MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121001	NC_009512	GGT	2	6	5720979	5720984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121002	NC_009512	TGGA	2	8	5720999	5721006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121003	NC_009512	CGAAG	2	10	5721097	5721106	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121004	NC_009512	GGC	2	6	5721107	5721112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121005	NC_009512	ATT	2	6	5721152	5721157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121006	NC_009512	ACG	2	6	5721197	5721202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121007	NC_009512	TAT	2	6	5721269	5721274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121008	NC_009512	T	7	7	5721311	5721317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121009	NC_009512	ACA	2	6	5721320	5721325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121010	NC_009512	A	6	6	5721333	5721338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121011	NC_009512	GCA	2	6	5721405	5721410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121012	NC_009512	C	6	6	5721494	5721499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121013	NC_009512	TTGA	2	8	5721500	5721507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121014	NC_009512	AAC	2	6	5721515	5721520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121015	NC_009512	CAT	2	6	5721531	5721536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550291
121016	NC_009512	TGGTG	2	10	5721636	5721645	0 %	40 %	60 %	0 %	148550291
121017	NC_009512	CCTC	2	8	5721710	5721717	0 %	25 %	0 %	75 %	148550291
121018	NC_009512	ATCCC	2	10	5721797	5721806	20 %	20 %	0 %	60 %	148550291
121019	NC_009512	GCT	2	6	5721852	5721857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550291
121020	NC_009512	TTC	2	6	5721889	5721894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550291
121021	NC_009512	TGC	2	6	5721911	5721916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550291
121022	NC_009512	GGT	2	6	5721921	5721926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550291
121023	NC_009512	GCC	2	6	5722010	5722015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550291
121024	NC_009512	GCC	2	6	5722020	5722025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550291
121025	NC_009512	CGA	2	6	5722077	5722082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550291
121026	NC_009512	CGA	2	6	5722086	5722091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550291
121027	NC_009512	CTGC	2	8	5722101	5722108	0 %	25 %	25 %	50 %	148550291
121028	NC_009512	CAC	2	6	5722198	5722203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550291
121029	NC_009512	CAGG	2	8	5722318	5722325	25 %	0 %	50 %	25 %	148550291
121030	NC_009512	CAA	2	6	5722368	5722373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550291
121031	NC_009512	CGC	2	6	5722404	5722409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550291
121032	NC_009512	CGG	2	6	5722425	5722430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550291
121033	NC_009512	CCG	2	6	5722488	5722493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550291
121034	NC_009512	GC	3	6	5722499	5722504	0 %	0 %	50 %	50 %	148550291
121035	NC_009512	ACCG	2	8	5722566	5722573	25 %	0 %	25 %	50 %	148550291
121036	NC_009512	TGA	2	6	5722634	5722639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550291
121037	NC_009512	GGC	2	6	5722641	5722646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550291
121038	NC_009512	GGCG	2	8	5722653	5722660	0 %	0 %	75 %	25 %	148550291
121039	NC_009512	CAC	2	6	5722663	5722668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550291
121040	NC_009512	CAA	2	6	5722677	5722682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550291
121041	NC_009512	AGC	2	6	5722721	5722726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550291
121042	NC_009512	AAC	2	6	5722744	5722749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550291
121043	NC_009512	GAC	2	6	5722774	5722779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550291
121044	NC_009512	CGC	2	6	5722919	5722924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121045	NC_009512	GCG	2	6	5722938	5722943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121046	NC_009512	CGC	2	6	5723114	5723119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550292
121047	NC_009512	CAG	2	6	5723240	5723245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121048	NC_009512	GAT	2	6	5723345	5723350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550292
121049	NC_009512	TC	3	6	5723386	5723391	0 %	50 %	0 %	50 %	148550292
121050	NC_009512	CG	3	6	5723404	5723409	0 %	0 %	50 %	50 %	148550292
121051	NC_009512	CAG	2	6	5723456	5723461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121052	NC_009512	CAC	2	6	5723492	5723497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550292
121053	NC_009512	ACCGCC	2	12	5723525	5723536	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148550292
121054	NC_009512	AGC	2	6	5723556	5723561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121055	NC_009512	GC	3	6	5723560	5723565	0 %	0 %	50 %	50 %	148550292
121056	NC_009512	GC	3	6	5723594	5723599	0 %	0 %	50 %	50 %	148550292
121057	NC_009512	GCA	2	6	5723625	5723630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121058	NC_009512	CAG	2	6	5723633	5723638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121059	NC_009512	CTG	2	6	5723684	5723689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121060	NC_009512	CAA	2	6	5723753	5723758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550292
121061	NC_009512	ACA	2	6	5723851	5723856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550292
121062	NC_009512	TCG	2	6	5723871	5723876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121063	NC_009512	GTG	2	6	5723924	5723929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550292
121064	NC_009512	GCG	2	6	5724018	5724023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550292
121065	NC_009512	GGT	2	6	5724121	5724126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550292
121066	NC_009512	GCACCA	2	12	5724184	5724195	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148550292
121067	NC_009512	GCA	3	9	5724214	5724222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550292
121068	NC_009512	ATC	2	6	5724409	5724414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121069	NC_009512	CG	3	6	5724436	5724441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121070	NC_009512	TGG	2	6	5724565	5724570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550293
121071	NC_009512	CGG	2	6	5724723	5724728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550293
121072	NC_009512	GC	3	6	5724808	5724813	0 %	0 %	50 %	50 %	148550293
121073	NC_009512	CAC	2	6	5724893	5724898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550293
121074	NC_009512	GGTCGG	2	12	5724921	5724932	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148550293
121075	NC_009512	GCAT	2	8	5725003	5725010	25 %	25 %	25 %	25 %	148550293
121076	NC_009512	CGA	2	6	5725044	5725049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550293
121077	NC_009512	TGGC	2	8	5725155	5725162	0 %	25 %	50 %	25 %	148550293
