MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009512	GCA	2	6	555871	555876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11502	NC_009512	CCG	2	6	555931	555936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545732
11503	NC_009512	GTC	2	6	555966	555971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11504	NC_009512	TCA	2	6	555996	556001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545732
11505	NC_009512	CGT	2	6	556048	556053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11506	NC_009512	AGC	2	6	556164	556169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11507	NC_009512	GCT	2	6	556175	556180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11508	NC_009512	CGG	2	6	556219	556224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545732
11509	NC_009512	CGA	2	6	556240	556245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11510	NC_009512	CGA	2	6	556252	556257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11511	NC_009512	CCTGGC	2	12	556264	556275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148545732
11512	NC_009512	AAC	2	6	556277	556282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545732
11513	NC_009512	GAA	2	6	556285	556290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545732
11514	NC_009512	AG	3	6	556372	556377	50 %	0 %	50 %	0 %	148545732
11515	NC_009512	CAA	2	6	556411	556416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545732
11516	NC_009512	TACATG	2	12	556442	556453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148545732
11517	NC_009512	TGG	2	6	556470	556475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545732
11518	NC_009512	CG	3	6	556489	556494	0 %	0 %	50 %	50 %	148545732
11519	NC_009512	CAG	2	6	556523	556528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11520	NC_009512	GGT	2	6	556535	556540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545732
11521	NC_009512	GGT	2	6	556553	556558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545732
11522	NC_009512	GAC	2	6	556643	556648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545732
11523	NC_009512	TATCGA	2	12	556759	556770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148545732
11524	NC_009512	AGG	2	6	556838	556843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_009512	AAG	2	6	556965	556970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545733
11526	NC_009512	GCG	2	6	557113	557118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545733
11527	NC_009512	TCG	2	6	557141	557146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11528	NC_009512	CTG	2	6	557226	557231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11529	NC_009512	GCT	2	6	557324	557329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11530	NC_009512	ACG	2	6	557332	557337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11531	NC_009512	GAC	2	6	557370	557375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11532	NC_009512	GCT	2	6	557411	557416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11533	NC_009512	GCC	2	6	557446	557451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545733
11534	NC_009512	GAA	2	6	557457	557462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545733
11535	NC_009512	AAG	2	6	557493	557498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545733
11536	NC_009512	CCTG	2	8	557546	557553	0 %	25 %	25 %	50 %	148545733
11537	NC_009512	TGC	2	6	557581	557586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11538	NC_009512	TGG	2	6	557618	557623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545733
11539	NC_009512	TCG	2	6	557657	557662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11540	NC_009512	AAC	2	6	557676	557681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545733
11541	NC_009512	CTG	2	6	557694	557699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11542	NC_009512	CAT	2	6	557717	557722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545733
11543	NC_009512	TGC	2	6	557743	557748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11544	NC_009512	CTG	2	6	557766	557771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11545	NC_009512	GCC	2	6	557779	557784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545733
11546	NC_009512	ACT	2	6	557893	557898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545733
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11548	NC_009512	ACC	2	6	558024	558029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545733
11549	NC_009512	AAG	2	6	558042	558047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545733
11550	NC_009512	TGC	2	6	558212	558217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11551	NC_009512	TGA	2	6	558298	558303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545733
11552	NC_009512	CAA	2	6	558311	558316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545733
11553	NC_009512	GCCA	2	8	558326	558333	25 %	0 %	25 %	50 %	148545733
11554	NC_009512	ATC	2	6	558345	558350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545733
11555	NC_009512	GCC	2	6	558474	558479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545733
11556	NC_009512	GGT	2	6	558536	558541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545733
11557	NC_009512	TCG	2	6	558556	558561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11558	NC_009512	ACC	2	6	558564	558569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545733
11559	NC_009512	GTCG	2	8	558570	558577	0 %	25 %	50 %	25 %	148545733
11560	NC_009512	GCT	2	6	558581	558586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11561	NC_009512	CAG	2	6	558601	558606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11562	NC_009512	ACG	2	6	558616	558621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11563	NC_009512	GAA	2	6	558638	558643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545733
11564	NC_009512	TGGT	2	8	558682	558689	0 %	50 %	50 %	0 %	148545733
11565	NC_009512	CAT	2	6	558806	558811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545733
11566	NC_009512	CGA	2	6	558824	558829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
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11568	NC_009512	ACG	2	6	558919	558924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11569	NC_009512	GAT	2	6	558938	558943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545733
11570	NC_009512	ATG	2	6	559020	559025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545733
11571	NC_009512	CAT	2	6	559109	559114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545733
11572	NC_009512	TCG	2	6	559241	559246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11573	NC_009512	TGG	2	6	559249	559254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545733
11574	NC_009512	TGA	2	6	559312	559317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545733
11575	NC_009512	CA	3	6	559321	559326	50 %	0 %	0 %	50 %	148545733
11576	NC_009512	GGC	2	6	559332	559337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545733
11577	NC_009512	CCGG	2	8	559425	559432	0 %	0 %	50 %	50 %	148545733
