCCT	2	10	679939	679948	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14156	NC_009512	GTT	2	6	680098	680103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545857
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14159	NC_009512	GAG	2	6	680351	680356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545857
14160	NC_009512	CAT	2	6	680380	680385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545857
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14162	NC_009512	GCG	2	6	680413	680418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545857
14163	NC_009512	GCC	2	6	680523	680528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14164	NC_009512	CAGC	2	8	680544	680551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14165	NC_009512	TC	3	6	680642	680647	0 %	50 %	0 %	50 %	148545858
14166	NC_009512	TGC	2	6	680648	680653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545858
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14168	NC_009512	CCGC	2	8	680682	680689	0 %	0 %	25 %	75 %	148545858
14169	NC_009512	GCATT	2	10	680784	680793	20 %	40 %	20 %	20 %	148545858
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14174	NC_009512	ACC	2	6	681008	681013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545858
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14176	NC_009512	ATGGC	2	10	681050	681059	20 %	20 %	40 %	20 %	148545858
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14189	NC_009512	GCTG	2	8	681609	681616	0 %	25 %	50 %	25 %	148545858
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14192	NC_009512	CAG	3	9	681661	681669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545858
14193	NC_009512	CGGC	2	8	681710	681717	0 %	0 %	50 %	50 %	148545858
14194	NC_009512	CACGGC	2	12	681796	681807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148545858
14195	NC_009512	TGG	2	6	681815	681820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545858
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14199	NC_009512	TG	3	6	681991	681996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14200	NC_009512	GCTC	2	8	682012	682019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14201	NC_009512	CGGC	2	8	682042	682049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14202	NC_009512	GC	3	6	682162	682167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14203	NC_009512	TGC	2	6	682177	682182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14204	NC_009512	TGC	2	6	682203	682208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14205	NC_009512	CAA	2	6	682248	682253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545859
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14208	NC_009512	GCGCCC	2	12	682342	682353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545859
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14211	NC_009512	GCT	2	6	682746	682751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
14212	NC_009512	TTC	2	6	682816	682821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545859
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14216	NC_009512	CG	3	6	682964	682969	0 %	0 %	50 %	50 %	148545859
14217	NC_009512	TGC	2	6	682979	682984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
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14219	NC_009512	ATT	2	6	683057	683062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545859
14220	NC_009512	GGC	2	6	683155	683160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545859
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14222	NC_009512	GCT	2	6	683208	683213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
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14225	NC_009512	TTC	2	6	683383	683388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545859
14226	NC_009512	TGC	2	6	683429	683434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
14227	NC_009512	CTG	2	6	683443	683448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
14228	NC_009512	CTG	2	6	683611	683616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
14229	NC_009512	GGCG	2	8	683629	683636	0 %	0 %	75 %	25 %	148545859
14230	NC_009512	GCA	3	9	683702	683710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545859
14231	NC_009512	GCCG	2	8	683772	683779	0 %	0 %	50 %	50 %	148545859
14232	NC_009512	GGT	2	6	683931	683936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545859
14233	NC_009512	GGCC	2	8	684013	684020	0 %	0 %	50 %	50 %	148545859
14234	NC_009512	AGC	2	6	684038	684043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545859
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14236	NC_009512	GAATTC	2	12	684121	684132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148545859
14237	NC_009512	TGG	2	6	684134	684139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545859
14238	NC_009512	GGC	2	6	684162	684167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545859
14239	NC_009512	CGC	2	6	684199	684204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545859
14240	NC_009512	TAC	2	6	684208	684213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545859
14241	NC_009512	GCG	2	6	684431	684436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545859
14242	NC_009512	GTCACC	2	12	684505	684516	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148545859
14243	NC_009512	CCGC	2	8	684517	684524	0 %	0 %	25 %	75 %	148545859
14244	NC_009512	TGA	2	6	684542	684547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545859
14245	NC_009512	TGG	2	6	684571	684576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545859
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14248	NC_009512	GC	3	6	684708	684713	0 %	0 %	50 %	50 %	148545859
14249	NC_009512	TGC	2	6	684722	684727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
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14255	NC_009512	GCC	2	6	685004	685009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545859
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14260	NC_009512	GAC	2	6	685114	685119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545859
