MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009512	TGC	2	6	603300	603305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_009512	TCA	2	6	603391	603396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_009512	TCG	2	6	603401	603406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_009512	AGTG	2	8	603465	603472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_009512	CG	3	6	603532	603537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_009512	C	6	6	603538	603543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12507	NC_009512	GC	3	6	603562	603567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_009512	TGA	2	6	603623	603628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_009512	GGGC	2	8	603644	603651	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12510	NC_009512	CT	3	6	603706	603711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_009512	AGA	2	6	603712	603717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_009512	AGC	2	6	603756	603761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_009512	ATG	2	6	603774	603779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_009512	CAG	2	6	603780	603785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_009512	CAG	2	6	603794	603799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_009512	GGC	2	6	603863	603868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_009512	GCCAGC	2	12	603879	603890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12518	NC_009512	GAT	2	6	603896	603901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_009512	GA	3	6	603911	603916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_009512	A	6	6	603916	603921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_009512	GAA	2	6	604019	604024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_009512	ATG	2	6	604065	604070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_009512	GC	3	6	604115	604120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12524	NC_009512	GGC	2	6	604154	604159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_009512	GATCAG	2	12	604160	604171	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12526	NC_009512	GTG	2	6	604174	604179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_009512	ACGC	2	8	604182	604189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_009512	ACA	2	6	604390	604395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_009512	CCG	3	9	604416	604424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12530	NC_009512	A	6	6	604436	604441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_009512	CAG	2	6	604531	604536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_009512	TGAA	2	8	604642	604649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_009512	TCTG	2	8	604772	604779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12534	NC_009512	T	6	6	604875	604880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_009512	TCA	2	6	604882	604887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_009512	CTG	2	6	604900	604905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_009512	TATGCG	2	12	604910	604921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148545785
12538	NC_009512	GTG	2	6	604936	604941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545785
12539	NC_009512	GAG	2	6	604980	604985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545785
12540	NC_009512	CGCC	2	8	605007	605014	0 %	0 %	25 %	75 %	148545785
12541	NC_009512	CTCA	2	8	605040	605047	25 %	25 %	0 %	50 %	148545785
12542	NC_009512	GCT	2	6	605048	605053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545785
12543	NC_009512	AGC	2	6	605128	605133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545785
12544	NC_009512	GCGG	2	8	605150	605157	0 %	0 %	75 %	25 %	148545785
12545	NC_009512	GT	3	6	605221	605226	0 %	50 %	50 %	0 %	148545785
12546	NC_009512	GCGT	2	8	605317	605324	0 %	25 %	50 %	25 %	148545785
12547	NC_009512	GCA	2	6	605336	605341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545785
12548	NC_009512	TGC	2	6	605347	605352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545785
12549	NC_009512	CTG	3	9	605430	605438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545785
12550	NC_009512	GAT	2	6	605442	605447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545785
12551	NC_009512	TGA	2	6	605471	605476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545785
12552	NC_009512	GCC	2	6	605478	605483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545785
12553	NC_009512	CGC	2	6	605569	605574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545785
12554	NC_009512	CGC	2	6	605641	605646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545785
12555	NC_009512	CG	3	6	605657	605662	0 %	0 %	50 %	50 %	148545785
12556	NC_009512	GC	3	6	605747	605752	0 %	0 %	50 %	50 %	148545785
12557	NC_009512	CGG	2	6	605814	605819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545786
12558	NC_009512	GTT	2	6	605853	605858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545786
12559	NC_009512	CGA	2	6	605886	605891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545786
12560	NC_009512	CCGG	2	8	605900	605907	0 %	0 %	50 %	50 %	148545786
12561	NC_009512	ACC	2	6	605927	605932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545786
12562	NC_009512	GGCT	2	8	605991	605998	0 %	25 %	50 %	25 %	148545786
12563	NC_009512	GGC	2	6	606018	606023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545786
12564	NC_009512	CCA	2	6	606066	606071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545786
12565	NC_009512	CAGCG	2	10	606147	606156	20 %	0 %	40 %	40 %	148545786
12566	NC_009512	CAA	2	6	606165	606170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545786
12567	NC_009512	GGT	2	6	606291	606296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545786
12568	NC_009512	CTT	2	6	606303	606308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545786
