MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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118502	NC_009512	GCA	2	6	5594769	5594774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550177
118503	NC_009512	CTGC	2	8	5594806	5594813	0 %	25 %	25 %	50 %	148550177
118504	NC_009512	AGC	2	6	5594850	5594855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550177
118505	NC_009512	GGC	2	6	5594861	5594866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550177
118506	NC_009512	TGC	2	6	5594923	5594928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550177
118507	NC_009512	GTGG	2	8	5594947	5594954	0 %	25 %	75 %	0 %	148550177
118508	NC_009512	CAA	2	6	5594974	5594979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550177
118509	NC_009512	TGG	2	6	5595003	5595008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550177
118510	NC_009512	ATTG	2	8	5595016	5595023	25 %	50 %	25 %	0 %	148550177
118511	NC_009512	GTG	2	6	5595026	5595031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550177
118512	NC_009512	CTG	2	6	5595103	5595108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118513	NC_009512	CCG	2	6	5595121	5595126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118514	NC_009512	GCC	2	6	5595136	5595141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118515	NC_009512	A	6	6	5595178	5595183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118516	NC_009512	T	7	7	5595202	5595208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118522	NC_009512	GC	3	6	5595671	5595676	0 %	0 %	50 %	50 %	148550178
118523	NC_009512	CAG	2	6	5595741	5595746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550178
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118553	NC_009512	CAG	2	6	5596992	5596997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550180
118554	NC_009512	GGCA	2	8	5597016	5597023	25 %	0 %	50 %	25 %	148550180
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118616	NC_009512	CTG	3	9	5600111	5600119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550184
118617	NC_009512	CTC	2	6	5600123	5600128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550184
118618	NC_009512	CGCCA	2	10	5600162	5600171	20 %	0 %	20 %	60 %	148550184
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118625	NC_009512	GCT	2	6	5600365	5600370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550184
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118628	NC_009512	GCA	2	6	5600428	5600433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550184
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118725	NC_009512	CAG	2	6	5604405	5604410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550188
118726	NC_009512	GCCC	2	8	5604415	5604422	0 %	0 %	25 %	75 %	148550188
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118728	NC_009512	TCG	2	6	5604527	5604532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550188
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118730	NC_009512	CGG	2	6	5604594	5604599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550188
118731	NC_009512	GCTG	2	8	5604855	5604862	0 %	25 %	50 %	25 %	148550188
118732	NC_009512	ACC	2	6	5604932	5604937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550188
118733	NC_009512	CCCA	2	8	5604944	5604951	25 %	0 %	0 %	75 %	148550188
118734	NC_009512	AG	3	6	5604966	5604971	50 %	0 %	50 %	0 %	148550188
118735	NC_009512	GC	3	6	5604999	5605004	0 %	0 %	50 %	50 %	148550188
118736	NC_009512	CGG	2	6	5605026	5605031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550188
118737	NC_009512	TCG	2	6	5605049	5605054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550188
118738	NC_009512	CGC	2	6	5605086	5605091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550188
118739	NC_009512	GGCC	2	8	5605158	5605165	0 %	0 %	50 %	50 %	148550188
118740	NC_009512	TGA	2	6	5605301	5605306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550188
118741	NC_009512	GA	3	6	5605316	5605321	50 %	0 %	50 %	0 %	148550188
118742	NC_009512	TCG	2	6	5605550	5605555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550188
118743	NC_009512	AACA	2	8	5605660	5605667	75 %	0 %	0 %	25 %	148550188
118744	NC_009512	CCCG	3	12	5605800	5605811	0 %	0 %	25 %	75 %	148550189
118745	NC_009512	AGGGCC	2	12	5605828	5605839	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148550189
118746	NC_009512	GCC	3	9	5605870	5605878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550189
118747	NC_009512	GAAGGC	2	12	5605890	5605901	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148550189
118748	NC_009512	CTGG	2	8	5605943	5605950	0 %	25 %	50 %	25 %	148550189
118749	NC_009512	GAA	2	6	5606081	5606086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550189
118750	NC_009512	AGC	2	6	5606164	5606169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550189
118751	NC_009512	CCA	2	6	5606201	5606206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550189
118752	NC_009512	CTG	2	6	5606211	5606216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550189
118753	NC_009512	AGC	2	6	5606239	5606244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550189
118754	NC_009512	GAGC	2	8	5606255	5606262	25 %	0 %	50 %	25 %	148550189
118755	NC_009512	AAGCG	2	10	5606282	5606291	40 %	0 %	40 %	20 %	148550189
118756	NC_009512	GAA	2	6	5606339	5606344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550189
118757	NC_009512	GCT	2	6	5606440	5606445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118758	NC_009512	CGC	2	6	5606494	5606499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550190
118759	NC_009512	CTGC	2	8	5606549	5606556	0 %	25 %	25 %	50 %	148550190
118760	NC_009512	ACC	2	6	5606563	5606568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550190
118761	NC_009512	GCA	3	9	5606674	5606682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550190
118762	NC_009512	GCG	2	6	5606725	5606730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550190
118763	NC_009512	GCG	2	6	5606888	5606893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550190
118764	NC_009512	ACA	2	6	5606905	5606910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550190
118765	NC_009512	CTG	2	6	5606943	5606948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550190
118766	NC_009512	CAA	2	6	5607056	5607061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550190
118767	NC_009512	GCG	2	6	5607129	5607134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550190
118768	NC_009512	CTC	2	6	5607179	5607184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550190
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118772	NC_009512	TCC	2	6	5607340	5607345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550190