121078	NC_009512	TTC	2	6	5725200	5725205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550293
121079	NC_009512	CAG	2	6	5725224	5725229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550293
121080	NC_009512	CAG	2	6	5725251	5725256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550293
121081	NC_009512	GAA	2	6	5725284	5725289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550293
121082	NC_009512	CAG	2	6	5725440	5725445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550293
121083	NC_009512	CTG	2	6	5725467	5725472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550293
121084	NC_009512	GCG	2	6	5725576	5725581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550293
121085	NC_009512	GGC	2	6	5725587	5725592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550293
121086	NC_009512	CTC	2	6	5725630	5725635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121087	NC_009512	CAT	2	6	5725648	5725653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121088	NC_009512	CTG	2	6	5725693	5725698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121089	NC_009512	CT	3	6	5725703	5725708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121090	NC_009512	C	6	6	5725719	5725724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121091	NC_009512	CTG	2	6	5725809	5725814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121092	NC_009512	CAA	2	6	5725823	5725828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550294
121093	NC_009512	CCG	2	6	5725891	5725896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550294
121094	NC_009512	CTGCGC	2	12	5725908	5725919	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148550294
121095	NC_009512	TGGC	2	8	5725969	5725976	0 %	25 %	50 %	25 %	148550294
121096	NC_009512	GAA	2	6	5726030	5726035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550294
121097	NC_009512	CTG	2	6	5726048	5726053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121098	NC_009512	CAC	2	6	5726102	5726107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550294
121099	NC_009512	GGT	2	6	5726159	5726164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550294
121100	NC_009512	AGG	2	6	5726212	5726217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550294
121101	NC_009512	GAGCTG	3	18	5726226	5726243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148550294
121102	NC_009512	CTG	2	6	5726265	5726270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121103	NC_009512	GCC	2	6	5726289	5726294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550294
121104	NC_009512	CTG	2	6	5726346	5726351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121105	NC_009512	GAC	2	6	5726412	5726417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121106	NC_009512	GCC	2	6	5726424	5726429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550294
121107	NC_009512	CTG	2	6	5726442	5726447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121108	NC_009512	GCA	2	6	5726449	5726454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121109	NC_009512	GAGC	2	8	5726525	5726532	25 %	0 %	50 %	25 %	148550294
121110	NC_009512	GC	4	8	5726534	5726541	0 %	0 %	50 %	50 %	148550294
121111	NC_009512	GCA	2	6	5726562	5726567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550294
121112	NC_009512	CG	3	6	5726569	5726574	0 %	0 %	50 %	50 %	148550294
121113	NC_009512	CCA	2	6	5726575	5726580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550294
121114	NC_009512	CTTG	2	8	5726609	5726616	0 %	50 %	25 %	25 %	148550294
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121116	NC_009512	GAA	2	6	5726691	5726696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550294
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121118	NC_009512	GCTG	2	8	5726815	5726822	0 %	25 %	50 %	25 %	148550294
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121460	NC_009512	ATC	2	6	5743342	5743347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550310
121461	NC_009512	CCG	2	6	5743351	5743356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550310
121462	NC_009512	CAA	2	6	5743365	5743370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550310
121463	NC_009512	GC	3	6	5743384	5743389	0 %	0 %	50 %	50 %	148550310
121464	NC_009512	GCA	2	6	5743418	5743423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550310
121465	NC_009512	GGC	2	6	5743461	5743466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550310
121466	NC_009512	TGC	2	6	5743487	5743492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550310
121467	NC_009512	CTG	2	6	5743555	5743560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550310
121468	NC_009512	CGA	2	6	5743584	5743589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550310
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121470	NC_009512	ACG	2	6	5743871	5743876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121471	NC_009512	TCG	2	6	5743968	5743973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550311
121472	NC_009512	CGC	2	6	5743990	5743995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550311
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121474	NC_009512	CGCC	2	8	5744073	5744080	0 %	0 %	25 %	75 %	148550311
121475	NC_009512	ACG	2	6	5744102	5744107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550311
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121477	NC_009512	ACCT	2	8	5744161	5744168	25 %	25 %	0 %	50 %	148550311
121478	NC_009512	TGC	2	6	5744174	5744179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550311
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121482	NC_009512	TGC	2	6	5744426	5744431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550311
121483	NC_009512	GCG	2	6	5744542	5744547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121484	NC_009512	G	6	6	5744553	5744558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121485	NC_009512	TGGC	3	12	5744570	5744581	0 %	25 %	50 %	25 %	148550312
121486	NC_009512	CAG	2	6	5744684	5744689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550312
121487	NC_009512	C	6	6	5744723	5744728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121488	NC_009512	CCG	2	6	5744765	5744770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121489	NC_009512	ACA	2	6	5744803	5744808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121490	NC_009512	CGCA	2	8	5744815	5744822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121491	NC_009512	AGC	2	6	5744882	5744887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121492	NC_009512	TGA	2	6	5744905	5744910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550313
121493	NC_009512	CGA	2	6	5744921	5744926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550313
121494	NC_009512	GC	3	6	5744961	5744966	0 %	0 %	50 %	50 %	148550313
121495	NC_009512	TTC	3	9	5745030	5745038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550313
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121499	NC_009512	GCC	2	6	5745280	5745285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550313
121500	NC_009512	CA	3	6	5745383	5745388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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