11578	NC_009512	CGA	2	6	559442	559447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
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11582	NC_009512	GAA	2	6	559706	559711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545733
11583	NC_009512	CGA	2	6	559805	559810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11584	NC_009512	CGTGAG	2	12	559818	559829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545733
11585	NC_009512	CGGTG	2	10	559847	559856	0 %	20 %	60 %	20 %	148545733
11586	NC_009512	AAGG	2	8	559866	559873	50 %	0 %	50 %	0 %	148545733
11587	NC_009512	GAA	2	6	559971	559976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545733
11588	NC_009512	ACTG	2	8	560006	560013	25 %	25 %	25 %	25 %	148545733
11589	NC_009512	GCCA	2	8	560153	560160	25 %	0 %	25 %	50 %	148545733
11590	NC_009512	CG	3	6	560213	560218	0 %	0 %	50 %	50 %	148545733
11591	NC_009512	GGT	2	6	560256	560261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545733
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11595	NC_009512	CTG	2	6	560517	560522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11596	NC_009512	GC	3	6	560530	560535	0 %	0 %	50 %	50 %	148545733
11597	NC_009512	TGC	2	6	560629	560634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11598	NC_009512	TCA	2	6	560671	560676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545733
11599	NC_009512	TGC	2	6	560764	560769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11600	NC_009512	CTTC	2	8	560818	560825	0 %	50 %	0 %	50 %	148545733
11601	NC_009512	ACC	2	6	560832	560837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545733
11602	NC_009512	GTC	2	6	560911	560916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545733
11603	NC_009512	AGCG	2	8	560949	560956	25 %	0 %	50 %	25 %	148545733
11604	NC_009512	GAT	2	6	561108	561113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_009512	CGGG	2	8	561114	561121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11606	NC_009512	TAG	2	6	561256	561261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_009512	CGT	2	6	561349	561354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545734
11608	NC_009512	GT	3	6	561368	561373	0 %	50 %	50 %	0 %	148545734
11609	NC_009512	ACC	2	6	561376	561381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545734
11610	NC_009512	A	6	6	561388	561393	100 %	0 %	0 %	0 %	148545734
11611	NC_009512	GGT	2	6	561463	561468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545734
11612	NC_009512	CGT	2	6	561495	561500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545734
11613	NC_009512	GGC	2	6	561511	561516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545734
11614	NC_009512	CT	3	6	561561	561566	0 %	50 %	0 %	50 %	148545734
11615	NC_009512	T	7	7	561655	561661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_009512	CGT	2	6	561749	561754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545735
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11618	NC_009512	AAG	2	6	561842	561847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545735
11619	NC_009512	CGT	2	6	561971	561976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545735
11620	NC_009512	CGG	2	6	561979	561984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545735
11621	NC_009512	CGT	2	6	562022	562027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545735
11622	NC_009512	GCG	2	6	562071	562076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545735
11623	NC_009512	GCT	2	6	562108	562113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545735
11624	NC_009512	TGC	2	6	562117	562122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545735
11625	NC_009512	TGC	2	6	562135	562140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545735
11626	NC_009512	AAG	2	6	562145	562150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545735
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11639	NC_009512	CAA	2	6	562897	562902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545736
11640	NC_009512	GCC	3	9	562913	562921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545736
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11643	NC_009512	AGGC	2	8	562986	562993	25 %	0 %	50 %	25 %	148545736
11644	NC_009512	GC	5	10	562996	563005	0 %	0 %	50 %	50 %	148545736
11645	NC_009512	TCG	2	6	563042	563047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545736
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11647	NC_009512	CCTGA	2	10	563138	563147	20 %	20 %	20 %	40 %	148545736
11648	NC_009512	CGA	2	6	563185	563190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545736
11649	NC_009512	GAC	3	9	563201	563209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545736
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11651	NC_009512	TTCG	2	8	563270	563277	0 %	50 %	25 %	25 %	148545736
11652	NC_009512	TCA	2	6	563313	563318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545736
11653	NC_009512	AAGA	2	8	563333	563340	75 %	0 %	25 %	0 %	148545736
11654	NC_009512	AAG	2	6	563391	563396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545736
11655	NC_009512	GCT	2	6	563414	563419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545736
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11673	NC_009512	CGTT	2	8	564283	564290	0 %	50 %	25 %	25 %	148545736
11674	NC_009512	TCG	2	6	564357	564362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545736
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11686	NC_009512	CTG	2	6	564884	564889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545737
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11696	NC_009512	GAC	2	6	565277	565282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545737
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11703	NC_009512	T	8	8	565648	565655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11704	NC_009512	CCT	2	6	565695	565700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11720	NC_009512	AGT	2	6	566670	566675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545739
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11727	NC_009512	CGTGCT	2	12	566986	566997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545740
11728	NC_009512	TGGCG	2	10	567019	567028	0 %	20 %	60 %	20 %	148545740
11729	NC_009512	GTG	2	6	567029	567034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545740
11730	NC_009512	CAA	2	6	567075	567080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545740
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11732	NC_009512	GCT	2	6	567265	567270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545740
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11734	NC_009512	GAG	2	6	567376	567381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545740
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11854	NC_009512	CGG	2	6	572918	572923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545753
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11975	NC_009512	GTCT	2	8	578936	578943	0 %	50 %	25 %	25 %	148545764
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