MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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114502	NC_009512	GGA	2	6	5409992	5409997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550025
114503	NC_009512	GAT	2	6	5410016	5410021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550025
114504	NC_009512	CCTGAC	2	12	5410091	5410102	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148550025
114505	NC_009512	CCGC	2	8	5410250	5410257	0 %	0 %	25 %	75 %	148550026
114506	NC_009512	GTG	2	6	5410270	5410275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550026
114507	NC_009512	CTT	2	6	5410284	5410289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550026
114508	NC_009512	CTG	2	6	5410408	5410413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
114509	NC_009512	TCT	2	6	5410460	5410465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550026
114510	NC_009512	GCT	2	6	5410497	5410502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
114511	NC_009512	TGC	2	6	5410574	5410579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
114512	NC_009512	GGC	2	6	5410586	5410591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550026
114513	NC_009512	TGC	2	6	5410598	5410603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
114514	NC_009512	GC	3	6	5410602	5410607	0 %	0 %	50 %	50 %	148550026
114515	NC_009512	TCA	2	6	5410643	5410648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550026
114516	NC_009512	TGG	2	6	5410689	5410694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550026
114517	NC_009512	CTGG	2	8	5410695	5410702	0 %	25 %	50 %	25 %	148550026
114518	NC_009512	CCTG	2	8	5410740	5410747	0 %	25 %	25 %	50 %	148550026
114519	NC_009512	GCG	2	6	5410796	5410801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550026
114520	NC_009512	CAC	2	6	5410809	5410814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550026
114521	NC_009512	CTG	2	6	5410834	5410839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
114522	NC_009512	TGC	2	6	5410919	5410924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
114523	NC_009512	GCCT	2	8	5410939	5410946	0 %	25 %	25 %	50 %	148550026
114524	NC_009512	GC	3	6	5410962	5410967	0 %	0 %	50 %	50 %	148550026
114525	NC_009512	CGCC	2	8	5411049	5411056	0 %	0 %	25 %	75 %	148550026
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114527	NC_009512	TGC	3	9	5411090	5411098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
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114529	NC_009512	GGC	4	12	5411151	5411162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550026
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114532	NC_009512	CTG	2	6	5411251	5411256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
114533	NC_009512	GCCTGG	2	12	5411261	5411272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148550026
114534	NC_009512	GCT	2	6	5411295	5411300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
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114537	NC_009512	CTG	2	6	5411410	5411415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
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114544	NC_009512	CGT	2	6	5411617	5411622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550026
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114609	NC_009512	CAG	2	6	5414414	5414419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114610	NC_009512	CTT	2	6	5414429	5414434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114611	NC_009512	GC	3	6	5414470	5414475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114612	NC_009512	TTC	2	6	5414583	5414588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114613	NC_009512	CAT	2	6	5414608	5414613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550029
114614	NC_009512	GTCA	2	8	5414631	5414638	25 %	25 %	25 %	25 %	148550029
114615	NC_009512	CTG	2	6	5414741	5414746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550029
114616	NC_009512	CAT	2	6	5414764	5414769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550029
114617	NC_009512	CGA	2	6	5414791	5414796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550029
114618	NC_009512	GCC	2	6	5414808	5414813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550029
114619	NC_009512	GCCCTG	2	12	5414903	5414914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148550029
114620	NC_009512	GCG	2	6	5415021	5415026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550029
114621	NC_009512	GCT	3	9	5415055	5415063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550029
114622	NC_009512	TGT	2	6	5415090	5415095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550029
114623	NC_009512	ACA	2	6	5415133	5415138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550029
114624	NC_009512	TTC	2	6	5415155	5415160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550029
114625	NC_009512	CAG	2	6	5415248	5415253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550029
114626	NC_009512	GGT	2	6	5415262	5415267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550029
114627	NC_009512	ATC	2	6	5415293	5415298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550029
114628	NC_009512	CCAAC	2	10	5415319	5415328	40 %	0 %	0 %	60 %	148550029
114629	NC_009512	CGC	2	6	5415643	5415648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550029
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114632	NC_009512	CGC	2	6	5415738	5415743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550029
114633	NC_009512	TGT	2	6	5415798	5415803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550029
114634	NC_009512	ATC	2	6	5415887	5415892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550029
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114637	NC_009512	GTG	2	6	5416052	5416057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550029
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114639	NC_009512	CAC	2	6	5416072	5416077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550029
114640	NC_009512	GTTCCT	2	12	5416213	5416224	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148550029
114641	NC_009512	GCA	2	6	5416306	5416311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550029
114642	NC_009512	CGA	2	6	5416330	5416335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550029
114643	NC_009512	CCA	2	6	5416389	5416394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550029
114644	NC_009512	AGG	2	6	5416434	5416439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550029
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114651	NC_009512	CGC	2	6	5416865	5416870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550030
114652	NC_009512	CGA	2	6	5416891	5416896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550030
114653	NC_009512	GCG	2	6	5416954	5416959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550030
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114659	NC_009512	GC	3	6	5417274	5417279	0 %	0 %	50 %	50 %	148550030
