MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
119001	NC_009512	CATTC	2	10	5618935	5618944	20 %	40 %	0 %	40 %	148550202
119002	NC_009512	TCG	2	6	5619054	5619059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550202
119003	NC_009512	TGG	2	6	5619081	5619086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550202
119004	NC_009512	TGGT	2	8	5619156	5619163	0 %	50 %	50 %	0 %	148550202
119005	NC_009512	TCG	2	6	5619204	5619209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550202
119006	NC_009512	CCG	2	6	5619313	5619318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550202
119007	NC_009512	CAGG	2	8	5619347	5619354	25 %	0 %	50 %	25 %	148550202
119008	NC_009512	TGA	2	6	5619451	5619456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550202
119009	NC_009512	CAG	2	6	5619470	5619475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550202
119010	NC_009512	TTG	2	6	5619504	5619509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550202
119011	NC_009512	AG	3	6	5619554	5619559	50 %	0 %	50 %	0 %	148550202
119012	NC_009512	AC	3	6	5619720	5619725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119013	NC_009512	CAC	2	6	5619768	5619773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119014	NC_009512	CCG	2	6	5619875	5619880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550203
119015	NC_009512	GC	3	6	5619884	5619889	0 %	0 %	50 %	50 %	148550203
119016	NC_009512	CAG	2	6	5619960	5619965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550203
119017	NC_009512	TCG	2	6	5620003	5620008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550203
119018	NC_009512	AAC	2	6	5620020	5620025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550203
119019	NC_009512	CTG	2	6	5620041	5620046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550203
119020	NC_009512	GCT	2	6	5620079	5620084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550203
119021	NC_009512	TGG	2	6	5620183	5620188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550203
119022	NC_009512	TTC	2	6	5620197	5620202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550203
119023	NC_009512	GTG	2	6	5620212	5620217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550203
119024	NC_009512	CCA	2	6	5620231	5620236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550203
119025	NC_009512	CGC	2	6	5620262	5620267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550203
119026	NC_009512	CG	4	8	5620319	5620326	0 %	0 %	50 %	50 %	148550203
119027	NC_009512	AGA	2	6	5620435	5620440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550203
119028	NC_009512	ACC	2	6	5620456	5620461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550203
119029	NC_009512	CGCC	2	8	5620472	5620479	0 %	0 %	25 %	75 %	148550203
119030	NC_009512	GGC	2	6	5620697	5620702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550203
119031	NC_009512	GAA	2	6	5620704	5620709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550203
119032	NC_009512	TCA	2	6	5620744	5620749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550203
119033	NC_009512	A	6	6	5620755	5620760	100 %	0 %	0 %	0 %	148550203
119034	NC_009512	CCG	2	6	5620787	5620792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550203
119035	NC_009512	GAC	2	6	5620872	5620877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550203
119036	NC_009512	AAC	2	6	5620881	5620886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550203
119037	NC_009512	CTG	2	6	5620890	5620895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550203
119038	NC_009512	GCT	2	6	5620928	5620933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550203
119039	NC_009512	CGAG	2	8	5620934	5620941	25 %	0 %	50 %	25 %	148550203
119040	NC_009512	GCC	2	6	5621049	5621054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119041	NC_009512	C	6	6	5621078	5621083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119042	NC_009512	CGG	2	6	5621157	5621162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119043	NC_009512	CG	3	6	5621196	5621201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119044	NC_009512	GCG	2	6	5621237	5621242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119045	NC_009512	GCC	2	6	5621287	5621292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119046	NC_009512	GC	3	6	5621369	5621374	0 %	0 %	50 %	50 %	148550204
119047	NC_009512	ATC	2	6	5621409	5621414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550204
119048	NC_009512	GTTC	2	8	5621438	5621445	0 %	50 %	25 %	25 %	148550204
119049	NC_009512	TGG	2	6	5621479	5621484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550204
119050	NC_009512	GTGGC	2	10	5621506	5621515	0 %	20 %	60 %	20 %	148550204
119051	NC_009512	TGA	2	6	5621540	5621545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550204
119052	NC_009512	ACG	2	6	5621563	5621568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119053	NC_009512	GCC	2	6	5621697	5621702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550204
119054	NC_009512	CGG	2	6	5621735	5621740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550204
119055	NC_009512	GCCA	2	8	5621769	5621776	25 %	0 %	25 %	50 %	148550204
119056	NC_009512	CGA	2	6	5621828	5621833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119057	NC_009512	AGCGC	2	10	5621851	5621860	20 %	0 %	40 %	40 %	148550204
119058	NC_009512	CCAC	2	8	5621965	5621972	25 %	0 %	0 %	75 %	148550204
119059	NC_009512	AGC	2	6	5621983	5621988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119060	NC_009512	CGGC	2	8	5621998	5622005	0 %	0 %	50 %	50 %	148550204
119061	NC_009512	TCG	2	6	5622013	5622018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119062	NC_009512	CTA	2	6	5622032	5622037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550204