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14262	NC_009512	CGC	2	6	685233	685238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545859
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14267	NC_009512	GGGCA	2	10	685462	685471	20 %	0 %	60 %	20 %	148545859
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14270	NC_009512	GCCG	2	8	685679	685686	0 %	0 %	50 %	50 %	148545859
14271	NC_009512	CG	3	6	685711	685716	0 %	0 %	50 %	50 %	148545859
14272	NC_009512	ACC	2	6	685750	685755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545859
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14274	NC_009512	CTG	2	6	685867	685872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
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14277	NC_009512	CTG	2	6	685960	685965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545859
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14291	NC_009512	TGG	3	9	686816	686824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545859
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14303	NC_009512	GCT	2	6	687242	687247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14356	NC_009512	AGCA	2	8	689476	689483	50 %	0 %	25 %	25 %	148545861
14357	NC_009512	CAC	2	6	689529	689534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545861
14358	NC_009512	CCAC	2	8	689536	689543	25 %	0 %	0 %	75 %	148545861
14359	NC_009512	GCAG	2	8	689547	689554	25 %	0 %	50 %	25 %	148545861
14360	NC_009512	CTGGGC	2	12	689566	689577	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148545861
14361	NC_009512	GCG	2	6	689700	689705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545861
14362	NC_009512	CGC	2	6	689741	689746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545861
14363	NC_009512	CAC	2	6	689762	689767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545861
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14367	NC_009512	TGG	2	6	689862	689867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545861
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14369	NC_009512	TGC	2	6	689930	689935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545861
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14371	NC_009512	TGC	2	6	690142	690147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545862
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14373	NC_009512	GCG	2	6	690209	690214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545862
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14385	NC_009512	TGCA	2	8	690757	690764	25 %	25 %	25 %	25 %	148545862
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14421	NC_009512	AGT	2	6	692689	692694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14434	NC_009512	A	6	6	693323	693328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14436	NC_009512	GCGT	2	8	693411	693418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14437	NC_009512	TGCA	2	8	693500	693507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14461	NC_009512	GTA	2	6	694368	694373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545866
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14466	NC_009512	GCT	2	6	694665	694670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545866
14467	NC_009512	TGC	2	6	694685	694690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545866
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14469	NC_009512	GCA	2	6	694715	694720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545866
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14471	NC_009512	GCG	2	6	694763	694768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14472	NC_009512	GGC	2	6	694779	694784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545867
14473	NC_009512	GGTGG	2	10	694819	694828	0 %	20 %	80 %	0 %	148545867
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14477	NC_009512	AACC	2	8	695102	695109	50 %	0 %	0 %	50 %	148545867
14478	NC_009512	GCA	2	6	695130	695135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545867
14479	NC_009512	GCCA	2	8	695159	695166	25 %	0 %	25 %	50 %	148545867
14480	NC_009512	GGCC	2	8	695259	695266	0 %	0 %	50 %	50 %	148545867
14481	NC_009512	GC	3	6	695275	695280	0 %	0 %	50 %	50 %	148545867
14482	NC_009512	TGG	2	6	695327	695332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545867
14483	NC_009512	GCCA	2	8	695342	695349	25 %	0 %	25 %	50 %	148545867
14484	NC_009512	GCGG	2	8	695394	695401	0 %	0 %	75 %	25 %	148545867
14485	NC_009512	GCA	2	6	695430	695435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545867
14486	NC_009512	GCC	2	6	695461	695466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545867
14487	NC_009512	GCAC	2	8	695554	695561	25 %	0 %	25 %	50 %	148545868
14488	NC_009512	CAG	2	6	695595	695600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545868
14489	NC_009512	CAC	2	6	695613	695618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545868
14490	NC_009512	GGCA	2	8	695655	695662	25 %	0 %	50 %	25 %	148545868
14491	NC_009512	GGC	2	6	695727	695732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545868
14492	NC_009512	TTC	2	6	695743	695748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545868
14493	NC_009512	TGC	2	6	695837	695842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14494	NC_009512	AAGC	2	8	695868	695875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14495	NC_009512	GGCCC	2	10	695892	695901	0 %	0 %	40 %	60 %	148545869
14496	NC_009512	GCA	2	6	695930	695935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545869
14497	NC_009512	CAC	2	6	695994	695999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545869
14498	NC_009512	AAC	2	6	696133	696138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545869
14499	NC_009512	GCCG	2	8	696197	696204	0 %	0 %	50 %	50 %	148545869
14500	NC_009512	CGG	2	6	696260	696265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545869

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