MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113501	NC_009512	C	6	6	5360568	5360573	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113502	NC_009512	TGA	2	6	5360642	5360647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148549988
113503	NC_009512	TGG	2	6	5360714	5360719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148549988
113504	NC_009512	CGCTGG	2	12	5360720	5360731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148549988
113505	NC_009512	CATG	2	8	5360772	5360779	25 %	25 %	25 %	25 %	148549988
113506	NC_009512	ACC	2	6	5360809	5360814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549988
113507	NC_009512	GCT	2	6	5360838	5360843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113508	NC_009512	TGG	2	6	5360903	5360908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148549988
113509	NC_009512	CTG	2	6	5360977	5360982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113510	NC_009512	CTG	2	6	5361124	5361129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113511	NC_009512	TCA	2	6	5361167	5361172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549988
113512	NC_009512	CTG	2	6	5361181	5361186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113513	NC_009512	ACCG	2	8	5361232	5361239	25 %	0 %	25 %	50 %	148549988
113514	NC_009512	CGCC	2	8	5361261	5361268	0 %	0 %	25 %	75 %	148549988
113515	NC_009512	TGCA	2	8	5361272	5361279	25 %	25 %	25 %	25 %	148549988
113516	NC_009512	CGGAGC	2	12	5361302	5361313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148549988
113517	NC_009512	GAA	2	6	5361319	5361324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148549988
113518	NC_009512	GAC	2	6	5361325	5361330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113519	NC_009512	CGA	2	6	5361339	5361344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113520	NC_009512	CGC	2	6	5361351	5361356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549988
113521	NC_009512	CG	3	6	5361380	5361385	0 %	0 %	50 %	50 %	148549988
113522	NC_009512	GAC	2	6	5361412	5361417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113523	NC_009512	CTG	2	6	5361433	5361438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113524	NC_009512	GAC	3	9	5361439	5361447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113525	NC_009512	GCC	2	6	5361460	5361465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549988
113526	NC_009512	CGA	2	6	5361480	5361485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113527	NC_009512	ACG	2	6	5361614	5361619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113528	NC_009512	ACG	2	6	5361638	5361643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113529	NC_009512	GCA	2	6	5361644	5361649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113530	NC_009512	GC	3	6	5361723	5361728	0 %	0 %	50 %	50 %	148549988
113531	NC_009512	GCA	2	6	5361876	5361881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113532	NC_009512	CTG	2	6	5361978	5361983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549988
113533	NC_009512	TG	3	6	5361982	5361987	0 %	50 %	50 %	0 %	148549988
113534	NC_009512	GCAT	2	8	5362037	5362044	25 %	25 %	25 %	25 %	148549988
113535	NC_009512	GGC	3	9	5362183	5362191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113536	NC_009512	CGG	2	6	5362201	5362206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113537	NC_009512	CAG	2	6	5362219	5362224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113538	NC_009512	GGCC	2	8	5362225	5362232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113539	NC_009512	TG	3	6	5362280	5362285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113540	NC_009512	GCG	2	6	5362332	5362337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113541	NC_009512	CGG	2	6	5362349	5362354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113542	NC_009512	CAG	2	6	5362367	5362372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113543	NC_009512	GGCC	2	8	5362373	5362380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113544	NC_009512	A	6	6	5362422	5362427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113545	NC_009512	CTT	2	6	5362538	5362543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148549989
113546	NC_009512	CTT	2	6	5362576	5362581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148549989
113547	NC_009512	CCG	2	6	5362615	5362620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549989
113548	NC_009512	GCA	2	6	5362645	5362650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549989
113549	NC_009512	CGA	2	6	5362673	5362678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549989
113550	NC_009512	TGC	3	9	5362692	5362700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549989
113551	NC_009512	CACGGC	2	12	5362729	5362740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148549989
113552	NC_009512	CAG	2	6	5362811	5362816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549989
113553	NC_009512	TAC	2	6	5362859	5362864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549989
113554	NC_009512	GCCAG	2	10	5362882	5362891	20 %	0 %	40 %	40 %	148549989
113555	NC_009512	CAG	2	6	5362901	5362906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549989
113556	NC_009512	GTCG	2	8	5362946	5362953	0 %	25 %	50 %	25 %	148549989
113557	NC_009512	CAC	2	6	5363074	5363079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549989
113558	NC_009512	CAG	2	6	5363132	5363137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549989
113559	NC_009512	TCA	2	6	5363143	5363148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549989
113560	NC_009512	TCA	2	6	5363176	5363181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549989
113561	NC_009512	GGC	2	6	5363191	5363196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549989
113562	NC_009512	ATC	2	6	5363271	5363276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113563	NC_009512	TGC	2	6	5363408	5363413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549990
113564	NC_009512	GTC	2	6	5363448	5363453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549990
113565	NC_009512	TTC	2	6	5363535	5363540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148549990
113566	NC_009512	TTG	2	6	5363578	5363583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148549990
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113568	NC_009512	GCC	2	6	5363653	5363658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549990
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113572	NC_009512	CA	3	6	5363835	5363840	50 %	0 %	0 %	50 %	148549990
113573	NC_009512	GGC	2	6	5363860	5363865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549990
113574	NC_009512	GCC	2	6	5363920	5363925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549990
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113576	NC_009512	GCGCA	2	10	5364052	5364061	20 %	0 %	40 %	40 %	148549990
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113582	NC_009512	GC	3	6	5364309	5364314	0 %	0 %	50 %	50 %	148549990
113583	NC_009512	GAT	2	6	5364411	5364416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148549990
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113585	NC_009512	GGC	2	6	5364506	5364511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549990
113586	NC_009512	CCA	2	6	5364545	5364550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549990
113587	NC_009512	CGGC	2	8	5364576	5364583	0 %	0 %	50 %	50 %	148549990
113588	NC_009512	GAT	2	6	5364594	5364599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148549990
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113597	NC_009512	TCGG	2	8	5364937	5364944	0 %	25 %	50 %	25 %	148549990
113598	NC_009512	CA	3	6	5365011	5365016	50 %	0 %	0 %	50 %	148549990
113599	NC_009512	GCG	2	6	5365043	5365048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549990
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113601	NC_009512	GC	3	6	5365110	5365115	0 %	0 %	50 %	50 %	148549990
113602	NC_009512	GCA	2	6	5365118	5365123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549990
113603	NC_009512	CGGC	2	8	5365124	5365131	0 %	0 %	50 %	50 %	148549990
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113605	NC_009512	AGCGT	2	10	5365203	5365212	20 %	20 %	40 %	20 %	148549990
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113609	NC_009512	GGCATC	2	12	5365416	5365427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148549990
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113842	NC_009512	GCC	2	6	5376990	5376995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550001
113843	NC_009512	TGC	2	6	5377060	5377065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550001
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113940	NC_009512	CCCG	2	8	5381409	5381416	0 %	0 %	25 %	75 %	148550005
113941	NC_009512	CGG	3	9	5381473	5381481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550005
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113945	NC_009512	CTG	2	6	5381627	5381632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550005
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113947	NC_009512	CCTT	2	8	5381724	5381731	0 %	50 %	0 %	50 %	148550005
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113949	NC_009512	CTG	2	6	5381747	5381752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550005
113950	NC_009512	ACTGGC	2	12	5381770	5381781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148550005
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113952	NC_009512	GCA	2	6	5381948	5381953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550006
113953	NC_009512	TC	3	6	5381966	5381971	0 %	50 %	0 %	50 %	148550006
113954	NC_009512	GAA	2	6	5382130	5382135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550006
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