MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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119502	NC_009512	GCAGA	2	10	5642521	5642530	40 %	0 %	40 %	20 %	148550217
119503	NC_009512	CCTT	2	8	5642574	5642581	0 %	50 %	0 %	50 %	148550217
119504	NC_009512	TC	3	6	5642593	5642598	0 %	50 %	0 %	50 %	148550217
119505	NC_009512	CGAG	2	8	5642620	5642627	25 %	0 %	50 %	25 %	148550217
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119508	NC_009512	AGG	2	6	5642886	5642891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119509	NC_009512	GAA	2	6	5642902	5642907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550218
119510	NC_009512	A	7	7	5642912	5642918	100 %	0 %	0 %	0 %	148550218
119511	NC_009512	CAC	2	6	5642938	5642943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550218
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119515	NC_009512	TCA	2	6	5643066	5643071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550218
119516	NC_009512	GAT	2	6	5643143	5643148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550218
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119518	NC_009512	CAAG	2	8	5643172	5643179	50 %	0 %	25 %	25 %	148550218
119519	NC_009512	AG	3	6	5643224	5643229	50 %	0 %	50 %	0 %	148550218
119520	NC_009512	TGG	2	6	5643243	5643248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550218
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119553	NC_009512	CATT	2	8	5644617	5644624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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119602	NC_009512	TC	3	6	5647130	5647135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119603	NC_009512	TGC	2	6	5647136	5647141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119618	NC_009512	AAAGG	2	10	5648350	5648359	60 %	0 %	40 %	0 %	148550223
119619	NC_009512	CAA	2	6	5648376	5648381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550223
119620	NC_009512	AAT	2	6	5648441	5648446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550223
119621	NC_009512	TCA	2	6	5648723	5648728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550223
119622	NC_009512	ATC	2	6	5648762	5648767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550223
119623	NC_009512	AAC	2	6	5648821	5648826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550223
119624	NC_009512	TGC	2	6	5648899	5648904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550224
119625	NC_009512	AGC	2	6	5648905	5648910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550224
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119628	NC_009512	T	6	6	5649167	5649172	0 %	100 %	0 %	0 %	148550224
119629	NC_009512	ACA	2	6	5649179	5649184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550224
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119632	NC_009512	TTC	2	6	5649334	5649339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550224
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119640	NC_009512	CGC	2	6	5649882	5649887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550224
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119645	NC_009512	CATT	2	8	5650122	5650129	25 %	50 %	0 %	25 %	148550224
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119647	NC_009512	CAT	2	6	5650203	5650208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550224
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119649	NC_009512	T	6	6	5650551	5650556	0 %	100 %	0 %	0 %	148550225
119650	NC_009512	GCT	2	6	5650600	5650605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550225
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119672	NC_009512	CAT	2	6	5651619	5651624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550225
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119674	NC_009512	CAA	2	6	5651657	5651662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550225
119675	NC_009512	CTGC	2	8	5651708	5651715	0 %	25 %	25 %	50 %	148550225
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119677	NC_009512	GGC	2	6	5651838	5651843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550225
119678	NC_009512	TTGTTT	2	12	5651920	5651931	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119679	NC_009512	AAGG	2	8	5652047	5652054	50 %	0 %	50 %	0 %	148550226
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119681	NC_009512	GCC	2	6	5652178	5652183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550226
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119683	NC_009512	ATCA	2	8	5652403	5652410	50 %	25 %	0 %	25 %	148550226
119684	NC_009512	GAC	2	6	5652418	5652423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550226
119685	NC_009512	TCA	2	6	5652428	5652433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550226
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119687	NC_009512	ACA	2	6	5652588	5652593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550226
119688	NC_009512	TAA	2	6	5652792	5652797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550226
119689	NC_009512	CTG	2	6	5652810	5652815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550226
119690	NC_009512	AGT	2	6	5652885	5652890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550226
119691	NC_009512	ATC	2	6	5652931	5652936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550227
119692	NC_009512	TGC	2	6	5652976	5652981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550227
119693	NC_009512	CG	3	6	5653094	5653099	0 %	0 %	50 %	50 %	148550227
119694	NC_009512	ATCG	2	8	5653188	5653195	25 %	25 %	25 %	25 %	148550227
119695	NC_009512	TCA	2	6	5653310	5653315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550227
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119697	NC_009512	TGG	2	6	5653614	5653619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550227
119698	NC_009512	GGT	2	6	5653635	5653640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550227
119699	NC_009512	GC	3	6	5653790	5653795	0 %	0 %	50 %	50 %	148550227
119700	NC_009512	GCT	2	6	5653838	5653843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550227
119701	NC_009512	ACC	2	6	5653913	5653918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550227
119702	NC_009512	CAT	2	6	5654013	5654018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550227
119703	NC_009512	GCA	2	6	5654023	5654028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550227
119704	NC_009512	GA	3	6	5654189	5654194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119705	NC_009512	CAG	2	6	5654222	5654227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550228
119706	NC_009512	CAACCC	2	12	5654315	5654326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550228
119707	NC_009512	AC	3	6	5654393	5654398	50 %	0 %	0 %	50 %	148550228
119708	NC_009512	GCA	2	6	5654457	5654462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550228
119709	NC_009512	ATT	2	6	5654471	5654476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550228
119710	NC_009512	AGCT	2	8	5654482	5654489	25 %	25 %	25 %	25 %	148550228
119711	NC_009512	CAC	3	9	5654573	5654581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550228
119712	NC_009512	GAT	2	6	5654666	5654671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550228
119713	NC_009512	CAC	2	6	5654678	5654683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550228
119714	NC_009512	CTC	2	6	5654699	5654704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550228
119715	NC_009512	TCC	2	6	5654751	5654756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550228
119716	NC_009512	GAT	2	6	5654768	5654773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550228
119717	NC_009512	ACCT	2	8	5654828	5654835	25 %	25 %	0 %	50 %	148550228
119718	NC_009512	GTG	2	6	5654876	5654881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550228
119719	NC_009512	CAG	3	9	5654896	5654904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550228
119720	NC_009512	CCT	2	6	5654953	5654958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550228
119721	NC_009512	AGC	2	6	5654981	5654986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550228
119722	NC_009512	CCTC	2	8	5655001	5655008	0 %	25 %	0 %	75 %	148550228
119723	NC_009512	GCT	2	6	5655088	5655093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550228
119724	NC_009512	GGC	2	6	5655163	5655168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119725	NC_009512	GCTCCA	2	12	5655367	5655378	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148550229
119726	NC_009512	GGT	3	9	5655445	5655453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550229
119727	NC_009512	ATGCC	2	10	5655521	5655530	20 %	20 %	20 %	40 %	148550230
119728	NC_009512	AGC	2	6	5655547	5655552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550230
119729	NC_009512	GAA	2	6	5655577	5655582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550230
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119731	NC_009512	GAC	2	6	5655658	5655663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550230
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119993	NC_009512	CAA	2	6	5671814	5671819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550246
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119999	NC_009512	GGGT	2	8	5672100	5672107	0 %	25 %	75 %	0 %	148550246
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