MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_009512	CGA	2	6	580420	580425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545766
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12004	NC_009512	TGC	2	6	580593	580598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545766
12005	NC_009512	ACCA	2	8	580646	580653	50 %	0 %	0 %	50 %	148545766
12006	NC_009512	AATG	2	8	580813	580820	50 %	25 %	25 %	0 %	148545766
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12008	NC_009512	TGA	2	6	580890	580895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545766
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12012	NC_009512	ACT	2	6	581104	581109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_009512	T	6	6	581120	581125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12021	NC_009512	TGCG	2	8	581569	581576	0 %	25 %	50 %	25 %	148545767
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12120	NC_009512	ATC	2	6	586416	586421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545770
12121	NC_009512	GCT	2	6	586445	586450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545770
12122	NC_009512	CGG	2	6	586451	586456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545770
12123	NC_009512	CAG	3	9	586470	586478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545770
12124	NC_009512	GGC	2	6	586479	586484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545770
12125	NC_009512	GGC	2	6	586503	586508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545770
12126	NC_009512	GGC	2	6	586518	586523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545770
12127	NC_009512	CAG	2	6	586524	586529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545770
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12129	NC_009512	GCT	2	6	586623	586628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545770
12130	NC_009512	T	7	7	586718	586724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_009512	GCA	2	6	586729	586734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12140	NC_009512	GC	3	6	587043	587048	0 %	0 %	50 %	50 %	148545771
12141	NC_009512	GCC	2	6	587050	587055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545771
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12143	NC_009512	GCT	2	6	587148	587153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545771
12144	NC_009512	GAT	2	6	587164	587169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545771
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12150	NC_009512	CG	3	6	587463	587468	0 %	0 %	50 %	50 %	148545771
12151	NC_009512	CGC	2	6	587507	587512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545771
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12157	NC_009512	TGC	2	6	587653	587658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545771
12158	NC_009512	CAGC	2	8	587673	587680	25 %	0 %	25 %	50 %	148545771
12159	NC_009512	TTGT	2	8	587703	587710	0 %	75 %	25 %	0 %	148545771
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12164	NC_009512	GCT	2	6	587956	587961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545771
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12168	NC_009512	ATTT	2	8	588228	588235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12169	NC_009512	ATC	2	6	588268	588273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12170	NC_009512	TGGA	2	8	588324	588331	25 %	25 %	50 %	0 %	148545772
12171	NC_009512	TCG	2	6	588421	588426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545772
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12207	NC_009512	GGC	2	6	589971	589976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12209	NC_009512	CG	3	6	590024	590029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12210	NC_009512	CCA	2	6	590031	590036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12211	NC_009512	TTC	2	6	590076	590081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545774
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12222	NC_009512	GCT	2	6	590559	590564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545774
12223	NC_009512	GGCT	2	8	590573	590580	0 %	25 %	50 %	25 %	148545774
12224	NC_009512	ACCA	2	8	590697	590704	50 %	0 %	0 %	50 %	148545775
12225	NC_009512	GCA	2	6	590754	590759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12226	NC_009512	CAA	2	6	590807	590812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545775
12227	NC_009512	ACT	2	6	590866	590871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545775
12228	NC_009512	GGGC	2	8	590909	590916	0 %	0 %	75 %	25 %	148545775
12229	NC_009512	ACG	2	6	591034	591039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12230	NC_009512	GT	3	6	591049	591054	0 %	50 %	50 %	0 %	148545775
12231	NC_009512	GCA	2	6	591122	591127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12232	NC_009512	TGA	2	6	591148	591153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545775
12233	NC_009512	AGC	2	6	591154	591159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12234	NC_009512	ATG	2	6	591219	591224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545775
12235	NC_009512	CCT	2	6	591244	591249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545775
12236	NC_009512	GCA	2	6	591299	591304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12237	NC_009512	GCT	3	9	591347	591355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12238	NC_009512	GACC	2	8	591422	591429	25 %	0 %	25 %	50 %	148545775
12239	NC_009512	CTG	2	6	591435	591440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12240	NC_009512	CGC	2	6	591494	591499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545775