12569	NC_009512	TCT	2	6	606365	606370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545786
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12572	NC_009512	GCTG	2	8	606546	606553	0 %	25 %	50 %	25 %	148545786
12573	NC_009512	GCG	3	9	606595	606603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545786
12574	NC_009512	GTT	2	6	606645	606650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545786
12575	NC_009512	GCT	2	6	606731	606736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12576	NC_009512	CAG	2	6	606737	606742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_009512	CCA	2	6	606855	606860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545787
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12579	NC_009512	ACCA	2	8	606916	606923	50 %	0 %	0 %	50 %	148545787
12580	NC_009512	ACCG	2	8	606935	606942	25 %	0 %	25 %	50 %	148545787
12581	NC_009512	TCA	2	6	606999	607004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545787
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12583	NC_009512	TTC	2	6	607049	607054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545787
12584	NC_009512	TTC	2	6	607067	607072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545787
12585	NC_009512	ATC	2	6	607118	607123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545787
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12589	NC_009512	GCT	2	6	607400	607405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545788
12590	NC_009512	CAG	2	6	607424	607429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545788
12591	NC_009512	G	6	6	607456	607461	0 %	0 %	100 %	0 %	148545788
12592	NC_009512	GCT	2	6	607474	607479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545788
12593	NC_009512	TGC	2	6	607593	607598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545788
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12596	NC_009512	CTG	2	6	607730	607735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545788
12597	NC_009512	GGCT	2	8	607740	607747	0 %	25 %	50 %	25 %	148545788
12598	NC_009512	CGGG	2	8	607749	607756	0 %	0 %	75 %	25 %	148545788
12599	NC_009512	GT	3	6	607782	607787	0 %	50 %	50 %	0 %	148545788
12600	NC_009512	CGC	2	6	607795	607800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545788
12601	NC_009512	CGG	2	6	607846	607851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545788
12602	NC_009512	GAG	2	6	607861	607866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545788
12603	NC_009512	TGC	2	6	607926	607931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545788
12604	NC_009512	GCG	2	6	607938	607943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545788
12605	NC_009512	GT	3	6	607950	607955	0 %	50 %	50 %	0 %	148545788
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12608	NC_009512	GGC	2	6	608077	608082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545788
12609	NC_009512	GTC	2	6	608094	608099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545788
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12612	NC_009512	CTG	2	6	608192	608197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545788
12613	NC_009512	GCAG	2	8	608236	608243	25 %	0 %	50 %	25 %	148545788
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12615	NC_009512	GTG	2	6	608280	608285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545788
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12617	NC_009512	CG	3	6	608453	608458	0 %	0 %	50 %	50 %	148545788
12618	NC_009512	GGC	2	6	608461	608466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545788
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12623	NC_009512	TACC	2	8	608679	608686	25 %	25 %	0 %	50 %	148545789
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12863	NC_009512	CTG	2	6	619886	619891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545804
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12874	NC_009512	CGG	2	6	620190	620195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545804
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12981	NC_009512	TGG	2	6	625638	625643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545810
12982	NC_009512	TGG	2	6	625692	625697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545810
12983	NC_009512	GGC	2	6	625716	625721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545810
12984	NC_009512	CGT	2	6	625755	625760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545810
12985	NC_009512	CCG	2	6	625916	625921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12986	NC_009512	CA	3	6	625975	625980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12987	NC_009512	GGGCC	2	10	626022	626031	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12988	NC_009512	CCG	2	6	626048	626053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12989	NC_009512	GCC	2	6	626063	626068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12990	NC_009512	GGT	2	6	626104	626109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12991	NC_009512	CGT	2	6	626139	626144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12992	NC_009512	GCCG	2	8	626217	626224	0 %	0 %	50 %	50 %	148545811
12993	NC_009512	CAGC	2	8	626240	626247	25 %	0 %	25 %	50 %	148545811
12994	NC_009512	CTGG	2	8	626319	626326	0 %	25 %	50 %	25 %	148545811
12995	NC_009512	CACC	2	8	626336	626343	25 %	0 %	0 %	75 %	148545811
12996	NC_009512	ATG	2	6	626362	626367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545811
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12998	NC_009512	CAG	2	6	626388	626393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545811
12999	NC_009512	CTGC	2	8	626401	626408	0 %	25 %	25 %	50 %	148545811
13000	NC_009512	ACC	2	6	626458	626463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545811

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