119063	NC_009512	GCA	2	6	5622067	5622072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119064	NC_009512	ATG	2	6	5622102	5622107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550204
119065	NC_009512	GGC	2	6	5622123	5622128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550204
119066	NC_009512	CTG	2	6	5622150	5622155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119067	NC_009512	GCA	2	6	5622159	5622164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119068	NC_009512	AAG	2	6	5622166	5622171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550204
119069	NC_009512	CGG	2	6	5622284	5622289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550204
119070	NC_009512	GGC	2	6	5622321	5622326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550204
119071	NC_009512	CTG	2	6	5622327	5622332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119072	NC_009512	GCA	2	6	5622361	5622366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550204
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119075	NC_009512	GGCC	2	8	5622434	5622441	0 %	0 %	50 %	50 %	148550204
119076	NC_009512	CGA	3	9	5622497	5622505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550204
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119083	NC_009512	CTG	2	6	5622969	5622974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119084	NC_009512	AAG	2	6	5623017	5623022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550204
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119086	NC_009512	GTCC	2	8	5623041	5623048	0 %	25 %	25 %	50 %	148550204
119087	NC_009512	ACC	2	6	5623059	5623064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550204
119088	NC_009512	CTG	2	6	5623083	5623088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550204
119089	NC_009512	CCA	2	6	5623090	5623095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550204
119090	NC_009512	T	7	7	5623189	5623195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119091	NC_009512	CCG	2	6	5623302	5623307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550205
119092	NC_009512	CCTT	2	8	5623319	5623326	0 %	50 %	0 %	50 %	148550205
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119099	NC_009512	GC	3	6	5623621	5623626	0 %	0 %	50 %	50 %	148550205
119100	NC_009512	AGC	2	6	5623658	5623663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550205
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119106	NC_009512	GTA	2	6	5623999	5624004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550205
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119111	NC_009512	GGC	3	9	5624290	5624298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550205
119112	NC_009512	CAA	2	6	5624353	5624358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119113	NC_009512	GTTT	2	8	5624478	5624485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119114	NC_009512	T	6	6	5624541	5624546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119115	NC_009512	CTG	2	6	5624547	5624552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119116	NC_009512	CTG	2	6	5624585	5624590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550206
119117	NC_009512	CGC	2	6	5624627	5624632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550206
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119119	NC_009512	TGC	2	6	5624697	5624702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550206
119120	NC_009512	CTG	2	6	5624783	5624788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550206
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119122	NC_009512	CTG	3	9	5624894	5624902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550206
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119125	NC_009512	CTG	3	9	5625056	5625064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550206
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119327	NC_009512	AGGC	2	8	5633683	5633690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119328	NC_009512	TAG	2	6	5633748	5633753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119329	NC_009512	GCAT	2	8	5633798	5633805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119330	NC_009512	GAA	2	6	5633863	5633868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119331	NC_009512	GCA	2	6	5634066	5634071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550213
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119335	NC_009512	ACC	2	6	5634206	5634211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550213
119336	NC_009512	TCGA	2	8	5634212	5634219	25 %	25 %	25 %	25 %	148550213
119337	NC_009512	GGT	2	6	5634243	5634248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550213
119338	NC_009512	CCA	3	9	5634261	5634269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550213
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119340	NC_009512	CG	3	6	5634302	5634307	0 %	0 %	50 %	50 %	148550213
119341	NC_009512	TCC	2	6	5634308	5634313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550213
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119343	NC_009512	CTG	2	6	5634370	5634375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550213
119344	NC_009512	GTA	2	6	5634448	5634453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550213
119345	NC_009512	CTG	2	6	5634529	5634534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550213
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119451	NC_009512	GGCC	2	8	5639387	5639394	0 %	0 %	50 %	50 %	148550217
119452	NC_009512	TCT	2	6	5639397	5639402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550217
119453	NC_009512	TAG	2	6	5639544	5639549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550217
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