12241	NC_009512	GC	3	6	591512	591517	0 %	0 %	50 %	50 %	148545775
12242	NC_009512	TGA	2	6	591583	591588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545775
12243	NC_009512	CGG	2	6	591613	591618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545775
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12250	NC_009512	GCTG	2	8	591955	591962	0 %	25 %	50 %	25 %	148545775
12251	NC_009512	GAGC	2	8	592022	592029	25 %	0 %	50 %	25 %	148545775
12252	NC_009512	CCTGCG	2	12	592034	592045	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148545775
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12261	NC_009512	CCG	2	6	592382	592387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545775
12262	NC_009512	GCAAG	2	10	592418	592427	40 %	0 %	40 %	20 %	148545775
12263	NC_009512	TGG	2	6	592458	592463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545775
12264	NC_009512	CGC	2	6	592513	592518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545775
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12270	NC_009512	TG	3	6	592706	592711	0 %	50 %	50 %	0 %	148545775
12271	NC_009512	GCAC	2	8	592723	592730	25 %	0 %	25 %	50 %	148545775
12272	NC_009512	GCG	2	6	592746	592751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545775
12273	NC_009512	ACC	2	6	592752	592757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545775
12274	NC_009512	AGCA	2	8	592788	592795	50 %	0 %	25 %	25 %	148545775
12275	NC_009512	TCG	2	6	592831	592836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545775
12276	NC_009512	GCGGTG	2	12	592920	592931	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148545775
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12278	NC_009512	GCCA	2	8	593126	593133	25 %	0 %	25 %	50 %	148545776
12279	NC_009512	CAT	2	6	593137	593142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545776
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12284	NC_009512	TGCA	2	8	593408	593415	25 %	25 %	25 %	25 %	148545776
12285	NC_009512	ATC	2	6	593462	593467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545776
12286	NC_009512	TCG	2	6	593484	593489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545776
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12288	NC_009512	GCA	2	6	593670	593675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545776
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12293	NC_009512	CCAG	2	8	593836	593843	25 %	0 %	25 %	50 %	148545776
12294	NC_009512	TGG	2	6	593856	593861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545776
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12300	NC_009512	AGC	2	6	594060	594065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545776
12301	NC_009512	ACA	2	6	594077	594082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545777
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12304	NC_009512	CGG	3	9	594210	594218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545777
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12308	NC_009512	GCT	2	6	594411	594416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545777
12309	NC_009512	CTG	2	6	594427	594432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545777
12310	NC_009512	TGC	2	6	594446	594451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545777
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12313	NC_009512	GCT	2	6	594525	594530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545777
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12317	NC_009512	CAT	2	6	594655	594660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545777
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12320	NC_009512	CCTG	2	8	594793	594800	0 %	25 %	25 %	50 %	148545778
12321	NC_009512	CG	3	6	594826	594831	0 %	0 %	50 %	50 %	148545778
12322	NC_009512	CAG	3	9	594902	594910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545778
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12324	NC_009512	GCC	2	6	594982	594987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545778
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12333	NC_009512	GT	4	8	595399	595406	0 %	50 %	50 %	0 %	148545778
12334	NC_009512	GAT	2	6	595448	595453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545778
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12336	NC_009512	TGC	2	6	595490	595495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545778
12337	NC_009512	GCG	2	6	595541	595546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545778
12338	NC_009512	GAT	2	6	595562	595567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545778
12339	NC_009512	GTA	2	6	595787	595792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12340	NC_009512	GATC	2	8	595877	595884	25 %	25 %	25 %	25 %	148545779
12341	NC_009512	GCT	2	6	595922	595927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545779
12342	NC_009512	CGA	2	6	595928	595933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545779
12343	NC_009512	CCCG	2	8	595944	595951	0 %	0 %	25 %	75 %	148545779
12344	NC_009512	TCC	2	6	595990	595995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545779
12345	NC_009512	GCG	2	6	596005	596010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545779
12346	NC_009512	CGC	2	6	596043	596048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545779
12347	NC_009512	TGC	2	6	596071	596076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545779
12348	NC_009512	GAA	2	6	596106	596111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545779
