MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_009512	TGG	2	6	650503	650508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_009512	TGC	2	6	650539	650544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_009512	GGC	2	6	650559	650564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_009512	TGC	2	6	650576	650581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_009512	GAA	2	6	650692	650697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_009512	AGA	2	6	650711	650716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545834
13507	NC_009512	CAG	2	6	650745	650750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13508	NC_009512	CTG	2	6	650760	650765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13509	NC_009512	CAT	2	6	650778	650783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545834
13510	NC_009512	CTT	2	6	650811	650816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545834
13511	NC_009512	CCG	2	6	650821	650826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
13512	NC_009512	GGT	2	6	650849	650854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545834
13513	NC_009512	CA	3	6	650866	650871	50 %	0 %	0 %	50 %	148545834
13514	NC_009512	GCTTCG	2	12	650974	650985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13515	NC_009512	GGT	2	6	650994	650999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545834
13516	NC_009512	ACC	2	6	651007	651012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545834
13517	NC_009512	TTC	2	6	651024	651029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545834
13518	NC_009512	TTG	3	9	651046	651054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545834
13519	NC_009512	GTA	2	6	651078	651083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545834
13520	NC_009512	GCC	2	6	651120	651125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
13521	NC_009512	CTG	3	9	651186	651194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13522	NC_009512	GGTGTC	2	12	651216	651227	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148545834
13523	NC_009512	CGC	2	6	651236	651241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
13524	NC_009512	GCA	2	6	651251	651256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13525	NC_009512	CTT	2	6	651258	651263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545834
13526	NC_009512	CAC	2	6	651267	651272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545834
13527	NC_009512	GAA	2	6	651345	651350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545834
13528	NC_009512	GCC	2	6	651370	651375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
13529	NC_009512	ATG	2	6	651403	651408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545834
13530	NC_009512	GAT	2	6	651459	651464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545834
13531	NC_009512	CGG	2	6	651470	651475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545834
13532	NC_009512	ATG	2	6	651484	651489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545834
13533	NC_009512	TGG	2	6	651542	651547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545834
13534	NC_009512	ACG	2	6	651583	651588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13535	NC_009512	GCA	2	6	651605	651610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13536	NC_009512	AGC	2	6	651628	651633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13537	NC_009512	GCG	2	6	651647	651652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545834
13538	NC_009512	CAC	2	6	651672	651677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545834
13539	NC_009512	GAT	2	6	651744	651749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545834
13540	NC_009512	GCC	2	6	651816	651821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
13541	NC_009512	CAGC	2	8	651838	651845	25 %	0 %	25 %	50 %	148545834
13542	NC_009512	CAG	2	6	651975	651980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13543	NC_009512	GCA	2	6	652027	652032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
13544	NC_009512	GGC	2	6	652035	652040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545834
13545	NC_009512	TAT	2	6	652115	652120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545834
13546	NC_009512	CAC	2	6	652154	652159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545834
13547	NC_009512	GT	3	6	652231	652236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_009512	GGA	2	6	652441	652446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_009512	ACA	2	6	652478	652483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_009512	TGG	2	6	652537	652542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545835
13551	NC_009512	GGC	2	6	652553	652558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13552	NC_009512	GCTGC	2	10	652585	652594	0 %	20 %	40 %	40 %	148545835
13553	NC_009512	GGA	2	6	652597	652602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545835
13554	NC_009512	ACC	2	6	652605	652610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545835
13555	NC_009512	CGG	2	6	652617	652622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13556	NC_009512	GGT	2	6	652636	652641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545835
13557	NC_009512	CTG	2	6	652658	652663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13558	NC_009512	TGC	2	6	652689	652694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13559	NC_009512	ATGAA	2	10	652707	652716	60 %	20 %	20 %	0 %	148545835
13560	NC_009512	CAG	2	6	652727	652732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13561	NC_009512	TGC	2	6	652755	652760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13562	NC_009512	GCG	2	6	652810	652815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13563	NC_009512	GC	3	6	652862	652867	0 %	0 %	50 %	50 %	148545835
13564	NC_009512	CCTG	2	8	652890	652897	0 %	25 %	25 %	50 %	148545835
13565	NC_009512	CCAT	2	8	652917	652924	25 %	25 %	0 %	50 %	148545835
13566	NC_009512	CTG	2	6	653000	653005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13567	NC_009512	GC	3	6	653027	653032	0 %	0 %	50 %	50 %	148545835
13568	NC_009512	GAT	2	6	653092	653097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545835
13569	NC_009512	GCT	2	6	653103	653108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13570	NC_009512	AGC	2	6	653127	653132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13571	NC_009512	GTCG	2	8	653164	653171	0 %	25 %	50 %	25 %	148545835
13572	NC_009512	CCAA	2	8	653226	653233	50 %	0 %	0 %	50 %	148545835
