MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110501	NC_009512	ACCG	2	8	5222223	5222230	25 %	0 %	25 %	50 %	148549858
110502	NC_009512	GC	3	6	5222251	5222256	0 %	0 %	50 %	50 %	148549858
110503	NC_009512	GCC	2	6	5222265	5222270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549858
110504	NC_009512	CAGC	2	8	5222375	5222382	25 %	0 %	25 %	50 %	148549858
110505	NC_009512	CGG	2	6	5222408	5222413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549858
110506	NC_009512	CGGCCT	2	12	5222444	5222455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148549858
110507	NC_009512	AGGT	2	8	5222464	5222471	25 %	25 %	50 %	0 %	148549858
110508	NC_009512	AGGC	2	8	5222526	5222533	25 %	0 %	50 %	25 %	148549858
110509	NC_009512	CGG	2	6	5222543	5222548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549858
110510	NC_009512	CGATG	2	10	5222591	5222600	20 %	20 %	40 %	20 %	148549858
110511	NC_009512	GCT	2	6	5222616	5222621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549858
110512	NC_009512	TG	3	6	5222633	5222638	0 %	50 %	50 %	0 %	148549858
110513	NC_009512	GCCT	2	8	5222652	5222659	0 %	25 %	25 %	50 %	148549858
110514	NC_009512	GCC	2	6	5222670	5222675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549858
110515	NC_009512	GCG	3	9	5222783	5222791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549858
110516	NC_009512	TGGT	2	8	5222794	5222801	0 %	50 %	50 %	0 %	148549858
110517	NC_009512	G	6	6	5222839	5222844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110518	NC_009512	GA	3	6	5222866	5222871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110519	NC_009512	GC	5	10	5222939	5222948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110520	NC_009512	GGC	3	9	5222978	5222986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110521	NC_009512	CGG	2	6	5222996	5223001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110522	NC_009512	CAG	2	6	5223014	5223019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110523	NC_009512	AGCG	2	8	5223053	5223060	25 %	0 %	50 %	25 %	148549859
110524	NC_009512	GCA	2	6	5223069	5223074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110525	NC_009512	AACTC	2	10	5223114	5223123	40 %	20 %	0 %	40 %	148549859
110526	NC_009512	CG	3	6	5223141	5223146	0 %	0 %	50 %	50 %	148549859
110527	NC_009512	CCG	2	6	5223226	5223231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549859
110528	NC_009512	GAA	2	6	5223253	5223258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148549859
110529	NC_009512	ATC	2	6	5223286	5223291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549859
110530	NC_009512	ATC	2	6	5223334	5223339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549859
110531	NC_009512	CGG	2	6	5223350	5223355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549859
110532	NC_009512	ATC	2	6	5223368	5223373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549859
110533	NC_009512	CCA	2	6	5223408	5223413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549859
110534	NC_009512	GC	3	6	5223530	5223535	0 %	0 %	50 %	50 %	148549859
110535	NC_009512	GC	3	6	5223551	5223556	0 %	0 %	50 %	50 %	148549859
110536	NC_009512	GGC	2	6	5223585	5223590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549859
110537	NC_009512	CAT	2	6	5223634	5223639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549859
110538	NC_009512	CGAG	2	8	5223714	5223721	25 %	0 %	50 %	25 %	148549859
110539	NC_009512	CTG	2	6	5223856	5223861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110540	NC_009512	GCCAGC	2	12	5223887	5223898	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148549859
110541	NC_009512	GCTG	2	8	5223930	5223937	0 %	25 %	50 %	25 %	148549859
110542	NC_009512	TGA	2	6	5223948	5223953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148549859
110543	NC_009512	GACCA	2	10	5223991	5224000	40 %	0 %	20 %	40 %	148549859
110544	NC_009512	GAT	2	6	5224024	5224029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148549859
110545	NC_009512	GC	3	6	5224036	5224041	0 %	0 %	50 %	50 %	148549859
110546	NC_009512	CCA	2	6	5224057	5224062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549859
110547	NC_009512	CAG	2	6	5224099	5224104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110548	NC_009512	CAG	2	6	5224108	5224113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110549	NC_009512	GCGCA	2	10	5224123	5224132	20 %	0 %	40 %	40 %	148549859
110550	NC_009512	GC	3	6	5224170	5224175	0 %	0 %	50 %	50 %	148549859
110551	NC_009512	CAG	2	6	5224186	5224191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110552	NC_009512	TGC	2	6	5224221	5224226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110553	NC_009512	CCA	2	6	5224306	5224311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549859
110554	NC_009512	CGAA	2	8	5224371	5224378	50 %	0 %	25 %	25 %	148549859
110555	NC_009512	CACG	2	8	5224413	5224420	25 %	0 %	25 %	50 %	148549859
110556	NC_009512	ATC	2	6	5224472	5224477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549859
110557	NC_009512	GCT	2	6	5224500	5224505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110558	NC_009512	GCG	2	6	5224539	5224544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549859
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110560	NC_009512	GCAGTT	2	12	5224602	5224613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148549859
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110563	NC_009512	GCT	2	6	5224696	5224701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110564	NC_009512	GCG	2	6	5224731	5224736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549859
110565	NC_009512	CAG	2	6	5224750	5224755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110566	NC_009512	CGT	2	6	5224968	5224973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110567	NC_009512	GCA	2	6	5225001	5225006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549859