12349	NC_009512	TGA	2	6	596192	596197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545779
12350	NC_009512	CAA	3	9	596252	596260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545779
12351	NC_009512	GCC	3	9	596262	596270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545779
12352	NC_009512	TGC	2	6	596272	596277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545779
12353	NC_009512	GC	4	8	596296	596303	0 %	0 %	50 %	50 %	148545779
12354	NC_009512	AAGG	2	8	596304	596311	50 %	0 %	50 %	0 %	148545779
12355	NC_009512	CAT	2	6	596312	596317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545779
12356	NC_009512	GGT	2	6	596343	596348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545779
12357	NC_009512	CAT	2	6	596366	596371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545779
12358	NC_009512	CAC	2	6	596405	596410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545779
12359	NC_009512	GCC	2	6	596439	596444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545779
12360	NC_009512	CTG	2	6	596463	596468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545779
12361	NC_009512	GCA	2	6	596482	596487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545779
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12364	NC_009512	CTG	2	6	596688	596693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545779
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12370	NC_009512	CAGC	2	8	596993	597000	25 %	0 %	25 %	50 %	148545779
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12376	NC_009512	CTG	3	9	597266	597274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545780
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12394	NC_009512	CGTG	2	8	597880	597887	0 %	25 %	50 %	25 %	148545780
12395	NC_009512	TGCA	2	8	597891	597898	25 %	25 %	25 %	25 %	148545780
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12410	NC_009512	CTG	2	6	598502	598507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545780
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12415	NC_009512	CTG	2	6	598658	598663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545780
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12422	NC_009512	T	6	6	599246	599251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12423	NC_009512	TCG	2	6	599304	599309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12455	NC_009512	GCT	2	6	600533	600538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545782
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12464	NC_009512	GGTGCA	2	12	600942	600953	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545782
12465	NC_009512	GC	3	6	601043	601048	0 %	0 %	50 %	50 %	148545782
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12467	NC_009512	CAG	2	6	601245	601250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545782
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12470	NC_009512	CAG	2	6	601299	601304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545782
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12475	NC_009512	GC	3	6	601510	601515	0 %	0 %	50 %	50 %	148545782
12476	NC_009512	GAA	2	6	601542	601547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545782
12477	NC_009512	GCT	2	6	601548	601553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545782
12478	NC_009512	CCA	2	6	601562	601567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545782
12479	NC_009512	CGGC	2	8	601654	601661	0 %	0 %	50 %	50 %	148545782
12480	NC_009512	GCCT	2	8	601698	601705	0 %	25 %	25 %	50 %	148545782
12481	NC_009512	GAG	2	6	601815	601820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545782
12482	NC_009512	ATTCTT	2	12	601872	601883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12483	NC_009512	GCC	2	6	602102	602107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545783
12484	NC_009512	CAA	2	6	602133	602138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545783
12485	NC_009512	CTT	2	6	602193	602198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545783
12486	NC_009512	CCG	2	6	602228	602233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545783
12487	NC_009512	CAG	2	6	602278	602283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545783
12488	NC_009512	GTT	2	6	602304	602309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545783
12489	NC_009512	GGC	2	6	602329	602334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545783
12490	NC_009512	TAC	2	6	602356	602361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545783
12491	NC_009512	CAC	2	6	602478	602483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545783
12492	NC_009512	GCG	2	6	602521	602526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545783
12493	NC_009512	GTG	2	6	602692	602697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545783
12494	NC_009512	GAG	2	6	602713	602718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545783
12495	NC_009512	CCGG	2	8	602757	602764	0 %	0 %	50 %	50 %	148545783
12496	NC_009512	CTT	2	6	603014	603019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545784
12497	NC_009512	CGT	2	6	603110	603115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545784
12498	NC_009512	TTG	2	6	603196	603201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545784
12499	NC_009512	GGC	2	6	603204	603209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545784
12500	NC_009512	TGG	2	6	603235	603240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545784

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