13573	NC_009512	CTG	2	6	653246	653251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13574	NC_009512	GCG	2	6	653265	653270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13575	NC_009512	CGG	2	6	653338	653343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13576	NC_009512	GCCG	2	8	653431	653438	0 %	0 %	50 %	50 %	148545835
13577	NC_009512	GTCT	2	8	653474	653481	0 %	50 %	25 %	25 %	148545835
13578	NC_009512	CCG	2	6	653509	653514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545835
13579	NC_009512	TGC	3	9	653547	653555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13580	NC_009512	GCG	2	6	653556	653561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
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13582	NC_009512	GCG	2	6	653614	653619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13583	NC_009512	TCG	2	6	653631	653636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13584	NC_009512	CGG	2	6	653695	653700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13585	NC_009512	GC	4	8	653712	653719	0 %	0 %	50 %	50 %	148545835
13586	NC_009512	AGG	2	6	653721	653726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545835
13587	NC_009512	CGG	2	6	653755	653760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13588	NC_009512	CTG	2	6	653813	653818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13589	NC_009512	GGA	2	6	653827	653832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545835
13590	NC_009512	GGT	2	6	653839	653844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545835
13591	NC_009512	CTG	2	6	653906	653911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
13592	NC_009512	CGG	2	6	653982	653987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13593	NC_009512	GCT	2	6	654085	654090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
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13597	NC_009512	AGGGCG	2	12	654261	654272	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148545835
13598	NC_009512	CGG	2	6	654310	654315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
13599	NC_009512	AGG	2	6	654384	654389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545835
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13601	NC_009512	CG	3	6	654780	654785	0 %	0 %	50 %	50 %	148545836
13602	NC_009512	TGGC	2	8	654845	654852	0 %	25 %	50 %	25 %	148545836
13603	NC_009512	TGC	2	6	654861	654866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545836
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13606	NC_009512	TGG	2	6	654973	654978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545836
13607	NC_009512	TGG	2	6	655032	655037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545836
13608	NC_009512	CGA	2	6	655042	655047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545836
13609	NC_009512	CTT	2	6	655060	655065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545836
13610	NC_009512	CAA	2	6	655114	655119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545836
13611	NC_009512	TCGA	2	8	655160	655167	25 %	25 %	25 %	25 %	148545836
13612	NC_009512	CCA	2	6	655177	655182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545836
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13614	NC_009512	GCT	2	6	655263	655268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545836
13615	NC_009512	ACC	2	6	655283	655288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545836
13616	NC_009512	GGC	2	6	655295	655300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545836
13617	NC_009512	GTG	2	6	655373	655378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545836
13618	NC_009512	GCA	2	6	655430	655435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545836
13619	NC_009512	GTG	2	6	655451	655456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545836
13620	NC_009512	GCG	2	6	655501	655506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545836
13621	NC_009512	CCA	2	6	655558	655563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545836
13622	NC_009512	CCA	2	6	655578	655583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545836
13623	NC_009512	ACG	2	6	655698	655703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545836
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13647	NC_009512	GCG	2	6	656812	656817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545838
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13649	NC_009512	ACT	2	6	656878	656883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13668	NC_009512	AC	3	6	657594	657599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13720	NC_009512	TGT	2	6	660640	660645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13731	NC_009512	GGCC	2	8	661162	661169	0 %	0 %	50 %	50 %	148545842
13732	NC_009512	GGT	2	6	661192	661197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545842
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13734	NC_009512	CAGC	2	8	661306	661313	25 %	0 %	25 %	50 %	148545842
13735	NC_009512	GGT	2	6	661318	661323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545842
13736	NC_009512	GTT	2	6	661334	661339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545842
13737	NC_009512	GCACCA	2	12	661360	661371	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148545842
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13739	NC_009512	GCA	2	6	661405	661410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545842
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13854	NC_009512	GCA	2	6	666071	666076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545846
13855	NC_009512	AGG	2	6	666202	666207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545846
13856	NC_009512	CGCC	2	8	666212	666219	0 %	0 %	25 %	75 %	148545846
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13979	NC_009512	CG	5	10	671653	671662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13980	NC_009512	GCA	2	6	671681	671686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13981	NC_009512	ACC	2	6	671702	671707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13982	NC_009512	ACC	2	6	671731	671736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13983	NC_009512	CAG	2	6	671793	671798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545851
13984	NC_009512	CGCT	2	8	671863	671870	0 %	25 %	25 %	50 %	148545851
13985	NC_009512	CTG	2	6	671901	671906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545851
13986	NC_009512	CCG	2	6	671930	671935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545851
13987	NC_009512	CCG	2	6	671984	671989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545851
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13999	NC_009512	GCAGC	2	10	672509	672518	20 %	0 %	40 %	40 %	148545851
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