MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120001	NC_009512	GTC	2	6	5672320	5672325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550246
120002	NC_009512	GAT	2	6	5672346	5672351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550246
120003	NC_009512	CCA	2	6	5672381	5672386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550246
120004	NC_009512	TGA	2	6	5672393	5672398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550246
120005	NC_009512	CT	3	6	5672572	5672577	0 %	50 %	0 %	50 %	148550246
120006	NC_009512	CAG	2	6	5672609	5672614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550246
120007	NC_009512	CAT	2	6	5672627	5672632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550246
120008	NC_009512	CTT	2	6	5672648	5672653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550246
120009	NC_009512	GTG	2	6	5672665	5672670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550246
120010	NC_009512	CGC	2	6	5672717	5672722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550246
120011	NC_009512	TTCC	2	8	5672730	5672737	0 %	50 %	0 %	50 %	148550246
120012	NC_009512	TCA	2	6	5672795	5672800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550246
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120014	NC_009512	AAT	2	6	5672874	5672879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550246
120015	NC_009512	ATG	2	6	5672880	5672885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550246
120016	NC_009512	TCA	2	6	5672900	5672905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550246
120017	NC_009512	GTT	2	6	5673123	5673128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550246
120018	NC_009512	CAG	2	6	5673129	5673134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550246
120019	NC_009512	GCGA	2	8	5673359	5673366	25 %	0 %	50 %	25 %	148550246
120020	NC_009512	GAGG	2	8	5673371	5673378	25 %	0 %	75 %	0 %	148550246
120021	NC_009512	GAA	2	6	5673435	5673440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550246
120022	NC_009512	TCGC	2	8	5673487	5673494	0 %	25 %	25 %	50 %	148550246
120023	NC_009512	TCTT	2	8	5673639	5673646	0 %	75 %	0 %	25 %	148550246
120024	NC_009512	GAT	2	6	5673687	5673692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550246
120025	NC_009512	CTT	2	6	5673699	5673704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550246
120026	NC_009512	CAGCTT	2	12	5673831	5673842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148550246
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120032	NC_009512	AAGCG	2	10	5674029	5674038	40 %	0 %	40 %	20 %	148550246
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120041	NC_009512	TCT	2	6	5674528	5674533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550247
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120062	NC_009512	GTCAAG	2	12	5675434	5675445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120063	NC_009512	GAA	2	6	5675455	5675460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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120115	NC_009512	A	7	7	5677941	5677947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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120213	NC_009512	CGCCAG	2	12	5682767	5682778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550255
120214	NC_009512	CAC	2	6	5682794	5682799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550255
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120219	NC_009512	ACCA	2	8	5682969	5682976	50 %	0 %	0 %	50 %	148550255
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120221	NC_009512	GCA	2	6	5682997	5683002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550255
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120224	NC_009512	AGC	3	9	5683077	5683085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550255
120225	NC_009512	GAT	2	6	5683094	5683099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550255
120226	NC_009512	GTC	2	6	5683139	5683144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120227	NC_009512	CTT	2	6	5683168	5683173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120228	NC_009512	TCC	2	6	5683296	5683301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550256
120229	NC_009512	CCA	2	6	5683318	5683323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550256
120230	NC_009512	GCCC	2	8	5683378	5683385	0 %	0 %	25 %	75 %	148550256
120231	NC_009512	TTG	2	6	5683389	5683394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550256
120232	NC_009512	GCA	2	6	5683438	5683443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120233	NC_009512	TCG	2	6	5683449	5683454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120234	NC_009512	GCC	2	6	5683472	5683477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550256
120235	NC_009512	TGC	2	6	5683554	5683559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120236	NC_009512	GGGT	2	8	5683587	5683594	0 %	25 %	75 %	0 %	148550256
120237	NC_009512	GAT	2	6	5683724	5683729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550256
120238	NC_009512	CCA	2	6	5683813	5683818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550256
120239	NC_009512	CTT	2	6	5683853	5683858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550256
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120241	NC_009512	CAG	2	6	5683882	5683887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120242	NC_009512	TCG	2	6	5683908	5683913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120243	NC_009512	TGC	2	6	5683928	5683933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120244	NC_009512	GAC	2	6	5683958	5683963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550256