118773	NC_009512	GCT	3	9	5607353	5607361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550190
118774	NC_009512	CTG	2	6	5607423	5607428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550190
118775	NC_009512	GCCA	2	8	5607518	5607525	25 %	0 %	25 %	50 %	148550190
118776	NC_009512	CTG	2	6	5607555	5607560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550190
118777	NC_009512	GAC	2	6	5607582	5607587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550190
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118783	NC_009512	CAA	2	6	5607807	5607812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550191
118784	NC_009512	CGG	2	6	5607819	5607824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550191
118785	NC_009512	GCT	2	6	5607825	5607830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118786	NC_009512	CT	3	6	5607829	5607834	0 %	50 %	0 %	50 %	148550191
118787	NC_009512	CCAT	2	8	5607866	5607873	25 %	25 %	0 %	50 %	148550191
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118792	NC_009512	CTGCGC	2	12	5608129	5608140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148550191
118793	NC_009512	CTT	2	6	5608154	5608159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550191
118794	NC_009512	GCT	2	6	5608179	5608184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118795	NC_009512	TGC	2	6	5608247	5608252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118796	NC_009512	CG	3	6	5608265	5608270	0 %	0 %	50 %	50 %	148550191
118797	NC_009512	GCA	2	6	5608349	5608354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550191
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118799	NC_009512	CAAGCC	2	12	5608465	5608476	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148550191
118800	NC_009512	CAG	2	6	5608483	5608488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118801	NC_009512	CGA	2	6	5608556	5608561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118802	NC_009512	CAG	2	6	5608584	5608589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118803	NC_009512	CTG	2	6	5608597	5608602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118804	NC_009512	TGG	2	6	5608697	5608702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550191
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118806	NC_009512	GGC	2	6	5608765	5608770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550191
118807	NC_009512	CTG	2	6	5608837	5608842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118808	NC_009512	CCCA	2	8	5608864	5608871	25 %	0 %	0 %	75 %	148550191
118809	NC_009512	TGC	2	6	5608913	5608918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118810	NC_009512	CTG	2	6	5608951	5608956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
118811	NC_009512	ATC	2	6	5608988	5608993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550191
118812	NC_009512	CAT	2	6	5609182	5609187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118813	NC_009512	TCCG	2	8	5609222	5609229	0 %	25 %	25 %	50 %	148550192
118814	NC_009512	TGGC	2	8	5609320	5609327	0 %	25 %	50 %	25 %	148550192
118815	NC_009512	ACTGGT	2	12	5609382	5609393	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148550192
118816	NC_009512	GCA	2	6	5609442	5609447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550192
118817	NC_009512	GTT	2	6	5609495	5609500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550192
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118820	NC_009512	GCCA	2	8	5609668	5609675	25 %	0 %	25 %	50 %	148550192
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118822	NC_009512	ACT	2	6	5609945	5609950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550192
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118825	NC_009512	ATC	2	6	5610004	5610009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550192
118826	NC_009512	CGA	2	6	5610050	5610055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550192
118827	NC_009512	CAC	2	6	5610068	5610073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550192
118828	NC_009512	TAC	2	6	5610145	5610150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550192
118829	NC_009512	ACG	2	6	5610156	5610161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550192
118830	NC_009512	TGG	2	6	5610176	5610181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550192
118831	NC_009512	TAGC	2	8	5610186	5610193	25 %	25 %	25 %	25 %	148550192
118832	NC_009512	CCA	2	6	5610362	5610367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118833	NC_009512	ATG	2	6	5610465	5610470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550193
118834	NC_009512	GCA	2	6	5610753	5610758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550193
118835	NC_009512	CTA	2	6	5610762	5610767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550193
118836	NC_009512	TCG	2	6	5610824	5610829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550193
118837	NC_009512	GTC	2	6	5610955	5610960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550193
118838	NC_009512	AACC	2	8	5610973	5610980	50 %	0 %	0 %	50 %	148550193
118839	NC_009512	AGGG	2	8	5611034	5611041	25 %	0 %	75 %	0 %	148550193
118840	NC_009512	AG	3	6	5611115	5611120	50 %	0 %	50 %	0 %	148550193
118841	NC_009512	CCGCA	2	10	5611318	5611327	20 %	0 %	20 %	60 %	148550193
118842	NC_009512	GA	3	6	5611337	5611342	50 %	0 %	50 %	0 %	148550193
118843	NC_009512	AAG	2	6	5611361	5611366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550193
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118845	NC_009512	TTGGC	2	10	5611412	5611421	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118846	NC_009512	ACC	2	6	5611625	5611630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118847	NC_009512	TGC	2	6	5611691	5611696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550194
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118930	NC_009512	ACA	2	6	5615299	5615304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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118953	NC_009512	GGCT	2	8	5616312	5616319	0 %	25 %	50 %	25 %	148550198
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118957	NC_009512	GCG	2	6	5616488	5616493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550198
118958	NC_009512	GCG	2	6	5616546	5616551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550198
118959	NC_009512	GCA	2	6	5616560	5616565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550198
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118978	NC_009512	ATC	2	6	5617624	5617629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550200
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