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114664	NC_009512	GCA	2	6	5417663	5417668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114665	NC_009512	GAT	2	6	5417672	5417677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114666	NC_009512	CAC	2	6	5417729	5417734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550031
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114672	NC_009512	GTG	2	6	5417945	5417950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550031
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114677	NC_009512	GGT	2	6	5418097	5418102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550031
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114680	NC_009512	AGGC	2	8	5418188	5418195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114681	NC_009512	GAT	2	6	5418316	5418321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550032
114682	NC_009512	TGCG	2	8	5418375	5418382	0 %	25 %	50 %	25 %	148550032
114683	NC_009512	CTG	2	6	5418388	5418393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550032
114684	NC_009512	GCG	2	6	5418428	5418433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550032
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114686	NC_009512	GGGC	2	8	5418480	5418487	0 %	0 %	75 %	25 %	148550032
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114688	NC_009512	GCT	2	6	5418544	5418549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550032
114689	NC_009512	TGC	2	6	5418570	5418575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550032
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114692	NC_009512	CAA	2	6	5418726	5418731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550033
114693	NC_009512	CCT	2	6	5418756	5418761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550033
114694	NC_009512	CTT	2	6	5418787	5418792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550033
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114699	NC_009512	GTA	2	6	5419071	5419076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550033
114700	NC_009512	CAG	2	6	5419167	5419172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550034
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114702	NC_009512	CTGC	2	8	5419236	5419243	0 %	25 %	25 %	50 %	148550034
114703	NC_009512	GCA	2	6	5419319	5419324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114704	NC_009512	CCG	2	6	5419329	5419334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550034
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114706	NC_009512	GCA	2	6	5419395	5419400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550034
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114709	NC_009512	GC	3	6	5419605	5419610	0 %	0 %	50 %	50 %	148550034
114710	NC_009512	GGC	2	6	5419672	5419677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550034
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114712	NC_009512	CGG	2	6	5419750	5419755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550034
114713	NC_009512	TGC	2	6	5419775	5419780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114714	NC_009512	GCA	2	6	5419785	5419790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114715	NC_009512	GGC	2	6	5419809	5419814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550034
114716	NC_009512	CTG	2	6	5419858	5419863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114717	NC_009512	GC	3	6	5419906	5419911	0 %	0 %	50 %	50 %	148550034
114718	NC_009512	CCGT	2	8	5419912	5419919	0 %	25 %	25 %	50 %	148550034
114719	NC_009512	GCTT	2	8	5419958	5419965	0 %	50 %	25 %	25 %	148550034
114720	NC_009512	GCA	2	6	5419995	5420000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114721	NC_009512	CAGTG	2	10	5420158	5420167	20 %	20 %	40 %	20 %	148550034
114722	NC_009512	GCT	2	6	5420223	5420228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114723	NC_009512	CGT	2	6	5420259	5420264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114724	NC_009512	CGAG	2	8	5420268	5420275	25 %	0 %	50 %	25 %	148550034
114725	NC_009512	GCGCCT	2	12	5420316	5420327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148550034
114726	NC_009512	CAG	2	6	5420361	5420366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114727	NC_009512	CGG	2	6	5420381	5420386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550034
114728	NC_009512	GCT	2	6	5420430	5420435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550034
114729	NC_009512	CAC	2	6	5420449	5420454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550034
114730	NC_009512	CAC	2	6	5420473	5420478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550034
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114732	NC_009512	C	7	7	5420535	5420541	0 %	0 %	0 %	100 %	148550034
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114754	NC_009512	CGGT	2	8	5421376	5421383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114755	NC_009512	A	7	7	5421418	5421424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114781	NC_009512	TC	4	8	5422533	5422540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114782	NC_009512	CGT	2	6	5422549	5422554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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114836	NC_009512	GC	4	8	5425451	5425458	0 %	0 %	50 %	50 %	148550039
114837	NC_009512	TTGG	2	8	5425523	5425530	0 %	50 %	50 %	0 %	148550039
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114839	NC_009512	GGA	2	6	5425611	5425616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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114842	NC_009512	GAT	2	6	5425822	5425827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550040
114843	NC_009512	GC	3	6	5425888	5425893	0 %	0 %	50 %	50 %	148550040
114844	NC_009512	GCA	2	6	5425908	5425913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550040
114845	NC_009512	CTG	2	6	5426116	5426121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550040
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114956	NC_009512	GCA	2	6	5431174	5431179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550043
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114959	NC_009512	GAC	2	6	5431411	5431416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550043
114960	NC_009512	GC	3	6	5431450	5431455	0 %	0 %	50 %	50 %	148550043
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114980	NC_009512	GAA	2	6	5432523	5432528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550044
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114983	NC_009512	CG	3	6	5432676	5432681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114984	NC_009512	ATGC	2	8	5432694	5432701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114985	NC_009512	ACAGC	2	10	5432795	5432804	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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114991	NC_009512	GCG	2	6	5433176	5433181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550045
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