MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124501	NC_009512	TGA	2	6	5885157	5885162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550440
124502	NC_009512	TGGC	2	8	5885163	5885170	0 %	25 %	50 %	25 %	148550440
124503	NC_009512	TGT	2	6	5885177	5885182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550440
124504	NC_009512	TG	3	6	5885199	5885204	0 %	50 %	50 %	0 %	148550440
124505	NC_009512	TGG	2	6	5885213	5885218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550440
124506	NC_009512	TTA	2	6	5885289	5885294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124507	NC_009512	CCA	2	6	5885416	5885421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550441
124508	NC_009512	GCG	2	6	5885572	5885577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550441
124509	NC_009512	GGC	2	6	5885580	5885585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550441
124510	NC_009512	GAA	2	6	5885618	5885623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550441
124511	NC_009512	GCAG	2	8	5885730	5885737	25 %	0 %	50 %	25 %	148550441
124512	NC_009512	CCAG	2	8	5885854	5885861	25 %	0 %	25 %	50 %	148550441
124513	NC_009512	GAAT	2	8	5885951	5885958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124514	NC_009512	TGA	2	6	5885992	5885997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550442
124515	NC_009512	CAG	2	6	5886011	5886016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550442
124516	NC_009512	CAC	2	6	5886017	5886022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550442
124517	NC_009512	GC	3	6	5886034	5886039	0 %	0 %	50 %	50 %	148550442
124518	NC_009512	CGC	2	6	5886050	5886055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550442
124519	NC_009512	TA	3	6	5886069	5886074	50 %	50 %	0 %	0 %	148550442
124520	NC_009512	GCC	2	6	5886086	5886091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550442
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124522	NC_009512	CAG	2	6	5886122	5886127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550442
124523	NC_009512	TGA	2	6	5886166	5886171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550442
124524	NC_009512	CAG	2	6	5886179	5886184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550442
124525	NC_009512	CGA	2	6	5886187	5886192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550442
124526	NC_009512	TTG	2	6	5886281	5886286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124527	NC_009512	TTCGA	2	10	5886318	5886327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124528	NC_009512	GTG	2	6	5886449	5886454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550443
124529	NC_009512	CAA	2	6	5886475	5886480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550443
124530	NC_009512	CGGC	2	8	5886490	5886497	0 %	0 %	50 %	50 %	148550443
124531	NC_009512	CG	3	6	5886637	5886642	0 %	0 %	50 %	50 %	148550443
124532	NC_009512	GAA	2	6	5886680	5886685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550443
124533	NC_009512	AC	3	6	5886724	5886729	50 %	0 %	0 %	50 %	148550443
124534	NC_009512	CTGG	2	8	5886770	5886777	0 %	25 %	50 %	25 %	148550443
124535	NC_009512	CACG	2	8	5886853	5886860	25 %	0 %	25 %	50 %	148550443
124536	NC_009512	CAG	2	6	5886902	5886907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550443
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124538	NC_009512	TCT	2	6	5886948	5886953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550443
124539	NC_009512	GCA	2	6	5886961	5886966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550443
124540	NC_009512	CGT	2	6	5886982	5886987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550443
124541	NC_009512	CGGC	2	8	5887012	5887019	0 %	0 %	50 %	50 %	148550443
124542	NC_009512	CTGC	2	8	5887051	5887058	0 %	25 %	25 %	50 %	148550443
124543	NC_009512	TCG	2	6	5887239	5887244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550443
124544	NC_009512	GGT	2	6	5887258	5887263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550443
124545	NC_009512	GCGCA	2	10	5887303	5887312	20 %	0 %	40 %	40 %	148550443
124546	NC_009512	GCC	2	6	5887391	5887396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550443
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124550	NC_009512	CGA	2	6	5887647	5887652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550444
124551	NC_009512	GGC	2	6	5887689	5887694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550444
124552	NC_009512	CACCGG	2	12	5887721	5887732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550444
124553	NC_009512	GAT	2	6	5887734	5887739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550444
124554	NC_009512	CCT	2	6	5887763	5887768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550444
124555	NC_009512	CAG	2	6	5887782	5887787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550444
124556	NC_009512	ACC	2	6	5887810	5887815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550444
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124558	NC_009512	TCG	2	6	5887919	5887924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550444
124559	NC_009512	GC	3	6	5887949	5887954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124560	NC_009512	CAA	2	6	5887961	5887966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124561	NC_009512	GCC	2	6	5888058	5888063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124562	NC_009512	CTG	2	6	5888122	5888127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124563	NC_009512	CGA	2	6	5888137	5888142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124564	NC_009512	TGC	2	6	5888144	5888149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124565	NC_009512	CGG	2	6	5888256	5888261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550445
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124573	NC_009512	TGC	2	6	5888632	5888637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550445
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124584	NC_009512	TGCA	2	8	5889314	5889321	25 %	25 %	25 %	25 %	148550446
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124588	NC_009512	ACA	2	6	5889504	5889509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550446
124589	NC_009512	CGC	2	6	5889593	5889598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550446
124590	NC_009512	CGC	2	6	5889645	5889650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550446
124591	NC_009512	GC	3	6	5889740	5889745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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124598	NC_009512	CAA	2	6	5890005	5890010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550447
124599	NC_009512	TGC	2	6	5890131	5890136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550447
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124603	NC_009512	ACG	2	6	5890343	5890348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550447
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124605	NC_009512	GCT	2	6	5890395	5890400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550447
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124613	NC_009512	CAGCTG	2	12	5890984	5890995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148550447
124614	NC_009512	CTG	2	6	5891044	5891049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550447
124615	NC_009512	TGC	2	6	5891066	5891071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550447
124616	NC_009512	TCG	2	6	5891084	5891089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550447
124617	NC_009512	GCT	2	6	5891250	5891255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550447
124618	NC_009512	GAC	2	6	5891257	5891262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550447
124619	NC_009512	CGA	2	6	5891271	5891276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550447
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124621	NC_009512	T	8	8	5891415	5891422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124622	NC_009512	CA	3	6	5891514	5891519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124623	NC_009512	TGC	2	6	5891563	5891568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550448
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124629	NC_009512	GCT	2	6	5891816	5891821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550448
124630	NC_009512	CTG	2	6	5891874	5891879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550448
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124632	NC_009512	TCTG	2	8	5891983	5891990	0 %	50 %	25 %	25 %	148550448
124633	NC_009512	GAC	2	6	5892012	5892017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550448
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124642	NC_009512	TCG	2	6	5892339	5892344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550448
124643	NC_009512	GCA	2	6	5892376	5892381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550448
124644	NC_009512	GCT	2	6	5892392	5892397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550448
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124647	NC_009512	GGGCC	2	10	5892652	5892661	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124648	NC_009512	GCC	2	6	5892694	5892699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124649	NC_009512	CGA	2	6	5892713	5892718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124650	NC_009512	CAC	2	6	5892732	5892737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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124653	NC_009512	AAC	2	6	5892844	5892849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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124709	NC_009512	TCA	2	6	5895055	5895060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550451
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124718	NC_009512	CGT	2	6	5895601	5895606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550451
124719	NC_009512	GTC	2	6	5895608	5895613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550451
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124722	NC_009512	GCC	2	6	5895797	5895802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550451
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124724	NC_009512	GCA	3	9	5895871	5895879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550451
124725	NC_009512	CTG	2	6	5895902	5895907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550451
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