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120247	NC_009512	GCA	2	6	5684050	5684055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120248	NC_009512	GCC	2	6	5684079	5684084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550256
120249	NC_009512	GCAG	2	8	5684086	5684093	25 %	0 %	50 %	25 %	148550256
120250	NC_009512	GCA	2	6	5684154	5684159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120251	NC_009512	GCC	2	6	5684174	5684179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550256
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120253	NC_009512	TCG	2	6	5684274	5684279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550256
120254	NC_009512	GCA	2	6	5684359	5684364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550256
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120257	NC_009512	TGG	2	6	5684431	5684436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550256
120258	NC_009512	CG	4	8	5684452	5684459	0 %	0 %	50 %	50 %	148550256
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120260	NC_009512	GCCG	2	8	5684486	5684493	0 %	0 %	50 %	50 %	148550256
120261	NC_009512	CCACG	2	10	5684503	5684512	20 %	0 %	20 %	60 %	148550256
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120263	NC_009512	CG	3	6	5684677	5684682	0 %	0 %	50 %	50 %	148550256
120264	NC_009512	TCT	2	6	5684692	5684697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550256
120265	NC_009512	CGT	2	6	5684927	5684932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550257
120266	NC_009512	CTT	2	6	5684960	5684965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550257
120267	NC_009512	GCG	3	9	5685145	5685153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550257
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120279	NC_009512	AAC	2	6	5685882	5685887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550258
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120282	NC_009512	TTG	2	6	5686047	5686052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550258
120283	NC_009512	GTC	2	6	5686112	5686117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550258
120284	NC_009512	TCG	2	6	5686152	5686157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550258
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120288	NC_009512	CCA	2	6	5686412	5686417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550258
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120292	NC_009512	TGT	2	6	5686617	5686622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550259
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120294	NC_009512	GTC	2	6	5686682	5686687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550259
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120297	NC_009512	TCCAGC	2	12	5686779	5686790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148550259
120298	NC_009512	GCT	2	6	5686891	5686896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550259
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120313	NC_009512	GC	3	6	5687572	5687577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120314	NC_009512	TGC	2	6	5687648	5687653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120315	NC_009512	GAA	2	6	5687681	5687686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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120317	NC_009512	ATC	2	6	5687890	5687895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550260
120318	NC_009512	CAT	2	6	5687913	5687918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550260
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120320	NC_009512	TGTC	2	8	5687972	5687979	0 %	50 %	25 %	25 %	148550260
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120325	NC_009512	CTCG	2	8	5688215	5688222	0 %	25 %	25 %	50 %	148550260
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120327	NC_009512	TGA	2	6	5688272	5688277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550260
120328	NC_009512	CAG	2	6	5688279	5688284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550260
120329	NC_009512	CAC	2	6	5688348	5688353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550260
120330	NC_009512	ATG	2	6	5688468	5688473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550261
120331	NC_009512	TTC	2	6	5688518	5688523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550261
120332	NC_009512	CGA	2	6	5688604	5688609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550261
120333	NC_009512	TTG	2	6	5688624	5688629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550261
120334	NC_009512	CGAAG	2	10	5688641	5688650	40 %	0 %	40 %	20 %	148550261
120335	NC_009512	GTC	2	6	5688653	5688658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550261
120336	NC_009512	ACCAC	2	10	5688721	5688730	40 %	0 %	0 %	60 %	148550261
120337	NC_009512	TCA	2	6	5688901	5688906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550261
120338	NC_009512	CAG	2	6	5688995	5689000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550261
120339	NC_009512	CGC	2	6	5689042	5689047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550261
120340	NC_009512	GAA	2	6	5689079	5689084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550261
120341	NC_009512	GCA	2	6	5689123	5689128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550261
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120343	NC_009512	CCG	2	6	5689383	5689388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550261