110568	NC_009512	GTCGC	2	10	5225061	5225070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110569	NC_009512	GAC	2	6	5225092	5225097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110570	NC_009512	GCA	2	6	5225106	5225111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110571	NC_009512	CGAT	2	8	5225235	5225242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110572	NC_009512	TGG	2	6	5225283	5225288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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110574	NC_009512	GGC	2	6	5225360	5225365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549860
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110583	NC_009512	CTG	2	6	5225816	5225821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549860
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110589	NC_009512	CAGC	2	8	5226146	5226153	25 %	0 %	25 %	50 %	148549861
110590	NC_009512	GCCG	2	8	5226159	5226166	0 %	0 %	50 %	50 %	148549861
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110604	NC_009512	CGC	2	6	5226699	5226704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549861
110605	NC_009512	GA	3	6	5226741	5226746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110606	NC_009512	GGC	2	6	5226841	5226846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549862
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110613	NC_009512	GC	3	6	5227010	5227015	0 %	0 %	50 %	50 %	148549862
110614	NC_009512	CCA	2	6	5227106	5227111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549862
110615	NC_009512	CAT	2	6	5227155	5227160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549862
110616	NC_009512	GCT	2	6	5227172	5227177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549862
110617	NC_009512	CTG	2	6	5227198	5227203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549862
110618	NC_009512	CCGGCT	2	12	5227211	5227222	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148549862
110619	NC_009512	ACCCTG	2	12	5227279	5227290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148549862
110620	NC_009512	CGC	2	6	5227305	5227310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549862
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110624	NC_009512	CGA	2	6	5227461	5227466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549862
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110627	NC_009512	TCG	2	6	5227550	5227555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549862
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110630	NC_009512	GCC	2	6	5227669	5227674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549862
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110632	NC_009512	GCC	2	6	5227700	5227705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148549862
110633	NC_009512	GCA	2	6	5227758	5227763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549862
110634	NC_009512	CAC	2	6	5227794	5227799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549862
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110639	NC_009512	AAT	2	6	5228143	5228148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110641	NC_009512	CCAA	2	8	5228175	5228182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110642	NC_009512	GCT	2	6	5228216	5228221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110643	NC_009512	CCA	2	6	5228236	5228241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110644	NC_009512	CTT	2	6	5228324	5228329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148549863
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110650	NC_009512	CTG	2	6	5228645	5228650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549863
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110725	NC_009512	CAC	2	6	5232649	5232654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549868
110726	NC_009512	CTA	2	6	5232663	5232668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148549868
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110737	NC_009512	GCCG	2	8	5233012	5233019	0 %	0 %	50 %	50 %	148549868
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110838	NC_009512	TC	3	6	5237156	5237161	0 %	50 %	0 %	50 %	148549871
110839	NC_009512	GCA	2	6	5237172	5237177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549871
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110959	NC_009512	ACG	2	6	5242688	5242693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549877
110960	NC_009512	ACC	2	6	5242730	5242735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549877
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110963	NC_009512	GTT	2	6	5242807	5242812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148549877
110964	NC_009512	ACGC	2	8	5242844	5242851	25 %	0 %	25 %	50 %	148549877
110965	NC_009512	CTT	2	6	5242865	5242870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148549877
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110970	NC_009512	GGTA	2	8	5242985	5242992	25 %	25 %	50 %	0 %	148549877
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110986	NC_009512	ACG	2	6	5243605	5243610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148549878
110987	NC_009512	AGGC	2	8	5243663	5243670	25 %	0 %	50 %	25 %	148549878
110988	NC_009512	GC	3	6	5243704	5243709	0 %	0 %	50 %	50 %	148549879
110989	NC_009512	GGT	2	6	5243769	5243774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148549879
110990	NC_009512	CCTT	2	8	5243782	5243789	0 %	50 %	0 %	50 %	148549879
110991	NC_009512	TGCT	2	8	5243830	5243837	0 %	50 %	25 %	25 %	148549879
110992	NC_009512	TCG	2	6	5243902	5243907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549879
110993	NC_009512	CAA	3	9	5243978	5243986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110994	NC_009512	AAC	2	6	5244032	5244037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148549880
110995	NC_009512	AGA	2	6	5244042	5244047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148549880
110996	NC_009512	CGG	2	6	5244071	5244076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148549880
110997	NC_009512	ACC	2	6	5244082	5244087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148549880
110998	NC_009512	CGGTG	2	10	5244184	5244193	0 %	20 %	60 %	20 %	148549880
110999	NC_009512	GTC	2	6	5244262	5244267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148549880
111000	NC_009512	GCCAG	2	10	5244269	5244278	20 %	0 %	40 %	40 %	148549880

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