120344	NC_009512	GCC	2	6	5689406	5689411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550261
120345	NC_009512	CTGG	2	8	5689415	5689422	0 %	25 %	50 %	25 %	148550261
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120348	NC_009512	CGA	2	6	5689567	5689572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550261
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120377	NC_009512	TTGC	2	8	5691238	5691245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120378	NC_009512	GAA	2	6	5691251	5691256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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120398	NC_009512	AAAAG	2	10	5691965	5691974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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120410	NC_009512	CAG	2	6	5692542	5692547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120412	NC_009512	ACG	2	6	5692581	5692586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120449	NC_009512	CTT	2	6	5694179	5694184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550267
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120451	NC_009512	CGA	2	6	5694287	5694292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550267
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120455	NC_009512	GAT	2	6	5694398	5694403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550267
120456	NC_009512	CGG	3	9	5694416	5694424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550267
120457	NC_009512	CTG	2	6	5694438	5694443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550267
120458	NC_009512	GCCAGC	2	12	5694448	5694459	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550267
120459	NC_009512	AAC	2	6	5694489	5694494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550267
120460	NC_009512	CTG	2	6	5694498	5694503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550267
120461	NC_009512	TAC	2	6	5694579	5694584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550267
120462	NC_009512	GGC	2	6	5694587	5694592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550267
120463	NC_009512	CGC	2	6	5694608	5694613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550267
120464	NC_009512	GGT	2	6	5694716	5694721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550268
120465	NC_009512	GCA	2	6	5694734	5694739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550268
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120467	NC_009512	CCCA	2	8	5694889	5694896	25 %	0 %	0 %	75 %	148550268
120468	NC_009512	GCA	2	6	5695007	5695012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550268
120469	NC_009512	CAG	2	6	5695065	5695070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550268
120470	NC_009512	TGCG	2	8	5695094	5695101	0 %	25 %	50 %	25 %	148550268
120471	NC_009512	GCA	2	6	5695109	5695114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550268
120472	NC_009512	C	8	8	5695133	5695140	0 %	0 %	0 %	100 %	148550268
120473	NC_009512	CTG	2	6	5695215	5695220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550268
120474	NC_009512	CGC	2	6	5695253	5695258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550268
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120476	NC_009512	GCA	2	6	5695364	5695369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550268
120477	NC_009512	AAC	2	6	5695372	5695377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550268
120478	NC_009512	GCT	2	6	5695388	5695393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550268
120479	NC_009512	CGC	2	6	5695428	5695433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550268
120480	NC_009512	GCC	2	6	5695440	5695445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550268
120481	NC_009512	CAGC	2	8	5695446	5695453	25 %	0 %	25 %	50 %	148550268
120482	NC_009512	TG	3	6	5695454	5695459	0 %	50 %	50 %	0 %	148550268
120483	NC_009512	TGGC	2	8	5695512	5695519	0 %	25 %	50 %	25 %	148550268
120484	NC_009512	GTG	2	6	5695522	5695527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550268
120485	NC_009512	GCAG	2	8	5695547	5695554	25 %	0 %	50 %	25 %	148550268
120486	NC_009512	CAA	2	6	5695656	5695661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120487	NC_009512	ATG	2	6	5695734	5695739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120488	NC_009512	ATC	2	6	5695871	5695876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550269
120489	NC_009512	TTG	2	6	5695901	5695906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550269
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120491	NC_009512	ACG	2	6	5696130	5696135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550269
120492	NC_009512	TGC	2	6	5696148	5696153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550269
120493	NC_009512	CACC	2	8	5696209	5696216	25 %	0 %	0 %	75 %	148550269
120494	NC_009512	CCTG	2	8	5696233	5696240	0 %	25 %	25 %	50 %	148550269
120495	NC_009512	GCC	2	6	5696274	5696279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550269
120496	NC_009512	GCC	2	6	5696367	5696372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550269
120497	NC_009512	GCT	2	6	5696403	5696408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550269
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120499	NC_009512	CAC	2	6	5696482	5696487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550270
120500	NC_009512	CGA	2	6	5696499	5696504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550270

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